Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21459 LG5 33272705 33274522 PREDICTED: protein ODORANT1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 33273357 intron_variant
T/A 33273362 intron_variant
T/A 33273759 intron_variant
G/T 33273802 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/A 33273940 missense_variant p.Ser98Asn
C/A 33273962 synonymous_variant p.Ile105Ile
A/C 33273965 missense_variant p.Lys106Asn
A/G 33273993 missense_variant p.Lys116Glu
G/T 33273995 missense_variant p.Lys116Asn
A/G 33274062 missense_variant p.Ser139Gly
G/A 33274200 missense_variant p.Val185Met
G/T 33274222 missense_variant p.Arg192Leu
A/T 33274241 synonymous_variant p.Pro198Pro
C/T 33274420 missense_variant p.Thr258Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21459.1
MGRQPCCDKVGLKKGPWTAEEDKKLINFILTNGQCCWRAVPKLAVIFPCKHSKWSKIASHLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHKSLSITTEQSQAQPDQKPNQPLQEPQDQQQAIQIEEDPKFEPENGQNKEPEKAETSFDVSTITEEAKEEDQIMIPLFESIMNELFTDEVPIIEPSEILVPSATSTSPTTTSSSTSSSSYSNSPNFFEDLQLPDFDWSDDYNDTKIDNNNSSVALWDDDLIRSWNMLINDDGDGDRKQVFDTSANQYPRLIMDSESWAYGLF*


CDS Sequence:
>Vu_21459.1
ATGGGAAGACAACCTTGCTGTGACAAAGTGGGGTTGAAGAAGGGCCCATGGACTGCAGAGGAAGATAAGAAACTCATCAACTTCATCCTTACCAATGGCCAATGTTGCTGGAGAGCTGTCCCTAAACTAGCAGTTATTTTTCCTTGTAAACATTCCAAGTGGTCTAAGATTGCTTCTCATCTTCCAGGAAGAACTGATAATGAGATCAAGAATCACTGGAACACTCACATAAAGAAAAAGCTCAAGAAAATGGGAATTGATCCTGTTACCCACAAGTCACTTTCCATTACAACTGAGCAAAGCCAAGCCCAACCAGATCAAAAACCCAATCAGCCATTGCAAGAACCACAAGATCAGCAACAAGCTATCCAAATTGAGGAAGACCCAAAATTTGAGCCTGAAAATGGGCAAAACAAGGAGCCAGAGAAGGCAGAGACTTCATTTGATGTATCAACCATCACCGAAGAAGCTAAGGAGGAAGACCAAATCATGATACCCCTTTTTGAATCGATAATGAATGAGTTATTCACTGATGAAGTTCCCATTATAGAGCCCAGTGAGATATTAGTTCCATCTGCGACTTCCACTTCACCAACCACTACATCATCTTCAACGTCATCGTCTTCATATTCAAATTCCCCCAACTTCTTTGAAGACCTGCAGCTCCCAGATTTTGACTGGTCTGATGATTACAATGATACTAAGATTGACAACAACAATAGCAGTGTGGCCTTGTGGGATGATGACTTGATTAGAAGTTGGAATATGCTTATTAACGATGATGGTGATGGTGACAGAAAGCAAGTGTTTGACACTTCTGCTAATCAGTACCCAAGACTCATCATGGATTCAGAATCTTGGGCATATGGGTTGTTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21459::LG5:33270705-33272705(+)
ACGATTTATTGAGTAGCTATTGTAAGATCTACCTAAAACTTATGCATAACACCTTTTTTATAATTTATAAGTTTACTCTGGAGAAAAGATATTGGAGCTGTTATAGCAAAGTTTGACATTTACTACTGATCATGGAACTTTGCGAAAATATATGTTTCCACCAACCACGGTTGAAAAGAAAAAAAAAAGTTATGTTGAGAGTTGTTTCGTGTCAGGTGTCTCAGTTTTGGAGTCATTTCATATATTATAATCTCACTTAAGTCACCTGTTATTGCATATATGATTAATAAGCGAGATTAATTCCGATATAAAATATCAACAGGTGAATGCATACAGTGATAACTAATAAATCATTGACATATGTTGAGTTTTTTCTTTTCATACTATTTTAAACACACATTTTGATGCAACTTATTTATTGCTTCTGTAAGGTGTCCCAACCTGACTTTAATTACAAAAATGGAGAATAGGGAACAAGATGTGGATATTAATAAAAGCTGATTACATGTCATACATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATTGTAGATAATTAAGGGAGCAAAGTATATGTTTTGGAAGGTAAAGTTATGGTAATTTTGCTTTTAAGGGAAAACAAGTGTATGGACCAAATCAGTTGGGTGTGCTACATGCATTTTGTTTGTTTCAACGCGTATGCAGTAACTCTGGTAATTATAGGCTGTTCATTATTTCTGACTTGTTATTAATAATGGCTTCAATTGAATTGACTTGGTTGGGAACTTCCTGTATTGGGTTTAATGAGTTTAGCGCTTACCTATTCTCAGAAACAATGTCTAACTTTTAGTAATAGAAACATTTCCTTCAAATGTTAGAATAAAAAGAAAAAAAAACTAATTTCATTTCGTAATTTGTATAGGAAATCACACATAATGATGTAGAAATTATTATACGCATAACATTTCTCGTTATAAAAACAACTCAGGAGTTTATATTTGTTTAGACACAGGTGACAGTCTTTTCATTTGTTTTTATTTTTTTTTCCAAGTGGTTCTGACTTAAGCAATGTTCTGAAATTCCAAATACAACAAAAGTAACTCCTGTAAAAAAAAATTAATAATTCGCTAATTTCTTTCTTCTTTTTTTATCTCCTTAAAAAATACAATTGATGATAAGAACCTCATAAATTAACTTTTAGTTATGTTTCATAATAACATATTTAAAGACGTGATGTACTTGAGTAAAATATTAAAATTTGTGTTAAGTGGATTGACAATTTTGAAGGGACAGTAACACAAGAAAGAAAAGAAGTTGTCGAAGAGTTTTGCATTTACATTGATTGTGTAGATTAATGGATTTTTATATTACCAGAATGAGGGTGTGAACCCTAATTTTACAGACTGGCGTAAATTTGATGGTTGTTGTGTTGGTGATAACGACGGCAGTATAAACGAAAATGTCAACAAAAAAAAGGGAATGGGAAAAAGAGTTGGTGATGTATGTGGTGCCATTATTTATGGAATTTAAGTGTTATTTGTTGTATTACTGTTTTTGGAGAGGATTGAGTTAGTGGAGTATCTCACGCTTCCAACCAAAGCAAAGAAGTTTGATGATGTGGTGTTTTCTGAAGAAGACGTAGCACGTGTGGACCGTGTCACATCCCTGCAGAACACGTGTCAGTCTCCACTGATAATAAAATAAAAGGTAAATAAATAGGTAGTAAAGAAAGTTAATAAAAGAGAAATGAGAAATTGTGGTGGTGGGGTAAGGGGAGTTTTGGGTTAAGAGGGCGTTGAATTTTATATATAAATAAGTAGGTGGTGGTGCTCTATCCCACCTTGTTATGTGCATATTCTTAGGAACTCTAAGTCTTCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTATATCAATACTCATCTGAAACCTCTGGTTTGAGGGATCAATTGCAGATTCCAGGTACACTTTCTTGGCATTTGAGTTGTGGGGAACACAAAA


Gene Sequence:
>Vu_21459(+)
ATGGGAAGACAACCTTGCTGTGACAAAGTGGGGTTGAAGAAGGGCCCATGGACTGCAGAGGAAGATAAGAAACTCATCAACTTCATCCTTACCAATGGCCAATGTTGCTGGAGAGCTGTCCCTAAACTAGCAGGTCCCCTTTCTCTTCCTGCATGTCTTTATTCTTCAACACACTTTTTTCCTTAATGTCTTTAACCATTTGCCTTTCCGAACATTTTTGTTTTTTGCATGTCTTTTGAGCATTCTAATCGCAAGTAATCAAGAAACATTATGGCTTGTGTTGTTTCTTGAACATAATGATTTCAGTATAGCTTGATTTCACTGGCATGTTTTGTAATCACTGCATGCTGACTTAACAAATCTGTCTTGTGTCTTCATGCAGGGCTGTTAAGGTGTGGCAAAAGTTGCAGGCTCAGATGGACAAATTACCTAAGGCCAGACCTCAAGAGAGGCCTTTTATCAGAATATGAAGAGAAAATGGTCATTGATCTCCATGCTCAACTTGGCAATAGGTTCTTCCTCCACCCGCTCTGTTTCCCCTGTCTCTTCTGCATGTTTGGCTTTTTCCTTAATCAACGTTTTTTTTTAATTGATTAAATAACCGGTACAGTGTTCTTCTGAAATATTAGACTAGGCTAATCTAAAAACATTGTTTTATATAAAATTAAAACATATCTCAATCATGTCAAAAGCAATAACTAAAACAAAGTTATCATTTCTATTATACACGCCCTCAAGTGGCAATTTGTTTATTCATCAAAAACACAAAACAAAACATGGTCCCATGGTATCACACTCCCACAAGAAAACGTATAAAAATTGCAGACCAACTCTATTTCTTCCTTAGTATTTTTTAAAAGGAAAGGAACTGTATGATTGTAGTTATTTCATGTTGACTGTAAGGGGAATCATTAATATAGAAATGATCCCCAAGTTTGTCTTACGAGCAAATTTTCTGATTTTGTAACTTCCATGACGTAGTTATTTTTCCTTGTAAACATTCCAAGTAGGAACTTTTTTACGGAACCACTTTTTTTTAATATAACTGGGTTCCTTCCTGTACTGATTTCTGATGTTTTGTTTTCTCACTTGTGCAGGTGGTCTAAGATTGCTTCTCATCTTCCAGGAAGAACTGATAATGAGATCAAGAATCACTGGAACACTCACATAAAGAAAAAGCTCAAGAAAATGGGAATTGATCCTGTTACCCACAAGTCACTTTCCATTACAACTGAGCAAAGCCAAGCCCAACCAGATCAAAAACCCAATCAGCCATTGCAAGAACCACAAGATCAGCAACAAGCTATCCAAATTGAGGAAGACCCAAAATTTGAGCCTGAAAATGGGCAAAACAAGGAGCCAGAGAAGGCAGAGACTTCATTTGATGTATCAACCATCACCGAAGAAGCTAAGGAGGAAGACCAAATCATGATACCCCTTTTTGAATCGATAATGAATGAGTTATTCACTGATGAAGTTCCCATTATAGAGCCCAGTGAGATATTAGTTCCATCTGCGACTTCCACTTCACCAACCACTACATCATCTTCAACGTCATCGTCTTCATATTCAAATTCCCCCAACTTCTTTGAAGACCTGCAGCTCCCAGATTTTGACTGGTCTGATGATTACAATGATACTAAGATTGACAACAACAATAGCAGTGTGGCCTTGTGGGATGATGACTTGATTAGAAGTTGGAATATGCTTATTAACGATGATGGTGATGGTGACAGAAAGCAAGTGTTTGACACTTCTGCTAATCAGTACCCAAGACTCATCATGGATTCAGAATCTTGGGCATATGGGTTGTTTTGA