Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21581 LG5 34560978 34563019 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 34561614 synonymous_variant p.Lys108Lys
T/A 34561669 missense_variant p.Lys90Ile
G/A 34561868 upstream_gene_variant
C/T 34561943 missense_variant p.Arg30Lys
C/A 34561963 missense_variant p.Glu23Asp
C/T 34561979 missense_variant p.Gly18Glu
T/A 34561983 missense_variant p.Ile17Phe
G/A 34562000 missense_variant p.Pro11Leu
C/G 34562015 splice_region_variant&intron_variant
T/C 34562070 upstream_gene_variant
T/A 34562133 downstream_gene_variant
T/A 34562547 downstream_gene_variant
T/C 34562642 downstream_gene_variant
T/C 34562645 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21581.1
MIRSFYDFRRSRVSSFASGVDYVSRSSSSGGTDLETFPVSGFASEAELVAATNNFSLNNKIGAGRLGVVYIGKLVDGREVAIKRVETWQKKKISSIKSALTFLSRLHHKHLVGLVGFCEEKYERLLVYEYMKNGTLYDHLHENGSNALNRWKMRITIALDASRGIEYLHKYAAPLFLHGHVKSSNILLDATWLARVSDFKLCLMSPEAERDYRRIKVGGTVGYIDPEYYDLNTLTAKSDVYGLGVVLLELLTGKKAIFLDGEDEVTLSVHRLVDFAVPAILDPRVGPPGVNEIEALELVAQTALHCVNRKGKDRPSMADL*


CDS Sequence:
>Vu_21581.1
ATGATCAGATCATTCTATGATTTTCGAAGGTCCCGTGTCTCCAGTTTTGCATCGGGAGTGGACTATGTGAGCAGGAGTAGCAGTAGTGGAGGAACAGATTTAGAAACCTTCCCTGTGTCTGGTTTTGCTTCTGAGGCTGAGCTTGTAGCAGCGACCAACAATTTCTCACTTAACAACAAGATTGGTGCTGGAAGGCTTGGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTCGTGAGGTTGCAATCAAGAGGGTTGAAACCTGGCAAAAGAAAAAGATCTCATCAATTAAATCTGCATTGACCTTCTTGTCCCGTTTACACCACAAGCACTTGGTTGGGTTGGTTGGATTCTGTGAAGAGAAATACGAGAGGCTGTTGGTGTATGAGTACATGAAGAATGGTACCTTGTATGATCATTTGCATGAAAATGGTAGCAATGCGTTGAATCGGTGGAAAATGAGGATCACTATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAAGTATGCAGCTCCACTATTTCTTCACGGGCACGTCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCCACTTGGCTGGCAAGAGTGTCTGATTTTAAATTGTGTTTGATGAGTCCAGAAGCTGAGCGTGATTACCGACGAATAAAGGTAGGAGGAACAGTTGGATACATTGATCCTGAGTACTATGATCTAAATACGTTGACAGCAAAGAGTGATGTGTATGGGCTGGGAGTTGTATTGCTAGAGCTTTTAACAGGAAAGAAAGCTATATTCCTTGATGGGGAAGATGAAGTTACCTTAAGTGTGCACCGTTTGGTGGACTTTGCCGTGCCTGCCATTTTGGATCCTAGGGTTGGACCACCGGGTGTGAATGAGATAGAGGCATTGGAGTTGGTGGCCCAAACAGCCCTCCATTGCGTGAATCGGAAAGGTAAAGATAGACCATCCATGGCTGATTTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21581::LG5:34563019-34565019(-)
TTCAAAAATTATTCAATTCGTCCCCAAAAATTTATGTTTATCTACAATATATCAACAAGTTGAAATTCGTTCATAAAAGTTATGACAAATTAATCAATTTGATTTTATAAGCTTTAATTAATCCATTTAATTTTTGTTGAACTATTCATCACTAAATATAACATATATTTTACGATTTAACTTTCTCTTTTTAAGAAGCACCGATTTAACCATTCAAATGTCTCATGTATTGTAAGAATCCCTCGTCAATAGCTTTCATCAATAATGTTATCAATTCCTACAAAATAATCATCTTAAATTCAGAATTTCACACAACAACCTTTATCCCCAAATCATTAATTCAATTCACGTTCTCAACCAACCAATTTATACCACACATCAAATCCAATTAATACAAATCAAAATTAAACCATGATTCTATAACAAGACACAATCAAATTTAATTAATTAACTTTCCTTACTCATTTAATAACACAACATAACTTCTTTGATCTCTAAGCATTCATAAACATAGAGAACATAATATAAACTATCAACACAAAGAAAACTTAGATCAATTTTCATATCTTAATGATCTTAATAAAACAAAGATCACACTACTATAAAAGAATAAAAATAAAAATTTAGTCTATTTAACAAAATAATTAGATGAATAAGTAGGTCTCATAGTCATAAGTGTGCTCCGATAATAGAGAATTAAAAATTCTAGAAACAAAATAGAGGTGGAAGAATACTCTTATTTTTAGAAAAATAATAAATTTTATAAAATGAACTATATTTATTTTTATCAAAACTTTTTAATAATAAGTTATATGATATGAATTGCAATTATCTTAATGTTTAATAAATTTTTTTTTCAATTATCATAATACTTTTTTAATTTAATTCTACTATTTTTAATGTTTTTAATTTAATTTTTTTAATGAGTTAATATGAACCTTTCTGTTTCGGTATATATTTGTGTAGGACCGAGAGACATACCTTTTCTGTCGTAGTCTTCTTATATTTTGATCTATGAATCCCGTGTTCTAAGTTTCTTCTAGTCCGAGCCATGGGAAGGACACCTGTAAAAGACATTCCGACACTCAAATAAGTGACTGACATGATAATATTAATAATGTTCGGTCTGTTACTCATAAACAACTTCTTTATCCTGCAATCAATTATCAATATCTTTAATTAATTTATTGGTTACTTATTTGCTCAAACCATCGACCAATTATAATAACTTAAGTGCAGGCCCAACATCAATAACTTAAGTACTGGCCCAACATTGGATCTGTTTTGACCGTTGACAAAAAGTAACAGACCGAACAATTGTGGATGTTGTCCGTTTTGACCGTTCGACCTATCCCATATACCATACACTTTTTATTTGGTGAAAAATAGAACAAAGTTTTGATATTTTAAAATAAATATTTTAGCATTATTTTAAATTTACATATATTGAAAGGGCAGACATATGGTTTTGATATTTAAAAGCACATTTGTTCTAGAATTAATATATTTTAAAATTTTCTTTGTTTTATTAGTTACTTACCCTTACGCGTAGAAACATATAAGGAAATGTCTTCTTTAACAACTCTTTTTTAACAATTTTTTTGACAACACAGACGTGGTGGCTTATGATGGGTTGGTTTCAAATATTTTTCTAAAAACAAATTCAAACAAACCAATAAAGCAATGACATGTGACCCATTATCAAAAAATTGTTAAAATTTATTGTTAAAATATCAGGATCCAACATATAATACTGTTATAAGGTGAATGATTAATATTGATCTATTGACGAATTGGTATAAACTCAGAAGAACACTAACTTATCTAACTGGTATGCATTGACCAAGAATTATAAGATATTTGTTTCTCTTTATTATAATATCTTATATATGATATTATAAAATTGTCTCGTATATGTTTCCAGACGTCATTTTTCTCTGTACACGGTTTTCAAGAATTCGTCGTGGCCGAGCTTGTATAAGCCGCCAGCAATTTCTCAA


Gene Sequence:
>Vu_21581(-)
ATGATCAGATCATTCTATGGTTCTGGAAGCTCTGTTGATGTGTAGAGAGGTGGGACCATTCAAATGTCTCATGTAATGTAAGAATTTCTCGTCAATAGCTATCATCAATGTTATCAATTGCTAAAAAATAATCATCATAAATTCAGAATTTCACACAACAACCTTTACCCCCAAAGCATTAATTCAATTCACATTCTCAGTCAACCAATTTATGCCATACATCAAATCTAATTAATACAAATCAAAATTAAACCATGATTCTATAACAAGACACAATCAAATTTAAATAACTAACTTTCCTTATTCTACTAATAACACAGCATAACTTCTTTGATCTCTAAACACCCATAAACATAGAGAACATAATATATATCATCAGCACAAAGAAAACTTAGATTAATTGTCATATTTTAATGATCATAATAATACAAAGATCACGCTGCTATAAAAAGAATAAAATAAAAGTTTACTCAATTTAACAAAATAATTAGATGAATAAGTAGGTCTCATAATCATAAGTATGCTCCGATATTCTAACATATGAATAGAGAATTAAAATTTCTAGAAAGAAAATAGAGGTGGAAGAATATTCTTATTTTTAGAAAAATAATAAATTCTATAAAATGAACTATATTTATTTTTATTGAAACTTTGTAATAATAAATTAAATGAGTGTAAATTATAGGTATGAATTGCAATTATCTTCTTAATGTTTAATAACTTTTTTTTTTTCAATTATCATAATACTTTTTAATTCTACTATTTTTCAATGTTTTTAATTTAATTTTTTTAATGAGTTAATATAAACCTTTCTATTGGGTGAAAAATAAAATAAAGTTACATTAGGTCATAACAGAAAAAAAAGTATAAATATTTTTAAATTATTATTTTAGCATTATTTTAAATTTACATATATTGAAAGGGCAGACATATGGTTTTGATATTTAAAAGCACAATTGTTCTAGAATTAATATATTTTGAAGTTTTCTTTGTTTTCTGAAGCAGATTTTCGAAGGTCCCGTGTCTCCAGTTTTGCATCGGGAGTGGACTATGTGAGCAGGAGTAGCAGTAGTGGAGGAACAGATTTAGAAACCTTCCCTGTGTCTGGTTTTGCTTCTGAGGTTTACTCTACCACTGTTTCTGAAGGGTCGCCACCAGTGTTGTCCAATGTCACAGAACATGCTGTTAATAAAGGCTTGTAATTATTCAGCAAGGCTGAGCTTGTAGCAGCGACCAACAATTTCTCACTTAACAACAAGATTGGTGCTGGAAGGCTTGGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTCGTGAGGTTGCAATCAAGAGGGTTGAAACCTGGCAAAAGAAAAAGATCTCATCAATTAAATCTGCATTGACCTTCTTGTCCCGTTTACACCACAAGCACTTGGTTGGGTTGGTTGGATTCTGTGAAGAGAAATACGAGAGGCTGTTGGTGTATGAGTACATGAAGAATGGTACCTTGTATGATCATTTGCATGAAAATGGTAGCAATGCGTTGAATCGGTGGAAAATGAGGATCACTATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAAGTATGCAGCTCCACTATTTCTTCACGGGCACGTCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCCACTTGGCTGGCAAGAGTGTCTGATTTTAAATTGTGTTTGATGAGTCCAGAAGCTGAGCGTGATTACCGACGAATAAAGGTAGGAGGAACAGTTGGATACATTGATCCTGAGTACTATGATCTAAATACGTTGACAGCAAAGAGTGATGTGTATGGGCTGGGAGTTGTATTGCTAGAGCTTTTAACAGGAAAGAAAGCTATATTCCTTGATGGGGAAGATGAAGTTACCTTAAGTGTGCACCGTTTGGTGGACTTTGCCGTGCCTGCCATTTTGGATCCTAGGGTTGGACCACCGGGTGTGAATGAGATAGAGGCATTGGAGTTGGTGGCCCAAACAGCCCTCCATTGCGTGAATCGGAAAGGTAAAGATAGACCATCCATGGCTGATTTGTGA