Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22067 LG5 44064705 44066659 "PREDICTED: protein kinase 2A, chloroplastic-like "
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 44064800 intron_variant
A/G 44064806 intron_variant
C/G 44064986 intron_variant
T/A 44065118 splice_region_variant&intron_variant
C/T 44065221 missense_variant p.Leu53Phe
A/T 44065243 missense_variant p.Gln60Leu
C/T 44065634 synonymous_variant p.Phe156Phe
G/T 44065640 missense_variant p.Gln158His
T/A 44065933 splice_donor_variant&intron_variant
C/G 44066018 intron_variant
T/C 44066468 missense_variant p.Leu318Pro
A/G 44066474 missense_variant p.Glu320Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22067.1
MGNTCAKGKPIAHVSSSNFSGNKRPASKPRQDSNSSAQNHAPKTSESNVPVSISSSLKSFSLNDLKEATKNFRKENLIGEGGFGRVFKGWIDENSYGPTRPGTGIVVAIKNLKPESFQGHSEWLAEVSYLGQHQHDNLVKLIGYCLEGKNRLLVYEFMQKGSLENHLFRKGVQPMAWVTRVNIAIGVARGLAFLHSLDQNVIFRDLKASNILLDSDFNAKLSDFGLARDGPTGDNTHVSTRVIGTQGYAAPEYVATGHLAPRSDVYSFGVVLLELLTGRRAVEDDRPGFSDETLVDWAKPFLSDNRRVLRIMDTRLGGQYSKKGAMAAAALALQCLNTDPKFRPPMVEVLAALEVLNSSNSFSRTPPRPESHATKNSAGHSQK*


CDS Sequence:
>Vu_22067.1
ATGGGAAACACTTGTGCGAAAGGAAAACCGATTGCTCATGTATCTTCCTCCAATTTTTCTGGAAACAAGAGGCCTGCAAGTAAGCCAAGGCAGGATTCAAATTCTTCTGCACAAAATCATGCTCCAAAAACTTCAGAATCAAATGTTCCCGTATCCATCTCTAGTAGCTTAAAGTCCTTCAGCTTGAATGATCTAAAGGAGGCCACTAAAAATTTCAGGAAAGAAAATTTGATCGGAGAGGGAGGATTTGGGCGTGTCTTCAAAGGATGGATTGATGAGAATTCATATGGTCCCACAAGACCAGGCACTGGAATTGTGGTGGCCATTAAAAATCTTAAACCAGAAAGTTTCCAAGGCCACAGCGAATGGCTTGCAGAAGTCAGTTATCTTGGGCAGCATCAGCATGACAATTTGGTGAAACTTATTGGTTATTGTTTGGAGGGTAAAAACAGGCTTCTGGTTTATGAGTTCATGCAGAAAGGAAGTTTGGAGAATCATTTATTCCGAAAAGGTGTTCAACCTATGGCTTGGGTTACAAGGGTCAACATTGCAATTGGTGTAGCAAGAGGACTAGCATTCTTACATTCCCTGGATCAAAATGTCATCTTTCGTGATTTAAAGGCTTCCAATATCCTACTTGATTCAGACTTCAATGCAAAGCTTTCAGATTTTGGCTTGGCAAGGGATGGTCCAACTGGAGATAATACTCATGTTTCAACTCGAGTAATAGGAACTCAAGGCTATGCTGCACCAGAGTATGTTGCTACAGGTCACCTGGCACCAAGAAGTGATGTATACAGCTTTGGTGTAGTGTTGTTAGAGTTGCTTACTGGTAGGCGTGCTGTGGAAGATGACAGACCTGGATTTTCAGATGAAACCTTGGTGGATTGGGCAAAGCCATTTTTGAGTGACAACAGAAGAGTTTTGAGAATAATGGACACAAGGTTGGGGGGTCAATACTCTAAGAAAGGGGCAATGGCTGCAGCTGCACTTGCACTGCAATGCCTCAACACTGACCCCAAATTTAGACCCCCTATGGTGGAAGTTCTAGCAGCATTGGAAGTGCTTAATTCCTCAAATTCATTCTCAAGAACACCACCAAGACCTGAGAGCCATGCAACCAAAAATTCTGCTGGTCATTCTCAAAAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_22067::LG5:44062705-44064705(+)
GATAACTTAAATTATTCTAAGATATGATAATTGAAAATTTTCAAGCTCACAATTATATTTATAAATTGGTTTAAATAATCCAATTCAATAAAATTAATGGTTGAAGATTATATTTTACAAAGGGATTTTAACCCATTTTTTTATAATCATGTTAATGAGAAATATTTATTGGTGTTTTACGTACAAGTCCAAAAATTAAATATATATTGTTTAATATTATTGATTTTGATGAAAAATTTAATATAAATTTGTATCTATTATGATTAATGCAATATTTCGTTCGAATATAGTATCTTTCTAATCATCAATTTATTGGTACTCATCTTTTCGTAACGAAATGACTGCTCTTTTTGCTTTTCTTATAAGAAATAATAGATAATACATTTATATTATAATTTATTTCTTATAAAAAGGTTATTGGTATTATAATAAAAGTTGAATAATTTAAATCAATCTTACTATATCGGATTTCTTTAAAAATAAGAGTTCTTTCTAAATGAAATACGATATTATTATATTTTCTATATGCCGCCGCCTCTTCTTACTAGCCGCCATAGTATTATTAATGGTTGTTGATTTGTTCCTTTACACTTTTTACATGTATGGCGGCCAGATTTAGTGTTGATTTACTTTTAAAATCATATTTGATTAATTACATTTAAATATGATTATAGTGATTTATTTCTAAATTTGTAGTTTGAAAAAAGTGTTTTATTCTAATCTGTAATTTTGTTTTACGTAAATAGACTTAAATAAATGTTTTAAAAGTTTTGTGTGACAACAATAACAAAATCAAGTAGTTAGTGTTTAATGACTTATAATTTATATCGATACAATTCAAGTCTTTAGGATACATAATGTAATTATTTTATGTAAGTAAGATAATTATTTTAAGATTTATCTACTTGCGTTAGATAGGATTTTTTTTTTTTCAAAATTGATTAAGATTTATAGAGTATAAGATTTTCAAAATTATATCATTAGCATGATAATTTCGTTTACACCTATTTCTGTTTTTAATGCCTTCGTTTAGTCTTATTATTTTCTGTAAGAATAGATTATAAGTGAACTTTAGAGGACAACTAGTTAAAATGTGAAACTTTCATGGTACCTAAAAATAAACTTTTTCTATATATAAAAAAAAGTAAGTTTAACACTAACTTTTATTTTAAAGAATCAGTTTTAAACTAATCACATAAAAATGTCTAGGAACTAATTTATTATTAAATTATATAACAATATAAATATCATACTTTTTATATTAAACAAAATTTTTGTTCAGTCAAAAACTAAATTATTATTAATTTACACATTTAGAAAATAAAATTATTATTTATCCAAATGTTTAACGATATTTAAGGACGATTATTTTAGGAACTTGAAAAATATTAATTTTAAAATTTTAAAATAGAATTCAAGTTCATTTTAAATTTGAAGAACTAATAATGTAATTAAATTTTAATTAAAATATAATTAATTTTCAGCTTTCGCATCTCTGATTGAATTTTTGAATAAAATATTATATCTCGTAGTTATATCAATTTCAACTACAATTCTTGCATTAAAATATTTCAAATCATATATGAAAATGAAATTTATGTTATTTGTAAACCATAGTTAATCCTTGTCTGAGTTAAAAGGCAACTTTAATCTAGTTTCAAATTTTGACGTCACAACTTTTGAGACAAAGTACCATGTCATATAATGTGGTCAAAATCTGACCTGGAATGTTCAATAAGTGCTCGCTGGCAATTGTGCTATGAAGGTTCATGAAAGCAAATTATTGCATTTTTAATTATTTTCTGGTTGAACCAAAAGTTGACGACTCGCCCCTTGAGCTAATTAACCATGGCATTGCTGTGGACATTTTCTTCTTGGTTAGACTAGATAATCACTTTCAGTTTCTGAGACTTTTCCTCATACTCTTTTTCTTCATCTTCTTCTTCTGCTTTTCCTTCATGAGTTTTGCTGGTTTGGTCTAACAGCAACGCGTTTCATCA


Gene Sequence:
>Vu_22067(+)
ATGGGAAACACTTGTGCGAAAGGAAAACCGATTGCTCATGTATCTTCCTCCAATTTTTCTGGTTGGTTTCTCTTCATTGTGATCATCTTCATGGGATGATGACTTTACTTTCTTCTTTGGTGCTTTGAAGCCACTCTGTGTCTTTTTCCCCTTTGTTTGTGCACTAATCACAGAAAGAGTTTCAAGTTTGACTTTTTGTTTGTCATGCTCAATGTTTGGACTTTTCCTATTTAGTTTCTGATGCTTAAAACTTTATGTTCACTGCAAATTGTAAGCACTGACGTTTGCCCCAGAACTTCTAATCCAAGATGCCTGCCCATAACTTGTTTGCTGATTTTACAGTCACAAATTTCCTTGCACAATTATGTTGGAAAGTTAATATCATTGCTGCTCTTAACTTGCTTCTTATCTGTTTGTAGGAAACAAGAGGCCTGCAAGTAAGCCAAGGCAGGATTCAAATTCTTCTGCACAAAATCATGCTCCAAAAACTTCAGAATCAAATGTTCCCGTATCCATCTCTAGTAGCTTAAAGTCCTTCAGCTTGAATGATCTAAAGGAGGCCACTAAAAATTTCAGGAAAGAAAATTTGATCGGAGAGGGAGGATTTGGGCGTGTCTTCAAAGGATGGATTGATGAGAATTCATATGGTCCCACAAGACCAGGCACTGGAATTGTGGTGGCCATTAAAAATCTTAAACCAGAAAGTTTCCAAGGCCACAGCGAATGGCTTGTATGTGTAACAAGAACCATAAACCAAAGTTTTCTTTTTAGCCTGACTAATCAATGGTCTTGCTGTGCTGATGACTAGTTTTACTTCCTTTGTTCTGGCAGGCAGAAGTCAGTTATCTTGGGCAGCATCAGCATGACAATTTGGTGAAACTTATTGGTTATTGTTTGGAGGGTAAAAACAGGCTTCTGGTTTATGAGTTCATGCAGAAAGGAAGTTTGGAGAATCATTTATTCCGAAGTAAGTTCATTTCACTCTAAGCATAAGCATATTTTTGTAAGCTTTTACAATACCAATTTGAGGTGAACCAAGATTGCTATATCAATTCATCCTACCCTAAAATTTTGTTTTCTGTTTCTGCAGAAGGTGTTCAACCTATGGCTTGGGTTACAAGGGTCAACATTGCAATTGGTGTAGCAAGAGGACTAGCATTCTTACATTCCCTGGATCAAAATGTCATCTTTCGTGATTTAAAGGCTTCCAATATCCTACTTGATTCAGTATGTGACATTAAAAGTTTGATTTGTGGATCTGTACTGACTACATATTCTGGTTTACACATAAGTTTCCATTCTTAAAGAGTAGCCTAATGCATATGTAGGACTTCAATGCAAAGCTTTCAGATTTTGGCTTGGCAAGGGATGGTCCAACTGGAGATAATACTCATGTTTCAACTCGAGTAATAGGAACTCAAGGCTATGCTGCACCAGAGTATGTTGCTACAGGTATTAAAGTTTGAAATCTAAATTTAGCTCAAACTAGTTCCTTTTTATTCTAAATACTTATTAAAGGTCATTTCAATAGTCATCCTTAGCTGATTTCTAAGTTGGTCATCAACTGAACAGGTCACCTGGCACCAAGAAGTGATGTATACAGCTTTGGTGTAGTGTTGTTAGAGTTGCTTACTGGTAGGCGTGCTGTGGAAGATGACAGACCTGGATTTTCAGATGAAACCTTGGTGGATTGGGCAAAGCCATTTTTGAGTGACAACAGAAGAGTTTTGAGAATAATGGACACAAGGTTGGGGGGTCAATACTCTAAGAAAGGGGCAATGGCTGCAGCTGCACTTGCACTGCAATGCCTCAACACTGACCCCAAATTTAGACCCCCTATGGTGGAAGTTCTAGCAGCATTGGAAGTGCTTAATTCCTCAAATTCATTCTCAAGAACACCACCAAGACCTGAGAGCCATGCAACCAAAAATTCTGCTGGTCATTCTCAAAAGTAA