Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21829 LG5 36572938 36575210 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase CDL1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 36573207 intron_variant
A/T 36573234 intron_variant
T/C 36573490 splice_region_variant&intron_variant
G/T 36574091 missense_variant&splice_region_variant p.Arg185Ile
C/T 36574095 splice_region_variant&intron_variant
T/A 36574490 intron_variant
T/G 36574505 intron_variant
G/T 36574672 intron_variant
T/C 36575153 missense_variant p.Ile360Thr
C/A 36575172 synonymous_variant p.Thr366Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21829.1
MSLFPCCASQKRLNKKTLKKSIKKEREYEDRSVTSFSNISFKSDSGKRKFITDEIARLGKGNISSKIISYREICAATQNFHPDNMIGEGGFGRVYKGHLKTTNQNVAVKQLDRNGFQGTREFLVEVLILSLLHHPNLVNLIGYCAEGEHRILVYEYMVNGSLEDHLLDLPEGAKALDWHTRMKIAEDENFNPKLSDFGLAKLGPTGDKKHVSTRVMGTYGYCAPEYASTGQLTTKSDVYSYGVVLLEMITGRRVIEYSRPEEEQNLVLWVCFQTFLMKKFTQMADPLLKCEYPVKSLYQALAVAAMCLQEEDETRPLISDVVTAVEFLGRKRVEEDEPQPTKKITSTEEEEEEDSNEDKQSHKDRDDNHNDQNQDEEKKN*


CDS Sequence:
>Vu_21829.1
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Promoter Sequence:
>Vu_21829::LG5:36570938-36572938(+)
TCTTATACTACTACAAAATTATACCCATAACCGATAAGTTAATTTAAGAGTGATGACCGAACGGTTCACCCAAAACTATAAACATTAATATGACCGAACGATCATAAACTAAATAGCAGGATTCTCGCCGTTCAACTCCTGCTCCAACGTACACTCCTCCCCTTCTACTCACACCCAAAAGGTGATCATCGTAAGAGAAAAATCGAACGGAAACATGGACAAACAAAAAATAAGGATAAACTAATATAATTTAATTTACTATACATACATTCAGTTTCTACAAATATTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATTTCGTTTATATTTAAGTAAGTAATTTCTTACTTTTTAAATGATTTTTTTTTATCAAAATTAGCAATAGATTATTTATAATATTAAGTGGTTTATTATGTATCATTTGTTAATATTCACTAAATTTATTACTATTAGAATACTTAGAGATTATATGCATTTTCTACGCTAGTGGTTATTAATTCAATTGTTTAACTTGCATGTAATTTATTAGTTTCTCATTTTTCTATTCTTGTAATTTTTTTAATCATACATATATAATTTAAGGATTCTTGTCAGAACTCTTAATTTCAGTAGAGAGAGTGGAAGCCAGGTGTAGGTGTAGGAGATTTGGAAGATAGGTGTGAGCAACAGAGTGGACCGATCGATTTTTTACGGTAGTATATAAAAGAAAATTTTAAAATTTGGTGCCACTCTCTGCATGCAACTGATCTTTCTAAAATTCTGAAACCTTCTTTTCTCCTCCTTCTCTCTAGCTTCTCTCTAAAATTATCCTCCTTTTCCCTACAAATTCTCACATTCTTCTTCATCTGATCACCTTTTATGTGGCTGTATAATTTTCTTATATATAAAAACAATCTAGTTTATTAAAATCTATATTTATTAAAATGTTTGTATATAAGTATTTGACAAATTAAAAATATTTATATTTACAAATAATTAGAAATTAATTATATTTTTCTTGTATTAATAATTTTTCTAAAAGAAATTCATGGATCGGTCGTATAGGACTTTTTTATCGTGTAGATTTTTTTACCCCACGTGATTCAAAATTAAGCCAAATTGACGGGTCTACGGAGCAAATTCTACTTAACAATGAAGTTTGTTCAATATTGAAATGACACATCTTATTGACACTGCGTTTTATCATTTAGAAATTTATTGCCCTATTGAAAAGCATATTGGAAATTTTGTATTCTCAGTAAATTTTCATTATTAAAAATGGCATTTTTTTCTTTCTATTAAAAATTTATTTGTTTGACTTTATTTTATTCGTGTCACGGAAAAAAGTACCTGTTTACAAAAAATAGTCAATTTTAACAACTTTTAAAAAGTAATCAAAAGCTGAAAAATACTCATTAAATCAATTTGTTTTTTAAAAAAATTATTGTAAACAGACGTGAGTTAAAATTTCTTTTTTTAACTCAAAATAACCACTAAGTTGTTCTATAATAAAATCATTTTTATTTTACCTTAAATAAGCTCTTGGCCTGAAAGATAATAGAACAATATTATATATTTAAAGGAGTTAGTTGGAATCACAAGTGAGAAGACATGCAACAAATCCATTAAATTAAAATTGTTGTAACAGATAGATGTTACCGAACAAGAGCCATAGCATGATAACTCACTTTGGCTATTTTTGTTATTGGCAAATTTGACTATGTCTTAATATCTATTCCATGCTCATATGCCTTGAAGAAGCAAAAGAAACCATGTGAGATGACAGATTCTCAGAATCTAGAATATTTGCATGGTATTTTGCAGAACAAGGTTTGAATCAATAACAATCAAACAAAGATTTTAAGGCACTTTTGGGGTGTTGGATATTGCTGGGTACGTAACATTTGCATAAGAGAAGGGTTTCGAAAGCCAATGCAATAAGTTTCTAAAACTTTGAAAATGGAGCTTTGATCAAATCAAATTTTGAAAAAAGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_21829(+)
ATGAGTTTATTTCCTTGTTGTGCTTCGCAAAAGAGGCTCAACAAGAAGACATTGAAGAAGAGCATTAAGAAAGAAAGAGAATACGAAGATAGAAGTGTCACCTCATTTTCTAACATCTCTTTTAAATCAGGTGATGAGTTGTCATAATTATTGCTCTTATTTTTGTTGTATGTACAGGTTTTGAATTACATTTTTTTCATAATTATGTTTCTTATTCTTACTTTGCATTAGGGTTTTTTAATTGCATTTTCTTATCATATAGATCGAATTGTATGATTTAGAGGCTAAAATGTTGCAAAAATAGTGTTTTTTTTTATGATAATTTGCTAAAACTATTCAAAATCTCTTAAATTTTGGTCTAAAATGAAAAACAAAATGTGATGTTAGAACAATCAAAATTGTGGTGCACAGGTTATGTAAACCTCATCAAATCTTACAACAAGTGTAAAATAAAAAAGATTTGAAAGGAAAGAGTTTGTCTAATTTCTTTGCAAGTTTATCATTTGTGAAAGAAAAATATGAATGCTGAAAACTTGAAGAATTTTTGTGTTGTAGATAGTGGCAAGAGAAAGTTCATAACAGATGAGATAGCAAGGCTTGGGAAAGGAAACATTAGCTCTAAGATAATTTCTTATCGTGAGATATGTGCTGCAACTCAGAACTTTCACCCTGACAACATGATTGGTGAAGGAGGGTTTGGGAGGGTATACAAAGGACACCTTAAAACCACTAATCAAGTATTAATTACTTTAACTTCTCTTTGAAATAGTGTTAAAAGGAAGAAATTATATCCAAGTTTTGACTAACCTTCAAAGTTTTGTGACATGCAGAATGTTGCTGTGAAGCAACTTGACAGAAATGGATTTCAAGGAACCAGAGAATTTCTTGTAGAGGTTTTAATTTTGAGCCTTTTGCACCATCCTAATCTTGTCAACTTGATAGGGTATTGTGCTGAAGGAGAACATAGAATTTTGGTGTATGAATACATGGTCAATGGTTCTCTAGAAGATCACTTACTTGGTGAGTAAATGAAATAAATAAAGTAAGTTTTCACTGCATGATTTAACAAGAATCTAATGTTATTAATGAATTTTCAGACTTACCTGAAGGAGCAAAGGCTTTGGATTGGCATACCAGAATGAAAATTGCAGAAGGTGCAGCAAAAGGACTTGAATATCTGCATGACCAAGCAAATCCTCCAGTGATATATCGTGATTTCAAAGCATCAAACATATTGTTAGATGAAAACTTCAATCCAAAACTCTCTGATTTTGGACTTGCAAAGCTTGGTCCAACAGGAGACAAAAAACATGTGTCTACCAGAGTGATGGGAACATATGGATATTGTGCTCCTGAGTATGCATCAACAGGGCAATTGACTACAAAATCAGATGTCTATAGCTATGGAGTGGTGCTTTTGGAGATGATCACGGGAAGAAGAGTCATTGAATATTCAAGACCAGAAGAAGAGCAAAATTTAGTTCTTTGGGTATGTTTTCAGACCTTTCTTATGTACTCAACTTCATACTATTTCCTTAGCAAAATATCCTCCTACCAAAATTTCATTTGTCGAATTGAAGTTTTCAACTTCAAAATCAGTTTCTGACTAGCCCATCAAATTAATCAGTTGAAAATAAGATAGAAAGACCACATTTTTTAAATTAAAAATTAAAATATAAATACTTTAATAAATTAATTCTTTCATATTTTATTACTTTAAAAATATTATTACTAGTATAATTTAAATCATTAATATTTATAAATTAAATTTTAATTATTAATTATAATAAACTAATTTAATATTATAATAGAATAATTTAACATATAAAAAAATTCTTTATTCAACAATTTTGATTGACTAGCTATATGAAAGTGTGAAAAATATCATTTGAAAAAGAAAAAAACATGAACTAATTAGGATATATGCTTCTCTTCAGGCACAACCACTCTTAAAAGATAGGAAGAAGTTTACACAAATGGCAGATCCATTGTTAAAATGCGAGTATCCTGTAAAAAGTTTATACCAAGCTTTAGCAGTGGCAGCAATGTGTCTCCAAGAAGAAGATGAAACTCGACCTTTAATCAGTGATGTAGTTACAGCAGTTGAATTTTTGGGAAGGAAGAGAGTAGAAGAGGATGAACCACAACCCACCAAAAAAATTACTTCTACTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAGTAATGAAGACAAGCAATCTCATAAAGATCGAGACGACAACCACAATGATCAGAACCAAGATGAAGAAAAGAAGAATTGA