Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21289 LG5 31700914 31702269 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 23
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 31701041 missense_variant p.Gly43Val
G/A 31701304 missense_variant p.Glu131Lys
T/C 31701316 splice_region_variant&intron_variant
G/A 31701394 downstream_gene_variant
A/T 31701405 downstream_gene_variant
A/T 31701406 downstream_gene_variant
C/A 31701420 downstream_gene_variant
T/A 31701426 downstream_gene_variant
C/G 31701463 downstream_gene_variant
G/A 31701951 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21289.1
MDNNKEMMMMMMMMGVKKEEDYSIGSSSFHCNYPFLDFSDDKGSLGFMELLGVQEYSPLLDLPLGSNMEVRQTSDHKEPPQTKKDWPEVTNQQPATPNSSSISSASSEALNDEQKNRTVDQTHDEHKKTKEQLKAKKTNQKRQREPRFAFMTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPSPVMGRSNNFGSLMSGSENYMSQYYQQHHQQQLHVDALSSLGFLSPKNVTFPQQTALLSDYGRLQDVVPSQQMFKQD*


CDS Sequence:
>Vu_21289.1
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Promoter Sequence:
>Vu_21289::LG5:31698914-31700914(+)
ATAACAGTGGACCCCTTGTTCAAAATTAACATCACAAATAACTCTGTATTTCATTATCAGTTGTATTAATCTAATTGGTTCTTCAATTAAATGTAAAAAAATATCTACTTATCAAAAAAATTAATTTAAAGTTTATAAAAATGTGAAGTCCCATTTACAATAATAGAAACATTTTTGCAGACACATTAAAAAGCAGAAGACTTTCAATATATTCTCTTGCTTCTAGATCGGTAATAGGGTATAATCTCATTTACTTGTGAACCCTCGCTTTGGTATAAATTCTCGGTTTAACCAGAAACGAATCACTCAATTTGTATGTGATTGTCGTATTCCTTGTATGCTTGTCGTTCCAAGATTTGGTTTAACTTTTTTTTTTTTACAATATTTTTCTAAAAAGTATTTTTAAAATGTTTACGTGTAAATATTCATTTTATCGATTAATGTTTTCTCTCCTCTTCATTTTTAAATCTGAAATTTCAGTTTCTCATGAGCGTGATAGGGTCGAGATCACCAATTTAGATAGTGTATATTTTATGATCATATTCAAGATTTTGTAATTAGATTATATATAATTGAAAATTATAAAGACGTATATTTTTTTATCACGTTGTTACAAAATTTTAACAATGATAACACACGTGCACCCTTCTTTTCCCCTTCATTAACTTTGTACAGTCATTTTTTATTTAAAGATCGTAAAGCTCAAAAAGAAAAAATAATACTAAAGAAATAGGACTTAGGAGGATGTACCTAGTTCACTTTATATATACACATAGGCCAAAACTATGTGGTGTTTAATTTGCATAACACCGTCGCAGACGTGTCGTCTGTAGATTCTTTAATATACTTCGCATTATCCAATTTAATTAACTTCATCTCTACACTAATATCTTAATCTCACCGTATAATCCAAATATAAAAAAAAAATAACGTGTCTTTATATATACATGTAAATTAATGGTTTTTTATTATAGTTTTAAAAGACAAAAGAAGAATACTTTCTCTATTATTTGCCAAAAAAAATATATTATCTTAGGCACAAAATACTCCATTTTTGGCAAGGGAGGGAGTACAAAAGTCGCAAGCATTTTCGAAAAATAAAGTTCTGGTTTCTAGTATGAACTTTTTATACTGGTATTGAATTAAAATTAAAATTTAACTTACGTAGTAAAATTCCACATTAGTTAATATAAACATAAAGTAAAACTACTCTTAAAAGATAAAGCTTATTTACATGAAGTAGTAAGATTGTAATAAACTATTACGGCCTTAATCATTGACATTGTAATTTGTGAACGAAAATGAGGAAACCATGGTTTTGTTATGGAAAATATTGTTTAACACACTTAAAATTTTTTACATTCATTTCACGTGAAATGACTATAAAAGAAAGACTGTCATGTTATTATTTCTCTTTTGTTATTCATAAGAGAAGAGCAAAAGGAAGAAGAAAAAGAAAAGAAGTATGTTTATTATGAGTATTTTGCACCGTAAAGCGGATTAGAATCCATATATAACGTGTTTGATTCCGTTGGAGAAGGAGGTAGCGTAACCCCGTTCACACACAGAAACAGAAACACGCCCACAATGAATCAATGAAAGGCTACGTATGAAAACGTCGACCATGCATTGAATGCCACCGGCTGCCACGTAGTCCGTACCACCCACTAACCTACAATTGCCGGTGGCCTCTTTGGTGTCACTGTTTTTGGCTTTAACCATGGAACATATGTATGTATGTATTCATATTCATTCATTACTACTTGCTTGTTTCGCTTCCAACTCATTTCCACAATCACCTCTCACTTTCTTCCAACCCACAAAGCCGCGCTATCTATCTATATCTATCTATCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTCTTTCATCCACCTAACCAGATCGATCGACCCCATCATATATTTATCGTATCTATCTCACTGCTCTTGTAGCTGTTTGAATGAAGGATTTCAGATTGGGCATTTGAGAGATAAGTATATATA


Gene Sequence:
>Vu_21289(+)
ATGGATAATAATAAGGAGATGATGATGATGATGATGATGATGGGTGTGAAGAAGGAGGAGGATTATTCCATAGGGTCATCGTCCTTCCATTGCAATTATCCATTCCTTGATTTCTCTGATGACAAGGGCTCTTTAGGGTTTATGGAGTTGCTGGGTGTGCAAGAATACAGTCCTCTGCTTGATTTGCCTTTAGGGTCCAACATGGAAGTGCGTCAAACCTCTGATCATAAGGAACCACCTCAGACTAAGAAAGATTGGCCCGAGGTAACCAACCAGCAACCTGCGACTCCGAACTCGTCATCCATTTCCTCCGCGTCCAGTGAGGCTCTCAACGATGAACAAAAGAATAGAACTGTAGACCAAACACATGATGAGCACAAAAAGACAAAGGAACAGTATGTTTCTTTCTCTAATGTTCTAATTTTCTCTCACCTTTTAAATTCTTTTGTGTAGTTATTTGGTTATTTAAGCCTATGATTCGCATTTTTTTCAAAAAAAAAAAAGATCTTTGGTGTTTGAATGGCTCATGGCATATCGGCAGAAGAAAAACCTTGGGGGCGGTGGAGTGTGAATTACGTGTTTGATAATCTAATTAGGGGTAGGGGATGAAAAAGACGGGGGCTGGGTATTTGTTTTCTATAATATTTTTGTGATGGTTTGTTTTTGCGAGGAATAGTGGTACGTTGATTTATTTAATGTTTGGAAGATTCTAATAAGATTTGATGGTTTTCGGGGATGGGTTTAGGTTGAAGGCTAAGAAGACAAATCAGAAGAGACAGAGAGAACCGAGATTCGCGTTCATGACGAAAAGCGAGGTGGATCATCTGGAAGATGGGTACAGATGGAGAAAGTACGGTCAAAAAGCTGTGAAAAACAGCCCCTTTCCCAGGTAACACTTTATCTCATTCTGCAATACACGCTTTGCTTCCTTCGCATCCTCACTTTTCGCTTCGATTTTGTTTCGTTTAAACCACCCAAAAATAAATTAAATGCTCTCGACATTTGAACAGGAGCTACTATCGTTGCACCAGTGTTTCGTGTAATGTGAAGAAACGCGTAGAGCGATCTTTTAGCGACCCAAGCATTGTGGTGACAACCTACGAAGGTCAACACATTCATCCAAGCCCGGTTATGGGTCGCTCCAACAACTTTGGTTCGCTAATGTCTGGATCTGAGAACTACATGTCCCAATATTATCAGCAGCACCATCAACAACAGCTCCATGTCGATGCATTGTCTTCTCTGGGTTTCCTCTCTCCAAAGAATGTCACATTTCCTCAACAGACAGCGTTGTTGAGTGACTATGGCCGTCTTCAAGATGTTGTTCCTTCACAACAAATGTTCAAACAAGACTAG