Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21437 LG5 33070923 33076139 PREDICTED: transcription repressor KAN1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 33070963 missense_variant p.Ser14Cys
T/A 33071093 synonymous_variant p.Pro57Pro
C/T 33071195 synonymous_variant p.Asn91Asn
C/T 33071196 missense_variant p.Pro92Ser
T/C 33071240 synonymous_variant p.His106His
A/T 33071320 missense_variant p.Asn133Ile
T/A 33071322 missense_variant p.Tyr134Asn
G/C 33071384 synonymous_variant p.Val154Val
G/A 33071399 synonymous_variant p.Ser159Ser
T/A 33071407 missense_variant p.Phe162Tyr
T/A 33072079 intron_variant
C/G 33072080 intron_variant
C/G 33072093 intron_variant
T/A 33072097 intron_variant
A/G 33072261 intron_variant
G/A 33072373 intron_variant
C/T 33072585 intron_variant
T/A 33073099 intron_variant
A/C 33073101 intron_variant
C/T 33073761 intron_variant
A/T 33073867 intron_variant
G/T 33074534 intron_variant
G/T 33074603 intron_variant
A/G 33074619 intron_variant
T/A 33074764 intron_variant
G/T 33075364 intron_variant
A/T 33075404 intron_variant
A/G 33075725 intron_variant
G/C 33075769 synonymous_variant p.Thr425Thr
T/C 33075848 intron_variant
C/G 33075975 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21437.1
MPLEGIFIEPTSTSTPDLSLHISPPSTSSSSSLICNNGTSAGATNYEARNSTGTNFPSQAHTELSLGRNFSGGGRGGIEEPPPHNTNSSINPYYQTQQPRFHHLHHHSNTGNVSKAATATSTTSSSNHLSHINYGVSLLDVSSEGLRPIKGIPVYHNRSFPFLPMEHSGDKDHHAKMCLYHHMPTYPSLSSSCSPLCSSSSSFTSSPAPYFAAAAGAPDPMSYLSSGGTTVAAAAAYRAATATRFNGISGEAFKTHHPLHHHHSSSHYGVGLGGSHEASSGLMRSRFLPKLPTKRSMRAPRMRWTSTLHARFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLAHVKSHLQMYRTVKTTDKPAASSGLSDGSGEDDMSPMGSSGGMRQFSDQRSLSDRPVQQDMDYSSANTLWSNSSSNREPWQQNSSNDINGFRPPIFQSQQISGGHQIQDCDSSKLKNSLSGSANLECKNPSLEFTLGRPDWNGKGQA*


CDS Sequence:
>Vu_21437.1
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Promoter Sequence:
>Vu_21437::LG5:33068923-33070923(+)
TTGAGGTGTCCACTGGAAGATAGATCTAATGAAATGGCATTCAGTACGTCGTACGGTGGATTGCAATTTAATGGATACAAGGTACAAGATACTCATATTATGACATAAGGTTTTAGATTTTCCAAATATTATTATTATTGCTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTCCTGAACAGTAAATATTTATCATCTACCCCAGAGAGAAATAAATTTAGGTGTAATACATATATAATATAATGCAAAAACTAAAAATAATTTCATGACTCAAGTTGAATTCTCACATTGGAGTAAAAATAATAATAAATGCCCTTAAATCTTATGTGTTAAACAAGGAATTTTCTGTTAATTTATTGCATCATAAATGTTCTAAGAAAATAGAGCAAGGAAAAATAAAAGGCCTAAATATGGTATTTCTAGTATCATACATATCTTTACTCTAGAGTTTACCAATAAGAGGTGATTTAACTCATAATATCGACTACAATATGGATTCAACTGTTGATGTAAATTGTTTAAAAGTAATTGAAATTACACCTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATCATCTTAGTTTTATAATTATAAATATAGCATATTTTTATAAGAAAATAGTAGTTTTTGTTAATATAGACTATAATAAATATATTACTGACTTTGCCTAGGTCGCAAAAATTTTGGAAACTAATTTTAAAATATTCAAATGAATTCGCTGCTAATTAACTAATTATATTCTTATATGACCTAGTTTTCTAGATCATTAAGTCTACTAAAAACTAAAATATTATAAGTTACATCTCTTATGTATTTTTTTATTCAACTCCTTAATTAACATGGGAGCAATATAATTGTTCAACAGTGTTAAGAAAAAACAGTAAATAGAGATTGGAGAAAGTGTGTATAATTTAATTTGTTTGCACACATGTAATTCATAATATTAAAAAGAAGATCACGTGTTTATGAAATTTGGGGTTCCTTTCATCTAAACCAAACATACATATATATCTTGATCACGTCTATCTCATTTTAATCTTGAATGCTTGCGCTTATAATGTGTATTAAATTAGGGAAATTCCGCATATGTAGTCTTCTTATCCTCTAATGTCTCATTTGAGATATTAAAAACCCCTCGACACTTTGAAAAAAATAATAATAAAATAATAATAATAATGTTTGTGTATCATACGTCTCACTAGTGTCATTTTCCGAGATATACTCTCGAGGAAAACAAAACGCAAATCCTCCTGTTTTTCTATTCCATGCCTTTCTGGAATTCTTTTCCATATTTTCTTTCTTCAATTATTTAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAATTAAATTCTCTTCTCATCTCTCCACTGTTAGCTGAACATCACTGCCTCCTATCTCTTCCTATCTATCTGTCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTTCTATTTCTCATTCTCATTCTCTCTCTATGCCCTCTCCTCATCACAAACACACATACACACTCTTCCGCTTTCTCTTGAGTATGTCTGTTTTTGTTTACTAAAGATTGCTATCATTCATTCTTCCTTTTTCCCTTAGCTTTCTCTCTCTCTGTACAATCTTCTTCCTTCTCTTATTGTTATTATTCTTTCTTTTTTGTTGGTTCTTTCAAAAGCACAAAGGTTTGTTCCCAGATAGCAAGAGTTAGCTTTCCAGATTCTTTCCCGGGGAAAGCCTAAAAACAGGAAAGCAAAATAATTCATTTCATTCTATGTCTTCAACCAACTCTCTCTCAGGAACAAAACAAAAGGATTCTTGAACAGTTTCTTGCCTGTGAATATTGCACTTTAATTGTTTTGTCTCAAAATCTGATTTTAATAAAGGAAAAGAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCACACACACTCTATACTTATCTCTATATCTCTCTTATATAGTCTTTAACCATCAAGCTATATACCCCTTCTCAAGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_21437(+)
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