Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21518 LG5 33932135 33935259 wall-associated receptor kinase-like 20
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 33932230 synonymous_variant p.Cys32Cys
C/G 33932419 synonymous_variant p.Val95Val
G/T 33932594 missense_variant p.Ala154Ser
T/G 33933116 downstream_gene_variant
T/C 33933166 downstream_gene_variant
A/G 33933181 downstream_gene_variant
C/T 33933194 downstream_gene_variant
T/G 33933331 downstream_gene_variant
T/A 33933554 downstream_gene_variant
G/A 33933716 downstream_gene_variant
C/A 33933867 downstream_gene_variant
A/G 33933869 downstream_gene_variant
T/A 33934151 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21518.1
MEFTTRHFVLAIMLLMLSRAPHVSPATPCPACGNTTVPFPLSTTSTCGDPLYKIRCSSGTLIFDTLNNSYPIESIDAKSQRLVIRPAALVQNTCVSTDKVHQGIQLNSTLPFNITSSNTIVYLNCTLTLLQSPLNCSAASACNAYINATASASACQSGLCCTYRTGGSSNSYMIRVRDSGCSAYSSFVNLNTAQPVSRWTEPGLEIQWLSPRETVCGSQEDCDSATSTCGPDASSTSGIKRCFCHDGLVWNPIQGVCAKKITCQNPDGCGDSTNKKVIIAGSVCGAGAAIILAIIAFLFYKRHKRIKEAQARLAKEREGILNASNGGRAAKLFSGKEIKKATNDFSNDRLLGVGGYGEVYKGFLQDGTAVAVKCAKLGNPKGTDQVLNEVRILCQVNHRNLVGLLGCCVELEQPILVYEFIENGTVLDHLQGQIPKGRGSLSWTHRLEIAHMSHISTCAQGTLGYLDPEYYRNFQLTEKSDVYSFGVVLLELLTAQKAIDFNRAPDDVNLAIYVHRMMEEELLMDVIDPVLKNVANTIELETMKAVAFLALGCLEEKRQNRPSMKEVAEEIEYIISIITSAKVV*


CDS Sequence:
>Vu_21518.1
ATGGAGTTCACCACCAGACACTTCGTTTTGGCAATTATGCTGCTGATGCTATCACGCGCCCCGCACGTGTCCCCCGCCACACCGTGTCCCGCGTGTGGCAACACCACGGTGCCGTTTCCCCTCAGCACCACCTCGACATGCGGCGATCCGCTGTACAAAATTCGGTGCAGCTCCGGCACACTCATCTTCGACACGCTGAACAACTCGTACCCGATCGAGTCCATCGACGCGAAATCGCAGCGCCTTGTGATACGGCCTGCTGCGCTCGTGCAGAACACGTGCGTCTCCACCGATAAGGTGCACCAGGGGATCCAGCTCAACAGCACCCTCCCCTTCAACATCACCAGTTCCAACACCATCGTCTACCTCAACTGTACCCTCACGCTCCTTCAGTCCCCCCTCAACTGCTCCGCAGCTAGCGCCTGCAACGCCTACATCAATGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCTGCCAGAGCGGCCTCTGCTGCACCTATCGTACTGGCGGCTCCAGCAACTCCTATATGATTCGCGTAAGAGACTCTGGTTGCAGCGCCTACTCCAGCTTCGTTAACCTCAACACGGCTCAACCTGTGAGCCGCTGGACCGAACCAGGTTTGGAGATTCAGTGGCTCTCGCCCAGAGAAACCGTTTGTGGATCCCAGGAGGATTGCGACTCTGCCACGTCGACTTGTGGGCCCGACGCCTCCTCTACGAGCGGGATCAAGAGGTGCTTCTGTCACGATGGGCTCGTGTGGAACCCCATCCAAGGGGTGTGTGCTAAAAAAATTACATGCCAGAACCCAGACGGTTGTGGGGATTCAACTAATAAAAAGGTCATAATCGCAGGTTCAGTATGTGGGGCTGGAGCAGCAATCATCCTTGCCATCATTGCCTTTCTATTCTACAAACGCCACAAGCGCATCAAAGAAGCACAAGCCCGGTTAGCCAAAGAGCGTGAAGGAATTCTGAATGCCAGTAATGGGGGAAGAGCCGCTAAACTTTTCAGTGGCAAAGAGATAAAGAAAGCCACAAACGACTTCTCCAATGACCGACTTCTTGGTGTCGGGGGCTATGGTGAAGTTTACAAGGGCTTTCTTCAAGATGGTACTGCTGTGGCTGTCAAGTGTGCCAAGCTTGGCAACCCCAAAGGCACTGATCAAGTCCTTAATGAGGTTCGCATATTATGCCAAGTTAACCACCGAAACCTTGTCGGTCTACTTGGTTGCTGCGTGGAACTGGAGCAGCCTATTTTGGTTTATGAGTTCATAGAAAATGGTACCGTTCTTGATCACTTGCAAGGTCAAATTCCTAAGGGCCGTGGTTCGCTTAGTTGGACTCATCGCCTTGAAATTGCACATATGAGTCATATCTCCACTTGTGCTCAGGGGACCCTTGGGTACCTTGATCCTGAGTATTATAGAAACTTCCAATTGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTGGTGCTTCTTGAGCTTTTGACAGCTCAGAAAGCAATAGATTTTAACAGGGCACCAGATGATGTGAACTTGGCAATTTATGTTCATAGAATGATGGAGGAGGAACTGTTGATGGATGTCATTGATCCAGTGTTGAAGAATGTAGCCAACACTATAGAGCTAGAGACTATGAAGGCAGTGGCATTTCTGGCATTGGGCTGCTTGGAGGAAAAGAGACAGAACCGACCTTCAATGAAAGAGGTAGCAGAGGAGATTGAGTATATCATCAGTATTATTACCTCAGCAAAGGTAGTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21518::LG5:33930135-33932135(+)
ATAATTAGAACATGACTACAGAAAAAGTTTATAACAGTTAACTGCACCAATTGAATCAAAACCCTTGCATCATGTAAACACAAGGATTATTATTGAGAAAACAATTAAAAATACGTAAAGTAATGTTTTATAATGAAATCAGTTAACTTTTATCATTAATACTATTATCTCCCCTTTTCTTTTCTTTTATAAAACCTCACAATCCTTTTAAATTAAAAAAATATTGAGATTTAACATACATATATTATTAAATACATGCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGCTCTCACGTATTTTATATAGGAAATAATTCCTTCCTAACATTGAATTTTTGCAAGACTTTGAATTCGACGCATTTCTTTAAAAAAGAAACAAAGCATAATGCAATTCAAAATTAAAAAAAAAATGCCTTTAGTCAAGAAAGCAAACATAGAATAACACGTTGAGTACTGTTTTGGCAACACCCAATAAACTATAAACTCTACAGTTTGTGCAAATAAAATACAGTGATAAAAATAGTTGCAAATAAAATACAATGATAAAAATAGTAGTAAAATGATGCTACGGTTGATAGCATTATTGGAAAAAAAATCAATCATAAACACAAAAGTCAACTTCAAGAAATATATTCTCTTTTGTTTTCTCCTACAATCTTCACTAAATTATCAATTTAGATTTTCAAAGTGTACTATTTACAATTAAAAAAATATTTCAAATTTTTTATTAAAATTCTTAAAGTTAACGTTTTATTATTACTTTGTCCAAAAACATGTTCATGCTGTTGTTTAAAATTTGAATTAAAAAAGTTACATAATTATATTTTAAGGACTAATATAAATATGCATTTTTAAATATTAAGAAAGTAGTTTCCTCATCATTAACTACTGAGTGCATAAAGTAATCAGTGTACAATGATCTATATTTGAGAATTGGATTTGTTTGTTTGGTTCTACTAAATGCCTGTAATTCTAAAATATCAAAGTATTTCAGAATTGATTTTTTAAAATTCAAACTTAAATAATTTTAAAATAAATAAAATTACATATATTCGAATACTTCACTTAAAGGTATTATTAATTTTTATAAGCATATATGAAAAACAAAAAAAAATACTATAAAGTAGGGTTTAAATAAAAAATGTGGACAACTAGCTTTATAAATGGTGGGTTAAATTTTATTGGTTTTGAGTGACTTTTTATTGCCACAATTTCAGGTATAATCTCTTATTAAATAGTGAGATTATTATCAGTTTAAGTCAAATGTAATTGTAATTAGTGGATTTTTTTTTTAATTTTGATGATCAAAGCTTCTATATAAATTTAATCATTTTTAATAAAAATAGAGTTTTTATTCATAAAAGTAGAGTTTATTTATTTTATTTTAGTTAGAATTATTTTTTTAAGTTTATAAGTCATTCAAGAATATTTTGACTGTGTTAGATGACTTTCTTATCTTTTGTACGTTCACCCTCTTAAAAAGAATGATTTTTTTTTTTCATCTTTAATATTCACCTATTGTTTTTCGTTGACCCGAAATTCAAAAATTCACTTTTGTCCAAAATTATTTTGTAGTTATATCTCTCTCGTTCTATCAGAACAAATTAAGTAATTCTCCAACTTAACTTGAAATTTAAAACGTAAATCTTTTTCTCATTTTTGAAATTCTCTCAATTAAAGTTATATAATTCCATATATCTGAGTTTCTTAGATAGTGTGTAACCTAAATTTCCGTAAACTTTTTAATTCACCTTCTCATTAATTTTTCAAATTCAATTCAAAGTTCTAACCCTATAAATAGTGAAAAGGGTTTCATCAAGTATATTTATCATATTGAGTTGCAGTATTAAATACAAAGTTATATTAAATAAAATATAAATTTAAGAAAGTTAATGAATTAACATGACAGTATTTAAGAAGGCAGAAGCAGCAGTTTCAACTGCCAGCTTTGCCACCAA


Gene Sequence:
>Vu_21518(+)
ATGGAGTTCACCACCAGACACTTCGTTTTGGCAATTATGCTGCTGATGCTATCACGCGCCCCGCACGTGTCCCCCGCCACACCGTGTCCCGCGTGTGGCAACACCACGGTGCCGTTTCCCCTCAGCACCACCTCGACATGCGGCGATCCGCTGTACAAAATTCGGTGCAGCTCCGGCACACTCATCTTCGACACGCTGAACAACTCGTACCCGATCGAGTCCATCGACGCGAAATCGCAGCGCCTTGTGATACGGCCTGCTGCGCTCGTGCAGAACACGTGCGTCTCCACCGATAAGGTGCACCAGGGGATCCAGCTCAACAGCACCCTCCCCTTCAACATCACCAGTTCCAACACCATCGTCTACCTCAACTGTACCCTCACGCTCCTTCAGTCCCCCCTCAACTGCTCCGCAGCTAGCGCCTGCAACGCCTACATCAATGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCTGCCAGAGCGGCCTCTGCTGCACCTATCGTACTGGCGGCTCCAGCAACTCCTATATGATTCGCGTAAGAGACTCTGGTTGCAGCGCCTACTCCAGCTTCGTTAACCTCAACACGGCTCAACCTGTGAGCCGCTGGACCGAACCAGGTTTGGAGATTCAGTGGCTCTCGCCCAGAGAAACCGTTTGTGGATCCCAGGAGGATTGCGACTCTGCCACGTCGACTTGTGGGCCCGACGCCTCCTCTACGAGCGGGATCAAGAGGTGCTTCTGTCACGATGGGCTCGTGTGGAACCCCATCCAAGGGGTGTGTGCTAAAAGTGAGTTGTACAGGATTATACCCCTTCTCCTATTTCTTCTTACGTTGACTAAGTTTGGAATTCCGGTTTGACTTTTTATGCAGAAATTACATGCCAGAACCCAGACGGTTGTGGGGATTCAACTAATAAAAAGGTCATAATCGCAGGTATTAGTTTCGCCTTTTTGTTTTCCTTTTTAATCTCTCATTTTTATTTTACAAAAATATTAACTTGATTTTTAGAATATGAACCAGTTTAATAGACATAATGCATGTTTAGATTAAAGTTTATTGATGTATGGTCGGTGAATTACTAGTCGAGTTTGGATTAAAACGACGGTATTATTTTCATTATCAAATATGATGAGCTTGTAAGCGTAATTTGAAGTAACATATCTCAGTGAGTTTACTGAGAAATGTCATTTAAAAGAGGCCAAACGTTAAACCGAACAAAACACAACCGGATGTCGTCAGTATAAAAGAAGTTATATTATCAATTATCGGAAGTCATGTTTAATATAATTTAAGATAATTTTTTTTGTTAATTTTAAAAGATTTATCCTATTGTGATTAGAAGATAATGTATAACCTTGTTAATTAACATCAGCACATGTATTATTAATGTAACTTCTGGATTTTTTTTAGGAAAAAATGTAAATTTTTTAAGTCTATAATAATATATATTTGGATGACAATTGAAAAATTAATTGCGAGAGGATTCTAACTAAATTTTATGTATGAATATGGTATTGTTTAATAATAAGCCTTCTTGGTTTGCTATTTGTTAGAGGTGATTTTGTTTTGACATCTCTTTTTCATAGTCTGGACTAGTTGTAACACGGATTTCTTAAAAAAAGTCAGGGATGTTTCGTGCGGATAATTGGTCGTGCACTACATGATAGGTGAACACATAATTCATATACAACGAAATTGTTGAAAAAGTGCATTAATGACGGCATGTGAATTGAGTCTTTGTCAATAATGAAGGTCTGACTAATATAAATTGCATAGATAACAGTTGGAAGTTAAATACAGGTCAAAGAATCAACCTACCCAAGCATTGTGAGTTAATAGAAGAGATAAAATTTTAATTTGCGTGTAAAGAACTAAATAAATATGTACCGGTACATTTTTGTGTGAATTTAGAGCTGATAAATTGCTGGTATATTTCATCCATTGAAGAAAAGAAAAATATGTTCTCAGTATCCTTGATGAGTGAAAACTTGACCACGATTCTGAACAATGGTTCTTGTGGCCTCTTTCGTATGATGCACTATTTATTTACAATTTGATGGTAACAATGTGCAGGTTCAGTATGTGGGGCTGGAGCAGCAATCATCCTTGCCATCATTGCCTTTCTATTCTACAAACGCCACAAGCGCATCAAAGAAGCACAAGCCCGGTTAGCCAAAGAGCGTGAAGGAATTCTGAATGCCAGTAATGGGGGAAGAGCCGCTAAACTTTTCAGTGGCAAAGAGATAAAGAAAGCCACAAACGACTTCTCCAATGACCGACTTCTTGGTGTCGGGGGCTATGGTGAAGTTTACAAGGGCTTTCTTCAAGATGGTACTGCTGTGGCTGTCAAGTGTGCCAAGCTTGGCAACCCCAAAGGCACTGATCAAGTCCTTAATGAGGTTCGCATATTATGCCAAGTTAACCACCGAAACCTTGTCGGTCTACTTGGTTGCTGCGTGGAACTGGAGCAGCCTATTTTGGTTTATGAGTTCATAGAAAATGGTACCGTTCTTGATCACTTGCAAGGTCAAATTCCTAAGGGCCGTGGTTCGCTTAGTTGGACTCATCGCCTTGAAATTGCACGTCAGACTGCTGAGGGTCTTGCTTATCTTCACTTCATGGCTGTGCCTCCTATCTACCACAGAGATGTCAAGTCTAGCAACATTCTGCTAGATATCAATCTGAATGCCAAGGTTTCAGATTTTGGGTTGTCTAGATTGGCCCAGACAGATATGAGTCATATCTCCACTTGTGCTCAGGGGACCCTTGGGTACCTTGATCCTGAGTATTATAGAAACTTCCAATTGACTGAGAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTGGTGCTTCTTGAGCTTTTGACAGCTCAGAAAGCAATAGATTTTAACAGGGCACCAGATGATGTGAACTTGGCAATTTATGTTCATAGAATGATGGAGGAGGAACTGTTGATGGATGTCATTGATCCAGTGTTGAAGAATGTAGCCAACACTATAGAGCTAGAGACTATGAAGGCAGTGGCATTTCTGGCATTGGGCTGCTTGGAGGAAAAGAGACAGAACCGACCTTCAATGAAAGAGGTAGCAGAGGAGATTGAGTATATCATCAGTATTATTACCTCAGCAAAGGTAGTGTAG