Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21300 LG5 31782242 31783276 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 31782449 missense_variant p.Val189Asp
C/G 31782450 missense_variant p.Val189Leu
C/T 31782780 intron_variant
T/C 31782798 intron_variant
A/T 31782844 intron_variant
C/T 31782865 intron_variant
T/C 31783067 intron_variant
C/T 31783074 intron_variant
G/A 31783075 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21300.1
MDVNMKKSRSAEEANSEDTRKGPWSVEEDTLLQNYVATHGDGRWNSVARCLKRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQEQITILDLHSRWGNRWSKIARHLPGRTDNEIKNYWRTRVLKQARNLKCDVDSEQFKDALRYVWMPRLIERIEPSSETHHPPPVSLFELHPNPTPSLHHQNGFHGSSSAKLESPLEPEDMGHNNVSVPGVCENMNDRDVEQGNITLPFAGGDSMESLWDDETLWLMQQLCDDLEIKDNFLA*


CDS Sequence:
>Vu_21300.1
ATGGATGTTAACATGAAGAAATCACGGTCCGCAGAAGAGGCGAATAGTGAAGACACTAGAAAAGGTCCGTGGAGCGTTGAAGAGGACACTCTTCTCCAAAATTACGTCGCCACCCACGGCGACGGTCGCTGGAATTCCGTCGCACGCTGCCTTAAGAGATCAGGGAAAAGTTGCAGGCTGAGATGGTTAAACTACTTGCGGCCCGATGTTCGTCGTGGAAATATAACACTCCAGGAACAGATAACCATTCTGGACCTTCACTCTCGGTGGGGCAATAGGTGGTCGAAAATTGCTCGGCATCTTCCCGGTAGAACGGACAACGAAATAAAGAATTATTGGAGGACTCGTGTGCTTAAGCAAGCAAGGAATCTGAAGTGTGACGTGGACAGTGAACAGTTCAAAGATGCCTTACGTTACGTGTGGATGCCCCGTTTGATTGAGCGCATTGAACCGTCATCGGAAACTCACCACCCGCCCCCTGTGTCCCTCTTCGAACTTCACCCGAACCCAACTCCTTCGCTCCATCACCAAAACGGGTTTCACGGTTCGTCAAGTGCCAAGTTGGAGAGTCCTTTAGAGCCTGAAGATATGGGTCATAATAATGTTTCAGTTCCGGGAGTGTGTGAAAATATGAATGATCGAGACGTGGAACAGGGGAATATCACGCTACCTTTTGCTGGTGGGGACTCAATGGAGAGTTTGTGGGATGATGAGACTCTGTGGCTTATGCAGCAACTTTGTGATGATCTGGAAATTAAAGACAATTTCCTTGCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21300::LG5:31783276-31785276(-)
TTATTTTAATTTTATATATAGCATATTTTAAACATTTATGAATTATCAGGTTAATTCTTTCAAATTAAAATATATAAATTCTAAGTATATATGGACAAGCAAATTAAAATAATATATCTGGTCCTTAATTATTCTAATTAGTTTTAAATATTATAATTATTTTAATTTAGTTTATGTTAGAAATTCAAGTATGAGTCCAAGTCCCACATTAGATAGAAATGAGAAAGTAGAACAATGTATAAAGATGAAAGACCTACTAACACATTGTCTTAAGGTTTTTGGTAGAGAGTGGTGTCAATTCTTTATATGGTTGGACTCAGATGTCATTGGTGTGTATCTCCTAGGTGAACCTCCTCTTTGATAGACCCAACGGTGGTATTAGAGTTGATTATTTGTCTTGATGACCGACTTAGACGAGTATAATGGTCCATATATCGAAAGTTTTCTTGGTGAAAGGTTTCAAGTAAGCGTGTCCTCCCCTTATGTGGAAGGGACTGTATAAAAGTCAAAGACTCATTAACTCAATGCCTTAAGGTTTTTTATAGAGACTGATCTGAATCCCTTGTATGGTTGGGCTCAAATGGTATTGTGTCTTTTCAGTGACCTCCTCCTTGATAAATCCAACAATTTAATCCCGATTATCACTGTAAAAATACATATGACTAACAAAAGTATCCTAACTATTTTAAAATATGCACTTATTGTAAAATGTTTAACAATATAATTATGAGTTAAAAATAAAATATCTTATTTTATAATAGATAATAATTGATACCAAAGTAAGAAAACAAAATTATGTATAGTATAAAAGAAAATCTGATAAAGTATTAATTAGTAAAATGTCTTTTTTGTTTTATTAAATTGCATGTTTACATATACGACAAAGAAGATTGAACTTTTAATGTCATATTATGTTATGTTAGACTGATAAAAAGATATTCTTATGTTATTAATTCAATCTTAGTCACTGGATTGTAACTATAGTGGATTATACCAAATTGCATTTGGTAAACGTCTATTTAACTTACATAGTCAATAATTAATTACACTATACATGAAATGAGCAAGACCAATAGTCTAAGAGAATGGAAGGGTGGATTATTACTCTCCTTCACCACTAGATAAGTTCAAAGTTGCAAATAACATGTTACATTTAATGTATACTATGATGAAACATGTTTCACACTTTCTATAATATTTTAAAATTTAATTTTAATGTAATATTCAACATATTTTAATATAAATTTAGAGGTTATTCAATCACTTGTAATCTTGCTGTTGATATTCTTTTGTAGATGTCGTATATCAATCTATTAAATCTATGGGATGTCAACCTATTTATAGAGACTTGTGGAATTAGGCCTGTATTAACACGATTCTAATTAACTAAATGGGTGATTAGTGATCTACGTTTGCTTTTGGACCCTGTATGTACACCGAATGTGGCCTCCTAACATATATTACACATATATTTGTAATTTTTCTAAAAAAAAAAACATCTACATTACATTTAATATAGATACATGTTTCTAAAAAAAATGACATATCTCACTCTTAATTATTATCTTTTATGTTATCTTTAGTCTTCAAGATTTTGGTTTAACTTCGTGTCAAGCAGTAATGCTTTGTTTTCTTTTTAAATAGTTATTTTTTATTTTAGTTTCAAAATTAATATTAAATTTATTATTACATATACTTCGTCAGACGGGAGAAAACGAGAGTGGAAAAAATAAAGTTAATTTTATCTTAAATAAGAGATAAAGAAATGCCAAAAACCAGACACTAAGAAAGGTGAAACTGGGAGCTATTTATAGTTGTTGACACTGGAAGAACAAGACCAAAACAACCATCTCCTTCATTCCTAGTTTGTCTTGTCTCATCCCCACGGAATATATCGCTCACTTACACTCATCTTCCAAAGTATATGTATGTCTCATCCCTATACACTATGCTCTCACTATGTTAAGAATTTGAGTTCCTATATATAAATAAGAGACATA


Gene Sequence:
>Vu_21300(-)
ATGGATGTTAACATGAAGAAATCACGGTCCGCAGAAGAGGCGAATAGTGAAGACACTAGAAAAGGTCCGTGGAGCGTTGAAGAGGACACTCTTCTCCAAAATTACGTCGCCACCCACGGCGACGGTCGCTGGAATTCCGTCGCACGCTGTGCAGGCACTTATTATACTCTACGCTATCAAACTAAACACTCTCAGCATTATCGATTCTAAAATAGATGAAGTTATTTTTGTAATAATGTAAAATTAAACGTGTGCAGGCCTTAAGAGATCAGGGAAAAGTTGCAGGCTGAGATGGTTAAACTACTTGCGGCCCGATGTTCGTCGTGGAAATATAACACTCCAGGAACAGATAACCATTCTGGACCTTCACTCTCGGTGGGGCAATAGGTAATTAAACTGGAACATGTTCCCGGTTAATATATTCTTGTTCTTTTTTTTTTCTTCTTCTCATTTCCGAGTTAGTGGATAACATGGAATAAAAAACAGAGAAATCCTCGTGAAGACGTTGATTAGTGCGCTATATAATATTTTCGTAGGTGGTCGAAAATTGCTCGGCATCTTCCCGGTAGAACGGACAACGAAATAAAGAATTATTGGAGGACTCGTGTGCTTAAGCAAGCAAGGAATCTGAAGTGTGACGTGGACAGTGAACAGTTCAAAGATGCCTTACGTTACGTGTGGATGCCCCGTTTGATTGAGCGCATTGAACCGTCATCGGAAACTCACCACCCGCCCCCTGTGTCCCTCTTCGAACTTCACCCGAACCCAACTCCTTCGCTCCATCACCAAAACGGGTTTCACGGTTCGTCAAGTGCCAAGTTGGAGAGTCCTTTAGAGCCTGAAGATATGGGTCATAATAATGTTTCAGTTCCGGGAGTGTGTGAAAATATGAATGATCGAGACGTGGAACAGGGGAATATCACGCTACCTTTTGCTGGTGGGGACTCAATGGAGAGTTTGTGGGATGATGAGACTCTGTGGCTTATGCAGCAACTTTGTGATGATCTGGAAATTAAAGACAATTTCCTTGCGTGA