Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22093 LG5 44679321 44684828 PREDICTED: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 44679396 5_prime_UTR_variant
G/T 44679653 upstream_gene_variant
G/T 44679752 upstream_gene_variant
G/T 44680408 stop_gained p.Glu211*
T/C 44680512 intron_variant
G/T 44680920 intron_variant
G/C 44680980 intron_variant
G/T 44681008 intron_variant
G/A 44681081 intron_variant
A/G 44681485 intron_variant
C/T 44681690 intron_variant
T/C 44681737 intron_variant
C/T 44681917 intron_variant
G/C 44682215 intron_variant
T/C 44682874 intron_variant
T/G,A 44683116 intron_variant
C/T 44683118 intron_variant
G/A 44683145 intron_variant
T/C 44683146 intron_variant
G/A 44683160 intron_variant
G/A 44683171 intron_variant
T/G 44683259 intron_variant
C/T 44683422 intron_variant
G/A 44683547 intron_variant
G/A 44683574 intron_variant
C/A 44684233 intron_variant
G/A 44684337 3_prime_UTR_variant
G/C 44684381 3_prime_UTR_variant
C/T 44684415 3_prime_UTR_variant
G/C 44684730 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22093.1
MGIQTMGSQGIGQQSHLQSSSLSRQGSWYNLTLDEVNSQLGDLGKPLGSMNLDELLQNVWTAEASKSSVIGADSENISSSSSLQRQASLTLARALSGKTVDDVWREIQQGQKKRYGGEVKTQEGEMTFGETTLEDFLVQAGLFAEASISPAVGLDTMDFSAAQGFQQKTGLSSSPSIGSLSDTRPGRKRDAPDAYEKTLERRLRRKIKNRESAARSRARKQAYHNELVGKVSRLEEENVKLKKEKEFEERFTPDPLPEPKYQLQRHNSAPF*


CDS Sequence:
>Vu_22093.1
ATGGGGATTCAGACAATGGGATCTCAAGGTATTGGGCAACAGTCTCATTTACAGTCTTCATCTTTGTCTAGGCAAGGTTCATGGTATAATCTTACTCTTGATGAGGTTAATAGTCAATTAGGAGACTTAGGGAAGCCATTGGGTAGCATGAACCTTGACGAGCTTCTTCAAAATGTGTGGACTGCCGAAGCAAGTAAGTCTTCGGTGATAGGTGCGGATAGTGAGAACATTTCGTCCTCTTCCTCGCTTCAGCGGCAGGCCAGCCTGACGCTGGCTCGTGCGTTGAGTGGGAAGACTGTGGATGACGTGTGGAGGGAAATTCAGCAAGGGCAGAAGAAAAGGTATGGAGGGGAAGTGAAAACTCAGGAGGGAGAAATGACTTTTGGTGAGACAACCTTGGAAGATTTCTTGGTGCAAGCAGGGCTTTTTGCTGAAGCTTCTATCAGTCCAGCTGTGGGGTTGGATACAATGGATTTCTCAGCAGCTCAAGGTTTCCAGCAGAAAACGGGCTTGTCTTCATCCCCTTCTATTGGCAGTTTATCGGACACGAGACCGGGCAGGAAAAGGGATGCTCCTGATGCATATGAGAAAACCCTGGAGAGGAGGTTGAGGAGGAAGATCAAGAATAGGGAATCTGCTGCTAGGTCACGAGCTCGTAAACAGGCTTACCATAATGAACTGGTTGGCAAGGTTTCCCGTCTAGAAGAAGAAAATGTAAAGCTAAAGAAAGAGAAGGAATTTGAAGAAAGGTTTACTCCCGATCCATTGCCGGAACCAAAATATCAACTTCAAAGACATAACTCTGCCCCTTTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_22093::LG5:44677321-44679321(+)
TCCCCCTCAAATTTTTATTGAATTCACTAACCTTTTGACGTCTAACGTTGGAGCATTTGAAATTTTATGTCCTTTTACGTCGAATTACAATTCTAAATGACGTTTAATAATTGCATTTATTTACAAAAATGTCACCGATCATTTTTAACGTTGGCTATTGAGTGGTTGGAAGTTGAACGCGTGACGTTATACGTTGTTTTTGCACTAGTGTATGAATTCAAAAATGCAAAATAAAAGCACTCAAGGAACATATATGGTGAAGTTTTGAAAATGAACATATATTTTTTTGTGATTTTTTCAAGATTAAACTAAGTAGAAACATAAAAACATATTAGACATTACTCTAGACAACGTGAAACGATTTGAAAATAAAAATGACCCTAACGTAAGACTCAACAAAAGCTAAGCACATGTAAACTTTTTATCCAACACATTTAAAGCATTTAAAAGACGGGAAATAGTAGTCAAAATTACCAAAGGAAAACATTAAAGCCAAATTAGATAATTATGTTTTTTTAACTGGAAACTAGACTCGCTGCCTCATAATAGGAAGCTTTCACCAACATGGCTACATATCACATATGTCAAATATCTTATTTTACTATTTATGGTTTATGCTCAACTACTCATAAAATAAATTTTTTTTCCTTGGTCTTGCACCAATTTGCTCAATTGATTCGATCCTAAGTTCCTTAATTCAACACCAATTCAATAATACAATAATATACAAACATCCAACACAAACCAAATTTTAACATATCAAACACCATTATATCACTTAATCATGCAAAAACATAAATTTCAAGACATCTATAACTTAAAAACAAAGCAATTAACTTCCCTTACTTGAAAGACAACCAAACTACTTGAAAGACCTAAAAACACCTCCAAACGCATAAGTACCTCTATATGCTCCTATGAATAACATAGACACGATCGTGATAAACCATTAGGACCACTAATCAACATATATTCTTAAATAAAGTTCAAACACCACATGCGAACTAAGACTATCAACATGCATGGAAGAACACATGAACTAAGAAAAAGGGTAAAAAACCAACTTACTCTATTACAGAAGCTAACTGGATAGAAGTGGAGAACTTGCCTCAAGATCACCTTAGCGACATCTGATCTTCAATCAGATGAACAAACAATACAAAACTCTAGAGAGAAGGAAGAAAGTGCCAAAAGAAAGGTGTTTAGAGAGATGATGTGATTTTAAGATAATGAAACTCAGACTTTTTTATACTTTAAACTTTAATTATTAAAATAATCGAGTTTCACTACTTTATACATACGGTTAATTCTTAAACACGATTTTCTAGACTCTTAGAACAAGTATCCCACACACAACTCCAATTTGATAATTTATCGTGATAGGTAAAATAAAAACATATTAAAATTCTCTAAATTTATGATATAAAATTAATTTAACTTAATTATCATATAATTTACATAAAATTATATTTAATTTTAAATATTTTTTATAAAATAAAATGAAGATTTAGAGATTTAAAAATAAATTAAAAAATAAATTAAATTATTCATCCATAACACAAATAGATAACATCAAAAAGAAATTAAAAAAAATAAATAACAAGAAAAATAATATAATCTTTTAACTAATTTCATAAAATACATGGACAAGTTATTCTATTTCTTATACTAGTTAGATATGTGATAAAAATTCATTCAAAAAGACCATTTTCCAAAATAGATGAAGATGATAAAAAAGAGTAAAAAATCACATGTAAAAAACTATTTTAAATGGTTTTTTATTTTTTATGTTTTATTAAAATATGTTTTGAGACAAAAGGAAAATATAATAAAATAAATTATTAACGAGGATGAGCCCTAAACGAGCCTATGAACGTTTGCCACTTGCCAATTCCACAAAATTCCGAATCACTCCCACGTTACATCACAACTCAAGTTTACACCAACTACCCTTTTTTTCCTTTCACTTTTCTTCTCAAATTGTTCCCATTTTCACTCTG


Gene Sequence:
>Vu_22093(+)
GATTTACCCCCCACCAAATGATGTGTTTCTTTCCGCACTTGCCAACCCCGAACTCATAGGGTCTTTCTCTGTGTTCTTTCAGATCATTTTCTCTTTCTCTTTTCCTATTTTCAGGTAAAAGTCTATTTTTTTATGCTGTCCTTTTGCTGTGTGATCTTGTGTGATGGTTTTTGATTAAGTGGGATTGATCATAATTTGTGAATCATAAAGTTTGAGTCTCGATGGGTTCTTTGGGTTGAAATCCCAACTCTTTTGTTGTTATGGTGTCTTTCTGGGGACCCCAGATAGGGGGGAGTGTTGGGATTTTGAAAAAGGTTGGAAATTTGTTTAGGGAAAAGCTTTGGAGTGGTGTTTTTGATTGGGATGTGAGTGAGTTAGGATCCAAGTGCAATGGTTAATGTTTTAGTTATTTATTTTATTGTTGCTTTGTGGTTACAACTTACAGGTTTTAGTTTGAATGGGGATTCAGACAATGGGATCTCAAGGTATTGGGCAACAGTCTCATTTACAGTCTTCATCTTTGTCTAGGCAAGGTTCATGGTATAATCTTACTCTTGATGAGGTTAATAGTCAATTAGGAGACTTAGGGAAGCCATTGGGTAGCATGAACCTTGACGAGCTTCTTCAAAATGTGTGGACTGCCGAAGCAAGTAAGTCTTCGGTGATAGGTGCGGATAGTGAGAACATTTCGTCCTCTTCCTCGCTTCAGCGGCAGGCCAGCCTGACGCTGGCTCGTGCGTTGAGTGGGAAGACTGTGGATGACGTGTGGAGGGAAATTCAGCAAGGGCAGAAGAAAAGGTATGGAGGGGAAGTGAAAACTCAGGAGGGAGAAATGACTTTTGGTGAGACAACCTTGGAAGATTTCTTGGTGCAAGCAGGGCTTTTTGCTGAAGCTTCTATCAGTCCAGCTGTGGGGTTGGATACAATGGATTTCTCAGCAGCTCAAGGTTTCCAGCAGAAAACGGGCTTGTCTTCATCCCCTTCTATTGGCAGTTTATCGGACACGAGACCGGGCAGGAAAAGGGATGCTCCTGATGCATATGAGAAAACCCTGGAGAGGAGGTTGAGGAGGAAGATCAAGAATAGGGAATCTGCTGCTAGGTCACGAGCTCGTAAACAGGTCTAACATGTGCTACAAATTTTGCTTTGGTGAATTGAATACATTCTTTTACATGTTGAAATTGTTAGTTTTGACAATATCAACCTTTCATGGTTCAGGCTTACCATAATGAACTGGTTGGCAAGGTTTCCCGTCTAGAAGAAGAAAATGTAAAGCTAAAGAAAGAGAAGGTAACATACCCAATTCACGTTTCTTTTTTCATCCAACGTTCCTCGTATTTGTTGTATAGATGTTTGTATTTTCTTTTATTAGAAAATCTATTGAGTTTATTTGTGATTAATTGAAAAGTTTAGGATTTGTTGTGTGGATTGAATGTGCTTTGCAACTAAGAGACTATTTGGTAACCTTGTACTGGATTTTATCATCCTTCGGGAAATGGGAACTTGCAGTTCCCCAATATTTTTCAAAATTCTAATATTTAAATTTTAATTGAGTATAATGATATTCGAGATATGAATACATGATCTTCTGTTCTTTCGGTCAGTGTTGTTAAATAGTAATTATAATGCCGCCACAACGCTATAGCATGGCGTTTTTCAGCCCTTCACCCTAGGCAATCTATGAAGGGAGGCCCATTGTGGACAATGGTGTGTTTATATGGAAGAATTTTGGCCGTCTTCCATTGATAACCTTGCCGTCAGTTATTTCTGAGTATTGATGTATCTTCCATTTCAATAAATTAGAATCTGATTGTGACTAATTTCACTAGAATCTGTGCATGTGTCTTTACCCTTTACCTGTTGCAGATGATAATATTAATCTAATAGTTGAGCTTACATGTTCTATTAATGATTGTGAAACCATTATTACAAAATACTTTATGTAAATGATTGTGCAAAAAATTTTGGTTGCAATGGACCCTAAGTTCTCAGTTGATCTATGTATTTAACCTAGTCTAATTAGATAGGCATAGTTTTTGTTGAAGATTAATCTGTATTTTATTCCATCTTATGTGCTCCATCAAATCTTTTTCCATTATGTATGACTTGAATTTGAATGATAAAAATGAATTAGTTGTTAATATATGTATATGTATGTATGTATATATGAAAGAGAGAGATACATTACAAGGTAAAGGTATACCTTATAGCACTCAACCCTTAGGCTGGGTACATAACATACACCGAAAATGCATGTCATCATCATTGTTGGCAGTGGAGAAGAAGGTGCTAAGTTGGTCCATTGTTGGGAAATCCTTCAGGTCCAGCAGATTCAGACTTTTGACTTGCAGATTTAGGATTTTGGTTCACCTCTATTCTTTCCCTCTCAGCTTCAGCTTTAGTTATATTACCCTTTTGAATTTATTTTTTTTTCATTTTATGATCCACAAGATAAATTTGGGAATATAAAAGACTCATCAACTTTCTCTCTTGAACTCTCTCCCTAAAGATGAGGATGGTTAAAATAGATAAGTTACTCATTAAAGGTGACATCCCTTGATGCAAATTTTTGAAAGGAGGATGAAAGAACTTATAACCTTTTTGTGTGATAGTGTACCTATGAAAACACATTTAACAGAGTTTGCGTCTAGTTTTTATTCCCCTTTGCTGTTTATGAATGTACAAATGAGACATACCCAAATATTGTAGGTTGAAGGCTAAGTGTATGAGTTATATGTGGATAGAAAGAGTGGAGAACTTCCATTGGACTTTTTAATGACAAAACTGGAGAAGGTAAATGTTAATTAAATAATTGGAAGTAGGTATGGATTCTCACCAAAATTCTTATGGAATGTTATTTTGAAAAAGGAGTGCTCTAGTTTGTTCTAGTAAGTGTCCATTTTTTCGTTTAGCAATTCCATTTTGTTGGGGTGTGTAAACACATGAGGATTCATGGATTATCCCTTCTTTTTGAAAAAGAAGAATTTGAGGTATGATTGAAATCAACCCTAAGTTGCTTGATAGTAACCCAAAGTAATTTTTTATCACTGGCACAAACTGGATAACCTTAGAGATAACCTTAGATTTGTTTTTAAGGAGAAAATGCCATGTTACCCTTGTACAGTCATCAATAAAGGTGATAACCATTTAGCCCCCTGAAATATTATGAACTTTAGAGCAACACCACACATCTGTATGAACAAGATGAAAAGGAGAAGTACTGATTATATTGTATTACAAGTGAAGGATACTCCTACTAAAGAATTTCCCTAGAAGCCATAAACTTTTGCCAGACACATTCACTAACAGGGGGACATTAAAGGTTTTTCTGAACATGCAAGACATTTGCAGGGGTGTTGTATTGGGAAGGCATGAAGAGAATATCAGGGATTACGTGGTGGAATGTGAAATTTGCCAGGAAAAGCATGAATCACTAACTCCAGAAGGGCTTTTACAACTCTTACCTCTCCCAACCCAAGGTGGACAGATAATGGTTGTTGTGAATAGGCTGACCAGATTCTTACATCTCATAGTATTGAGCCATCCTATACAGTTAGCGAAGTGGATGCTGTTTTCTCAAAGAAATAGTTCGACTGCATGGTTTCCTTGCCTCTTTAGTTGTAGACAGGGATCAAGTTTTCTTAAGCAGATTCTGGAAGGAGTTGTTTAAGGAGCAGGAAGACAGCTGAAATATAGCTCAGCTTTTCATCCTCAAACTGATGTGTTAACTAAAGTAGTTTACCATTGTCTGGAGAACTATATGAAATGTTTGACAGGAACTAAGCCAAAGCAATATCCATAATGGTTTTTGGGCAGATTTTTTGGTAATACAAATTACGGGGCCTCTTCCGAGATGACTCCCTCCAAGGCCTTATGATCATGAATGGGGAACAAATGTTGGAGGTTCAGCCAGAGTTGGTGTTGAACCTTAGGGAAGGTTCACGAGTAGAATTGGAAGTGTGCTGATAAAGTGCAAGTAGCTCTCAGAGTGTGAGAACAGTTGGGAATCACATCCAGAATCCCAGAAGCATTTCCAGAATTTCACCTTAAGGGCAAGGACTTTTAGGGAGGTGGGGGGGCGGGATTGATAAGGGTCCCTGGCCCAAAATATATAAGGTGTATGGAAAAGAGAAAAATAAAAAAGATGCAGGGAATCATAACCCTGATATAGATAGTTTGAACAACATTATGAATTGGGCATCAGAAGCGAGAGGGGACCATTTTTTGTGGAGTATTCAAGGAACCGAGCTGGGGGAGGGTGCAGGGCTCTCAAAATCCCTGTAAAGGTAGTTTTCCTTTATTATTTTCCCAATCTTATGCTACTGCCAAATTGGTCAGTAGGATTAGGAATCAATTCTCAATATATATATACCTTGTTTCCATTTTTTATTCTTCAGTTTTGGTCGGGTGCCTATCAGAATAACAGTAATGAAATTTAATTGACATTTCAGCATTATGTTAGTTATGGACACCGTAATATTCATGTGTTCATTATTGCTGCTTAATATTCCCATTTTTTCTTTGGAGAAAGTTACTCAAATTTTAATATTTCAGGCCATTTTTCTCTCTCACACTAGCAATCTTTGCACTATGGATGATGGTTTTGTACAGATTCATGCCACCCCTACCTTTGGTTGTAACTCCTTTGCGTTTCCATTAACTTCTGGTTGTCAAAATATCCCTTTGTTTTTTCAAAGAAATTTAGTTTTCTTTTACAATTTCATCTTACTGATTTATAGCTGTTTGTTATTATTGATTTTGTGCCAAGAACATTGTATACTATTCCAAGCCTGATGATTATTGATGCATTATTTTATTATTTCAATTAGAAATCTACCATTCTCCGTCAATTATTACTCGATAATTTCAATATTTTTGCTACAATATGAATCTGATTTCATATTTTGGACTTCCCCTTTAATAGGAATTTGAAGAAAGGTTTACTCCCGATCCATTGCCGGAACCAAAATATCAACTTCAAAGACATAACTCTGCCCCTT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