Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21260 LG5 31436862 31440610 hypothetical protein PHAVU_001G211700g
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   positive regulation of flavonol biosynthetic process, flavonol biosynthetic process, positive regulation of flavonol biosynthetic process, response to UV-B, response to light stimulus, response to UV-B, flavonol biosynthetic process
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity, protein binding
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 31436877 synonymous_variant p.Leu272Leu
T/C 31436878 stop_lost p.Ter271Trpext*?
G/T 31436964 missense_variant p.Leu243Ile
T/C 31437066 missense_variant p.Thr209Ala
T/C 31437272 upstream_gene_variant
C/A 31437358 upstream_gene_variant
G/T 31437420 upstream_gene_variant
G/A 31437535 stop_gained p.Gln142*
T/A 31437553 stop_gained p.Arg136*
G/A 31437898 intron_variant
T/A 31438083 intron_variant
C/T 31438107 intron_variant
T/C 31438161 intron_variant
T/A 31438262 intron_variant
T/A 31438306 intron_variant
T/A 31438392 intron_variant
C/A 31438393 intron_variant
A/T 31438408 intron_variant
G/T 31438506 intron_variant
A/T 31438599 intron_variant
A/T 31438600 intron_variant
G/T 31438608 intron_variant
A/G 31438660 intron_variant
G/A 31438675 intron_variant
A/T 31438728 intron_variant
C/G 31438734 intron_variant
A/T 31438740 intron_variant
T/A 31438802 intron_variant
T/C 31439121 intron_variant
C/T 31439183 intron_variant
T/C 31439760 intron_variant
T/C 31439804 intron_variant
G/A 31439809 intron_variant
A/G 31440081 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21260.1
MGRAPCCEKVGMKKGRWTAEEDEILTKYIQANGEGSWRTLPKNAGLLRCGKSCRLRWINYLRADLKRGDISLEEENTIVKLHASLGNRWSLIASHLPGRTDNEIKNYWNSNLSRKIYTFRGTTNTKPDIITLTLPPKRKRGRTSRWAMKKNKTYCAPKTKATALTSSYSESSEVVGNKTCDHTVLSSGREKQCFCSTKFSSDSDLCQSAAQLDHKDESLLDHKDEPLLDHKDESVSWEQHQSLLSWLCEDEDWEKDLQSVGEIDPQKQKDMVDWFLS*


CDS Sequence:
>Vu_21260.1
ATGGGAAGGGCTCCTTGTTGTGAGAAGGTGGGAATGAAGAAGGGGAGGTGGACGGCGGAGGAAGATGAGATTTTGACCAAGTACATTCAGGCCAATGGAGAAGGTTCTTGGAGGACGTTGCCAAAAAATGCAGGATTGTTAAGATGTGGGAAGAGTTGCAGGTTAAGGTGGATTAACTATTTGAGAGCTGATCTAAAGAGAGGAGACATTTCTCTCGAGGAAGAAAACACCATTGTCAAGTTGCATGCTTCGTTAGGCAACAGGTGGTCCTTGATAGCAAGCCACTTGCCAGGAAGAACCGACAACGAGATTAAAAATTACTGGAACTCTAACTTAAGCAGAAAAATTTACACTTTCCGAGGCACAACTAATACCAAACCAGACATCATCACTCTCACTCTACCTCCCAAGAGGAAACGTGGTAGGACAAGTCGCTGGGCCATGAAGAAGAACAAGACATATTGCGCCCCGAAAACAAAAGCAACAGCTCTTACCAGCAGTTACAGTGAGAGCAGTGAAGTGGTTGGGAATAAAACTTGTGACCACACCGTTTTGTCGAGTGGTCGGGAGAAGCAGTGCTTTTGTTCAACCAAGTTTTCTTCTGATTCTGACTTATGCCAAAGCGCGGCACAGCTGGATCATAAGGATGAGTCTCTGCTGGATCATAAGGATGAGCCTCTGCTGGATCATAAGGATGAGTCTGTGTCGTGGGAGCAGCATCAGAGCCTCCTCTCTTGGCTTTGCGAAGATGAAGATTGGGAGAAGGATTTGCAGAGCGTTGGTGAGATTGATCCTCAGAAACAAAAGGACATGGTTGATTGGTTTCTCTCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21260::LG5:31440610-31442610(-)
AACTATAATAAAATACTATTATTTTTAACACTTAATAAAAAAAAATCATTTTTTATAAATATTAAAACATATTTAAATGTAGATTGTGAACTAATATATGTAATATGAAAGAACATTTTTCTAAACATAATACGAGGACATATGTTTTTTCGCATTCATCACGTGAATTCAAAGGATTCAATCATTTAACTTTTGACAATTATTTTGTTTTGGAATAAATCATTTAACTTTTGACAATTATTTTGTTTTGGAATAAAATAATGATACATTGATTACATATTTTTGTTACAACATTGTATGTGTCATTTTATGATTGATTCATGTTAGTATTTATAAATTATTATTATTGATTGTGAAATAATTTTGGACGAATCACAAATAACACGTAAATAATATTAAAATATCGTAAAAAAAATGTTTTCAGAAGTGTCCTTATTTTTTTTTAATAACACTGTCAAACAATGATTTGAAGTAATGAATAGCAGTGAAATATTGCGTAAAAGGACACCTAAAGTAATATAAAAAAGAAGTGAATAGAAAAAACGTAATGAAAAACCAATAATAGCATAAGATTAGAAATTGATGGAGACAATTCTTACCGCATTAAATTTGAAATAGTGGCGTTGTAAATGAAGGGCTATACATTAATGAGGAAGATGGAATGCTCCGTCAGTCGAGGCTCATGTCCCTCGACGGTGGGGAAGCCACGACTGTCGAGGCTGATGTCCCTCAAACTTTAAAATATATATTGGGACAGTCAACGTGGTTCCTCTTCCACCGCTAATATAAATCTCTTTCTAAAGCCCCACTTCCGCCCAACAAATATATACTACATATAATAAATATTAAATATATTTTAATATTTTAAATTTAACGCTAAATTAAATTTTTAATTTTAATAATACGAACATAAATTTTATTACTTTTAAATTTTTTTATATATTTTAACCTCAAACTTTAAAATATATATAATTATTTTAATTTTATAATATTAAACTATTTTAACATATCAAAAATATTTTTTAATGAATATTATAACATGAATGTGTCAAAAATATACATAACTTAAAATTAATATAAAAAGTGTTTGATATGTCAATACAATTTATTATAAATATAATTACATTAAAATAATTATATTTATTTATTTTTAAAATTTGATAACAATGTTTTAAGAAAAATTCAAATTCACATTAAAATTCAAAAAATATATTTAACGTTAAATAAATTATTAAACTATGAAAGAAAATAAAAATAAAAATACTGAAAATGTTTAACAGATTTTACAATGTTATTATTTTACGATTAAATTTATAAATTAAAAACTTAAAATATATATGTTTAGAAGTCTCAGATAAATTATAAATACAGTAAATTTAGAGTATATATATATAATTATAAAGTTTATCTCATAAATCAATTTTATAAAATTTAGTTAGATTTAAAAATTATTTATTAATATAATATTAAAATTATAAATTAAAATTTATTTTAACGATTTTTGTATTTGTTAAACATATAATTTTATCTATTATCAAATTATTATTGAATCATTTATTAACATCTAATTTTATCTTTAAAAATTAATTTAAAAAGAAAAGTAATTTATATTCTAACATTAAAAAATATATTAAAAATGTTATATAACTAAAACTAAAATTAATTTAAAAAATATATAAATATTAAATTAATTTAAAATTCTTTAATTCGTAACATAAGCAGACAAAGACTTTATATGAGCTAATATATTTTTAATCTTTCTATTTTTGTCTGGGGTCACCTTTCTCCTGCCTAGAGTCTGCTGCCCCTACCCTACCCTTTTTAAATAAGTTGTGCTGCTGACTGCAGCATTTGCTATTATCACACAGCAGCATTTGCTATTATCACAGAACCGCCACAAAAAGGTGATACATTAAAACTGAAACATGCATACAAGCACACCCACTAGTGCCAGCACAATTAAAATCAAGTGAAAGAGGTAGCTTCTGCAGAACTCAGAT


Gene Sequence:
>Vu_21260(-)
ATGGGAAGGGCTCCTTGTTGTGAGAAGGTGGGAATGAAGAAGGGGAGGTGGACGGCGGAGGAAGATGAGATTTTGACCAAGTACATTCAGGCCAATGGAGAAGGTTCTTGGAGGACGTTGCCAAAAAATGCAGGTAAAAAGCTAATTAATGCCACAACTATTATACATATATACTTTGCTTTTCTGGGTACCTTTTTGTTGACTGTGACCTTCAGCTATATAATTATTCTACAAGCCTCTAATTTTCAGCCATGGATCGAATCACTTTTTCTCTGACTGCCATTTACACTTTTGGGTTGTGCAGGATTGTTAAGATGTGGGAAGAGTTGCAGGTTAAGGTGGATTAACTATTTGAGAGCTGATCTAAAGAGAGGAGACATTTCTCTCGAGGAAGAAAACACCATTGTCAAGTTGCATGCTTCGTTAGGCAACAGGTTAGTTTCCAGATCATTCTCATGCTCGTTTCTCAGATTAAAGCCACTTATTTTCCGTCAAATTTAAACTTCATAAAACTCCTACTTTTAAACGTTATAAATGTTTCAAAATTAACATAACCATTTCTTCTCCATACTTCTCACTCATTCAATAGACAAAATGTATTTCTAAGCACAAAAGCACCTCAAACTAATGCAGCATGTCAGTCTTACTAATCAAAATTTTATGAATATTGCTCTTTGTTTTCTTTTTCTTTTCATTTGCGTGATTACACAAACTTTATTTTAAACAAATTTACTAAATCAACCAAATAGCGGCTTGGTTGAAAAGAGAACTGTGAGAAAGAGACTTCGACAACAATTCCTGCAGAGATTTTTTCATTAAGCCTAAGTTAGACAAACTTTATTAAAAAACAAATTGACTATATCAACCTATTACTGTCTTTTTTAGTTTTTTTTTTTTTTTATGAAAATTAATGTCTTGTTTATATGAAATGGAAAAAGAGAGAAAGAGACCGTGATAGCAATTATTGTAAAAGTTGTTTTCATTTATTTAATTTAGGCAAACTTTATTTAAAACAATTTACATAATCGGCCCATTAATTCTTCGTTTAACTGCAAAGAGACGGGAGGAAGAAAAAAAAAGACATGGATAACAATATTTGTAAAATTATGTTAAAAGAAAAAAAAACTATGGTATGTTTGGATAATATAAGAGAAAATAGAGACATGAAAATATAGATAATAGTATTATTGTTTGATTAATAAATAAAGGAAAATATTTTACTTTTGTGTACTAAAGAACTATACAATTTTTTTCAGCTTTTCTTATTAGAAGTTCTCTTCTTTTTTCTTTTTCCTTTCCAACCCTAAAGTAAAAGTAATTTTTGTTCCTAAATAAACTTATTTTTAAAAAAATACACAAATAAACTCTTCATAATTATGTTGATATAATTGTAGAATTGTTTATTATTCATAAATTAGACATTGAATGTTATGAAATCGAATTCTGACGTCTGAGCAACATTTATACGTAAAAAATCTGAATATAAGAAAATTATCTATTTAATAAAATTTAGAAAAGTTTATTTGTGTAATTTAAAAAAAATGTTTGGAAAAAATAATCTTGCATCTCTTGCACTAAATATTATATATAGATAAATAACATAGTCCATGTACTTTATACTTCAAAATTTTTCACTTTCCAATAACAATTTATTAACTATTGTCTCAGCCTTGACTACAGTTTTAGTTATTTTTAATCAAAATTAATTGATGTTCTCATTTTTTAAAAATAGTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATCCCCAGATAACTTTTATTTGTAATACATTAATTGTTTTTATTGTGTATTTAAAAAATTTAAATCGTTCTTATTATGGACAGAGGTATTATTATAAAAATAATAGTAAAGAAATAAAAAGTTTTTTTTTCTTAAAAATACCAATTCTATAATATCAATGTATCACCATATTTTTTAATCAATGAGATTCACTCTTTTTTTTGGTACTAATTGACAACACCAAATATTTTGACAAATTTAAACCAACATATTAATTTTAATATTTTTTCTTTAATTACTAAAATTACTTAATTCAACTAACATTTTAAGTTATATATTTTAATTTAAGTTTAATTAGGTGTTAAATTACTCATAAATTTATGTATTTTTACTTTATTTTCTTTTAATTTTTTTACTCTGTTGAGTAATTAAAATATTCATTTATTTTTCATTTAAGTTTTTAGTGTTTTTTGTTAACCGTGGAAGATGATTGTTCTCTCTCTTGTCTTCTTATCTATCTTAATGGTCTCCTTAAGAAATATGAAATTATGATTAAATATATGAAAAAAAATATATATGAGAAACATGGTTACCCAAAAAAATTTCATATTCAAATTATTTTAATTGTCTCCTTAAGAAATATGAAATTGTGATTAAATATAAAAAACAAATATCAGAAACATGTTATCCAAAAAAAAATCATTTTTCTTATGTAAATAAATGAGATAATATAACAACCATATCATGAATTTTTAGATACTTAATACAGTAACAAAATTTAACAGAAACTTAATTAAAAAATATCTAAAAATTTATATTTTTTCATAAATTTGAAACTTAATCCATCCTTTATTTTGTCTGAGAGAAATATTAGAAGATGTTTCTTGATAATTTATGACATTCTCTAGTATTAGCCACTTAAAGTTCATTGAAACATACAAATTTAGAAACAATTAATAGAGATATATAAATCTTATCAGTTTAATTATTTATTTAGTCCACTTCGTTGCACAAAATTACGAAGAGATGTGTTAACATTTCACATTCTGGAAACTTCATCTATCAACGTGTATATATATATATTCTTATTAATTTTATCATATTTTCCATGTGAATTTCACTTCACATAATTCAAAGAGATCATTAGTAATAGCTGTATGAGTTGGTGAACTTCAGGTGGTCCTTGATAGCAAGCCACTTGCCAGGAAGAACCGACAACGAGATTAAAAATTACTGGAACTCTAACTTAAGCAGAAAAATTTACACTTTCCGAGGCACAACTAATACCAAACCAGACATCATCACTCTCACTCTACCTCCCAAGAGGAAACGTGGTAGGACAAGTCGCTGGGCCATGAAGAAGAACAAGACATATTGCGCCCCGAAAACAAAAGCAACAGCTCTTACCAGCAGTTCCTCTTCCACCAACACCTCCACTTGAGACCGAGAAACATTCAGTTCACCCATGAGAATACTACTACTCAAGAAGAAGAAAACCTAGTCACTAATGCCACATGGGTTGAGGGTGAGAAAGAAATAATGAACATCTGGGGACCCTATGACGAGGAATTTATTAATGGGGGAGACGGGGGATCAAGTGTTGAGTTTTGAATCTTTCAACGACATCATGAACAGCTACTGTTCCCAAGCAAGTGGGTGTTGGACCATTTCTGATGAAGGTTACAGTGAGAGCAGTGAAGTGGTTGGGAATAAAACTTGTGACCACACCGTTTTGTCGAGTGGTCGGGAGAAGCAGTGCTTTTGTTCAACCAAGTTTTCTTCTGATTCTGACTTATGCCAAAGCGCGGCACAGCTGGATCATAAGGATGAGTCTCTGCTGGATCATAAGGATGAGCCTCTGCTGGATCATAAGGATGAGTCTGTGTCGTGGGAGCAGCATCAGAGCCTCCTCTCTTGGCTTTGCGAAGATGAAGATTGGGAGAAGGATTTGCAGAGCGTTGGTGAGATTGATCCTCAGAAACAAAAGGACATGGTTGATTGGTTTCTCTCTTGA