Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21277 LG5 31599456 31601217 PREDICTED: DELLA protein RGL1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 31599492 missense_variant p.Pro545His
A/G 31599603 missense_variant p.Leu508Ser
A/G 31600068 missense_variant p.Leu353Pro
T/C 31600173 missense_variant p.Gln318Arg
A/T 31600213 missense_variant p.Tyr305Asn
G/T 31600221 stop_gained p.Ser302*
C/T 31600404 stop_gained p.Trp241*
C/A 31600781 missense_variant p.Gly146Val
A/T 31601117 missense_variant p.Phe34Tyr
C/T 31601121 missense_variant p.Gly33Ser
C/G 31601139 missense_variant p.Val27Leu
G/A 31601170 synonymous_variant p.Ile16Ile
C/T 31601175 missense_variant p.Glu15Lys
T/G 31601205 missense_variant p.Lys5Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21277.1
MENDKFSSTALNLREILVGYGSTQEDVFQEKEGFSGMELLGPIEDEKGTKLFEDEDQKQVDKLLEVFNCDYDMQLKPTPQFDETTRPAKHDIESAEHNNHVSPSLASLELLRNYISRFKRISEQNIAKPSLDHHQISTEEIIRVAGARYVQYSAHWNDSFCIPMHPYGLDFGCLSEEENRDVELAQFLLAAAERVGCHQFERASRLLLHCQLNSSPNNGSPVQRVIFHFAQALRERIDRGLGRTTAKGSEKKEERGWIQKIDTNVALTFHQNIPFNQVMQFTGIQTIVEHVASETKIHVIDFETICGVHNTILMQALTERQDCKVQLLKITALALNSCRSMIQETGKRLASFAESLKLPFSYNAVFVTDFAEIREGDFEIGEGEAVAVYSPYFLRRMVSRPDCMENLMRVIWNMKPVIMIVLEVEANHNSPIFVNRFIEALFFYSAYFDCLGSCINDENESRRKIETVLSEGIREIVAMEGRERKVRNVKIDVWRKFFARYRMVETGFSESSLYQAHLVNKEFAFGKFCTLEKNGKCIIVGWKGTPVHSVSAWRFL*


CDS Sequence:
>Vu_21277.1
ATGGAAAATGATAAATTTTCATCCACAGCTTTAAATTTAAGAGAAATCCTAGTGGGTTATGGCTCTACACAAGAGGATGTGTTTCAAGAGAAAGAGGGTTTTTCTGGAATGGAATTGCTGGGACCTATTGAGGATGAAAAAGGAACCAAACTGTTCGAGGATGAAGATCAGAAACAAGTCGATAAGTTGTTAGAAGTGTTTAACTGTGACTATGATATGCAACTGAAACCGACACCACAGTTCGATGAAACTACGCGGCCAGCGAAGCATGACATAGAATCAGCTGAACACAATAATCATGTGTCACCATCATTAGCATCCTTAGAGCTGCTGAGAAACTACATAAGCAGATTTAAGAGGATAAGCGAGCAAAATATAGCGAAACCTTCTTTGGATCACCACCAGATATCAACTGAAGAAATTATAAGAGTAGCTGGAGCAAGATATGTTCAGTATTCTGCACATTGGAATGATAGTTTTTGCATCCCTATGCACCCATACGGATTGGATTTTGGATGTTTGTCTGAGGAGGAAAATAGAGACGTAGAACTTGCTCAGTTTCTCCTTGCTGCAGCTGAGAGGGTAGGTTGCCACCAGTTTGAACGTGCAAGCAGATTACTTCTCCACTGTCAACTGAATTCATCACCCAATAATGGAAGCCCCGTTCAAAGAGTTATCTTTCACTTCGCCCAAGCACTTCGAGAGAGAATCGACAGAGGACTGGGAAGAACGACAGCGAAGGGATCGGAGAAAAAAGAAGAAAGGGGGTGGATTCAAAAGATTGACACCAATGTTGCCCTAACATTCCATCAAAATATTCCTTTCAATCAAGTCATGCAATTCACTGGAATACAAACTATAGTGGAACATGTTGCATCTGAGACCAAAATTCATGTTATTGATTTCGAAACAATATGTGGGGTGCACAATACAATATTGATGCAAGCACTGACAGAACGCCAGGATTGCAAAGTGCAACTTTTGAAGATAACTGCACTTGCACTTAATTCATGCAGAAGCATGATACAAGAGACTGGAAAAAGGTTAGCTAGTTTTGCTGAATCATTGAAGTTACCCTTTTCATATAATGCAGTTTTTGTGACAGACTTTGCAGAGATAAGGGAAGGTGATTTTGAAATTGGAGAGGGTGAAGCAGTGGCTGTGTACTCTCCATATTTTCTGAGGCGCATGGTATCAAGGCCAGATTGTATGGAAAACTTGATGAGGGTTATATGGAATATGAAGCCGGTTATAATGATAGTTCTTGAAGTTGAAGCAAACCATAACTCACCCATCTTTGTGAACCGGTTCATTGAAGCATTGTTCTTCTACTCGGCTTATTTTGATTGCCTTGGAAGCTGCATAAATGATGAGAATGAGAGCAGAAGGAAAATAGAAACAGTTTTATCTGAGGGGATAAGGGAAATTGTTGCAATGGAAGGGAGAGAAAGAAAAGTTAGAAATGTGAAGATAGATGTTTGGAGAAAGTTCTTTGCAAGGTATCGAATGGTAGAAACAGGGTTTAGTGAGTCATCTCTTTACCAAGCTCACCTGGTGAACAAAGAGTTTGCTTTTGGGAAATTCTGCACTCTAGAAAAAAATGGCAAGTGTATTATAGTTGGATGGAAAGGGACCCCAGTTCATTCAGTCTCGGCTTGGAGGTTTCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21277::LG5:31601217-31603217(-)
AACCCTAATTCCATTCACTCTCCCTTTTCAGCGCCGCATCTACTGCCAGATAACTATTCATTTCTCTTTTTCCCTTTCTTCCTCCTCTCCTCCTCTTCTTTTACTTTTTTTTTTGTAATCATTTCCGTTAGCCCCACACCTCCACATAACCACTCATTTGTCTCTTTTCCTCTCTTCTGCTCTCCTCCTCTTCCTCTTTAATTTTTCATTTCCTTTTTCCTAAGTTGCTTCCATTCTCATTGAATTTCCTCCATTGCTTCCATTGTCACTATGATAGAGCTGATGAAATGAGCGGAAGTAATTGATGCAAAAGAACTTGCAACACTAGATTATTTTTGGTTTATTAATTAAATATTTTTTGTAGAGTTATTTATCCGATAGATTTATTTGTAGTTGATTTAAAAAAAATTGTATATTTATTTATGAAAAATAAAAATTATTTTGATATAAAAAATAAGAAAAAATGTATAAGGAGTCTACAGAAATGGAACATCCGTTGAAGTATTAACGGATCCGTTTTACCTTAAACGGATGTTGACATCCGTTGAAGGATGTTGACATCCTTCATCCGTTGAAGGATGTCACTTACGTTTTTTATTTTAGGGTTTTATTTGAAGGTTTATTCGAATACGCATCTGGAGGAAGCAACACACACTACACCACGAGAGCTACACCACGAGAGGGAGACTCCTTGATAATTCTTTCTACCACCACCAACCTTTGCAACTTGTAGTCTCAAAGCGACGAAAGAAAGAAAGGAAAAATATAATGTTAAAATAAAATAAAAGTATTTTACTCATATACGGGAGACTAGAATATTAGAATAGGGAGCGACCTTTAAAACCTTTGTCATCATGATTGACTTATTTGAGTCTTTTCCCGTAGATGGTTTGAAATATCTGCATGATTAACCGTAATTTATATTTACATATGGTAAAAATATGTATAAGTATTTTAGTTTATGAAAATAATAGTAGCACTTAATTATACCTCACTTCTTTTAATATTCATTTAAATTTTAGAAAATCTTTTTAGAATTAAATATTTAATAATTAAATACGTAAACAGATTTTATATTTTAATACGCTAAATGTATTAATCTTTTTTTAGTATATTTTATAATTAAAATTAAAAAATTAGCATTTGAACTGAATAAGATTCATAAAAACATATTTCAATCCTTAAAAATATTCGAAATATGATTGTAAAGTTCCTTCCAATATTATTAATTAAAATTTATTCAACAATATTGCAATTTTATGTGAATGACACTCCTTATTAATAACCTTACTCATAATTTTATTAATTTTAGCAAAGTTAAGTAATAAAAAATTTTGGACATGTATCGAATATTTATTGATTAGATTAGAGAAAGGTTCAATTAACCATTTATGTTACCATTTCTACATGACAAAGAAGTATGATTCTTAGTGAACATTAGCCAAAACAAAATCAATTATTACTTTTAAAATACATAGTATTCGTCATAGTTATGTGTACATAAAGTAATAAAAGTAGAGATAAAGTCAGTTTGGAGTTACACTCTTGTTGGATTCCCTTGTTGTCTTGGAAAAGGCCATCCCTCATTTTTATTTAAATCCATTCTTCATTTTCTTGGACCGTCTAATCAATCTGGCTGAACTTCTTATGAAAAGTTTCAGATATAATATTACTTCGTGGCTTCTTCGGACCCACACCATTGCTTCCACAGACAAAACTCCTCATAATTAAATACAAATTTTCATTGTTATATGCCAAAGTTTTGGTTTGGTAAAAATGTCCGGTTTTTTTTAATAGCTGGCTGACGACTGCAATGAGAACATCGAGGACATCATCGTCGGAGTTACATGTTCCTATCACTTTCATGAATTTCGTGATCATATGTTTCTTCGATCATTTATACGTTCAAATATTCCTTTTCCACCTTGAATCGTGGTAATGGATACCCTCTCCCCTACGTTTATCTAGATAAACACAATTTCTTGATTAATTACGTTAAC


Gene Sequence:
>Vu_21277(-)
ATGGAAAATGATAAATTTTCATCCACAGCTTTAAATTTAAGAGAAATCCTAGTGGGTTATGGCTCTACACAAGAGGATGTGTTTCAAGAGAAAGAGGGTTTTTCTGGAATGGAATTGCTGGGACCTATTGAGGATGAAAAAGGAACCAAACTGTTCGAGGATGAAGATCAGAAACAAGTCGATAAGTTGTTAGAAGTGTTTAACTGTGACTATGATATGCAACTGAAACCGACACCACAGTTCGATGAAACTACGCGGCCAGCGAAGCATGACATAGAATCAGCTGAACACAATAATCATGTGTCACCATCATTAGCATCCTTAGAGCTGCTGAGAAACTACATAAGCAGATTTAAGAGGATAAGCGAGCAAAATATAGCGAAACCTTCTTTGGATCACCACCAGATATCAACTGAAGAAATTATAAGAGTAGCTGGAGCAAGGTTTGTCACATATATTTTTAGTTGAATTGATATTTTTTAACATGTAAATTGTGTTTCCGATTCAAAATCTGTTATGATCTTGTGCTTTCAGATATGTTCAGTATTCTGCACATTGGAATGATAGTTTTTGCATCCCTATGCACCCATACGGATTGGATTTTGGATGTTTGTCTGAGGAGGAAAATAGAGACGTAGAACTTGCTCAGTTTCTCCTTGCTGCAGCTGAGAGGGTAGGTTGCCACCAGTTTGAACGTGCAAGCAGATTACTTCTCCACTGTCAACTGAATTCATCACCCAATAATGGAAGCCCCGTTCAAAGAGTTATCTTTCACTTCGCCCAAGCACTTCGAGAGAGAATCGACAGAGGACTGGGAAGAACGACAGCGAAGGGATCGGAGAAAAAAGAAGAAAGGGGGTGGATTCAAAAGATTGACACCAATGTTGCCCTAACATTCCATCAAAATATTCCTTTCAATCAAGTCATGCAATTCACTGGAATACAAACTATAGTGGAACATGTTGCATCTGAGACCAAAATTCATGTTATTGATTTCGAAACAATATGTGGGGTGCACAATACAATATTGATGCAAGCACTGACAGAACGCCAGGATTGCAAAGTGCAACTTTTGAAGATAACTGCACTTGCACTTAATTCATGCAGAAGCATGATACAAGAGACTGGAAAAAGGTTAGCTAGTTTTGCTGAATCATTGAAGTTACCCTTTTCATATAATGCAGTTTTTGTGACAGACTTTGCAGAGATAAGGGAAGGTGATTTTGAAATTGGAGAGGGTGAAGCAGTGGCTGTGTACTCTCCATATTTTCTGAGGCGCATGGTATCAAGGCCAGATTGTATGGAAAACTTGATGAGGGTTATATGGAATATGAAGCCGGTTATAATGATAGTTCTTGAAGTTGAAGCAAACCATAACTCACCCATCTTTGTGAACCGGTTCATTGAAGCATTGTTCTTCTACTCGGCTTATTTTGATTGCCTTGGAAGCTGCATAAATGATGAGAATGAGAGCAGAAGGAAAATAGAAACAGTTTTATCTGAGGGGATAAGGGAAATTGTTGCAATGGAAGGGAGAGAAAGAAAAGTTAGAAATGTGAAGATAGATGTTTGGAGAAAGTTCTTTGCAAGGTATCGAATGGTAGAAACAGGGTTTAGTGAGTCATCTCTTTACCAAGCTCACCTGGTGAACAAAGAGTTTGCTTTTGGGAAATTCTGCACTCTAGAAAAAAATGGCAAGTGTATTATAGTTGGATGGAAAGGGACCCCAGTTCATTCAGTCTCGGCTTGGAGGTTTCTTTGA