Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21472 LG5 33430708 33433936 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase CDL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T,* 33431180 synonymous_variant p.Arg444Arg
A/G 33431242 missense_variant p.Phe423Ser
G/A 33431249 synonymous_variant p.Leu421Leu
C/T 33431251 missense_variant p.Ser420Asn
T/C 33431371 downstream_gene_variant
G/T 33431395 downstream_gene_variant
T/A 33431471 downstream_gene_variant
A/T 33431472 downstream_gene_variant
T/A 33431707 downstream_gene_variant
G/C 33431956 synonymous_variant p.Gly379Gly
A/G 33431963 missense_variant p.Ile377Thr
T/G 33431964 missense_variant p.Ile377Leu
A/T 33432314 downstream_gene_variant
G/A 33432371 missense_variant p.Ser315Phe
A/G 33432380 missense_variant p.Ile312Thr
G/T 33432695 synonymous_variant p.Val235Val
C/A 33433555 missense_variant p.Gly65Val
G/A 33433686 synonymous_variant p.Ser21Ser
G/A 33433772 5_prime_UTR_variant
G/A 33433777 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 33433782 5_prime_UTR_variant
G/T 33433785 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 33433825 5_prime_UTR_variant
G/A 33433863 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 33433886 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21472.1
MGLSQGPCTDSRDLSNAQTSSPLVVDHYCDYNKLKFRTLLRKMIWEFGLACVANPSRRRRGSERGLGDGKKTNLEHNKAWLLAESGGCGAELSNADPQSVHSSFRFSFCSQVELESLNMSSSSAATVLMVNLDNGVSESRAKEIKWRRMESLEKSISPVAHSLIRFCYGEILSATRNFSKGRVLGRGALSCVFRGRVGLLRTAVAIKRLDKEDKESAKAFCRELMIASSLHSSNVVPLVGFCIDPEEGLFLVYKYVSGGSLERHLHGRKKGSSPLPWSVRYKVAIGIAEAVAYLHSGTERCVVHRDIKPSNILLSSRKTPKLCDFGLATWTSAPSVPFLCKTVKGTFGYLAPEYFQHGKVSDKTDVYAFGVVLLELITGRKPIEARRPSGEENLVLWAKPFLQKGKGAIEELLDPQLKCSLRFSNQMGRMIDAAAACVTNEESRRPGIREIIAILKGEEEPLLSRRKKSSFLGNGCVIDCYSQLQQTNNEMKSHLALAMLGVAEFEDDDYLYGR*


CDS Sequence:
>Vu_21472.1
ATGGGTTTATCCCAAGGACCCTGCACTGATTCCAGGGACCTTTCCAATGCACAAACCTCTTCCCCCTTAGTTGTAGATCACTACTGTGACTACAACAAGCTCAAATTCAGAACCTTGCTCAGAAAAATGATCTGGGAATTCGGTCTTGCCTGTGTGGCCAACCCTTCCCGGCGCCGGAGGGGCTCCGAGAGGGGACTGGGCGATGGCAAGAAGACGAATTTGGAACACAACAAGGCTTGGTTGCTCGCGGAGTCTGGTGGGTGTGGAGCAGAATTGTCCAATGCTGACCCTCAATCGGTTCACTCCTCTTTCAGGTTCAGTTTCTGTTCTCAGGTTGAGTTGGAGTCCCTCAACATGAGTTCTTCCAGTGCTGCGACCGTTTTGATGGTTAATTTGGACAATGGGGTGAGTGAATCTCGCGCCAAGGAAATCAAATGGAGGAGAATGGAGTCCTTGGAGAAGAGCATATCCCCTGTGGCTCACTCCTTGATCAGGTTCTGCTATGGTGAAATTCTCTCTGCTACTAGGAATTTCTCCAAGGGGAGGGTGTTGGGGAGAGGGGCATTAAGCTGTGTTTTTAGGGGGAGAGTTGGCCTTTTGAGGACTGCTGTGGCAATCAAACGGTTGGACAAGGAAGACAAGGAATCTGCCAAGGCCTTCTGCAGAGAATTGATGATTGCTAGTTCTCTTCACAGTTCAAATGTCGTTCCCCTTGTGGGTTTTTGTATTGATCCCGAGGAGGGTCTGTTTTTGGTGTACAAGTATGTCTCAGGGGGCAGTCTGGAGCGCCACTTGCATGGAAGGAAGAAGGGTAGTTCACCTCTTCCTTGGTCTGTGAGGTACAAAGTTGCAATTGGGATTGCTGAAGCTGTGGCTTATCTGCATAGTGGGACTGAAAGATGTGTTGTGCATAGAGATATTAAGCCCTCAAACATTCTGCTTTCTTCAAGGAAGACTCCCAAGCTATGTGATTTCGGATTAGCTACATGGACTTCTGCACCTTCAGTTCCTTTCCTTTGCAAAACCGTCAAAGGAACATTTGGATATTTGGCTCCTGAGTATTTCCAACATGGGAAAGTATCGGATAAGACTGATGTATATGCTTTTGGAGTGGTTTTACTGGAACTCATTACTGGCCGGAAGCCAATTGAGGCAAGAAGACCTTCAGGAGAAGAAAACTTGGTGTTATGGGCCAAACCTTTTCTACAGAAAGGGAAAGGTGCCATTGAAGAGTTGCTTGATCCTCAACTCAAGTGCAGTCTGAGATTCTCAAATCAAATGGGTAGAATGATTGATGCAGCAGCTGCCTGTGTCACTAATGAAGAATCTCGGAGACCTGGCATACGTGAGATTATTGCAATACTGAAGGGTGAAGAAGAGCCTCTTTTATCCAGAAGAAAGAAATCCAGTTTTCTTGGAAATGGATGCGTGATTGATTGTTATTCTCAGTTACAACAAACAAATAATGAGATGAAAAGTCACTTGGCTTTAGCTATGCTAGGAGTTGCAGAGTTTGAGGATGATGACTATCTCTATGGTCGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_21472::LG5:33433936-33435936(-)
AATACTCCAACTCCACGTGCATTGTATTATTCCAAAATAAGCTCAGTACAACTGTCAAAAATTAAATTATATATTCATGATTAATTCTAATATAATTAGTTTTTATAACTACAAATTTATTAAAAAGGAAAGTTTAAGATAATTATTTTATTTGGATATAATAAAAAACAGTTCTATAAAATGAAAATGTACATATAAGATTGGAAAGAAAAAATGTTAAAAAAATATAGTAAACAGTTATTCTAAACATATATTATATTTTCGTTTACAAATTTCAACTGTTATTCTAAACATATAATTGAAACTATTAATTTTCTTTTTGTCCAAAAACAGCTGAAACTTTTAAAAATAGCGTCCTTTTTGTTTTATCTAGAAACAGCTGATTTTTTTTTAAGCTGGTGTGGAGGTACGAGAATATTGATTTTAATAATAATTTTTTTATTATAATTATGGTAAAACAAATTAATAATATTTTTCGGTAACTGTTGGTCAATGTTCTTAACGCTCTTATTTCAATAAATGCTACTGTATTTTTGTTATGTTTCCAATATATTCTTAATATCCTTTTGAATAAACTTATTTTCAATTTATTTGAAAGGATAAATAAAAAACAACATAGAAAAAATTAAATAATTAAATCATGTAATAATTATAGAAAGGTTAATAAAATATTTATTGTGAAGTAATATTAACAAAAAAATATCAACTAAAAAGGGAATTTACTAAATATATGAATACGTATTTATACAATTCATCGCTAAAAATATTTTAAAATACAACTAATATGGTATTATTCAACCTGTTTATTAAAAATAATTGAAAGACGAGTAATTGATTTTTTCTTGATATTATTCAATGCTATAACAGTTACATGGTTACATTACGTATATAAAAGTTAATTTCTAATAAATCCAAAACATGAAATATGGTAATGAATAGATTCTAATAGTTATAAAGATTTTTTACAATGCATTGAAAGAAAAATATTTGAACATAAATTAGAGTTATTTACACATTTGCGAGAAAATTATTTATTTTAAGAAAATAATTTGTTAAATAAATTAAACCAAACGCTGCATATTCAGTCTAGTTTTAAAAATTGCATATGAGAAAAAATAATAATAAATGAGTAAGTATTATTATTATTCTTAGATAAGTTAAAGAACAGGAACTTCATGTGAAAGGATTATTCTAACTTCATTAGAGTCGTGTCCCTAACAACTAAAGGATGCTGTCCTTCTGTGGGTTCCCCGTCTTCTTCAGTCCTTCAAAACACACGATTCCCTTTCCTAACCTACCCAATACAATACCTTAATGATTATTTAATAATATTATTATTATTTTATTATTATCTATTAAATACTTTACTTTACATTTAATTATAATGCTAACTATTATTATTTATAAGATCTCACCCTATATCTTTTAAGGATAATGATACTTTGATAACATTTTTTTACAATATTTTAACATTATCCACGTGTCATTATGTGATTGATCCAAAATTACTTCATAATCAATAATAATATTCATAAATACTAACATAAACCAATCACAGAATGACACGTATATAAAGTTAAAATATTGTCAAAAAATATTCTTAAAAGTATGATTATCCATATTTTAATTATAGAATCAAATTACCACAAATAATAAGCTCACATATGTTAATTTACCTCTCTATGCATCTTTTCATTATAAGATGCATTGAATTAAACCTTAAAAAGGAATGAAACTAAAAGAGTTAGTCTTTATTTATTATTAAATAATCTTTCTAAGAAATAATTTTATTAGTTGCAATGAGAATATAGAGTGATTATTTAAATTACTCTTAAAATAATTTTTATTTAATTAATTCTTGCAGAAACTACTAAAAGGAAGAAGAAGAAAAGAAGATTGGTGTGACTGAGGGGTGTTTCAATATTTTTTGACCTTCTCGGACTCTGCAGTAGCAGGCAGCAGCATTACTTTAAATCCAATTATTTATACTCACAGCCACC


Gene Sequence:
>Vu_21472(-)
ATGCCTCCTTTCCATTTCTCCATCTTTTAAAAATTCTCCCTCACCCCACAAGCAAAGCACCCTTAACCTTTTTCGCTTCAATTTTTTATTTTTCATTGCTTCCTCTTTTTTCTTTCTCTCTTTTTCTTTCTCTCTACCCCATTTTGCTTTTCTGGGTTTCTGTGCTTGTTGTTGGGATCTATTTCATAATGGGTTTATCCCAAGGACCCTGCACTGATTCCAGGGACCTTTCCAATGCACAAACCTCTTCCCCCTTAGTTGTAGATCACTACTGTGACTACAACAAGCTCAAATTCAGAACCTTGCTCAGAAAAATGATCTGGGAATTCGGTCTTGCCTGTGTGGCCAACCCTTCCCGGCGCCGGAGGGGCTCCGAGAGGGGACTGGGCGATGGCAAGAAGACGAATTTGGAACACAACAAGGCTTGGTTGCTCGCGGAGTCTGGTGGGTGTGGAGCAGAATTGTCCAATGCTGACCCTCAATCGGTTCACTCCTCTTTCAGGTTCAGTTTCTGTTCTCAGGTTGAGTTGGAGTCCCTCAACATGAGTTCTTCCAGTGCTGCGACCGTTTTGATGGTTAATTTGGACAATGGGGTGAGTGAATCTCGCGCCAAGGAAATCAAATGGAGGAGAATGGAGTCCTTGGAGAAGAGCATATCCCCTGTGGCTCACTCCTTGATCAGGTTCTGCTATGGTGAAATTCTCTCTGCTACTAGGAATTTCTCCAAGGGTAAGTTATTTTTTTCTTCCTCTTATTTTGGTTAATAAACACTTTAGTCCTGGTAAAAAGTACTAAATTTTGGTTTTAATTTCTGTATGTTTTTCAAAATACCTAAATTGTGGTGGAGAAAGTGTTAATGTTTTAGAACTAAAGTTTGAGTAGTATAAAAAAATATAGCGAAGAAACTATTCATCTTAAAAGTCAAGACTAAAGTTGAAATTGGGGAATTTTTTCATGTATTAAAGACATTATTAACCTTTTTTTATATATATGCTTTGAATGTTTTTTATTGTTCTTTTATGAAAGTTGATTGGTTTGTGTGAGATCATGATTTGTTTCTATGTTATGGTGTATGTAGGGAGGGTGTTGGGGAGAGGGGCATTAAGCTGTGTTTTTAGGGGGAGAGTTGGCCTTTTGAGGACTGCTGTGGCAATCAAACGGTTGGACAAGGAAGACAAGGAATCTGCCAAGGCCTTCTGCAGAGAATTGATGATTGCTAGTTCTCTTCACAGTTCAAATGTCGTTCCCCTTGTGGGTTTTTGTATTGATCCCGAGGAGGGTCTGTTTTTGGTGTACAAGTATGTCTCAGGGGGCAGTCTGGAGCGCCACTTGCATGGTATTAATCTCTCAGAATTTACCTGCTTTTTCTTTTGTGAGGTTTTGAATTGAATTTCACTGATTCTGACATGTCTTTTTTGCAGGAAGGAAGAAGGGTAGTTCACCTCTTCCTTGGTCTGTGAGGTACAAAGTTGCAATTGGGATTGCTGAAGCTGTGGCTTATCTGCATAGTGGGACTGAAAGATGTGTTGTGCATAGAGATATTAAGCCCTCAAACATTCTGCTTTCTTCAAGGAAGACTCCCAAGGTGGGACATTTTCTCGTGAATCAATCGTAGACCTTTGTTATGTAATGTAGAATCTGTCTCCTATGGAGCTCATGCATGTCATTCTGATTGTTTTTGTTAAATTGTAGCTATGTGATTTCGGATTAGCTACATGGACTTCTGCACCTTCAGTTCCTTTCCTTTGCAAAACCGTCAAAGGAACATTTGGGTACAAACTTCAGTCTTTTATCTTGATTCTTCAAAAATATTATTCGTGTGTATAATTTCTTTTCATGTTAAGATTAGCTGAAAATAAAACTTCTATGCCTCTGCTTTCCCTACAGATATTTGGCTCCTGAGTATTTCCAACATGGGAAAGTATCGGATAAGACTGATGTATATGCTTTTGGAGTGGTTTTACTGGAACTCATTACTGGCCGGAAGCCAATTGAGGCAAGAAGACCTTCAGGAGAAGAAAACTTGGTGTTATGGGTGAGTTATTGCATTAATTCTTGCGAAATTGCCTTCTTTTTTTATGATATCATGATGGTGGAATTTATTCCTCTTGTGTGTATATATGATTGCTCGTAGCAAAAATCTTCTTTAGCTTAACCTACTGCATCTTTTTTGTATATCAAAGCAATAAATCAATAACACCAATTTCACCTTAGTTCATTGCTTCTAGGAACATTATGTACCTAATGTGTACTCCTATACAACACAAAATTTAGTTCAACATTGTTTATTTTATCTGCTTCTGTAATGAAACTTACTTGACGTAGATTTAAGCTATAAACCATTACAGCTAGATTTGTAATGCATCTTGATAGTTTAGATATATACTTTAATTAATATGTTCTTCTTGGTGGATGAATGGAATTAGGGAGTTTATTCATTTACATTGAAGTGTCCACAGTGAATTATGTTTTCCTTTATAGTGGAAAGGTTCCACGAAAGTTTCACATTTATGACCACATTTGTGCGAGTAATTACGGCACCGCATTTAAGTTAAGAACAGGAATATGGAATTGATATGGTCTTGTTAACACATGTCCAATCCAAAATTCATTTCCAGGCCAAACCTTTTCTACAGAAAGGGAAAGGTGCCATTGAAGAGTTGCTTGATCCTCAACTCAAGTGCAGTCTGAGATTCTCAAATCAAATGGGTAGAATGATTGATGCAGCAGCTGCCTGTGTCACTAATGAAGAATCTCGGAGACCTGGCATACGTGAGATTATTGCAATACTGAAGGGTGAAGAAGAGCCTCTTTTATCCAGAAGAAAGAAATCCAGTTTTCTTGGAAATGGATGCGTGATTGATTGTTATTCTCAGTTACAACAAACAAATAATGAGATGAAAAGTCACTTGGCTTTAGCTATGCTAGGAGTTGCAGAGTTTGAGGATGATGACTATCTCTATGGTCGATAAAACATATGTTGACAACTCTTCAATAACCTTTTACTTTTTGTTATGATTGTGACTAAGAGTGCTAAAGATTAGATGTGAGCGAGTTAAAATTGTAAATAGAAATAGGAGCTTAGATGAAGATTGTGTGTAGATACCTTCCTTTTCCCTTTCCCTTTTCACAAAGGGTAACCTAATAGATTTTCATTCATGTTGTGAATCATGTTCAATTCATGTGGGGAAATTTATGATTTTCAATTTCATTTAAAGCTTTCTTTCTC