Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22049 LG5 42950509 42955882 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 42952120 missense_variant p.Arg374Gly
C/G 42952125 missense_variant p.Gly372Ala
C/G 42952780 upstream_gene_variant
A/T 42952924 upstream_gene_variant
T/C 42952939 upstream_gene_variant
T/C 42952955 upstream_gene_variant
C/T 42952979 upstream_gene_variant
C/A 42953379 upstream_gene_variant
G/T 42953401 upstream_gene_variant
G/A,* 42955734 5_prime_UTR_variant
G/T 42955766 5_prime_UTR_variant
C/T 42955812 5_prime_UTR_variant
T/A 42955828 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22049.1
MEETTEMQSEENKLSMEKNKKRRLKTPAQLTALESFYNDHKYPTEEMKSELAEELELTEKQISGWFCHRRLKDKKLLNDEVGANGRQDRSSGVIQDRGSGLVQDSCGSTKHGDYRYLDPKEVESHGLYNHEFSAADMTYAHRNHHYAENDSATDNTSSESCSSLQDRLLPQGQDQYDMEPSSHLMPNGSLPPLNPKGANNMGYKPSGYLKVKGEIEHVAITAVKKQLGNHFQEDGPLLSVEFDTIPPGAFEGQIADLANEGYYAANPALPNSPEVSAGKKQSSSSRYDSYFTKLRSQDSHMVGGDFGSLHGPDFQDKKPHKQINQRASFHSFTNHLPHKNSSLDLYVDSTGEASAYNGGKNHRMGTKHGFEGMRSDSASYPSDHYEENAVAVKQIDSLLDLYNNINLKNVQKNEYVKSKPSNSIHKSQIYLNAEEKGLTKRMAKEEKFNDERKLRKQYHVPDGIRVLSNEKMVAKRAKVDPFESYDVKQTPLSDLEPRKVQRSAAEMPSRFSEDETAETSSSVD*


CDS Sequence:
>Vu_22049.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22049::LG5:42955882-42957882(-)
ATCTTTCATAACTAGGATTACCTTCATACATACATCACAATCTTAACTTTTGTTCAAAGTTATTCAAGGTTTATTTTATAATAGGTTTAATACGTATTTTGGTCCCTCTTTTCGTAGGGTCTGTTCAAAGTGGTCCTCCTTTTTTTCAAAAGTTCACTAACATCCTACTTTTCGCAAAAATGATGCACGTTAGTCCTTTTTGGTTACGGCGTTAAAAAGACTAACGACACAGCTGCCCAACTGGCACAAAACTGATGAGATGTACATTTTTCGTTGAGGTGGCAGTGTGACTAATGAGATGTACATTTTTCATCACATTCCTTCCTAACCTATTCCTAATTTCCTTCCTTCCGCAAGGTTAACATTATCATATGAAGAAGACAAACTGTTAGAAGCATCACCAGCTGCACGAATTTCAGGATCACCAGGAAACAACTGATGACTCCTACAATCTGATGGCAGTGAATTAAGTTGCGTAACAGTGAAAAAATCCCCATCCCACTTCCAATCATTCAAATCCCACTCCAAACTTCTCTTCCCGACACTCTTCATCTCTGGCACCACAGGTCCATACAAATACTGATTTTTCCCTTCTAATTGAGCCTCCACGAATCCAGACACCCCAAGACAAAAAAATCAACAAATCCCAAACACCCAGATTCTAAGTCCACCAGAACACAACCACCCAATTGAATAAATTACAGCATAACCACAAAGACTTCAAACCCTACCTCCAAAAACACAAATTAACCACCCAGAAGACCAATAAAAGGAACAATAAACCCCAAAAGCAAGCCCAACTCACATGGATCCGAACAACAGCTACATACCCAACACAAGCAGAGATGCCAGAATCAACTCTTGAACTATGGGGAAGTAACCCATAATTGAAAAATCCCCCATAATTGAAAAATCGAAACTTGCAGCATGATTTCACGTGGGCCAAAAGCTCAATGTCAAAGGATTTGAAGGGTGGGAGAAATTGGCATCAAAAGTGAAGAGAAATTGAAAGGGAGAGAAAAGAAGCAAAATAGGGAGTGGAGAGAGATGAAGAGAAATAAGAATATAGGAGGTGGCCACAGAAAGCATGCGTCAAACAGAGGGAAATTAGGAATAGGTTAGGAAGGAATGTGATGAAAAATGTACATCTCATTAGTCACAGTGCCACCTCAACGAAAAATGTACATCTCATCAGTTTTGTGCCAGTTGGGCAGCTGTGCCGTTAGTCTTTTTAACGCCGTAACCAAAAAGGACTAACGTGCATCGTTTTTGCGAAAAGTAGGATGTTAGTGAACTTTTGAAAAAAAGGAGGACCACTTTGAACATACCCTACGAAAAGAGGGACCAAAATACGTATTAAACCTTTATAATAATTAGTAGGAAATTTTTCATCAAATCTTTACTAAGATTTTTTTACAATGTTAGCGAGGAATATTTTGTAGTGAACTAAAACATTTATTTAACAAATAAAATAATGAAAATGAAACAATTTAAATTCAGTATATTTTAAAATTGTTAAAATCATGAAATTTCATAAGATTTTAGTAAAGAAAATATAAATTACTAGCTTTTATTTCTAGAAAACTTATATAGATATGTCTTCAACAATATTTTTAACTAATAAACCATATCATTTTTAACTTATATAGATATGTCTTCACAATATTTTTAACTAATAAACCATATCATTTTTAACTTATTATCATTAATTTTCTAATCTGAAACACAGAAGAAAAATCTTTGACTTATGGATCAAGATTCAAGAACGACTGTAAAAGAAAAAGAGCATGCAATAATATTTTTTTTTATAAATGAAAAGAAAAATGAGAACGCATTGTCCTCCAGATCATGTCGACACGTCCATTTATTAATTTTTATTTTATTATTTTGAGCAAAGCTGCATAATTTTCTTTCAGCGTTCATTCTTTCTGGGAAAAAACAAAGCACAGTAAAATTCAATTAACAATTAGAAAAAGGAAAAAACGTAGCTTGATTTCTCT


Gene Sequence:
>Vu_22049(-)
GTTCAATCAGAAAGTTAAAAAAAGAAAATGTAAAAGCTGATTGGAGGAAGAAACAAATGAAATAAGCAGAGAGAGAAAGGGAAATTGTTCTGCTGTCTCTATTGGCTTTCAACTTTCCCCAGAAGTTACTTTCTCTCTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCCCTGAGATGAATTAAGGGTCAGGTTGAATGAATCACAAACACCCACTTAATAATTTTGCATTTTCTTTTGGTTTCTGTCAAATGGGTCTCATTTTCCTGAGAACCCAGTGAAAAAGTTTGCACCTTTGACTCCAAAACTTGTCAGAGAAGAGGGAGATTCATCACAATTCCTCACAACCATGGAAGGTATTGTGTTATCAGAGATTTGGGATTTTTTATGTGATATTTTTCTTTACAAGATTGTGTCTAATTCATGTAGTGAATGCCTTTGTTGGAATCTAGGTCCTGGATATGAATTGTTTGCATTATAGGGTAGTTGTTGTTTTGATGGTTAATATGAAATCAAGGTTTTACATTTGGGGTCATTTTGCTCTGGGATAGTTAATCAAAGTGAAGGGAAATTAGGATTTGGTTGAATTTCTTTCATAATTTGGAATTAGATATTTGATTTGTGCATAAGGAACGGCTTTTGTTTGCTTTGTTAATATCATGAAATGATGCCTATCGTTGGATCTACTTCTTGTATGCACACCTTGTTCCATTGCAAAATTCTGGTAATTTTGCAACTTCTTTTCTACTTTTTAAAGTGTTTTTTCTTTAAATCTTAAGTTTTATTTTATAATAATATGCAAGTATGAATTATATACATTAACTTATACAGGACGTAAGTTCTTAATTTTTAATAATCATTTTGTTGACAAAATTGTGAGGATAGAAAGAAATGGCTGATTATGATCTGTTTTTTTATATTTATATGCATAGAAAACAATTTTTCTTGCCAGTTAGAAATAAAATTCATCAACTACATGTTCCCAGTGATCTCGTGTGACAACCTCTTGAAATTCATAAACCTCTTCTTTTGAAATCATTTTCTTATACATATTTGACCAAAACATGAATCTTTCTTCTCAAATATTTAAGGAAAACAGATTTTTCACTCTTGGGAAAATTTCCCATCATAAACTTGACTTCTTATGTGTTCATGCACACGTCCTTCTTCATATAGTCATTGCTGTTAAGCATGTAGCTGTATGATTGATTTCATAACAGTTTTTTCAATTGAACTGGATGGTATGACATTAGATTCTTTTACTTTTTTATTGGTATATTTTTTATTTCAAACTGCTGTTATTTTTTCCATCTTAACTCATGTACTCTGCTTTTCTGTTGGTATTCAGAAACAACCGAGATGCAATCAGAAGAAAATAAATTGTCAATGGAGAAAAATAAGAAAAGAAGGCTCAAAACACCTGCGCAGCTTACAGCATTGGAAAGTTTTTATAATGGTAGGTTAAGATCTTTCTGTCATATGGGTGTTAATGCATCTTGCTGAGTGATGATTCTCAAGGAATTCCCCTTTCCACTTTTTTTCTTTTTTTTCCAGATCACAAATATCCCACGGAGGAAATGAAATCAGAACTTGCTGAAGAGTTAGAATTGACAGAAAAGCAAATATCTGGATGGTTTTGCCACAGAAGATTGAAAGATAAAAAGTTGTTGAATGATGAAGTAGGTGCCAATGGACGACAAGATCGTTCAAGTGGTGTTATCCAGGACAGAGGCAGTGGTCTAGTGCAGGATTCATGCGGAAGCACTAAACATGGTGATTATAGGTATCTTGATCCCAAAGAGGTTGAGAGTCATGGCCTCTATAACCATGAATTTTCGGCTGCAGATATGACCTATGCACACAGAAACCATCATTATGCAGAAAATGATAGTGCAACTGATAACACGTCATCTGAGAGTTGCTCATCTTTGCAAGATCGATTGCTTCCTCAAGGACAGGATCAATATGACATGGAGCCTTCTAGTCATTTGATGCCTAATGGGTCTCTTCCGCCGCTAAATCCTAAGGGTGCAAATAACATGGGGTATAAACCATCAGGGTATTTAAAAGTGAAGGGAGAGATAGAACATGTTGCTATTACTGCTGTCAAAAAGCAATTAGGAAATCATTTTCAGGAAGATGGACCATTACTTAGTGTTGAATTTGATACAATTCCTCCAGGAGCATTTGAAGGACAAATTGCAGATCTAGCTAATGGTAGGTTGTACTATATGTGTTCAGTTATCACATTCTTTTCAACTCTCACTAGGCTTGCAACGCTACAATGGTTTTTTGTTGATTTAGGTTAATGGAATGTTGTTGCTCACAAAAGGTAGTGGGAAAGATATTTGGAACACATCACATTGTTTTCTTTCTTAGGTGGTAGCTTCAAGTATGTTCTTTCTTTGAATAGAAAATAAAAGCCCGTGGTTATTTGTCATGCATTATGATTTGGATGTTTAGATGTTTTGGAGAACTTTCAAGGGATGACTTCTTAATATGAATATTAACAGGTTCAATGATAATTAATCTGATCAGATTGGCTCTGTGGTCTGCAATAATTTTCAACATTTCTCTGAAGATTGCTAGTTGACATTGGATCTTGTAAATCAGGAGCTTTATGTCACAATTCACTAGCCAATGTCTTTTACAATTTGAGGTCCTGAATGAATGTTAGCACCTACTTATTTGAAGTGTAGAATGTAAGTGGTGTATAAAATTATATTGTTAAATGGGATGTAAGGGCTGAGGACAAAGAATAAAAACTGAGAGCTTAGCTTTTAGAAGTTGTAGGCATAACTAAGAGCTCAAACTGCTTTATTAATTGATGCATTTGTATTTTCTTTAGAAGGATCTGCCTTGAAAATATTATTTTGTTTTGGTTAATCATACTCATATTTTGAAGGAGGTAAGGTTCTAGTTCTTCTTAAAGTTGAAAACTTGTTACCACCAATGAATGCCTTCTTTTGGGATATGCATATGACTTTTGTGTACTCATCTTTGTGCAATATGCCTTTTTTTTTTCTGGTTCTGGTGAGGAGAGTTCATGATCTTTGAACGTTTACTTTCATAGATTTTCATCTTAGCTTGTGTGTCAAGGTTTATTGTCTTGATTATGTTGACTCTCATAACTCTAAATCTAATTTCTTCTTGCATATGGTCATTTGAAGAATAGATTGAGAATCTTACCCTTCTAATCTGATGAATGCTATGGCAGAAGGGTACTATGCTGCAAATCCTGCTCTTCCAAATTCACCAGAAGTCTCTGCTGGGAAAAAGCAATCCAGTAGCTCAGTAAGTTGAACTTTTGAATGCATTCATCTTCTGCTCTGATTATCCTAGTAGAGCATGATATGTTCAAATTATCAGATAAATGCTTCATAAATTGGGCATTTACTTGACTTTTAAGGTTAAATCTTACAAGCCTAGGATGAGTGTTGTTTTCTTTAAAATTAGTGCTTAATTTTTACTGCCTGGTCTCTCACTTTCTTTTTCTTGTGTGGGCAGAGATATGATTCATATTTTACCAAATTAAGGTCCCAAGATTCACATATGGTTGGAGGTGACTTTGGCTCTTTGCATGGTCCTGATTTCCAGGATAAGAAACCCCACAAGCAGATAAATCAAAGAGCAAGTTTTCACAGTTTTACCAATCATTTGCCTCACAAGAACTCTTCCCTGGATTTGTATGTAGACTCTACTGGGGAAGCATCTGCTTATAATGGTGGTAAAAACCATAGGATGGGTACTAAGCATGGTTTTGAGGGGATGAGGTCAGACTCGGCTTCCTACCCCAGTGACCACTATGAAGAAAATGCCGTTGCAGTTAAGCAGATAGATTCGCTGTTAGATCTCTACAATAACATCAATCTGAAGAATGTACAAAAGAATGAATATGTAAAATCTAAGCCTTCAAATTCAATACATAAGTCTCAAATTTACTTGAATGCTGAAGAAAAAGGGCTTACAAAAAGGATGGCCAAGGTCTGTGAATACACTTGCATTTCTTTATTTTTTCATGTAATCATCAAATTGTTTTGGTTTCAAATGACTTAACAGGCTTGTTTGGCTTAATTTGTTGCAGGAAGAGAAGTTTAATGACGAGAGAAAGTTAAGAAAACAATATCATGTTCCAGATGGAATTAGGGTGCTTTCAAATGAAAAAATGGTGAGTTTTAGTTGCATTGCATAAACTTCCTGCATTTGTGGCTTTTGGTAACATTATTTTCTTGTCAACTTATTCCTCTCTCATTCTTTGATAATGCACAGGATATTTTTCTTTACTGTGTTCTTATTCCATTTTTACATTAACATCATAGGTTGCAAAGCGAGCTAAAGTTGACCCATTTGAATCATATGATGTTAAACAAACACCTCTTTCTGACCTGGAACCAAGAAAAGTTCAAAGGTGGCTGTTTATAACCTTTTTTATTTTCTTTTTCTTGATTACTGGCTTCTTCTGGTCCTCCTGAAATTCTGTGATCTTATGTTCCTATCCACGTCTGTTTATTGTAGAACCGATTTGACTGTAATTCTGTAAGTAGATTATGTATAAGTGTTTATATTCACAGCTTAAATATTAGAGTTTTTGGGTGGAGTTGAAAAGAATAACTTCTGCACATGATGTCTAGTTCAACATGTTTCTGAGAAACAATCGTTTGTTGTTTAAATTATCGTTAAGGAACAAACTGCTTTTAAAGTATAAGTAAGATATAATTTGAATGCAACACCCCAAGATCAATTCTTATCACCCCAGATTTGAAAATCACTAAAAGAGAATTTAAGAAGTGGAAAGAAATGGATATTGAAGAACTATTTGAAAACTAACCATACACTTAGCCTCATTCCTTCGCTTTTCACTTAACTGGATATATAGTTCATGAGTTTAACACATTAATCTTAAAGCTTATAATAACTTAATCCTTGGAAGTTTTTATCCTACTTGTTATTGACATATGGAATGTAGAACTCTTTCTAATACTATCATTCATGATCATGTAGGTCTGCAG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