Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21375 LG5 32473467 32477085 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g18500
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 32473613 synonymous_variant p.Ser49Ser
A/C 32473616 missense_variant p.Arg50Ser
A/T 32473624 missense_variant p.Lys53Ile
A/T 32473981 missense_variant p.His172Leu
G/T 32474064 stop_gained p.Gly200*
T/G 32474164 intron_variant
C/A 32474189 intron_variant
T/C 32474195 intron_variant
C/G 32474386 intron_variant
T/C 32474574 intron_variant
A/T 32474584 intron_variant
C/A 32474775 intron_variant
A/T 32475346 downstream_gene_variant
T/A 32475429 stop_lost p.Ter370Lysext*?
C/T 32475433 missense_variant p.Thr371Met
T/C 32475752 downstream_gene_variant
G/T 32475771 downstream_gene_variant
G/A 32475825 downstream_gene_variant
A/G 32475855 downstream_gene_variant
G/T 32475870 downstream_gene_variant
G/A 32475955 downstream_gene_variant
T/C 32475993 downstream_gene_variant
G/A 32476014 downstream_gene_variant
G/A 32476032 downstream_gene_variant
C/T 32476050 downstream_gene_variant
A/T 32476476 missense_variant p.Lys450Ile
C/G 32476532 downstream_gene_variant
C/G 32476664 downstream_gene_variant
T/A 32476682 downstream_gene_variant
A/G 32476718 downstream_gene_variant
G/A 32476770 downstream_gene_variant
A/G 32476853 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21375.1
MGSGLNAELSKKTPIFGLKVWEIIGIVVGLSIIVILSVVSLCLSSRKKSRKEKDRIPLSQIPTVSKEIKEVRVEQVPTNSFAPRDGILLTIRDKSSGKESDNVMVHLGVGKMKNGNSNTHSDSFRYIEKDGSGSHSQSGEEGSSGTFTVYKQSSSHPITAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLELATNRFSKENVLGEGGYGVVYKGQLVNGTPVAVKKILNNIGQAEKEFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGFCVEGTHRMLVYEYVNNGNLEQWLHGGMRHHGYLTWEARIKILLGTAKALAYLHEAIEPKVVHRDIKSSNILIDDDFNAKVSDFGLAKLLGAGKSYVTTRVMGTFGYVAPEYANTGLLNEKSDVYSFGVLLLEGITGRDPVDYGRPANEVNLVDWLKMMVGNRRSEEVVDPNIEVKPSTRALKRALLTALRCVDPDSEKRPKMGQVVRMMETEDTEEEIEGGVEKWIPRRNILTQTGVRFRIPEKKEEGDKMDSSYSEFGGCTKWKW*


CDS Sequence:
>Vu_21375.1
ATGGGGTCTGGTCTTAATGCTGAATTATCCAAGAAAACTCCAATTTTCGGTCTCAAAGTTTGGGAAATAATTGGAATTGTAGTTGGTTTGTCAATAATAGTCATTCTTTCTGTGGTCTCACTTTGCCTTTCGTCAAGGAAGAAATCTAGAAAAGAGAAAGACAGGATTCCCCTTAGTCAAATACCAACCGTGTCAAAGGAAATCAAAGAAGTGCGGGTTGAACAAGTGCCAACTAATTCATTTGCTCCTCGCGATGGAATACTTCTTACAATTCGGGACAAGTCCAGTGGCAAGGAATCAGACAATGTCATGGTTCATTTAGGTGTGGGGAAGATGAAGAATGGGAACAGCAACACTCACTCAGATTCATTTCGTTACATAGAGAAAGATGGAAGCGGTTCACACTCACAGTCCGGAGAAGAAGGTAGCTCTGGCACGTTTACTGTGTACAAGCAATCTTCTTCACACCCTATAACAGCTCCCTCACCTCTATCTGGCCTTCCAGAATTTTCTCACTTGGGTTGGGGTCACTGGTTTACCTTGAGGGATCTTGAACTTGCCACTAACCGTTTTTCCAAAGAAAATGTCCTGGGAGAAGGAGGGTATGGAGTGGTTTATAAGGGTCAGTTGGTCAATGGAACTCCAGTGGCAGTTAAAAAGATACTCAATAACATTGGTCAAGCAGAGAAAGAATTTAGAGTGGAAGTTGAAGCTATTGGCCATGTCCGACACAAAAACCTGGTTCGCCTTTTGGGGTTCTGCGTTGAGGGAACCCACAGGATGTTGGTTTATGAGTATGTCAATAATGGAAACTTAGAGCAATGGCTTCATGGAGGAATGCGCCACCATGGATACCTTACCTGGGAAGCACGTATCAAGATTCTGCTGGGCACAGCCAAAGCGCTAGCATATTTGCATGAAGCAATTGAGCCAAAGGTGGTACACCGTGATATCAAGTCAAGCAACATATTAATTGATGATGATTTCAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGCCTGGCCAAGTTATTGGGTGCTGGGAAGAGTTATGTCACCACAAGAGTTATGGGAACTTTTGGATACGTGGCTCCTGAATATGCAAATACTGGTCTCCTAAACGAGAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTTTGCTATTGGAAGGAATTACTGGAAGAGACCCAGTTGACTATGGTCGACCAGCAAATGAAGTGAACCTGGTTGATTGGCTGAAGATGATGGTTGGTAATAGGAGATCAGAAGAAGTGGTGGACCCCAACATTGAGGTGAAGCCATCCACAAGAGCTTTAAAACGGGCTCTCTTAACAGCTTTAAGATGTGTAGATCCAGATTCTGAGAAAAGGCCCAAGATGGGCCAAGTCGTTCGCATGATGGAGACCGAAGACACCGAAGAAGAAATCGAGGGGGGAGTGGAGAAATGGATTCCCAGAAGGAATATTCTGACACAGACAGGAGTGAGATTCAGGATTCCAGAGAAGAAAGAAGAGGGTGACAAGATGGATTCTTCTTATTCAGAATTTGGTGGGTGTACAAAGTGGAAGTGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21375::LG5:32471467-32473467(+)
TTCACAAACATCATCAATCATCGATAACTGGCGTGCATTCATTTAGTGATTGCTTCATAATAGAGACATGCATTTATTTCACAATATTAATTTAATTTATAATTATATTAAATTAACATTTAATGTTATTAAAATCATGAAGTGAGGGAATATATTATCTTTTTTATGACTACTTTTGAAACTGTATATCTTAGAATCTTCACGAAAAAATAGCTATCTTCTTACATAAAGTAATGTAGCTATAATTATATTCAATCGTTAATTAATGTAAATCATTTACAGTATATGATAAATATTATGTTTATTAAAGTTTACAACGGCGATGGTGAATATATAATGCATGTCAATATTTAATTTATCTCAGAAAAATAACTTCAAATATTTAGAGACTTTAATTAACTTTTAAACTTACGCACATAAGACTTAATTAAAATATTGTTTTTATCATTAAATTTTACACCTGTTTATATATATAATATTGATTTTTATACCAACATGGTAATTCGTTAATGGATGACGATAAATCTGGTAATTCAATTAAACTTTTTGTTGCAATTGATAGTATAGTGTTCTCCAACTTTGAGAGAAAACTATTCTGGTCACATAAAAGTAAAAAATAAAAAATAAAAATACTAGTATGTATGTTTAGCGTTTAATATAGCCATGTTAAATTTCATTAATTGATTTGATTATTGTTTTCTTTCTTTCTTTTTTATTCGTTGTTTTCCCACAGTCTGACTGTTAAATATCATTTAAAGGTGTTAATAAATACTCATCTTATTGTAATCAGTGAAAAGGCATTCGTATATTTTATTATAAAAATCGTTCATGAGTTTTAGCAATTAGGAATGGACTCCAGCACTGATAAGTAGTTAGTTCTCTAAACAAAAATACTAACAGGTAATTAATAACTTTCTTCTGTCGTAATAATGTACAATGCATTTAATACAATATGGTGTCTGAGTTTTCTCTTAAGAGAAGCAAAAGGATAAACTAAATGGTGAATGTAAAACATATCTTACTCACAGAGAATGGTAACTTAAATTTATAATAGCAAAATGGTGGGCTCTGTATTGGTTTCCTCAAACATGGATTAAAAATATGATCTTGGGTAGGTTTAGTTAAAGGGATTTGATTCCACATAAACTAAAATTTGAATATTTGTTAGAATATGGATAAAAAAACATGAATGTGGCATTAATGGAGGAGGGGGTAAGAGGAAAATAGGAAAAGAAAAGATAAAGATTGAGAGATACAGGTGTTGATGGATGGTAAATTCACAGCATGGCTGAGCACGAAATGGAATGAAAGAAGAAGGATTGAAATGAAAATAGTTAGGCATATAGAGAGTGATGTTCATGAAATGGAAAGAGGGAGAAGCATAGCAGTGTTTTTGTGGTGCCGTACTTGCATTACATAAGAGAGTTTTGATGTTAGAAAAAGAAAATGGATGTTTGTTTATATGCATGCGTTGGAAGGCATCTATTCCAAAACTCATCACCTACCACTGATAACTCCACCCCTTCCTCTTTATCATCACTCACATTCCCCTTCATCTCCCTCTTACCCGACCACCTTTCTCTCTGTTCTTCAGATAGCTCCACTCCAACTTAGATTCACTCTAACATTTTCCGCATATATATGGGAATAGGATTCTCGCTTATATAGGCAAACTTGCTTTTGCTCACACCCCAACATTCGGAGGTCTCAAAGATCTGCCCTTTTGAGTTTCTTCCATTGTTTCAGCCTCTTAGTTTGTGAAGGGGCTATTTCAAAGATCTGGGATTTCAGGCTTCTCACTTGTTCTTCTGAATGAGTACTGGTCAGAGTGTGATTATTATCTCTTTAATTCGAGTTATTTCCAATCTCATGTCTGTGTTTCTTGGTTCCTTTTCCTTCCAATTTTTTTTTTTTTTATGAACGTGTTCTGTTGTGCTGATTGATTGATATTGATAATGTCTTTGTGTTGCATATTGCAGGTATTGAGGCTTTCTGAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_21375(+)
ATGGGGTCTGGTCTTAATGCTGAATTATCCAAGAAAACTCCAATTTTCGGTCTCAAAGTTTGGGAAATAATTGGAATTGTAGTTGGTTTGTCAATAATAGTCATTCTTTCTGTGGTCTCACTTTGCCTTTCGTCAAGGAAGAAATCTAGAAAAGAGAAAGACAGGATTCCCCTTAGTCAAATACCAACCGTGTCAAAGGAAATCAAAGAAGTGCGGGTTGAACAAGTGCCAACTAATTCATTTGCTCCTCGCGATGGAATACTTCTTACAATTCGGGACAAGTCCAGTGGCAAGGAATCAGACAATGTCATGGTTCATTTAGGTGTGGGGAAGATGAAGAATGGGAACAGCAACACTCACTCAGATTCATTTCGTTACATAGAGAAAGATGGAAGCGGTTCACACTCACAGTCCGGAGAAGAAGGTAGCTCTGGCACGTTTACTGTGTACAAGCAATCTTCTTCACACCCTATAACAGCTCCCTCACCTCTATCTGGCCTTCCAGAATTTTCTCACTTGGGTTGGGGTCACTGGTTTACCTTGAGGGATCTTGAACTTGCCACTAACCGTTTTTCCAAAGAAAATGTCCTGGGAGAAGGAGGGTATGGAGTGGTTTATAAGGGTCAGTTGGTCAATGGAACTCCAGTGGCAGTTAAAAAGATACTCAATAACATGTGAGTTCCAGTACAATGTCCAATTGTCCATTGTAGATACCTTACTTGCTTTGCTTTTGTTCCTTCTCTGTTCGGCTGAAATTCAACTCTAAGGTTTTTGGTTTAGCAGTGGTCAAGCAGAGAAAGAATTTAGAGTGGAAGTTGAAGCTATTGGCCATGTCCGACACAAAAACCTGGTTCGCCTTTTGGGGTTCTGCGTTGAGGGAACCCACAGGTATCACAATTATCAATTGCAGTATTATCATCTCAATATAAATGATTTCATATAACCTTGTCAATTTCTCAAGTTAACTCTTACACTCTTACACTTGTACAATTATAAGTAACCAAAACGAGTTAGCTCTAAGGCTCAAATTGTTTGAAGAAATCAACTCCTCTTTTAATTGTTTTCACTTTAGATGTGTTTATATATGATTAGGTCAGTTATGTAGTTTGTTCTTAATAGTGCTGATGTATCATCGCACTTTCTTATGGTGGTTTGCTACTTTTCTATATTATCAAATTAAAATGTGGAAATATTGCTGTGCTTAGTGTTATATTATGCATATATGTCATTACTGGGTTTTTAATATTGAGTAAAGTCTTACAAGTTTATGGAAACTCTTCAATTTTATGTGAACTTTTTTGAGTTTGACAACCTAGCATATAACATTATAACCGGCTTAGCTAAATTAAACAGTTTTTTTTCTTCCGGAATAATATGAATTGTGCGTGTTTATTAATCTGCTACTGGGTGATTTGTGTTCACTGAAACATATTTGTCCTGTTATGATACATTCACAGGATGTTGGTTTATGAGTATGTCAATAATGGAAACTTAGAGCAATGGCTTCATGGAGGAATGCGCCACCATGGATACCTTACCTGGGAAGCACGTATCAAGATTCTGCTGGGCACAGCCAAAGCGTGAGCGTCTGCATCTATTTTACTTCTATCTTTTCTTAGTCCTCATATAAAGCAATTTACTTATAACAGGCTAGCATATTTGCATGAAGCAATTGAGCCAAAGGTGGTACACCGTGATATCAAGTCAAGCAACATATTAATTGATGATGATTTCAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGCCTGGCCAAGTTATTGGGTGCTGGGAAGAGTTATGTCACCACAAGAGTTATGGGAACTTTTGGGTCAGTGATTTTGTGCTTTGCTGAAGCTTTCCCATTCTCAGTATTGTTATTTTGGTGAGAAAATAAAAAACCATGCTTATTTCTTTATTGCTATAAATATTTCACAGATACGTGGCTCCTGAATATGCAAATACTGGTCTCCTAAACGAGAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTTTGCTATTGGAAGGAATTACTGGAAGAGACCCAGTTGACTATGGTCGACCAGCAAATGAAGTGAGTAAAACTTGTTGTTTTTCTTGGGCAAAATCTAGTTTTCAGTATGCGTGCGCACTTGTTTTTTCAGCATTTCGCCAAATATCCTGTGTACTGGTTCAAATCCTGCAGTGAGTTAGGATCATTCAGCTAAATTGCTGCAGCAAAGTATCTGTATGGATGTCTTGTGTATATGAGGCTAATCTAAACATACGTTATAGCTATAAAATCTAATTATTTTCTCCAACATTGAAAGAAGCAAATAATTGGGACATTAAAGAGTGACCCAGTGTACAAGGCTCCACACCTAGTGAAGTTTGTTGAAAGGTAGATGCATGTGACCTTTTGGCTCAGGTGGAGAAGCTGTGTGCAGGATTTGAAGCAGTGGCTTGGGATTATACCGGGACATTATGCTTAAAAGATATTTGACAGTTAAAGTAAAACAAGGATAGGAATTAAAGTTAATCTTCGGTTTTGAAGCATATAGCACTAACTAATATTCTTAACAATGGTAGTAACTATTCTTTTTGCATGTTCATTGTTTTCACTACAACTTTAGGATAAATCCTTAGTTGATTCATGATAAATATTTTTTTTTCATGTTCATTACTTGTTCTCTGGGATAAAAAAAATTAACACTATTTTTCTACTTTCATTATTTCTGTGAGGATTAGTTTGGGTGAATGACTATAAATATTCCTCAATCCAGCACCCTTTGCTCGATTATTAACAAGAATTCTGTGTTGTTTATAACTTATTTCTACATGACAGGCTCTGATAAAGTGCTTTTAACTTGGCCGTACCAATTATCTGCATTGCTTTCAGGTGAACCTGGTTGATTGGCTGAAGATGATGGTTGGTAATAGGAGATCAGAAGAAGTGGTGGACCCCAACATTGAGGTGAAGCCATCCACAAGAGCTTTAAAACGGGCTCTCTTAACAGCTTTAAGATGTGTAGATCCAGATTCTGAGAAAAGGCCCAAGATGGGCCAAGTCGTTCGCATGATGGAGTCAGAGGAATACCCTTTACCAAGAGAGGTTAGTTTTTCCCCATTGCCATGATTTAAGTCCACAAACTCTGCTCCTATCTCCACTCTACTTTCATGAATACATTAAATATTGATCATTTTCCCCTTTAGTCTGGGATTATCTATAGTAAAACTCAACAAAAAACTTACTTATTATTTTTTTAATTCACATTAGATGGATGTTTACATGTTGCACCTTGAACATTTGAATCTAGTTCTATAATTGATAAGTAAAAGCAGCTACGGGCAGTCTTTATGTTGGATGAAGAAACTTATACCGGGTTTTACTTTACTATTAACTTGTTTTTAGAGTAAAAACTTGAAAGCATAAATCACATCATTTAAAAATATTGGATATTTGAGATGGTTTTGTGAATGTTCAGGACCGAAGACACCGAAGAAGAAATCGAGGGGGGAGTGGAGAAATGGATTCCCAGAAGGAATATTCTGACACAGACAGGAGTGAGATTCAGGATTCCAGAGAAGAAAGAAGAGGGTGACAAGATGGATTCTTCTTATTCAGAATTTGGTGGGTGTACAAAGTGGAAGTGGTAG