Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21600 LG5 34727187 34731581 PREDICTED: probable inactive receptor-like protein kinase At3g56050
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 34728378 intron_variant
T/C 34728504 intron_variant
G/T 34728677 intron_variant
A/G 34728761 splice_region_variant&intron_variant
T/C 34729030 synonymous_variant p.Lys386Lys
C/A 34729528 missense_variant p.Val297Phe
A/C 34729529 synonymous_variant p.Gly296Gly
A/G 34729577 synonymous_variant p.Gly280Gly
T/A 34729787 missense_variant p.Leu210Phe
A/G 34730186 splice_donor_variant&intron_variant
A/T 34730730 intron_variant
T/C 34730736 intron_variant
G/T 34730809 intron_variant
A/T 34730839 intron_variant
C/G 34731082 intron_variant
C/T 34731103 intron_variant
C/G 34731131 intron_variant
A/T 34731140 intron_variant
A/T 34731157 intron_variant
A/G 34731175 synonymous_variant p.Asn33Asn
G/A 34731182 missense_variant p.Ser31Phe
A/T 34731183 missense_variant p.Ser31Thr
A/C 34731234 missense_variant p.Leu14Val
C/T 34731320 5_prime_UTR_variant
A/G 34731323 5_prime_UTR_variant
T/A 34731524 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21600.1
MNKNWKSSCFRDPLFLLALCLFFQNFSSCCSLNEEGKALLKFKQGIVRDPFGALSNWVNDEVAVNHCNWFGVECSAGRVVVLNLKDLCLEGNLVPELANLVHIKSIILRNNSFYGIIPEGIAHLDELEVLDLGYNNFSGHLPTDLGNNISLTILLLDNNEHLCGFSPEINKLMLISEYQVDERQLSLAAKVPACTRRFIKRHIGKNKKGLRRLLQSSRDSNSFNRAARFPDSPPPSSSAPSPAPATPPPVEEPTFTDRNDSASPSPSLPEPRSGSSDSSGSSDSNVVAILAGVIGGVVFLVISIIGIYLCKTNKVATVKPWATGLSGQLQKAFITGVPKLKRSELEAACEDFSNVIGTSSIGTVYKGTLSTGVEIAVASVAATSSKDWSKTLEAQFRKKIDTLSKVNHKNFVNLLGHCEEDEPFTRMVVFEYAPNGTLFEHLHIKEAEHLDWETRLRVAMGMAYCLQHVHQLEPPLVIGNLNSSAVQLTDDCAAKISDLSFLTEIASAVMKSSARQHPDMTPASNIYSFGVILFEMVSGRLPYSVDNDGSLDDWASQYLHGDQPLKEMVDPSLASFQQEQLEQVDALIKSCVHPDPKQRPTMKEICVRLREITKITPEAAVPKLSPLWWAELEIASVNGN*


CDS Sequence:
>Vu_21600.1
ATGAACAAAAACTGGAAATCCAGCTGCTTCAGGGATCCTTTGTTCCTTCTAGCGTTGTGTTTGTTCTTTCAGAACTTTAGTTCCTGTTGCTCTTTGAATGAAGAAGGTAAAGCTCTTCTGAAGTTCAAGCAGGGAATAGTAAGAGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATTGGGTTAACGATGAAGTAGCAGTTAACCATTGTAATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCTGCTGGAAGAGTGGTAGTCTTGAATTTGAAAGACCTTTGTCTTGAAGGAAATCTGGTACCTGAGCTCGCGAACCTTGTTCACATAAAGTCCATAATTTTGCGGAACAATTCTTTTTATGGAATCATCCCTGAAGGAATTGCACACTTGGATGAATTGGAGGTTTTGGATTTGGGCTACAACAACTTCAGTGGACATCTACCTACAGATCTTGGGAATAATATTTCGCTAACAATCCTTTTGTTGGACAACAATGAACATCTCTGTGGTTTCTCTCCTGAAATTAATAAATTGATGTTGATTTCTGAATATCAAGTAGACGAAAGACAACTGAGTCTGGCAGCAAAAGTGCCAGCTTGTACAAGAAGATTCATCAAACGGCACATTGGCAAAAATAAGAAAGGTTTAAGGAGGCTACTGCAATCTTCTCGTGATAGCAATTCTTTTAACCGTGCTGCTAGGTTTCCTGATAGTCCTCCTCCATCTTCTTCAGCTCCCTCACCGGCCCCAGCAACACCGCCACCGGTTGAGGAACCAACTTTCACTGACCGAAATGATTCTGCTTCTCCTTCTCCTTCTCTGCCTGAACCGCGCTCTGGCTCATCAGATAGCAGTGGTTCATCAGATAGCAATGTTGTTGCTATTTTGGCTGGAGTTATAGGTGGTGTTGTATTTCTTGTCATTTCAATCATTGGCATATATCTCTGCAAAACAAACAAGGTAGCTACTGTAAAACCTTGGGCGACAGGATTAAGTGGACAGCTTCAGAAGGCATTCATAACAGGTGTGCCAAAGCTGAAGAGATCAGAGCTTGAAGCAGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAATTGGCACTTCTTCCATTGGTACAGTGTACAAAGGGACTTTGTCCACTGGTGTTGAAATAGCCGTGGCCTCTGTTGCAGCGACATCATCAAAAGATTGGTCAAAGACTTTAGAAGCCCAATTTAGGAAGAAGATAGATACATTATCAAAAGTGAACCACAAGAATTTTGTAAATCTTCTTGGACATTGTGAAGAAGACGAGCCTTTCACCAGAATGGTGGTTTTTGAGTATGCCCCAAATGGAACACTCTTTGAGCATTTGCACATAAAAGAAGCTGAGCACTTGGATTGGGAAACAAGACTCAGAGTTGCCATGGGTATGGCTTACTGCCTACAACATGTGCACCAGTTGGAGCCTCCTTTGGTTATTGGCAACCTGAATTCTTCAGCGGTTCAACTCACGGATGATTGTGCTGCCAAAATCTCTGATTTGAGTTTCTTAACTGAAATAGCTTCAGCTGTGATGAAATCTTCTGCTAGACAACACCCTGACATGACCCCAGCAAGTAACATTTACAGTTTTGGTGTTATATTATTTGAAATGGTGTCAGGCAGGCTCCCTTATTCAGTGGACAATGATGGCTCACTTGATGACTGGGCTTCACAATATTTACATGGGGATCAGCCCCTCAAAGAAATGGTGGATCCATCTCTGGCGTCCTTCCAACAAGAACAGCTGGAACAAGTTGATGCTTTGATCAAATCTTGTGTCCACCCTGATCCAAAGCAAAGACCAACTATGAAAGAAATTTGTGTGAGATTAAGAGAGATAACAAAAATAACACCCGAGGCAGCTGTTCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCGGAGCTTGAGATTGCCTCGGTAAATGGAAACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21600::LG5:34731581-34733581(-)
TAAAAATAAAAAAAAAGCCCGAGGGACAAAGATGCTTCGTTTTTTCTTTGTTTTTTTTAATCACTAAGATTTTATCAATAAAAAACACATTATCTATTATTAAAAAATTGGTCATTGAATGTTTTACCAAGTCTCAAGAGGTAGACAGAAACCCTAGAAATTGATATTATCAGAATTTACTCAAGTCAGCGGCGCACGATAGCCTGCAAAACCCCCTATTTTGTCTCATCTCATATCATATGAAAAAAATTGATCCAAAATATACAACAATGATACTTCCCCATCATATTATTTATTATATTTCATTTTCTACTGTATACATGTTCTAAAAATGTTAAATCATGTCTATGAAATATCACAGCAATTTTAAGAAATAAGAAATTAAAAACGGTTTTCAAATTATAAAATTAATAAATTTTAAAAAATTAGGAATTAACAATTTTCAATCTTTTAGGAATCATAGCAATCTTTATTTCAAACACAAATTTTTCTCATAATCATAGTTTTATAATCTTAAACCAGTTTTAGAAAATTCAAAATCACCTCTAAAATTATGGTTTTACCGTCTTAGACCATTTTTAGAAAGAGGAGAAAAATTCAAAATCACCTCTAAAATTATTAAATACGCATAACATTTGTTATGAATGTATTCTAAGAAGTACAGGTATTTTTAAAGAACAACGTAAAAAGGACTTTTTTTTTATGTGAAGCTTCCTGGTATTTCAGAACCGAAATCCTGGCTCTTTTTCATCTAATATTTAAAAAACAAGTGTAGTTTTTGGCATTTTAGTATTTATGTTTTCCTTTATTACATCATTAGAAGTTTACCGAGATGTTGTTTGTTTGAATTTAATGTAATGTAGTATTGAATGTTCATTTGATTAAATGATTAAACTACTATCACCAAATAATTTTAAGTGATTTAAGCAGTTTGACTTTTGAAATAATAGTTTAACTATGTGCATTAATTATGATAAACACGCAACAATAAAGTTAAAAAGAAAATTTGATTACAGCTATGGACATAGTAATTCTGATAACAGACCAGCTAATAATCTATTTGCTTAAATCAGATCTAATTCACTGTTTCTGTTATTATCTTCATACTCACCACTCTGCACTGTTCCTCGTCCCTACTTAGTCGGCGGCAACTCTCATCTTTGACCTATTCCATGCTGTACAATGTGTAATGTCGCATGTTGCTGATAAGAATTTTTTATTTTGCTTCTTTAACAATTGTGTCCATGTAGATGTTTAAAAATTAAATAAATCAAAACAATTTATTAAATAATTAACAAGTTTAATTTTGAACAAATCTATATTCATAACATAATTTACAGGTTGAAAGAAATGCTATTTATATACTTACATTGCTTTTATAAGAACTTTTAATATCAAAGATGAAATAATTTTTACACTATCATTATTTGTCTAAAATACAGTGATTTTTTATAACTTGTATAATAATTATTTTAAAAGTCACACTTATTATTGTTTATCATTGGTTGTTATTAGTATACCCTAATTTTTACCACCTAATCTAATGAAAAATAATTCATACCTTAATAATGTAAATTTGATTTTGTACTATTATTTAATCATATATATATATATATATAAATTGATTGACTGGTTTTATAATAAATATTTTAAAAACTATATTTGTTTTTCTTTCCAGATCAATTAATATTTAAAACTTTTACATTATGTTTTATCATTAGATCGAATAATAGTTTGTGCCTTGATATTATATATGGACCATTTTCATTAGTAGTTAATAAAATAAGAACATACGTAATAGTTTGATTAAGTTTTACAATAACTTAAAAGAAAAACATACTTATCATATTTTTCCTATATTACACTTTTTTACACTATTGCAAATAAACCAATAGTTTGTATATAGTATTATTTTGGAAATACAATTTTATTACAGGGTGAATAACGTGCGTGTTGGTGACAATTTTTATTTTTATAGAATGGGTGTTGAAGTTGCGTTT


Gene Sequence:
>Vu_21600(-)
AGATTTGGAAGTATTTTTAATAATATTAAAATAATATAAATGGAAAATTCTATTGTGAGGGAACGCGTTTTCAAATATTTTTGTAATGTGTTGTATGGGTCCAAACTGGTTTCCTTGGTCTAAGAACATGGTTTGGAGATTCACCCCTTTGCCATATATGACAATGTTTTAGAAATTTCATATTTTTCTATACTTTCGAAGACTGATCCTTTTGGGAATCAACTTCCTTCAATTTCGTTTCTTTGAAGAAAAATTCAATCTGGATCGTGCTTTTTTTGCCCCACAGTTGAGGTTTGCACGCAGCAAGAATGAACAAAAACTGGAAATCCAGCTGCTTCAGGGATCCTTTGTTCCTTCTAGCGTTGTGTTTGTTCTTTCAGAACTTTAGTTCCTGTTGCTCTTTGAATGAAGAAGGTATTGAGCTTTTGCTTTGTGGAATCTTCTATTTTAGTGAAGTTATTTGTGTATATCCGAGGGGGAAAATAAAGCTGAGAAGTGAGTTCTATGTGCAGGTAAAGCTCTTCTGAAGTTCAAGCAGGGAATAGTAAGAGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATTGGGTTAACGATGAAGTAGCAGTTAACCATTGTAATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCTGCTGGAAGAGTGGTAGTCTTGTAAGTTCTGATTTTGTGATCTGTTTTTGAGAAATTGAATTTATGTATTTTTCTGTTCAATTTAATTTATGGCCACAGAAAGAATATATAATTTTTTTTTTCAAATTTTATTCATTTGGGTCCTCAGATCAGAAACCCAAGTTTCAAATTTATACTTTATTTTTCTTTGTTATCAGCAAAACTGTTTGATTCGTAATTTTTTAGACTGCTATAAAAGTCTATCATGTTTTTTTTTTATTGTAGTCTAACATCTCCTCAATCGAAATGTACCTTGGTCTTGAATCAACTGATCCATAGAAGCTTGATATTGTCATTACAAAATTTTAAGACCAGTTTCCTGTTCAATAAAAATGACTTTTGTTAACATTTTTGGTTAGATAGAATTGGCAGTATTCTGATCTATAGAATATATTTTTGTTTGGCAGGAATTTGAAAGACCTTTGTCTTGAAGGAAATCTGGTACCTGAGCTCGCGAACCTTGTTCACATAAAGTCCATGTATGTTATCAATTTTTGTTGTTTGCTGCAACTAATTCCTTGATAAGTTCAGTTTTCAAATGTTTTCAACTGTCTAGTAATCGTATGATGAACATGTTGCAGAATTTTGCGGAACAATTCTTTTTATGGAATCATCCCTGAAGGAATTGCACACTTGGATGAATTGGAGGTTTTGGATTTGGGCTACAACAACTTCAGTGGACATCTACCTACAGATCTTGGGAATAATATTTCGCTAACAATCCTGTAGGATAAAGCTCTCTGAACATTTCAAATCTCATTTTTTAAACTTATTTTCCTACTTTGTTCTTAGTTTCTTCTTATTGCAGTTTGTTGGACAACAATGAACATCTCTGTGGTTTCTCTCCTGAAATTAATAAATTGATGTTGATTTCTGAATATCAAGTAGACGAAAGACAACTGAGTCTGGCAGCAAAAGTGCCAGCTTGTACAAGAAGATTCATCAAACGGTATGTCATTAAGCTTTCAAAAGGGCTCATCTCTAGTTTAGAGTTACAAGCCACGCCATTCTTTCGTGTATTTCTGGTTCACTGGTTCTATATATTCAGGTTGTGTCCATCTATTTCGCAATCTTACTCTATCATTCTTTTTTCTGAAGGCACATTGGCAAAAATAAGAAAGGTTTAAGGAGGCTACTGCAATCTTCTCGTGATAGCAATTCTTTTAACCGTGCTGCTAGGTTTCCTGATAGTCCTCCTCCATCTTCTTCAGCTCCCTCACCGGCCCCAGCAACACCGCCACCGGTTGAGGAACCAACTTTCACTGACCGAAATGATTCTGCTTCTCCTTCTCCTTCTCTGCCTGAACCGCGCTCTGGCTCATCAGATAGCAGTGGTTCATCAGATAGCAATGTTGTTGCTATTTTGGCTGGAGTTATAGGTGGTGTTGTATTTCTTGTCATTTCAATCATTGGCATATATCTCTGCAAAACAAACAAGGTAGCTACTGTAAAACCTTGGGCGACAGGATTAAGTGGACAGCTTCAGAAGGCATTCATAACAGGTGAATCTTAGCTGTCTATAACTAGTGATGTGGAGCAATGACTGAAAACAGTAGATAACTTGCACACAACCACTAATTCATGAGTCATGAAATGTCACCGTGAGAAAAAAGAAATACTTAACTTTTCAATTTGTCCTCAGTCATCTAATAGATCTAGCTTGATGTTATTTATGTATTGCTTTTACTATTTCTGCCTCTTTACATGAATGACAGATTTCAACATTTTCAGGTGTGCCAAAGCTGAAGAGATCAGAGCTTGAAGCAGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAATTGGCACTTCTTCCATTGGTACAGTGTACAAAGGGACTTTGTCCACTGGTGTTGAAATAGCCGTGGCCTCTGTTGCAGCGACATCATCAAAAGATTGGTCAAAGACTTTAGAAGCCCAATTTAGGAAGAAGGTACTGCCACCTTAAAAGTTAAACGAAATTATTTGTAAACTTGCAACTTAGCAGCTATCCTAACTGACATTTTAAGTAATTGCGGTTTCAGATAGATACATTATCAAAAGTGAACCACAAGAATTTTGTAAATCTTCTTGGACATTGTGAAGAAGACGAGCCTTTCACCAGAATGGTGGTTTTTGAGTATGCCCCAAATGGAACACTCTTTGAGCATTTGCACAGTGAGTACCTATCATTTTGGTCTTATTATTACATAGAAAGTAAATTAATGGTTGAGCATCCCTATCTATGACAATTTTGGTTTTACATACTTCGACATTCTGTTTAACAAGTTTTCATCTGTTGATACTTCATACATTCAGTTGATAGAAGGTTGTTCTCTTGTCCTCTAATCTGATGTTACCCCGTAGTTGGTTAAATTAGGACTAGTATTCTCTCATGCAACATAGCTTGTTAGTTTCTATTTTTTTTCTTTGCTTCCTCAACCAAACAAAGTCACCCTTCCATCCTTCCTCATCTGTCTATCAAGAAAGCCCAAGCATAAGAAACTGTTAATGTTAATCAATGTATTTTATAATGCTTAACACGTCCCCACCCTATTTTCTAGGAATGATCAGAACACTGTTGGTGTAAAGTAGGCTAACCTAGGTTGCTCGATCAGTAACCCTGTAAATAGGTTTAGGTTTTGAATTATATATGTGGGGAATTGAGCTAACAATGCATTGTTATTTATTTGCTTTATGTCTCTCTAGTCTCTACTCCCCGAGTTTACTTCTCTTTCAGAAGCAAGAATAGTTTCTTTTATGGACTTCATTTTGGCATATTCTATTGGTTTTGGAGTAGGAAACTGGCTGATGTATTTAATATTCCTGTGAATTCCAGTAAAAGAAGCTGAGCACTTGGATTGGGAAACAAGACTCAGAGTTGCCATGGGTATGGCTTACTGCCTACAACATGTGCACCAGTTGGAGCCTCCTTTGGTTATTGGCAACCTGAATTCTTCAGCGGTTCAACTCACGGATGATTGTGCTGCCAAAATCTCTGATTTGAGTTTCTTAACTGAAATAGCTTCAGCTGTGATGAAATCTTCTGCTAGACAACACCCTGACATGACCCCAGCAAGTAACATTTACAGTTTTGGTGTTATATTATTTGAAATGGTGTCAGGCAGGCTCCCTTATTCAGTGGACAATGATGGCTCACTTGATGACTGGGCTTCACAATATTTACATGGGGATCAGCCCCTCAAAGAAATGGTGGATCCATCTCTGGCGTCCTTCCAACAAGAACAGCTGGAACAAGTTGATGCTTTGATCAAATCTTGTGTCCACCCTGATCCAAAGCAAAGACCAACTATGAAAGAAATTTGTGTGAGATTAAGAGAGATAACAAAAATAACACCCGAGGCAGCTGTTCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCGGAGCTTGAGATTGCCTCGGTAAATGGAAACTGAAATCAGTTAATCAGGTTGTAAGTATGAAGTTCTTATCCTCATCCTTTTTCAATCGGTGAAGGCACAAAAATGTATTCACCTGTACATTAATACATCCCGTGTTTCATCATAGAAGAGTGGCAAATCACATGTACATAAGGGAGAGATAAAAATGTGATTTTTTCTTTCTTTGGGTGCTCTGTTTGGTTATGGTTTATGGAATTAAACTAACAAAAAAAGCTTCAAATATCAGTTAGTTTCATTTTCGCAGTTTGTTTATTTCGTGACTTACAAATGTTTTCGGTTATATTTCTTATCAGTTACAACCATTGCTCATTCTCTCCTTG