Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21885 LG5 37760557 37764239 mitogen-activated protein kinase 20 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 37760676 missense_variant p.Asn565Thr
C/A 37760706 missense_variant p.Arg555Met
A/T 37760719 missense_variant p.Tyr551Asn
T/C 37760797 missense_variant p.Thr525Ala
T/C 37760798 synonymous_variant p.Thr524Thr
G/A 37761265 upstream_gene_variant
T/A 37761266 upstream_gene_variant
T/A 37761607 upstream_gene_variant
T/C 37761620 upstream_gene_variant
C/T 37761735 upstream_gene_variant
A/G 37762090 missense_variant p.Tyr346His
A/G 37762289 upstream_gene_variant
T/A 37762580 upstream_gene_variant
G/T 37763306 upstream_gene_variant
A/G 37763365 splice_region_variant&intron_variant
C/G 37763370 missense_variant&splice_region_variant p.Asp175His
A/T 37763431 missense_variant p.Asn154Lys
T/C 37763434 stop_retained_variant p.Ter153Ter
G/C 37763449 missense_variant p.Cys148Trp
A/T 37763769 upstream_gene_variant
C/T 37763859 synonymous_variant p.Leu127Leu
T/C 37764091 missense_variant p.His50Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21885.1
MDFFSEYGDANQFRIQEVIGKGSYGVVCSAIDTRTGEKVAIKKIHDIFEHISDAARILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSWKDFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTKEHYQFFLYQLLRALKYIHSANVYHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARVAFSDTPTTIFWTDYVATRWYRAPELCGSFYSKYTPAIDIWSIGCIFAEVLMGKPLFPGKNVVHQLDLMTDLLGTPSLDTISRVRNEKARRYLTSMRKKQPVPFSQKFPNANPLALRLLERLLAFDPKDRPTAEEALADPYFKGLAKVEKEPSCHPITKMEFEFERRRVTKEDIRELIFREILEYHPQLLKDYMNGNERTNFLYPSAVDQFRKQFAHLEENGKNGHVMPLERKHVSLPRSTIVHSNSNTIHPKDQSNIVACKNRPTAEECNRNSRDTKILVPRSMQGPPRIPLAKPGKVVGPVVPYEYDNIVKDSYDPRSFIRGSVLPTQPVPPGYYYHQRSSTANQERAATEADKSVPLQAKQHDQEQFGINAKRAPDIAINIDTNPFFMTRAGVNKLEQGDQIVIETNLLQPKTYGGSSAAAGATAHRKVGPVQYGMTRMF*


CDS Sequence:
>Vu_21885.1
ATGGACTTTTTCTCTGAATATGGTGATGCCAACCAGTTCAGGATTCAAGAAGTCATTGGGAAGGGTAGTTATGGTGTTGTCTGTTCAGCCATTGACACTCGCACCGGAGAAAAAGTGGCAATTAAGAAGATTCATGACATCTTCGAGCATATATCTGATGCTGCTCGAATTCTCCGTGAGATAAAGCTGCTCAGACTTCTTCGACATCCTGATATTGTAGAAATAAAACACATTATGCTGCCTCCATCATGGAAGGACTTCAAAGATATCTATGTTGTTTTTGAGCTCATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTCATCAAAGCCAATGATGACTTGACAAAAGAACACTATCAGTTTTTCCTTTATCAATTACTTCGAGCATTGAAGTACATTCATAGTGCAAATGTCTATCATCGAGATTTGAAACCAAAGAATATACTGGCAAATGCAAACTGTAAGCTTAAAATCTGTGATTTTGGGTTAGCTAGAGTTGCCTTCAGTGACACGCCAACAACTATATTTTGGACGGATTATGTTGCTACAAGGTGGTATAGAGCTCCAGAGCTATGTGGATCATTTTACTCAAAGTATACACCAGCAATTGATATATGGAGTATAGGTTGTATCTTTGCTGAAGTACTAATGGGAAAGCCACTTTTTCCTGGGAAAAATGTAGTCCACCAATTGGACCTGATGACAGATCTGCTTGGGACACCTTCACTTGATACTATATCACGGGTACGCAATGAGAAAGCAAGGAGATACCTAACTAGCATGAGGAAAAAGCAGCCTGTGCCGTTTTCTCAAAAGTTTCCCAATGCAAACCCTTTAGCACTGCGTCTGCTGGAAAGGTTGTTGGCTTTTGATCCAAAAGATCGGCCTACGGCAGAAGAGGCATTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGGCTGGCAAAAGTTGAGAAGGAGCCATCTTGCCATCCTATCACAAAAATGGAATTTGAATTTGAAAGACGAAGAGTAACAAAGGAAGACATTCGAGAACTGATTTTCCGTGAGATTCTAGAGTATCACCCTCAGCTATTGAAAGACTACATGAATGGAAATGAGAGAACCAATTTTCTTTATCCAAGTGCTGTCGATCAATTCAGAAAGCAGTTTGCTCATCTGGAGGAAAATGGTAAAAATGGTCATGTTATGCCACTTGAAAGAAAGCATGTTTCTCTTCCAAGGTCAACCATTGTACATTCAAATTCTAATACAATACACCCAAAAGATCAATCAAACATTGTTGCCTGCAAAAACCGACCAACTGCTGAGGAATGCAACAGGAATTCCAGAGATACAAAAATTCTAGTGCCAAGGTCAATGCAGGGACCACCAAGAATTCCACTAGCAAAACCTGGTAAAGTTGTGGGGCCAGTTGTTCCATACGAGTACGATAACATTGTCAAGGATTCTTATGATCCTAGGTCGTTTATCAGAGGTTCTGTGCTTCCTACTCAACCTGTTCCCCCAGGGTACTATTATCATCAGAGATCCAGCACTGCAAATCAAGAAAGGGCTGCAACAGAAGCTGACAAGAGTGTGCCTTTGCAAGCAAAACAACATGATCAAGAACAATTTGGAATTAATGCCAAGAGGGCACCAGATATAGCTATTAATATTGATACAAATCCCTTTTTTATGACAAGGGCAGGAGTTAACAAGTTAGAGCAAGGTGATCAAATAGTCATAGAGACAAACTTGTTGCAGCCAAAGACATATGGTGGAAGCAGTGCTGCAGCTGGGGCCACTGCTCATAGAAAGGTGGGTCCTGTTCAGTATGGTATGACAAGAATGTTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21885::LG5:37764239-37766239(-)
AAGATATACTAAAGGCATAAACTAGATTTAAGCCTCAAAGTTCTAAAAGAAATTTCAATTTTCTCTCTCTTTGTCGGTGTACGCAGATCTTATGCATTCGACGATCTTGGCACCTGCTTTCTGTTGTTGTTCTTCTGGTTTGGCTTTGTGGGGTGAAACAAATTGTGGTTTTCTGGTTGAGGGTAGCTGAAAGGTGGATTTTTGTGTGGAAATGAGAGTGCTTTTGCTGGTGGGGTGGAGTGTATGTTAGAGGGTGGTTTTGGAAAGGGAAGGTGCATGTGGGATCTCAATTGGGTTCTATGTTTGGTGAAGAAGGGTTTGGGGGAAGGGAGAATAAGCTGGTATTGTTGTGGGTTTGTGATAATGAGCAGGGGTAGGTGGGGCAAATGTGGGTGAGGAAAACGGTGTGAGAGATTTGATTTTTGAGGGAAGTAAATTTGGGACCTGATTTTGTTCAGTTTTGGGCTTGATCTTCACTCTATAGGTATGTTTTGGAGAATTTTTGGGTGTCAGGGGAAAATGCAGCAAGATCACCGGAAAAAGGTGGAGTTTTTATTGTGTGGTGTGTATTTGTGTTGATTGGCTTTGTAATTGTGTAATTGGGATTGGGGAATAAAGATTGGATTTGTGTGCTTTTGTTTAATCTGAATGTTGTCTGAGATAGACAAATTTTCAGTGTGATGAGTCTATGGTTGTGTTGGTGAATGAATGGTGTGTGCTGAGAATTTTTTAATATAGCATTTCTCCTTAGGGTCCATCAATGATTTAGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAATATTTCTTGCACATGATTTGGCTGGCACCGCTAGATCTTCTAGTTTCCAACATTTTTCGGAGGGTTTGATGTAATGTACTTGCATTTTAACGAATTAGATTGCTATTTTATTGACCCCATCATATTTTATTTTTCTCTTTCCACACTTGTTGAGTTGAGCCTTTTCAAGTTTGCGCCAATACCAAGTGGCATTCACTTTTTTATATGCTTACAAGTTTTTCTTGATCGGATAAGATTTTGTCTACTCTTTGTTCTTGTTTTGTTAGGTTTCTGGTTTATTCTATTTTCTCTATGCTTGCATTTCCTTGTTTTATGGAATGGGTTGAATTTATTTTAAATAATTAATTAGGTGTAATAGATTGTATAAAGAGTTGGGATTTGGAGTTGGTAACGCATGTGTATTTTATGTGTTGATGCTCTTCTTGCGGAATCAGTGTCTACATTCCTGTTGAATTGAAAGAAAATAGAAAATGTTGATTTGCTTCAATGCAAATATGTATTTGATTTTGTACAAGTTGAAATATGAAGTTGATTTTGAATTGCATAAATATGTCGTTTTTTTTAGTCTACATATAAACTTATTTTTATCAATAAATATTGATGTATATTATTAAAATGCCAATTTAAACATGATACACATAGTTTATTTAGACTTTTATGTGTAATTTTAATGTTAAGAACCTATAAAATTGTGTTTTATTTTAGTTTTTAGCATCGACAAATTATGATATTGTATATTTTTTAATATTTTTTGTGTATTTTTAATTATTAAAATAATTTTCCTAATACTTGTTCAATCCCCCTTAAGCCACCAATTACCAGTTCCAATACTAAAATATTGATGGAAGCAATTCATGTTTTTGTATTTAATATATTATATATGTATGTTAGTTTGCCTGTGTTACTCCAATGCGTGTGAAAATGGTCATTTTCCTGGAGATAAAATCTGACTGTTGTTGAGATTATAACTCTTTTTGATACTATGATATTTCCCTAATGTGAATTCTCCAAATCTAAAGCAATTTTTTTTCAATTGTGTCTGTTAATTTATCTGCAAGAAGGAAAACATGCTTTTCATTTTAATTTCTATCTATACTGAAGCTTTTGCTTTTACTTTGTTGCTTTAGTTTGATTTGCTAATGTTTTCAGACTTTCGAATTCTAACTTTCTGGATTTTGCAATGGGGAATAAGCTACAGAT


Gene Sequence:
>Vu_21885(-)
ATGGACTTTTTCTCTGAATATGGTGATGCCAACCAGTTCAGGATTCAAGAAGTCATTGGGAAGGGTAGTTATGGTGTTGTCTGTTCAGCCATTGACACTCGCACCGGAGAAAAAGTGGCAATTAAGAAGATTCATGACATCTTCGAGCATATATCTGATGCTGCTCGAATTCTCCGTGAGATAAAGCTGCTCAGACTTCTTCGACATCCTGATATTGTAGAAATAAAACACATTATGCTGCCTCCATCATGGAAGGACTTCAAAGATATCTATGTTGTTTTTGAGCTCATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTCATCAAAGCCAATGATGACTTGACAAAAGAACACTATCAGTTTTTCCTTTATCAATTACTTCGAGCATTGAAGTACATTCATAGTGGTAAACATTGCTATGTCTTCGTTACATGTATATGTAAATGCACATTGTGTGGCTAATGCCTATAACATGTGCCTTCTACTTTCAGAAGTTGTATCTGAAACTGAATAATTTTTCAGCATTCCCACCAATGGAGATGTCAGAATTGGGCACATTATTTTTATCAGTTGCTTTTGTTTCCTTTTTTATTATCAGTTCCCCCTTAAATCATAAAATTGTACACTTTTAGTATTTGTCAAAATGTGAGACCTTCGTTAAGGGGAGGGTCTAACATTTGTCTACTTCGTAATGAGTATGCTTGCATTGATTTCAATATTGTGTATCTGATTCTTAACTTGTACAATGCAGCAAATGTCTATCATCGAGATTTGAAACCAAAGAATATACTGGCAAATGCAAACTGTAAGCTTAAAATCTGTGATTTTGGGTTAGCTAGAGTTGCCTTCAGTGACACGCCAACAACTATATTTTGGACGGTATTTTTCTCTAAATATTTGCATCGTTTGCTTCCTTCATATATTTAATTTATTTTGGCTTTTCTTGTTTTCATTTTTGTTGTTATTTTGGAGGGAAGAGACTGATGTTTCTTGTTGTTATTTTAATGCATTTGTCTATAGGATTATGTTGCTACAAGGTGGTATAGAGCTCCAGAGCTATGTGGATCATTTTACTCAAAGGTATGGATTTTCCAGATTTCTGTGGACATTGAAAAAGTGAGAGACGAAGTATATGTACTGAGTGTCGACTTATCATACCATCAAACATTCATTCTTTCATCTCCTTTTCTATCCATTAACTAACCACATGACCTAGGATGGAAGGACAATCTGTTCTTTGTTATCATTCTGTAAGTTACATATTTTTTCTGTTATTTTTTATCTGCCATCAAACTAACTCTTCAGTATTGACTGCAATATGAAGCAAAATCTGTGATACATTGAACTAACATTTTGGTGGTTGATGATAAATTATTTACTCAATGTGAAGCTATTGTGTGTTTGATAGGTCTAAGTTTTTAGTAAATCTTGATGCAGTATACACCAGCAATTGATATATGGAGTATAGGTTGTATCTTTGCTGAAGTACTAATGGGAAAGCCACTTTTTCCTGGGAAAAATGTAGTCCACCAATTGGACCTGATGACAGATCTGCTTGGGACACCTTCACTTGATACTATATCACGGGTAAATATTTTCTTCAATTCTGTAAGAACCATTTTAGTTGTGTAGCTTAGGATGCACCAGAAGTTGCTGAAACCGATCATAACCATTTTTTGTGATGGATGCAGGTACGCAATGAGAAAGCAAGGAGATACCTAACTAGCATGAGGAAAAAGCAGCCTGTGCCGTTTTCTCAAAAGTTTCCCAATGCAAACCCTTTAGCACTGCGTCTGCTGGAAAGGTTGTTGGCTTTTGATCCAAAAGATCGGCCTACGGCAGAAGAGGTTGGTTTGTTACATTCTTCTCTGCTTCTTATGTTATGTGCATTGAAATGTGCTATTTATAGTGTGAACAATAAAAGATATAATGAATCATAGTGAATAACAATCTATACTGTGGTATCTTGACATTTGTGATAACTGTTTCTTAAATGCTTTTGTGTGTTCAGGCATTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGGCTGGCAAAAGTTGAGAAGGAGCCATCTTGCCATCCTATCACAAAAATGGAATTTGAATTTGAAAGACGAAGAGTAACAAAGGAAGACATTCGAGAACTGATTTTCCGTGAGATTCTAGAGTATCACCCTCAGCTATTGAAAGACTACATGAATGGAAATGAGAGAACCAATTTTCTTTATCCAAGGTTTTTATTTTCGTAATTGGTTTTCAACTGTTTATAACATGTTATCTTTTTTGCCCTCTTGAGAATTGTCAATTTCGAATTTTGCTTTCATCTGAGTTTACTTTTTTGCTGCAATTTTTTACAGTGCTGTCGATCAATTCAGAAAGCAGTTTGCTCATCTGGAGGAAAATGGTAAAAATGGTCATGTTATGCCACTTGAAAGAAAGCATGTTTCTCTTCCAAGGTAATGTTTCTGATTCATAAACTCAGCTGCTCATTGGATTTCTTGTGACATTTGATGCATTCCAATTGTAGTGGTTACTTTTTTATTATATTATGCATATGTTAAGATGGTAATCACAAGACTGAAAGTCCTACGATACAAATCGCTAATTTGATTCTGCTCATGATCAATGAAATATTGACATTCTAGTAATGGAGGGACTATTTATGATTTGTATGATTCATGTTGGTTTGGAAGGAGAGCATAATATGTTTGATCATATTCTCATGCTTTTGGCTTATTGACAGGTCAACCATTGTACATTCAAATTCTAATACAATACACCCAAAAGATCAATCAAACATTGTTGCCTGCAAAAACCGACCAACTGCTGAGGAATGCAACAGGAATTCCAGAGATACAAAAATTCTAGTGCCAAGGTCAATGCAGGGACCACCAAGAATTCCACTAGGTATGGGGTTGTTATCATTGTTGTCTGTTAAGTTTTCGTGCATGATCATTGATTAATAATTAAAGGCATGTTTGATTCCCTTCTTACCTTTTTGTGTTTCAGAACAATTTCACATTATTCAGCAATCACTTTCTCATCCAAAGTTTGTTTAGTTTTGAATTTTGTTTTCCGAACAAGTATTTTATAAAAGCCAAAATTTGGAAACAACTGATGAATGTTGTCTCATCCTTTTATGTAGTATCATCTTCTAGGAGCCACCTTTTGTTACTATATTTTAGAAAATCAAAAACCCTCTTTTGAAACAATGAACAAAGAAGGCCTAATGATTTCATTTATTTTTCAGCAAAACCTGGTAAAGTTGTGGGGCCAGTTGTTCCATACGAGTACGATAACATTGTCAAGGATTCTTATGATCCTAGGTCGTTTATCAGAGGTTCTGTGCTTCCTACTCAACCTGTTCCCCCAGGGTACTATTATCATCAGAGATCCAGCACTGCAAATCAAGAAAGGGCTGCAACAGAAGCTGACAAGAGTGTGCCTTTGCAAGCAAAACAACATGATCAAGAACAATTTGGAATTAATGCCAAGAGGGCACCAGATATAGCTATTAATATTGATACAAATCCCTTTTTTATGACAAGGGCAGGAGTTAACAAGTTAGAGCAAGGTGATCAAATAGTCATAGAGACAAACTTGTTGCAGCCAAAGACATATGGTGGAAGCAGTGCTGCAGCTGGGGCCACTGCTCATAGAAAGGTGGGTCCTGTTCAGTATGGTATGACAAGAATGTTCTAG