Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21582 LG5 34565409 34566722 PREDICTED: putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 34565441 missense_variant p.Leu428Val
A/G 34565556 synonymous_variant p.Ile389Ile
C/T 34565953 missense_variant p.Arg257Gln
T/A 34566181 missense_variant p.Lys181Ile
A/C 34566187 missense_variant p.Ile179Arg
T/A 34566280 missense_variant p.Tyr148Phe
G/T 34566322 missense_variant p.Ala134Asp
C/T 34566323 missense_variant p.Ala134Thr
G/A 34566430 missense_variant p.Ala98Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21582.1
MANSGASLVHGFASIVENALRSIGGDLGAFPLQDFSLAVENALSSIGGDFGALPVHGFASIVNNAMRSVGGDLGAMPVHGFASAVENAMRSTGGDLGALLVHGFASAVENAMRSTGGDFRALPEHGFASTVENANGDLGMSHSPVPDYQLFSLVELAAATDNFSAGNRICVGSYSVVYIGKLVDGSKVAVERVETGLSRTPEEAFWWRRMSSSTFLPGLRPKNLVGLVGLCAEKDERVLVYECMKNGSLNDHLHDKRINVLNSWEIRIKIALDASRGIEYLHKYGIPYTVHGDIKPSNILLDATWTAKVCNFGKVAGSIGYIDPEYSTFGALTEKSDVYGFGVVLLELLTGKRAAYGQSRKNRGTILHVPFAEAAILGGDFVKILDTRIGEPYLGEAEALELVAHTAMNCVNVVGKFRPTISQVVVNLERALAYFLC*


CDS Sequence:
>Vu_21582.1
ATGGCGAATTCAGGAGCATCCCTTGTGCACGGTTTTGCTTCGATAGTGGAAAATGCTCTGAGAAGTATCGGAGGAGATTTGGGAGCATTTCCTTTGCAGGATTTTTCTTTGGCAGTGGAAAATGCTTTGAGTAGTATTGGAGGAGATTTCGGAGCATTACCTGTTCATGGATTTGCTTCTATAGTGAACAATGCGATGAGAAGTGTTGGAGGAGATTTGGGAGCAATGCCCGTGCATGGTTTTGCTTCGGCAGTGGAGAATGCGATGAGAAGTACAGGAGGAGATTTGGGAGCATTGCTCGTGCATGGTTTTGCTTCTGCAGTGGAGAATGCGATGAGAAGTACTGGAGGCGATTTTAGAGCCTTGCCCGAGCATGGTTTTGCTTCGACAGTGGAGAATGCCAATGGAGATTTGGGAATGTCTCATTCCCCCGTGCCTGATTATCAATTATTCAGCCTAGTTGAGCTTGCAGCAGCCACCGACAATTTCTCAGCGGGCAACAGGATTTGTGTTGGAAGCTATAGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTAGTAAGGTTGCAGTAGAAAGGGTAGAAACGGGGTTGAGTAGAACGCCTGAAGAGGCCTTCTGGTGGAGGAGAATGTCTAGTTCGACCTTTTTGCCCGGTTTACGCCCCAAGAACTTGGTTGGGCTGGTTGGGTTGTGTGCAGAGAAAGATGAAAGAGTGTTGGTGTACGAGTGCATGAAGAATGGATCGTTGAATGATCATTTACATGACAAGCGGATCAATGTGTTGAATTCGTGGGAAATAAGGATAAAAATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAAGTATGGAATTCCATATACTGTTCATGGAGATATCAAGCCTTCCAACATTCTTCTTGATGCTACCTGGACGGCAAAGGTGTGTAACTTTGGGAAGGTAGCAGGAAGCATTGGATACATTGATCCTGAGTACTCAACTTTTGGTGCGTTGACAGAAAAGAGTGATGTGTATGGATTTGGAGTTGTGTTGCTTGAACTTCTAACAGGAAAGAGAGCTGCATATGGGCAAAGTAGGAAAAATAGAGGCACCATATTACATGTACCCTTTGCAGAGGCTGCTATTTTGGGTGGAGATTTTGTGAAAATTTTGGATACAAGGATTGGAGAACCCTATCTCGGTGAAGCAGAGGCTTTGGAGTTAGTGGCTCATACTGCCATGAATTGTGTAAATGTGGTAGGGAAGTTTAGACCAACCATTTCTCAAGTTGTGGTCAATTTGGAGAGGGCTTTAGCTTATTTCTTGTGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21582::LG5:34566722-34568722(-)
TTAAGCAGCGGCTTGATTAATGCCTATTAATTGCTTTTTTATTACACGGCAATAATTTTGTAATATAAATGAGCCACCCACCAAACGACCTTTGAATTCACTTTTCTGCCTCTGCTTTTCTGATCTACCCTTTATCTTCTATATCTTCAGGACTTGGTCTCACATTTTGGTCGTCATCATTTATCAGACTACAAATTCAACTCTGATTTTGTCTCTTCCTCACTCCTCCCTAATAAACTTATTTCCATTTTGGAAGCTACAGGACTCATCTTTCTTAAAAGAACAAGTCAAGTTTGAGCTAAATATATTTACCCATTTCAATGTTTACCACGCTTTGCATTAATGTTTGACATGTGAACATGTTTCACATTCTATTTTATTTCTAGACTTATTATTCGATATATTCTTATCTGCAATATATCCTCTTCATGTCTAATGAGAAGTTCAAAATTTTATTTTCTACGGATAATACTCACACATATACATAATTAGCAGTTCGTTGTGTGCATGGTACAGAATAAATATTTTTTACATTGTTAAAATTATAATTAATAAATAAAATCGAATATATAACTCTTTATAATAAAATTCAGAATAACTAAATGAATTTGATTCTATAAGTTTAATATATATAATACACACCGTGTATGTATATTAGATGATCAAGAGACTTTTTTTTAATTATGAAAGTTGTGAAATGTCCCTTTAAATGAAATAATAAATAAAATATTCAGAATTTTTAATTGGTAAAAGGAGAAGAAGGTGACTTACATTTGTATATTGTATATTCCAATTTTAAATATAAGAATACATTTTGTTGAGAAAATATTCATTATAAATTTATGACTATTACTAACCATATCCCTCAATCCTATCTTTCCGGAATTCATTTTCCGGAACATATTAAAACAAATATTAAATTTTTTTTTCCGGTAGACAATCACCTATCTCTATTATGGAAATAATTTTCTTGAAGGTTTTTGGGGGTGCACCAAGAATTTGATAGGGTGAAGAAAGTAAATTTATTTACGAAGACAGGGGATGTTTGCCCAACCAAGAATGAGTTGATCCGTGTCCAGGCCCATGCATGAGGCCCAGAGAAACACTCGATAAGGAAAAAATAAAATTAAGTAATTTGTTTACAAATGCTTTTTCTACTTTTTAAATGGAAATAATTTGCAGCTTATTTTCAAAATTAAACACTTATAAATTTTAATTTTTTAACATTTAAAAAAATTACGAATAATTTTGTAGTAATTGACCGCATAGTTAAAATTCTTAAATATGAATTTTCATCCCAATGAGTAGGTTGGTTTTTGTTTTAGTAACTTGGGGGGTGGTGGGAGCAGTTGGCCTCAACAACGATGAACGAGGAAACTGCTGGAAGGTTACCCTTGTCTTGGCTCGAACCTTCTCAACAAATTCGCCCTGGCTCAGTCACTGTCAGTGTTTCAGAAAATGACTATATCATATTGTATGACTAAAATAGTAAAAGAAAAAGTTAACTTTTATATTTGAAAAATAAAAAAAAAATAAAGAACAGTGAAGGCTAAATGACGTTAATGTTTATTGGCGTTAGTTTAATTTAGTTTAGGACTTTTGAGGATCTTTGTACAAAGAAAAAAATATTTTAACCTAAACTTTTTACAATATTTTAATATAATATACGTGTATTTTTTTTTACTAATTCATTATGTATTTATTATTATACTAATATATTTAAATCCAATATAATATATGTATTATATTAAAATATGGTAAAACAATCTATATCAACTGTGGATACCTTGTAGAAAAAGAAAAAAAGTATTGCTTTTCTCCCTTGCCCATACAATGGTAGTGCTATTTTTAAAGTCAAATCATCCACCGCCCATTTACAAAGTCGGTGATAATCTTGAGTGATTTTGACTTATATTGTTTCCAGTTGTAGTATTTAATCTTCTGAAAATATATTAGTTTCACAGTTGAGGCAAGAGGAAAAAGAAAAATACATTGCATAT


Gene Sequence:
>Vu_21582(-)
ATGGCGAATTCAGGAGCATCCCTTGTGCACGGTTTTGCTTCGATAGTGGAAAATGCTCTGAGAAGTATCGGAGGAGATTTGGGAGCATTTCCTTTGCAGGATTTTTCTTTGGCAGTGGAAAATGCTTTGAGTAGTATTGGAGGAGATTTCGGAGCATTACCTGTTCATGGATTTGCTTCTATAGTGAACAATGCGATGAGAAGTGTTGGAGGAGATTTGGGAGCAATGCCCGTGCATGGTTTTGCTTCGGCAGTGGAGAATGCGATGAGAAGTACAGGAGGAGATTTGGGAGCATTGCTCGTGCATGGTTTTGCTTCTGCAGTGGAGAATGCGATGAGAAGTACTGGAGGCGATTTTAGAGCCTTGCCCGAGCATGGTTTTGCTTCGACAGTGGAGAATGCCAATGGAGATTTGGGAATGTCTCATTCCCCCGTGCCTGATTATCAATTATTCAGCCTAGTTGAGCTTGCAGCAGCCACCGACAATTTCTCAGCGGGCAACAGGATTTGTGTTGGAAGCTATAGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTAGTAAGGTTGCAGTAGAAAGGGTAGAAACGGGGTTGAGTAGAACGCCTGAAGAGGCCTTCTGGTGGAGGAGAATGTCTAGTTCGACCTTTTTGCCCGGTTTACGCCCCAAGAACTTGGTTGGGCTGGTTGGGTTGTGTGCAGAGAAAGATGAAAGAGTGTTGGTGTACGAGTGCATGAAGAATGGATCGTTGAATGATCATTTACATGACAAGCGGATCAATGTGTTGAATTCGTGGGAAATAAGGATAAAAATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAAGTATGGAATTCCATATACTGTTCATGGAGATATCAAGCCTTCCAACATTCTTCTTGATGCTACCTGGACGGCAAAGGTGTGTAACTTTGGGAAGGTAGCAGGAAGCATTGGATACATTGATCCTGAGTACTCAACTTTTGGTGCGTTGACAGAAAAGAGTGATGTGTATGGATTTGGAGTTGTGTTGCTTGAACTTCTAACAGGAAAGAGAGCTGCATATGGGCAAAGTAGGAAAAATAGAGGCACCATATTACATGTACCCTTTGCAGAGGCTGCTATTTTGGGTGGAGATTTTGTGAAAATTTTGGATACAAGGATTGGAGAACCCTATCTCGGTGAAGCAGAGGCTTTGGAGTTAGTGGCTCATACTGCCATGAATTGTGTAAATGTGGTAGGGAAGTTTAGACCAACCATTTCTCAAGTTGTGGTCAATTTGGAGAGGGCTTTAGCTTATTTCTTGTGCTAG