Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21364 LG5 32374495 32376118 PREDICTED: transcription factor MYB86
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 32375399 missense_variant p.Leu138Ile
T/A 32375744 missense_variant p.Asn78Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21364.1
MGRHSCCYKQKLRKGLWSPEEDEKLLNYITKHGHGCWSSVPKLAGLQRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGAFSQQEENSIIELHAVLGNRWSQIAAQLPGRTDNEIKNLWNSCLKKKLRQRGIDPNTHQPLSEVENDKDKPLTADRSNQKASNEVSVVEPPKQKPITCTTSMPMDRYPLEVSATSKISSGGNNSSSTLDRFGTCHDNNSSMASSDMMGMGYFPFQHLNYGPNMGLTTANPNNTPLCFIPGSTSSQMMSELNSTMLHSVFSTHVKPTVSLQSNNNNPSSIFSDGVQNWEGSAFSNNNNNNNASKSNGSSSCSIQLQSSTNFLDHGTITWGLQAESATKTDNKDANSSHVVPLQSEAEDIKWSEYLNNTPFYLGSTVQQHQTTHSLYSDEVKPETAFIADESSTSWHHSQHFQPSDIYSKDLQRFSVAFGQSL*


CDS Sequence:
>Vu_21364.1
ATGGGGAGACACTCTTGCTGCTACAAACAGAAGCTTCGTAAAGGCCTCTGGTCTCCTGAGGAAGACGAGAAGCTTTTGAATTACATCACCAAACATGGCCATGGATGTTGGAGCTCCGTTCCAAAACTGGCTGGCCTTCAGAGGTGTGGCAAGAGCTGCAGATTAAGGTGGATTAATTACCTTAGGCCAGATTTGAAGAGAGGGGCGTTCTCACAGCAGGAAGAGAACTCCATAATTGAACTTCATGCAGTCCTTGGCAACAGGTGGTCGCAGATCGCTGCCCAGTTACCGGGAAGAACTGATAATGAGATAAAGAATCTATGGAATTCCTGTCTGAAGAAGAAGCTTAGGCAAAGAGGCATTGACCCAAACACACACCAACCCCTCTCTGAGGTTGAGAATGACAAGGACAAGCCTCTCACGGCTGACAGAAGCAATCAGAAAGCCTCCAATGAGGTGAGTGTTGTTGAGCCACCAAAACAAAAGCCCATAACTTGTACTACTTCCATGCCAATGGATAGATATCCCCTTGAAGTTTCTGCTACCTCAAAGATCAGCAGTGGTGGCAACAACAGCAGCAGCACCCTAGACAGGTTTGGCACTTGTCATGACAACAACAGCTCCATGGCTAGTTCTGATATGATGGGAATGGGATATTTCCCTTTCCAGCACCTGAACTATGGACCAAACATGGGACTCACTACTGCAAATCCCAACAACACGCCACTTTGTTTCATTCCTGGTTCCACATCTTCCCAGATGATGTCAGAGCTGAATTCCACCATGCTCCATTCTGTGTTCTCAACACATGTAAAGCCCACTGTCAGCCTCCAGTCTAATAACAACAACCCATCTTCCATATTTTCTGACGGGGTTCAGAACTGGGAAGGAAGTGCCTTCAGCAATAACAACAACAACAACAATGCAAGCAAAAGCAATGGGAGCAGTAGCTGCAGCATCCAATTACAAAGCAGCACTAACTTCCTTGATCATGGCACAATAACATGGGGGCTGCAGGCAGAATCTGCTACCAAGACAGATAATAAAGATGCTAATTCTTCTCATGTGGTACCCTTGCAATCAGAAGCAGAAGACATCAAATGGTCCGAGTATCTGAACAACACCCCTTTTTACCTGGGAAGCACAGTGCAGCAGCATCAAACCACTCACTCTCTCTACAGTGACGAGGTGAAGCCAGAAACAGCCTTCATAGCAGACGAATCAAGTACCAGTTGGCACCACAGCCAGCACTTTCAACCCTCGGATATATATAGCAAAGATCTCCAGAGATTTTCAGTAGCCTTTGGACAATCCCTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21364::LG5:32376118-32378118(-)
GGTCACTTTTTTTTTGTCTTCCATTCTGTAATATTTTAGAAGTTGAACAATTCTAGATGTATGTTTCCTTAATTTTATTAGGTTAAGGGAATATTTTTTAGTGAAGTATGCATCCTAGAGATGGAATATTGTTTGAGCAGTTGCAGGCTGTAATGATGAGTACATGGTGAGCGGTATAAATACTAACTAGATACGAGACACAGATGCAGACATAGTAACACAGCAAATTTGATGAGTTTACACGTAATGAAGGTGAAGTTTCGTCCGATAGAAAATACAAGCGGTTCTTAAAATATGTTGGTAAACATAAATTAATCAGGTTTAGTGTGTTTATAAAAAATGCAGGCTTGGATAAGCGAATTAAAGGGACAGTTATATTATTGCGATTGTCGCACTTGTATAGAGTTGTTTGTCTCTATTATTAACTATGGTTATGGTACTCTACATAAAACAAGGACGGTTTTAGTATGTTTCCACACAGACGCAGAATTTTGATAAAGATCCAACGTTGAAATTGAAGAAATGGACATTTAATGAAAAAGAGACTTAATTTTCAAAATGCAAAAATGATGAATCATTTGGATAGTTGGTTGAAGTCCAACAATTTCTATGAGAAGAAATGTGACCTTAACTAGCTGGTTTGTCAAAAGTAAAATTGTATTTGTACCCAAATGATGGAACTTTTCCAAAGGATAATGATTTTTGAAAAATGATCCCTAAAAGCTAAAAAGAAGAGAAGGTCAGTTTTGTACCAAAGAGTATCTGGTGGAAAAGTTGGACAAGAAAAGGAAAGGGCTATAGAGTTTTCAAAACTTGAAGTATTATCAGCAATAGGAGCAAGAGAACCTAGAGAAGGTTCTGTTATCGTCAATTTAATGCAGTATGCTTTGTTTGCTTACCTTACCTCTCTCAGCCTTTACTTTTCCACGAGAATTTTGCCCTTCTTAATTCTACTGGTTTATTTGTACTTCATATTACTAATCTTGGACTTGCCTTTGCCTAGGCCATGCCACTCCTCCAAATTCCATTCAAGCTTCTTCCTTTCTTCTCTCTCATCCAAGTCATGTGGGAATGGAGAAATTTCGTCACACTCCACAACTTTCAAACTCACGAGATAACAACTATATGCTCTAAACCAGCATGGTACATATTACATAACATAACCACCAAGGTCGGTTAAAAGTGAAAACCGTCCTAGCTACCATTGTAGCAATTATACCCACCACAATTTCTCACATACCTATCTTTAGGACTACCTTCACTCCCTTACAACCATTATCACTTTTCCCATATTTACACATTTCTCAACTGTTTTTTTCCCTTCATTTCTTATTCACATCCTATTTTCTTTACATCACTCTTTTTTATTAATCAACTAAACAACACACACTTTAACCTATTCTGTCTCATCTTTCTCTATCTTTTACAATATAAAAATGAATTATATAGTATTAATCAATTTCAAACCACAAACTCACCTTGGATAACTACTTCTTCTTGTTGTTGTTGTTGTAAGTAGTAGTTGATTGGGAGTGTAAAACTCTTGGCTGTAAAAGTGCAAAGACTATTTTCTGGTAACAAAAACCTGAATGGCCATGGTGGTGGTGGGACATTCTCATAAATAAGTCAAAGCATATGATCCTCCCTGGTGGGATGTGATCCGTTGGATATAAGAGAGGAGTTGCAGGAGGAGCGTTGGATGAGAGTGTGGGACCGAAACAATTATGTGGAATGTCTCGTGAAGAAAAAAGATGAAGCTAGTTCTGGAAGGTCAGATATATAAATTTCAAAACGACAGTGTCCAATCACCCTTCTTATTATAAGGCTCCTTCTATATATTCGAATCTCTATGCAAGTTGCAAAATTCTTAAGCTCCAACGCTTCCCATTAATTCACATCAAAGCTCCTGTGTCCTTCTTGACGATCCACGTAGGTTCTGACACAAGACTTTTGCCGCTTTTAACAAACATTTCAAATCGCTTAAGGCAGCCATAGTGCAC


Gene Sequence:
>Vu_21364(-)
ATGGGGAGACACTCTTGCTGCTACAAACAGAAGCTTCGTAAAGGCCTCTGGTCTCCTGAGGAAGACGAGAAGCTTTTGAATTACATCACCAAACATGGCCATGGATGTTGGAGCTCCGTTCCAAAACTGGCTGGTACCACTACTGTGCAACACTTAATCTTTCATCACTTTATCAGTATTGCAGCATGTGCACAACACAAAACTCTTTTAATTAATTAATTAATTATTACCCTTCCTTCTCTCTCTCAAACTTTCTTCTTCCTTTCTATGCCAGGCCTTCAGAGGTGTGGCAAGAGCTGCAGATTAAGGTGGATTAATTACCTTAGGCCAGATTTGAAGAGAGGGGCGTTCTCACAGCAGGAAGAGAACTCCATAATTGAACTTCATGCAGTCCTTGGCAACAGGTACTGTTATTGTGTTCCAACTTGTTGCTATTTTTGGCTTCTCCTCATGTAGATTGTTGCCACTACAAGAATTCTCGGTGGACCGATTTCTGCAGGTTGTCGGTAATACATGTTTTTTGTTTATGGGATTGTATGCGTTTTGAACTTTTGATGGGTGTACCAGGTGGTCGCAGATCGCTGCCCAGTTACCGGGAAGAACTGATAATGAGATAAAGAATCTATGGAATTCCTGTCTGAAGAAGAAGCTTAGGCAAAGAGGCATTGACCCAAACACACACCAACCCCTCTCTGAGGTTGAGAATGACAAGGACAAGCCTCTCACGGCTGACAGAAGCAATCAGAAAGCCTCCAATGAGGTGAGTGTTGTTGAGCCACCAAAACAAAAGCCCATAACTTGTACTACTTCCATGCCAATGGATAGATATCCCCTTGAAGTTTCTGCTACCTCAAAGATCAGCAGTGGTGGCAACAACAGCAGCAGCACCCTAGACAGGTTTGGCACTTGTCATGACAACAACAGCTCCATGGCTAGTTCTGATATGATGGGAATGGGATATTTCCCTTTCCAGCACCTGAACTATGGACCAAACATGGGACTCACTACTGCAAATCCCAACAACACGCCACTTTGTTTCATTCCTGGTTCCACATCTTCCCAGATGATGTCAGAGCTGAATTCCACCATGCTCCATTCTGTGTTCTCAACACATGTAAAGCCCACTGTCAGCCTCCAGTCTAATAACAACAACCCATCTTCCATATTTTCTGACGGGGTTCAGAACTGGGAAGGAAGTGCCTTCAGCAATAACAACAACAACAACAATGCAAGCAAAAGCAATGGGAGCAGTAGCTGCAGCATCCAATTACAAAGCAGCACTAACTTCCTTGATCATGGCACAATAACATGGGGGCTGCAGGCAGAATCTGCTACCAAGACAGATAATAAAGATGCTAATTCTTCTCATGTGGTACCCTTGCAATCAGAAGCAGAAGACATCAAATGGTCCGAGTATCTGAACAACACCCCTTTTTACCTGGGAAGCACAGTGCAGCAGCATCAAACCACTCACTCTCTCTACAGTGACGAGGTGAAGCCAGAAACAGCCTTCATAGCAGACGAATCAAGTACCAGTTGGCACCACAGCCAGCACTTTCAACCCTCGGATATATATAGCAAAGATCTCCAGAGATTTTCAGTAGCCTTTGGACAATCCCTGTAG