Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21675 LG5 35379887 35386706 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g10290 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 35379984 3_prime_UTR_variant
A/T 35380347 synonymous_variant p.Val534Val
T/C 35380705 downstream_gene_variant
A/G 35380708 downstream_gene_variant
T/A 35380860 downstream_gene_variant
A/T 35380861 downstream_gene_variant
A/G 35380896 downstream_gene_variant
T/C 35380997 downstream_gene_variant
G/T 35380998 downstream_gene_variant
T/A 35381303 missense_variant p.Arg414Trp
G/T 35382687 downstream_gene_variant
T/A 35382717 downstream_gene_variant
T/C 35382724 downstream_gene_variant
G/A 35382725 downstream_gene_variant
A/T 35382729 downstream_gene_variant
G/T 35383268 downstream_gene_variant
G/A 35383960 downstream_gene_variant
A/C 35383968 downstream_gene_variant
A/C 35384115 downstream_gene_variant
A/T 35384116 downstream_gene_variant
T/C 35384574 splice_region_variant&intron_variant
A/G 35384575 splice_donor_variant&intron_variant
T/A 35384856 intron_variant
C/A 35384866 intron_variant
T/C 35385172 synonymous_variant p.Arg90Arg
G/T 35385261 intron_variant
G/T 35386682 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21675.1
MVDESGKMDLVFVLLLFTSVCFSALAGLDSQEDALYALKSSLNASTSQLTNWNKNLVDPCTWSNVECDQNNNVIRVSLEFMGFTGSLTPRIASLKSLETLSLQGNNITGDIPKEFGNLTSLVRLDLENNKLTGEIPYSLGNLRKLQFLTLSQNNLSGTIPESLASLPSLINVMLDSNDLSGKIPERLFSIPTYNFTGNNLNCGVSYHHLCSSDNAVQGSSHKTKVGLIVGIVAGLGIIFFLGCLLFFWYKGCKREIFVDVPGEVDRRITFGQIKRFSWKELQIATDNFSEKNILGQGGFGKVYKGILADGTKVAVKRLTDYKSAAGDAAFQREVELISVAVHRNLLRLIGFCTTTTERLLVYPFMQNLSVAYRLRELRPGEPVLDWPTRKRVALGTARGLEYLHEQCNPRIIHRDVKAANILLDGDFEPVVGDFGLAKLVDVRNTTVTTQVRGTMGHIAPEYLSTGKSSERTDIFGYGIMLLELVTGQRAIDFSRLEEEDDVLLLDHVKKLQREKRLDVIVDCNLKKNYIIGEVEMIVQIALLCTQPSPEDRPAMSEVVRMLEGEGLAERWEEWQHVEVATRQDYERLQRRMNWGEDSMNNQDAIELSGGR*


CDS Sequence:
>Vu_21675.1
ATGGTTGATGAGAGTGGAAAAATGGATTTGGTATTTGTTCTTTTGCTATTCACTAGTGTGTGCTTTTCTGCGTTGGCTGGGCTTGATTCACAAGAAGATGCGCTGTATGCGTTGAAGTCATCATTGAATGCTTCTACGAGCCAGCTTACAAACTGGAATAAAAATCTAGTTGACCCTTGTACTTGGTCCAATGTTGAATGTGACCAAAATAACAACGTTATTCGAGTTTCACTAGAATTTATGGGATTCACAGGATCGTTGACACCAAGAATAGCATCTCTGAAAAGTCTTGAAACTCTTTCTTTGCAAGGTAATAACATCACTGGTGACATTCCAAAAGAATTTGGAAATCTTACAAGCTTGGTCAGATTAGATTTGGAAAACAACAAATTAACTGGTGAAATTCCCTATTCACTTGGTAATCTTAGAAAGCTTCAATTCTTGACATTGAGTCAAAACAATCTTAGTGGAACTATTCCAGAATCACTTGCCAGTCTCCCAAGCTTGATCAATGTTATGCTAGATTCAAATGATCTTAGTGGGAAGATTCCGGAGCGGTTGTTCAGCATTCCTACATACAATTTCACTGGAAATAATTTGAATTGTGGAGTGAGTTATCATCATCTTTGCTCATCTGATAATGCAGTTCAAGGTTCGTCTCATAAAACAAAAGTAGGCCTCATAGTTGGAATAGTTGCAGGTTTAGGTATTATTTTTTTTCTTGGTTGTCTGCTGTTCTTCTGGTACAAGGGGTGCAAGCGTGAAATTTTTGTTGATGTTCCAGGCGAGGTCGATCGCCGAATTACATTTGGTCAAATAAAAAGATTTTCCTGGAAAGAGCTACAGATAGCTACAGACAACTTCAGCGAGAAAAATATTTTAGGACAGGGAGGCTTTGGAAAGGTTTACAAAGGTATTCTAGCAGATGGTACAAAAGTTGCTGTCAAAAGGTTAACCGATTATAAAAGTGCTGCGGGTGATGCTGCGTTTCAGCGTGAAGTGGAGTTGATAAGCGTAGCTGTCCATAGGAACCTGTTACGGCTCATTGGTTTTTGTACTACTACAACTGAACGTCTCTTAGTTTATCCCTTCATGCAAAACTTAAGTGTTGCCTATCGTCTACGAGAACTCAGACCTGGGGAACCCGTTTTGGATTGGCCTACTAGAAAACGAGTGGCTCTAGGAACAGCCCGCGGCCTAGAATATCTTCACGAGCAGTGTAATCCTAGGATTATTCATAGGGATGTGAAGGCAGCTAATATATTACTAGATGGAGATTTTGAACCAGTTGTTGGTGACTTTGGTTTGGCAAAATTAGTTGATGTCCGAAATACTACTGTGACAACTCAAGTTCGTGGGACAATGGGTCATATAGCTCCAGAATACTTGTCCACGGGAAAATCTTCAGAAAGGACTGATATTTTTGGTTATGGGATTATGCTTTTGGAACTTGTTACAGGTCAACGTGCTATTGACTTTTCACGTTTGGAAGAGGAGGATGACGTGTTATTGCTTGACCATGTTAAGAAACTGCAACGGGAGAAAAGACTAGATGTTATTGTGGACTGCAACCTGAAGAAAAATTACATAATAGGAGAGGTTGAAATGATTGTACAAATTGCATTACTCTGCACACAACCATCTCCGGAAGATCGACCAGCAATGTCAGAAGTTGTAAGAATGTTAGAGGGAGAAGGGCTTGCTGAAAGATGGGAAGAATGGCAGCATGTGGAGGTTGCTACGAGGCAAGATTACGAGAGACTACAGAGAAGAATGAACTGGGGAGAAGATTCAATGAATAACCAAGATGCCATTGAGTTGTCAGGTGGAAGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_21675::LG5:35386706-35388706(-)
GAAAAACCTAATCACAGTTCTTTAATATTTAAATACAAAGTATAAGGGAAATGACAAACATGATGCAAAAATATATAGTAGGAATTGTATATCAATTTTTATTAATGGGCTCTTATTTAACAGAGAAAAAAATTAGATACACCATTTTCATGTTACAGTTTTTTTAAACGGTTAAGATTGTAACAACGCATGTATAAATTACTAAAATAAAATATTATATAAATGTTAAAAGAACAATTAGGTAAAATAAACTTCTTTCAAAGAAGATATTTATTTCTATAGATCGATCTAACAACTCATCTACTTCTACCTCATCTCTAGCTGGAACAACTGAAAAAATGAATATCTAAGCTCACATCATTAGATGATCATTACAAAAGAAAAACAACATATAAAGACAAACAACAGAAAAACAAGGGTAAACTAGATACCAAAGAAATCATATCACATCTATAACATAACATACATAGATAATTTATATCACATACATCATTCCAAACATCTTAACTTATAAAGACCTTAGACTTGACTATCCAGATTAGTATGAATATGTAGTTATGGTAGTTCATGCACTTGTTATGGTGAAATAGCTGGCCCATCCCAAGCTACTACACAAGGTTAGTCCGTTATCACTTACCTCAAGTCAAGGAAAAGTCCTTAAGCTAGGACCTCCTGCTATTCTCACGACATGCCTCACTCCTCTCTACTTGAAAATAGATTATCATTAGAATGTCAGGATGAACTCCAAGACTGAATTTCTCATATTTATTCTTACAATCTTTGAAACAATCACTGAAATTTTTTTTCTTGGAATTCTCTTCCACACCATTTGAAACAACCATTTTTTGGGATTTTAGAAAGATATTGAAATTATGTTTAAAAAGCATTAACACTTATCATGTTCATAAATGGCATGATTAAAAAAACAGAAGAATCATTATGTCCTAACATCACTTATGTTCAAAAGGGCACACGGCGCAGGAGTACTGGACAGTAATTTTTTCTTTCTGACTTTTGACCACAAAATACTTTTAGCACAAAATAATTTTGACCTTGACTAGTAATATACACTGTAACATGATATTCAAACATATTTTATAAAAAGTGAAATAATCATAGAAATTATAAATTTTTATATTTATATAAAAAAATATCAAATAAATATAAGAGATTTTGTATGTCAAGACAAATACATGTTTACTGACAAAAAATAATATAGACAAATAAAAAAATATGATAAGTGATAGAATAGACAAGAGAGAAAATAACGAAAATAAATTGGTGCTAAAGATTGACACACTATAGTTTATAATTTGTTCACTTTTTTATTTTAGAAAAAAATCACAAAACAGTCTAAGAATCATATTTTCATTAAATAAAAGAAAAAGCCCTTTATATCCATATTTACTTTTCTATTTGTTTTCCGTCTCATTAAATAATATTAAAAAATAAATCAAAGAATAGCCTTTGACATAAAATGGGGACAATGATAGTGATTGATCGACAATGATTGGTCTTTATTTTCAAAGTACTACCGACTAGTGGACAGCACAATGGATTGCTTTATGCTAATCTCATCGCCCAGTATCATAGTAATATCTAGGGTTTTCTTTATTTTGTTCCCTTTTTAATTTTATCATTCTAGGGTTAATTTATTAAGTTTTAATTTTGCCCAAATTGCTATTATAACATCACTGTTGGAAGTTAATTTAGTAAATCACGAAATCAAGACTTCAATTTCAATCCACAGTGTAATCTGTTTTATGTTGAAATTCACTCAATTTTAATCAGAAACCTTTTTCATTAGCTTCTATTTCAGTTCAATGTCTTGTTTATATATTTCAACTTTACTCAAGTGTTATTATCTCTTCTCTTCATCATTTCCACAGAGCTACTCCTTTATTTATTTTACCAACCAAAAAAAAACAGACTTTGACCGGTTCAAACAATGTCTAATTTTTGTCTTATAAATGATTCCACTTCTGTTGCTGGTTTCATTT


Gene Sequence:
>Vu_21675(-)
GTTCTCTCTCTTTTGGTGGTTGACCCCTATCTGTTAGTACTTAAGCTTTTTCCATCGATGGTTGGAAATTCACGGTTGGTCATTTGACACGTCTGTCTCGTATCGCATCGTGCTTCCGGCAATCTTCTTCATTTCTCCCCTTTTATCTTTGTATGATATTTACCGACTGTCTTCAGTGATTGCAACTTAGTGGGGTGTTTTGTTTGTTCTACACTTGAGAGATGAAGATTTATGATGTGGTACTTGAGCATAATGCACGCTGTCACTGGTTGAATGGTTGATGAGAGTGGAAAAATGGATTTGGTATTTGTTCTTTTGCTATTCACTAGTGTGTGCTTTTCTGCGTTGGCTGGGCTTGATTCACAAGGTTCAGTATGCTGTTCAAACTTATTCGGTGTTAATCTTTAAGCTATGTAAAGATTTAGCTGAGTTTTTATTTTCTTCACTTCCTTTTCTCTGTCATGATGGTCTGGCACACTGGTATTATGGTTCTGAGATTCATTCATATTTAAGCACACTGGTATTATTGTTCTGCCTCTCTGAGATTTAATTTCTTCGTAATCCTTTTTGTTACCCTACTGTCACCTTTGGTTGACAAAGTGACACTTTGATCCATCAACTTTTTGCCCTTTTCCTATATCTTTTAGAAAAATCATTTGGGTTTTTTCAATTTATTTAAATATGCTCCATATGAATGATCGTACTTTCAACCATGGAATAAACTATTTGGTAACGGTGCTTGGAAATTAATGAAAGTTTGAAAATTTGGATCATGTACTTACTGGAAAGAATCATTATCCGAGAATTGTGTTCGCAACCTGTACCTTTGCACATCATTTATGAGGAATACATGGATAAAATGTTCGTTTACAACATATGATAATCTTATAACTTTTATAATATTGCAGTAGAAAATGCTATGGATTTTACATCTATCTGCCTTTCTGGTTTTGTCGAAGTTGCAAGTGGATTTGGACTTTCAGTCTTTAATAGATGTATAATTTATATGTTCATTTCAGAAGATGCGCTGTATGCGTTGAAGTCATCATTGAATGCTTCTACGAGCCAGCTTACAAACTGGAATAAAAATCTAGTTGACCCTTGTACTTGGTCCAATGTTGAATGTGACCAAAATAACAACGTTATTCGAGTGTAAGATATTCTTATTATAATATTGGAAACATCCACTGGCTTGTTTTCTTTGAAGAGAAATGCTAAGAACATTTTCTCTAGGATAGTTTTCTGAATATACTCTCTCTTGCCGGTTGAAATTTATTAAAAACGACAAAATTTTATGGATTCTATAACTTATTTAACAATCTCTCTTTTAATTTTGTAGTTTTCAATAAATATAACTAACAAGAGAGTGTATGTACCTAATCCTCCTCTTCATTTGAATATTTAGTTTGAGGATGATTGTGACAGCTTCAACTTCATTGGTACTTCAATATTTTATTCATAACGTATAATTATACATATTACTTCATTGCAGTTCACTAGAATTTATGGGATTCACAGGATCGTTGACACCAAGAATAGCATCTCTGAAAAGTCTTGAAACTCTGTAAGTATTTAATATGAAATATCCACAGAACTATCTTCTCCCTCTGCCCTGTCCCATATTTCAGTTCATAGCCTTAACGTTCTTGGTTTGTTTCATTTTAGTGTTGAGGCATAAATTCATGAAATTACATGGATGCATTAAAACCTTTTACCGTTGAATATACTATCCTCTGTGTATCCGATGAACTGTAGTACACTATTCAATCATTCAGTAGGGTTCCTACTTTGTAATTGTTAATTTAAGAAAGTGAATGGAAAAATGCATATAGCATTTGTAGTGTGTATGGAATTATGTAAACTTCGGTTACTTTTTCAAGAACCATATGATGTTTTTTGGTGAATTTTGTGATTTTAAATCTTACATTCTTCACGCTTTCAATTATTCATCTTTTTCACCTTTTTTCTTACACATTTACCGTGAAGTTCTTTGCAAGGTAATAACATCACTGGTGACATTCCAAAAGAATTTGGAAATCTTACAAGCTTGGTCAGATTAGATTTGGAAAACAACAAATTAACTGGTGAAATTCCCTATTCACTTGGTAATCTTAGAAAGCTTCAATTCTTGTAAGTATGGAGTCTTAGCATCTATTTTCCTTTTGTAATGTCTGGAAGTATCTAATTTTGGTCTTCAACTAGGACATTGAGTCAAAACAATCTTAGTGGAACTATTCCAGAATCACTTGCCAGTCTCCCAAGCTTGATCAATGTGTATGTTAATATTTTTTATACTCGTATTTTGATGACAAGTACATTTTATTATCATTTGATATCTGATGGATTGTTCAAACTTCTCTTTTACAGTATGCTAGATTCAAATGATCTTAGTGGGAAGATTCCGGAGCGGTTGTTCAGCATTCCTACATACAAGTACGTATGTTAAATCAGAATTAGATACCTTAAAACCAAAATGTGAAATTCTTCAAATACATTTTTTGACAGCAATTTTGTATCCCGGACCCAAGGACTATACCTAAAAGGCTAAAACACTTGGAAAGTGGATGCCTAAAGAACCCATGTCATCAATTTCATTCAACATTGTTACATAACCAAATGGTAGTCTATGATTCTAATGGTCATCTCTGGTTCCACTTTTTGATCTTCCTCTGAAAGATTTGTAATCATCACATATTCAATTTCTCCTACCTAATTTAGAGTTCTCATTGCCCAAATTTTTTCCATACACCCAATATATAATATTGAATGGCAGAAGTTTAAGGTGGTAGTTTTTTGTTACTTTAAAAGAAATATAATTTTTTATTGGCAAATACCGATCAGTTTCCTAAGGACCCATGTTAAGGAAACAATAATAATAGCCTTTTTTTCGTTAGGTGCGATTGGATACATGGGTCGTACAATACAATTGAGTTTGTAACAAACCAAAATTTCAGTGATATTATTCAACTTGAGATCCTTTTCCATAATTTCCTCCCATGTCCTTTTTGGTGTCTCTGTATCCCTTTTTTCAAGGCTAAAAAGCCATGAAATCTACTTTCCTTATTTCTAGTGGCTTTCTCTGTACATGTTCAAACCTAAGCTGATTGTCCATCATTTTATCCTTCATGTAAGTCTCAATAATATCTGCTTGTGTGCAATTATTTGATATCTTGTTTTTTGTTTTGTCGTCATACATCTAACTTTTCATGTTTATGGTGTCCTTGGACAAAACTACAAATTTGTATAAAAAAATCATTCATTGCTTAAATAGGCTTATTTGTGTTCCACTTTGTTTCACTGTTTTGCCCATTGCAGTTTCACTGGAAATAATTTGAATTGTGGAGTGAGTTATCATCATCTTTGCTCATCTGATAATGCAGTTCAAGGTTACTTTTATTAATACTGTTTTGATCTGTAAAGTGTTTTCCTTCTCCCACCCCCTCCATTTACAGGCAACAAGCTGAAAACTAGTTTTCCTTCATTTGACAGGTTCGTCTCATAAAACAAAAGTAGGCCTCATAGTTGGAATAGTTGCAGGTTTAGGTATTATTTTTTTTCTTGGTTGTCTGCTGTTCTTCTGGTACAAGGGGTGCAAGCGTGAAATTTTTGTTGATGTTCCAGGTTTGAGTTCCTTTTTCAGCCTTCACAATGTTTTTGTAGATTGTCTATATCTTCAGAATTAGTAGCTATTGATCTGGTGACGCTGCCTGCACATTCTGCTCAAAGTTGATCTAGTGCTATAAAATCGTGAATTTATGACATAAGTCACTGTTGTCCTCATTTAGATTAATTTTTATGAATGGGTACTCCATACCTCTTAATGCACCATCTCTTTATTGGAATTTCATTTTTCTTTTAAAAAATACTGGTATCCAGTATTAATATCTGTAGCATCTGTGTGTCTGCAGTAATATTTTTTCTATTTTAGAGCATCTGTCTAATTAATGTGATAGTATTTTTTATTGATTAGGCTTAGTTCTTCAAATTTTATTTCAAATATGTTTTTGGCTATCCTTTTCCTTCATTTTGGTATACTGACAACTTATGGCTCATTGGGTCTAATAACCACAAATTAGGATATACCTCTTTTGAACCATCCATGTCCGGTAAAGGTGGGATATGGTTAAATATTTATGAGATGAATGGGGAGTTTACTGGTTGAAGTATCTTGTAATGCTTTTAATTGTGACAACTAGTTCAATGTATGCTCAAGAGCTGAAGAAAAAAAAATTAAAACAAAGAAACAGTCAAGTTTTCTAGTTTAACGTCATTTTTAAAGGTTGATATGAACTATCTATTTTAACATATTTTGAAATTTTCCCTTGCTGATTAGCTATTTGAATATCTTTTTTCTCATGTATTTTCAGGCGAGGTCGATCGCCGAATTACATTTGGTCAAATAAAAAGATTTTCCTGGAAAGAGCTACAGATAGCTACAGACAACTTCAGCGAGAAAAATATTTTAGGACAGGGAGGCTTTGGAAAGGTTTACAAAGGTATTCTAGCAGATGGTACAAAAGTTGCTGTCAAAAGGTTAACCGATTATAAAAGTGCTGCGGGTGATGCTGCGTTTCAGCGTGAAGTGGAGTTGATAAGCGTAGCTGTCCATAGGAACCTGTTACGGCTCATTGGTTTTTGTACTACTACAACTGAACGTCTCTTAGTTTATCCCTTCATGCAAAACTTAAGTGTTGCCTATCGTCTACGAGGTATTGAGTAACATTGCATGTTTGCGTTACTGGTCTGCTAAATTTTAAATTTCACCTGCTATAAGAGAGTATAATCAGTGATTGCTTTACTTTGTAACCGGGATTGGAGGGTCATGACTCATTCAAACCATTTTAACATTTCCTAGATATGATTGGTTGCATTAAGTAATCAAAAGTTTAATCTAACACATTCAGGACACTTCTGGTTTGTATAAAGCTCCAGAGTTCTTTTGGAATTATAAGTAGTTATTGACTTCACATCAGACTTTGGGGAATAGAACAAGAATGTGA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