Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21504 LG5 33777076 33777938 PREDICTED: probable transcriptional regulator RABBIT EARS
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 33777151 missense_variant p.Cys233Arg
A/T 33777204 missense_variant p.Leu215His
T/C 33777246 missense_variant p.Gln201Arg
G/A 33777256 stop_gained p.Arg198*
T/C 33777398 stop_lost p.Ter150Trpext*?
C/A 33777831 missense_variant p.Glu36Asp
G/C 33777862 missense_variant p.Ala26Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21504.1
MEDSQYLLWFKRKQILNSHIQQPFGARITNTNSSWEERAFAEDAARILGGCIWPPRSYSCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLKQSLGHPNESLQHLHKNDCSAAASKASSSRPSTISTQENCYHQPTMSPYSPSFSWGHHHMGSSDSEPKGSAVNGREQFLKGSGCNDYVETSLSVGQSSVFGQKLPIESYGDEAISYKRSKTSMPPLPVFHKPCSSDRHLTFHSAEFVLGLKPGMEDLDLELRLGKPQKVI*


CDS Sequence:
>Vu_21504.1
ATGGAGGATTCTCAGTACTTGTTGTGGTTCAAGAGAAAACAAATCTTGAACTCACATATTCAACAACCGTTTGGAGCCCGCATCACCAACACCAACTCATCATGGGAGGAAAGAGCTTTTGCAGAAGATGCTGCTAGGATACTTGGTGGGTGCATATGGCCTCCAAGATCATACTCTTGTAATTTCTGTAAAAGAGAGTTTAGGTCTGCTCAGGCTCTAGGGGGACACATGAATGTTCACAGGAGGGACAGGGCTAGGCTCAAACAAAGCCTTGGTCACCCTAATGAATCCCTTCAACATCTTCACAAAAATGATTGTTCGGCTGCAGCAAGCAAAGCCTCATCTTCTAGGCCCTCAACTATATCCACTCAAGAAAATTGTTATCATCAACCTACCATGTCTCCTTACTCTCCTTCGTTTAGCTGGGGACATCACCACATGGGGTCTTCTGATTCAGAACCAAAAGGGTCTGCAGTGAATGGAAGGGAACAGTTTTTAAAAGGTTCGGGTTGCAATGATTATGTTGAAACAAGTTTGTCTGTGGGACAAAGTTCAGTGTTTGGCCAAAAGTTACCAATTGAATCATATGGGGACGAAGCTATCAGTTATAAAAGATCAAAGACTTCTATGCCTCCTTTGCCTGTCTTCCACAAGCCATGTTCAAGTGATAGACACCTAACTTTTCATTCTGCAGAATTTGTACTTGGACTCAAGCCTGGAATGGAAGACTTAGATCTTGAACTCAGGCTGGGGAAGCCACAGAAAGTTATTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21504::LG5:33777938-33779938(-)
TTCAGTGAGTTATTGATTTACATGCTGGATTTGGTACGGATGAAGGCTTTTCATCCATTTTCTTTATTGCAATAGCAGATATGTTGATCGTGATTGATCATAAGTTTTGGAAAAGCAATTACATTATAAATTACGACAGTGTATTGCTGTTGAAATTCAATATCAAATAATATTATATATTTATATTTAGCTGTCGTATCTTAATTCCAGATCCACGTGTGCAGGAACACTAGCATGAAAACATAGGTAGCAGCTCCATTGCCTTATGTCAGCAAAAATGGTAGCTAGGCACATCCTTCTTCACTTGGTCACTTGTGCAAGTCATTAGTTCTTGCTTGAGAACAAGGATTAGGTACTAATAATGTTAATTTCAATCACTAGCTTGTGGGGCTCGGAGTGCATAATTAAATTATACTGATTAGTCTAACCAATAATTGAAATCGTTCTTAATAAATAGGCCCTTGGTAACTATATTCTTCCTCAACAAAGTCCACTAAACATTAAAGAAATAAAAATGACAAAGAACCTAAAAATTAGTTAATACCAATTTGCTGTGCATGATGACACGGATAATTCGTTTGAAAACATAGCCAAATGAATATACATTATAATTGGAAGAAGCCAATTCACTACCAAATATAAAAATCCAGATGTTTCAACATTTGAAAGATAAACAAAAAATTTTTCTTATTAGCTTCCTTTTTTTAATCTTTATTTATTGTTTCTTATACTGCTTTAGAAGAATTGAGTGAAATCGAATCAACTTTGGGCTACCGATTTAATCTGCCCTGAATTGACTAGTTCGTGTGTTTGTCTCAATCGTGTGTGACTGTGTGAGTGAGAGACAGGGAGAAAAAACTCAATCATACATCATTAATTTGACTTCTTAATTTGACTTGTTAGCTTAACGTGATCTGGGAGAAAAAGCCTAAAAGATTCTTTGTGTGTTTCTGAAAGACAGATGCAAGAGGAAAAGGTGTGTAGATAATCCAAACAAAGCGGTGGCTCTTATATAGCTCCTTCTCAAACTTAATATATCATTTGTTCATGCCTTCAACATTAATATTCAAAGAAATTGTCATATATACACTGTATTTTTCTGAGCTTTAGCAATAACTCAAAAGTAATTAGTTGCCCTTTTCTGTTGGCAATTCGTTTGTTGAGTTTCCATGCACGTCGTTTAATTGATATTGGTATATAACATTTAAAGTGTTACGAACATAATTTATTGTTTGCTTTTGGTGTAAAACCTTTGGTGAAATACAACCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGTAATTAAAAATGGCTACAACATTACAAGATGTACGAAGTATTGTTTTATAGAGATTTTGTTTGTTTTGTTTAATCTGTTTGTTCCTCACATGCAATTTGTGCTCTTTATAGTGGTGAGGGACATGGAGTAATGAATAAAGTAGTTACTATAGTGGAACAGAAATACTAGACACGAGTTTAAATGAGTGGTACTTTGTGTGCGTGCTACATAGTAGAAGTTATTATGAGAACACTGGACAGTGTAACAGTATTACGTACCATGCATATGGGTTTGGTGGAAGCTTCAGAGAAACAGTTTAAATGTATTTTCTTACTCTCATAACCGTTATCTCCATCATCCGTGTGAATCAAGATGCTAGACAGTTGCATAAATGGGACCCTCCCGAGACTGTGTTGCAAGTAAACCAAGCAAAAAAACAACAGAAAAGCTTCAGTACTAAAGGCAAGACACAGGGCTTATAACAAGGCCTTTTCAGATAACCTTTTTCTCTTCCCCCATAGATTCTTAGGTTGCTTTCAAATATAATAATAACCAGGACATGCAACCCTAAACTATTCATATTCAACTCCCTCCCTAGCCAGCCTTTAATTTTCTCTTTATATAAAGCTTCTTCCACCTCATCTGTTTCTCACTTTCATTCTTATCATCTCCCAACAGGTTTAATTCTCCTTGCCACTCATAAAC


Gene Sequence:
>Vu_21504(-)
ATGGAGGATTCTCAGTACTTGTTGTGGTTCAAGAGAAAACAAATCTTGAACTCACATATTCAACAACCGTTTGGAGCCCGCATCACCAACACCAACTCATCATGGGAGGAAAGAGCTTTTGCAGAAGATGCTGCTAGGATACTTGGTGGGTGCATATGGCCTCCAAGATCATACTCTTGTAATTTCTGTAAAAGAGAGTTTAGGTCTGCTCAGGCTCTAGGGGGACACATGAATGTTCACAGGAGGGACAGGGCTAGGCTCAAACAAAGCCTTGGTCACCCTAATGAATCCCTTCAACATCTTCACAAAAATGATTGTAAGTCACCAAGTGCTCAATTTTCTCAAGAGATGGAGCTTCTCTCGTCTAGATATTGTTGCCTTATATAATTACTCTAACCCTTTCAGGTTCGGCTGCAGCAAGCAAAGCCTCATCTTCTAGGCCCTCAACTATATCCACTCAAGAAAATTGTTATCATCAACCTACCATGTCTCCTTACTCTCCTTCGTTTAGCTGGGGACATCACCACATGGGGTCTTCTGATTCAGAACCAAAAGGGTCTGCAGTGAATGGAAGGGAACAGTTTTTAAAAGGTTCGGGTTGCAATGATTATGTTGAAACAAGTTTGTCTGTGGGACAAAGTTCAGTGTTTGGCCAAAAGTTACCAATTGAATCATATGGGGACGAAGCTATCAGTTATAAAAGATCAAAGACTTCTATGCCTCCTTTGCCTGTCTTCCACAAGCCATGTTCAAGTGATAGACACCTAACTTTTCATTCTGCAGAATTTGTACTTGGACTCAAGCCTGGAATGGAAGACTTAGATCTTGAACTCAGGCTGGGGAAGCCACAGAAAGTTATTTAG