Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21580 LG5 34553126 34557108 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 34553383 downstream_gene_variant
G/C 34553457 downstream_gene_variant
A/T 34553489 downstream_gene_variant
G/A 34553538 stop_gained p.Arg822*
A/C 34553547 missense_variant p.Trp819Gly
C/A 34553818 downstream_gene_variant
C/A 34553824 downstream_gene_variant
A/T 34553833 downstream_gene_variant
A/G 34553939 downstream_gene_variant
T/G 34553971 downstream_gene_variant
T/C 34554322 missense_variant p.Glu760Gly
T/A 34554747 stop_lost p.Ter618Cysext*?
C/T 34554754 missense_variant p.Gly616Asp
G/A 34554793 missense_variant p.Ala603Val
A/C 34555087 missense_variant p.Val505Gly
C/A 34555222 stop_lost p.Ter460Leuext*?
G/A 34555232 missense_variant p.His457Tyr
C/G 34555260 missense_variant p.Lys447Asn
T/A 34555268 splice_acceptor_variant&intron_variant
T/C 34555273 splice_region_variant&intron_variant
C/T 34555288 downstream_gene_variant
C/T 34555299 downstream_gene_variant
T/C 34555328 downstream_gene_variant
G/C 34555330 downstream_gene_variant
C/T 34555356 downstream_gene_variant
T/A 34555476 downstream_gene_variant
T/C 34555505 downstream_gene_variant
C/T 34555552 downstream_gene_variant
A/C 34555611 downstream_gene_variant
T/G 34555668 stop_lost p.Ter426Cysext*?
T/G 34555784 downstream_gene_variant
C/A 34555868 splice_region_variant&intron_variant
T/C 34555924 synonymous_variant p.Pro395Pro
T/G 34555957 synonymous_variant p.Leu384Leu
T/C 34556003 missense_variant p.Asp369Gly
G/A 34556014 synonymous_variant p.Val365Val
A/C 34556029 missense_variant p.Ile360Met
T/C 34556044 synonymous_variant p.Gly355Gly
T/G 34556065 synonymous_variant p.Ala348Ala
A/G 34556079 synonymous_variant p.Leu344Leu
C/A 34556099 missense_variant p.Gly337Val
C/T 34556102 missense_variant p.Gly336Glu
A/G 34556154 synonymous_variant p.Leu319Leu
A/T 34556197 missense_variant p.Asn304Lys
C/A 34556285 missense_variant p.Trp275Leu
A/G 34556290 synonymous_variant p.Phe273Phe
A/T 34556374 synonymous_variant p.Val245Val
A/C 34556375 missense_variant p.Val245Gly
T/A 34556377 synonymous_variant p.Ala244Ala
G/A 34556453 missense_variant p.Ala219Val
A/G 34556476 synonymous_variant p.His211His
G/A 34556615 missense_variant p.Thr165Ile
G/A 34556722 synonymous_variant p.Leu129Leu
C/T 34556966 missense_variant p.Gly48Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21580.1
MGDATSFWSAVDSPIRSETASNFGASPPHSFASVVDYALRSSCASEAGFRTSRVSSFASGVDYVIRSSSSTGGTDLETFPVPGFTSEVHSTTVAEGSSPVLSNVTEHAVKGLQLFSQAELVAATNNFSLNNKIGAGRLGVVYIGKLVDGREVAIKRVETWQKKKTSSIKSALTFLSRLHHKHLVGLVGFCEEKYERLLVYEYMKNGTLYDHLHENGSNALNRWKMRITIALDASRGIEYLHNYAVPLFIHGDVKSSNILLDATWMARVSDFKFSWMSPEAECDYRRIKVGGTVGYIDPEYYDLNMLTAKSDVYGLGVVLLELLTGKRAIFLDGEDGGTLSVHRLVDFAVPAILAGELVNILDPRVGPPDVNEIEALELVAKTALHCVNRKGKDRPSMADIVICLERALAICYVGFCKEKDERLLVYEKMKNGALLNKVHVFISPRVDARSFSWAVDSAIASESASDMGESRVRSFASVVDSAIRSSSATEADFETSPISCFAFASALTQRIVAARLSQAVSDGIGYVHTRLFTLAELKAATNNFSLHNKIFGAGSISVVHRGKLFDGREVAIKRAETSSKMKEFHELFGYLSLLPCLHHNHLVGLVGFCKEKDKRFLVYEYMKNGALYDHLHDKNNVDKESSVLNSWRMRIKIALDASRGIEHLHKYVVPTIIYRDIKSSNILLDANWTARVSGFESSCFMSPEAEHVFAGMFTAKSDVYGLGVVLLELLTGKKTTFKYGTYRCTRMVNIARHVILDGKMVNILDPRVGAPHGNEEAEALELVAHTAVNCVNLNRKDRPTMTESSQMEPSALVAPPTPFCWIARASSPFQKATPCTSCTLSVLKVVADFHVDVWQKFGASKE*


CDS Sequence:
>Vu_21580.1
ATGGGTGATGCAACAAGTTTTTGGTCGGCTGTGGACAGTCCCATAAGGAGTGAGACTGCCTCAAATTTCGGAGCATCCCCTCCCCATAGTTTTGCTTCGGTGGTGGACTATGCATTGAGAAGTAGTTGTGCTTCTGAAGCAGGTTTTCGAACGTCACGTGTCTCCAGTTTTGCTTCGGGAGTGGACTATGTGATCAGGAGTAGTAGTAGTACTGGAGGAACAGATTTAGAAACCTTTCCTGTGCCTGGTTTTACTTCTGAGGTCCACTCCACCACTGTTGCTGAAGGGTCATCACCAGTGTTGTCCAACGTCACAGAACATGCTGTTAAAGGCTTACAATTATTCAGCCAGGCTGAGCTTGTAGCAGCGACCAACAATTTCTCACTCAACAACAAGATTGGTGCTGGAAGGCTTGGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTCGTGAGGTTGCAATCAAGAGGGTTGAAACCTGGCAAAAGAAAAAGACCTCATCAATTAAATCTGCATTGACCTTCTTGTCCCGTTTACACCACAAACACTTGGTTGGGTTGGTTGGATTCTGTGAAGAGAAATACGAGAGGCTGTTGGTGTATGAGTACATGAAGAATGGTACCTTGTATGATCATTTGCATGAAAATGGTAGCAATGCGTTGAATCGGTGGAAAATGAGGATCACTATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAACTATGCAGTTCCACTATTTATTCACGGGGACGTCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCCACTTGGATGGCAAGAGTGTCTGATTTTAAATTTTCTTGGATGAGTCCAGAAGCTGAGTGTGATTACCGACGAATAAAGGTAGGAGGAACAGTTGGATACATTGATCCTGAGTACTATGATCTAAATATGTTGACAGCAAAGAGTGATGTGTATGGGCTGGGAGTTGTATTGCTAGAGCTTTTAACAGGAAAGAGAGCTATATTCCTTGATGGGGAAGATGGAGGTACCTTAAGTGTGCACCGTTTGGTGGACTTTGCAGTGCCTGCCATTTTGGCTGGAGAATTGGTCAACATTTTGGATCCTAGGGTCGGACCACCGGATGTGAATGAGATAGAGGCATTGGAGTTGGTGGCCAAAACAGCCCTACATTGTGTGAATCGGAAAGGGAAAGATAGACCATCCATGGCTGATATTGTGATCTGTTTGGAGAGAGCATTGGCCATCTGTTACGTTGGGTTCTGTAAAGAGAAAGATGAAAGGTTATTGGTGTATGAAAAGATGAAGAATGGGGCGTTATTGAACAAGGTACACGTATTCATATCTCCACGCGTAGACGCAAGGAGTTTTAGTTGGGCAGTGGACAGTGCCATAGCGAGTGAGAGTGCGTCAGATATGGGAGAATCTCGTGTCCGCAGTTTTGCTTCGGTAGTGGACAGTGCCATAAGGAGTAGCAGTGCTACTGAAGCGGATTTTGAAACATCCCCTATCAGTTGTTTTGCTTTTGCTTCTGCGTTGACCCAAAGAATTGTTGCTGCACGACTATCACAAGCAGTGTCGGATGGGATAGGATATGTTCATACACGATTATTCACCCTAGCTGAGCTTAAAGCGGCCACCAACAATTTCTCACTTCACAACAAGATTTTTGGTGCTGGAAGCATTAGTGTTGTGCACAGAGGTAAACTCTTTGATGGTCGTGAGGTGGCTATCAAAAGGGCTGAAACCAGTTCTAAGATGAAGGAGTTTCACGAGTTATTTGGCTATTTATCCCTTTTGCCCTGCCTACACCATAATCACTTGGTTGGGCTAGTTGGGTTCTGTAAAGAGAAAGATAAAAGGTTCTTGGTCTATGAGTACATGAAGAATGGGGCGTTATATGATCATTTGCATGACAAAAACAATGTGGACAAGGAGAGCAGTGTGTTGAATTCTTGGAGAATGAGGATCAAGATTGCTTTGGATGCTTCCCGGGGAATAGAACACCTTCATAAATATGTAGTTCCAACTATTATTTACAGAGATATCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCTAATTGGACAGCAAGAGTATCTGGTTTTGAATCGTCATGTTTCATGAGTCCAGAAGCTGAGCATGTTTTCGCGGGTATGTTTACCGCAAAGAGTGATGTGTACGGGCTTGGAGTTGTGCTGCTTGAACTTTTAACAGGAAAGAAAACTACATTCAAGTATGGGACATATAGGTGCACACGTATGGTGAACATTGCACGACATGTTATTTTGGATGGGAAAATGGTGAACATTTTGGATCCAAGGGTTGGAGCACCCCATGGAAATGAAGAAGCAGAGGCACTGGAATTAGTGGCTCATACAGCGGTCAATTGTGTAAATTTGAACAGAAAAGATAGGCCAACTATGACAGAGAGCTCCCAAATGGAGCCATCGGCGCTGGTGGCACCACCTACGCCCTTCTGCTGGATCGCGCGAGCTTCTTCTCCTTTCCAGAAAGCGACACCTTGCACAAGCTGTACTTTGTCTGTATTGAAGGTCGTCGCTGACTTCCACGTTGACGTATGGCAGAAGTTTGGCGCAAGCAAGGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_21580::LG5:34557108-34559108(-)
GAAGTTTCCTCTCAATTTTATATTTTGTAATATTCCACAAGTTTAAATTTAAGTCATATGAATGCTCTATTAATGTAGAGAGAGAAAGAGAAAGATAATGCTCCATTAATGAAAGAAAGAGAAAGATTGTTGAGGATAGTGGGGAGGTGTAGAGTATTTTTGAAATAAAAGAAAATAGTGGGAGGTGTAAAGTATTTTTGGAATAAAAAAAAATAGTGTGGAGGTACAAAAGTACTTGGGGTGGTGGAGGGAGCAACACCCCTAAATGAGTCGGGTTGAGTTGGGTCACTAAATGACCAACCCGTAGTGGGTTGAGCCTAGTCAAACCAAATTATCCGTTTTGACAGCTTTATCTATAATCAAAATATAATAAATCAGTTATCAATTAAAATAATAATGTCATATTAAAGAAAATATTTATTTTTTTATTTATAATTTTTCATCGACAAACTATGATATTAATGTAAATTAATAAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAACTATTGGCCGTTTCTGGTTTTTGTCCCTCTTTCAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCAAAACGTTCGTTTTGGCCCTCGAAAACTAAACACTGTTTAAAAATTTGGTCCTTATTTAGCAAAAATTGAGGACTAAAACCAAAATTCCGAGGACTAAAATATTCAAAAATTGTACCTTACTTTGAAAGAGGGACGAAAACCAGAAACGGCCAATAGTTTAGGGACGAAAAACATATTTAACCCATTAATAAATAGGATCCATTGAAAAGAAATAAAGGTAATATTAACTATTGAAAACCTCCTCTTGGATATCGCAGTTGACGCAAGGAGTTTTAGTTGGGCAGTGGACAGTGCCATAGCGAGTGAGAGTGCGTCAGATATGGGAGAATCTCGTGTCCGCAGTTTATTAACCATTGTCCCAATACAATTATCTTCTTAATGTTTATTAACTTTTTTTTTTTCAATTATCATAATACTTTTTAATTTAATTCTACTATTTTGAACGTTTTTAATTTAATTAATTTTTTTTTTCAAATGAGTTAATATAAAACTTTCTATTGGGTGAAAATAAAATAAAGTTACATTAGGTAGGTCATAACAGAAAAATAAGTATAAATATTTTTTAATCATTTTTTAGCAGCATTTTAAATTTACATATATTAAAAGGGCATATATATTGTTTTGATATTTAAAAGCTCATGTGTTCTAGAGTTAATATATTTTAAAATTTTCTTTGTTTTCAGTCGTTGACAAGTAGTTACTTACCTTTACGCGTAGAAACATATAATATTATTATAAGGTGAATGATTAATATTTATGTATTGACAAATTAGTATAAACTCAGAAGAACACTAACTTATCTAACTGGTATGCACTCTTTTAAACTTTCTTTTTTATCTGGCAAAACGATCTTATTGGTACCTTTTAAAGAGAATTTTAGGCGTTGGATCCGTGTTGTTTGTATAACATACAAACATTCACTTAGGTAAGAGAGTGGAAATTTAGAGAAATTGATATGGCTGACATAAGATATTTGTTTCTCTTTATTATAATATCTTATATATAATAACAAATTCTAAATTATAGTAAAGCACTATATCAAATCAACAATTATATTAAAGAATATAATTATGATAAAAGAATACTTTATTATAAATATAAAATTGTCTCGTATATGTTTCCAGACGCCCTTTTTCTCTGTACACGGTTTTCAAGAATTCATCGTGGCCGAGCTTGTATCAGCTGCCAACAATTTCTCAAATGATCACATCATTCATTGGTTCTGGAAGTTTTGTTGATGTGTACAGAGGTGGGACCTATAGATACACGCAGCGTGAGTGACTTAATCTCTATGTAATTTGTAATTAATAATTAAAGTGGATTCTCCCTTCTCATTGCCTTGGAACATTCTCAACTGAGACGCGTAGTGTCTCTGTATAAATATCCAAAGGGAGTTCTTTCAAAGTACATACTTTCACATGGCTCGTTAC


Gene Sequence:
>Vu_21580(-)
ATGGGTGATGCAACAAGTTTTTGGTCGGCTGTGGACAGTCCCATAAGGAGTGAGACTGCCTCAAATTTCGGAGCATCCCCTCCCCATAGTTTTGCTTCGGTGGTGGACTATGCATTGAGAAGTAGTTGTGCTTCTGAAGCAGGTTTTCGAACGTCACGTGTCTCCAGTTTTGCTTCGGGAGTGGACTATGTGATCAGGAGTAGTAGTAGTACTGGAGGAACAGATTTAGAAACCTTTCCTGTGCCTGGTTTTACTTCTGAGGTCCACTCCACCACTGTTGCTGAAGGGTCATCACCAGTGTTGTCCAACGTCACAGAACATGCTGTTAAAGGCTTACAATTATTCAGCCAGGCTGAGCTTGTAGCAGCGACCAACAATTTCTCACTCAACAACAAGATTGGTGCTGGAAGGCTTGGTGTTGTGTACATAGGCAAACTCGTTGATGGTCGTGAGGTTGCAATCAAGAGGGTTGAAACCTGGCAAAAGAAAAAGACCTCATCAATTAAATCTGCATTGACCTTCTTGTCCCGTTTACACCACAAACACTTGGTTGGGTTGGTTGGATTCTGTGAAGAGAAATACGAGAGGCTGTTGGTGTATGAGTACATGAAGAATGGTACCTTGTATGATCATTTGCATGAAAATGGTAGCAATGCGTTGAATCGGTGGAAAATGAGGATCACTATTGCTTTGGATGCTTCCCGAGGAATAGAATATCTTCATAACTATGCAGTTCCACTATTTATTCACGGGGACGTCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCCACTTGGATGGCAAGAGTGTCTGATTTTAAATTTTCTTGGATGAGTCCAGAAGCTGAGTGTGATTACCGACGAATAAAGGTAGGAGGAACAGTTGGATACATTGATCCTGAGTACTATGATCTAAATATGTTGACAGCAAAGAGTGATGTGTATGGGCTGGGAGTTGTATTGCTAGAGCTTTTAACAGGAAAGAGAGCTATATTCCTTGATGGGGAAGATGGAGGTACCTTAAGTGTGCACCGTTTGGTGGACTTTGCAGTGCCTGCCATTTTGGCTGGAGAATTGGTCAACATTTTGGATCCTAGGGTCGGACCACCGGATGTGAATGAGATAGAGGCATTGGAGTTGGTGGCCAAAACAGCCCTACATTGTGTGAATCGGAAAGGGAAAGATAGACCATCCATGGCTGATATTGTGATCTGTTTGGAGAGAGCATTGGCCATCTGTTACGGTAGATCTTATCGTATTATTATGGGTGGATGGCTTCTCAAAAATATAGTTTGGAAATATAAGGGATATGTTAGGGATTTATAATTTTATTTTATATGTGTATTTTATTTTATTTTATCCAACCTTTGCCCCGTCTAAACCATAATCACTTGGTTGGGCTAGTTGGGTTCTGTAAAGAGAAAGATGAAAGGTTATTGGTGTATGAAAAGATGAAGAATGGGGCGTTATTGAACAAGGTGAGCAGTGTATTGAATTATTGGATAAGGAGAATCAAGATTGATTTGGATGCGTTCGGGGGGAATAGAACTAAGTCCCTAATAGTTAATCAAAACTAGATGTCTATCAATACTCTTTAACACTCAGATAAAATGAAAAAAAAAATATATATATATATATAATTATTTCCACGCGGTATATCCGTGTAACACGTATTTATATTCTCCTTTCCTTGCACCTTCTCAACCAATACATGGTACTTAACAGGTACACGTATTCATATCTCCACGCGGTATATCAGTGTAATTGTGTATATAGGTGTTCTACAACATACATAAACTCACTTAGCTAGTGCACGAATAATAATTGAGATGGCTGATATCACAGTAGACGCAAGGAGTTTTAGTTGGGCAGTGGACAGTGCCATAGCGAGTGAGAGTGCGTCAGATATGGGAGAATCTCGTGTCCGCAGTTTTGCTTCGGTAGTGGACAGTGCCATAAGGAGTAGCAGTGCTACTGAAGCGGATTTTGAAACATCCCCTATCAGTTGTTTTGCTTTTGCTTCTGCGTTGACCCAAAGAATTGTTGCTGCACGACTATCACAAGCAGTGTCGGATGGGATAGGATATGTTCATACACGATTATTCACCCTAGCTGAGCTTAAAGCGGCCACCAACAATTTCTCACTTCACAACAAGATTTTTGGTGCTGGAAGCATTAGTGTTGTGCACAGAGGTAAACTCTTTGATGGTCGTGAGGTGGCTATCAAAAGGGCTGAAACCAGTTCTAAGATGAAGGAGTTTCACGAGTTATTTGGCTATTTATCCCTTTTGCCCTGCCTACACCATAATCACTTGGTTGGGCTAGTTGGGTTCTGTAAAGAGAAAGATAAAAGGTTCTTGGTCTATGAGTACATGAAGAATGGGGCGTTATATGATCATTTGCATGACAAAAACAATGTGGACAAGGAGAGCAGTGTGTTGAATTCTTGGAGAATGAGGATCAAGATTGCTTTGGATGCTTCCCGGGGAATAGAACACCTTCATAAATATGTAGTTCCAACTATTATTTACAGAGATATCAAGTCTTCCAACATTCTTCTTGATGCTAATTGGACAGCAAGAGTATCTGGTTTTGAATCGTCATGTTTCATGAGTCCAGAAGCTGAGCATGTTTTCGCGGGTATGTTTACCGCAAAGAGTGATGTGTACGGGCTTGGAGTTGTGCTGCTTGAACTTTTAACAGGAAAGAAAACTACATTCAAGTATGGGACATATAGGTGCACACGTATGGTGAACATTGCACGACATGTTATTTTGGATGGGAAAATGGTGAACATTTTGGATCCAAGGGTTGGAGCACCCCATGGAAATGAAGAAGCAGAGGCACTGGAATTAGTGGCTCATACAGCGGTCAATTGTGTAAATTTGAACAGAAAAGATAGGCCAACTATGACAGAGGTAGTGGCCAATTTGGAGACAGCTTTATCACTTGCCAATGATAACAGAAAAACAGACCATTTGCACTATTTATGACAATTTAATTTTACACAATGTATATACACATGCCATCACTCATTAGAGTATCATGACGCTGAATACTAACATTTTTTGACAATTTTTTTCCAGTGAAAGTTGGGGATCCCTAGCATTGCATTAGTTATTAACATAGTTATCAAACTCGCGAGTTAACTCGTTAACTCGGACGAGTTTACGTTTCTAGTCATGGCTTCCGAGTCAACTCGGAAGCAAACTCGTTTTCCAACTAGAATCGATGGAATCGGATGTGAAATCGGTGGAATGTTCGAACTCGCGAGTTTGTAGTGGTTTGGCGAGTTCGAAAGAAGAAAAATATGAAGCCAAATCAAAGTACGTTTGGAGGGGAAAAATCACCTGGTTAGGGCTCCAATCTTTTAATATTAAGCCCCTTCTTCTTCGTTCTCCTGAGCTACATCATCCTCTCGCCATCGCGTCACTCTCTCTGGCCATCGCACTCGCCGTCGACCATCATCTCGTAGCTGCCACTGGTCGTGTCGCCTTCGCGTCACTCTCTGTGCAGAGCTCCCAAATGGAGCCATCGGCGCTGGTGGCACCACCTACGCCCTTCTGCTGGATCGCGCGAGCTTCTTCTCCTTTCCAGAAAGGTCTGTCGCACCAGTGAAGCTGTGTTTCCCTCCCAACAAAGGAAGTGAGGAGGTGCCGGGTGGCGCAGAAAATGGTGATAAAAGATAGGGTTTTCTTTTTTTACTTTGGGATAGAATGGGTATTAAAAATTAGGGAGGTGCAAAAGAAATAAATGGGGTGCAAGAAGGGGCAGCCCTCTCAATGGACACTCTCCCCTCTCCACACTGCACAATGTTGATTATTATGTGTTTATTTTTTAATTTTGTAGTGAAAAATTAAAATTAGACCATTATGTCTCGATCAAATTTAACAGCGACACCTTGCACAAGCTGTACTTTGTCTGTATTGAAGGTCGTCGCTGACTTCCACGTTGACGTATGGCAGAAGTTTGGCGCAAGCAAGGAATGA