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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21173 LG5 30786744 30789772 PREDICTED: wee1-like protein kinase
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09143 Cell growth and death   C 04110 Cell cycle [PATH:ko04110]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 30788004 missense_variant p.Gly299Val
A/T 30788036 intron_variant
C/T 30788074 intron_variant
G/T 30789164 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21173.1
MKGKSHKIGKKQSRKMKGALTNSTTRHLQLQLGQVSLIPLNQPSSTTSSDVSCFQNLLHSEPPNTSSSRVPLTDDSFADDRYCILSQDFFCTPDYITPDNQHTLNGFDCDMDTPCPKSPEKLNTTKSKRCRPDVMSVQPLSPTFSGDHQPAVELGKDSVDDEFALEKTIAAAKPKGQNYVSQSAIALRFRVMPPPCFRNPFLKDVTEKEIDSFGNQRLKCAGLFPAISGGDGLSRYRADFHEIEQIGGGNFSHVFKVLKRLDGCLYAVKRSIRPLRLETERTKALMEVQALAALGLHQNIVGYYSSWFENEQLYIQMELCDHSLSIRKCPEAFTEAQVLDALFQVANALRFIHEKGMAHLDVKPNNIYVKSGVYKLGDFGCATLLDSSLPIEEGDARYMPQEILNENYDYLDKVDIFSLGASIYELIRRLPLPESGCQYFNLKEGKFPLLPGHSLHLQNLLKVMMDPDPVKRPSARELVENPIFCKKTQRIA*


CDS Sequence:
>Vu_21173.1
ATGAAGGGGAAAAGCCACAAGATTGGAAAGAAGCAGAGTAGGAAGATGAAGGGCGCGTTGACTAACAGCACCACCAGGCACTTGCAGCTTCAGCTAGGTCAAGTCTCCCTCATTCCTCTCAACCAACCATCTTCTACCACTTCTTCCGATGTTTCTTGCTTCCAGAACCTTCTGCATTCCGAACCTCCCAACACGTCTTCATCGCGCGTTCCGCTCACCGACGATTCCTTCGCCGACGACAGATACTGTATTCTCAGCCAGGACTTCTTCTGCACTCCGGATTACATCACTCCGGACAATCAGCATACTTTGAATGGCTTTGATTGCGATATGGATACACCATGCCCCAAATCGCCTGAGAAGCTTAACACTACGAAGAGTAAGAGATGTCGACCAGATGTTATGTCGGTTCAACCTCTCAGCCCCACCTTTTCTGGTGACCATCAGCCAGCTGTGGAACTGGGAAAGGATTCTGTTGACGACGAATTTGCTTTGGAGAAAACAATAGCAGCTGCTAAACCAAAGGGTCAGAATTACGTGTCCCAATCTGCAATTGCATTGCGTTTCCGGGTTATGCCTCCTCCTTGCTTTAGGAACCCATTTTTAAAAGATGTTACAGAAAAGGAGATTGATTCTTTTGGAAACCAAAGATTGAAATGTGCAGGCCTCTTCCCTGCAATCAGTGGTGGTGACGGGCTTTCACGCTATCGTGCTGACTTTCATGAAATTGAGCAAATTGGTGGAGGGAACTTTAGTCATGTTTTCAAAGTATTAAAACGACTAGATGGATGTTTGTATGCTGTTAAACGGAGCATCAGACCGTTACGCCTTGAAACAGAAAGGACAAAAGCTTTGATGGAAGTTCAAGCTTTGGCGGCCCTAGGTTTGCATCAGAACATCGTGGGCTACTATTCTTCATGGTTTGAAAATGAACAGCTGTACATTCAGATGGAGTTATGTGATCACAGCTTATCTATAAGAAAATGCCCAGAGGCATTTACAGAAGCACAAGTGTTAGATGCCTTATTTCAGGTTGCCAATGCTCTGCGATTTATTCACGAGAAGGGAATGGCTCATCTAGATGTGAAACCCAATAATATTTATGTGAAGAGTGGTGTTTATAAACTCGGTGATTTTGGATGTGCGACTCTTCTTGATAGTAGCCTCCCAATTGAAGAGGGTGACGCACGTTATATGCCCCAGGAAATTCTTAATGAAAATTATGATTATCTAGACAAGGTTGATATCTTCTCCTTGGGAGCTTCTATTTATGAACTAATCCGCAGATTGCCTTTGCCAGAATCAGGATGTCAATATTTTAACCTCAAGGAAGGCAAGTTTCCCCTCTTGCCTGGTCATTCCTTGCATCTTCAAAACTTGCTCAAGGTCATGATGGACCCTGATCCGGTTAAGCGGCCTTCTGCTAGAGAATTGGTAGAAAACCCAATTTTTTGTAAGAAGACTCAAAGAATTGCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21173::LG5:30789772-30791772(-)
GCTTTACCGACGGCCGAAAGCCTTCGGTAATTACCGACGGACGAAAGATCCGTCGGTAAAGTTTACCGACAACGTTTTTACCGACGGTATGTTGGCCGTCGGTAAGCCGTCGGTAAATGCTAATTACCGACGAATTTTATACATTACCGACGAATTATGGCCGTCGATAATCTCAATCATTCTTGTAGTGATAAGATGGATGTAAACAGAAAGACAACAACTTTTTTTGAAGAAGGCTTTGGACGCTAAAAGAACCTATGTTTTAGTTTGATTAATATAGTTAATATTTTTTTTTTGTTATATAGTTATGTTTTGGATAATTGTAATTAAAATTTTATATATTGTTGTGTTAATTGATGTTGTTTATTAAGCATAATCATACAAATTCCTTCATATTCCTTTTTTTTAAACATAACTAGAAACTTCTAAATGTAGCATAAAGAATATAGACATATTTTTATGGTGAACGATGAGCTCCATATTCTTTTGTGAAAAGGAAATCTTAAATGCCTTTATTTTTATGAAATGTTGAATGCCTGTCTACAATTAAAATATTTCGTTTTTTTATTCTATAATGTAAATATTAATATGTTTTCATAAAAAAAATGCTATTTTTTAATATATTATAACTTTGACTTAATTATATCCATTTTTAGCAGCCTATAATGTATTTTCATTTAATAATGCACGGACAATAAATAAATATCTTTAAATCTTAATATATCATAATCACAATTCACTATATACTAAGTCTTCAATAAGATAATTATCATTTGGATTCAACCATTCATGATTAAAAATCAGTAAGCAAACGCAATACTTGTTTCTATCTCGTACTTGTATAATCATATTTTTATACTTTATTCTTAACACGTAATAAAAAAATTAAAGATACGTTCTATTCATTTTTGATCAAACATATATAAGTTAATAATTAATAATACACATTTTTTTTCTTTCAATTTAGATCTATATTTCATTTTATTAAAATAGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATCTCTGTGTCTTCCTTTCATACAATCAAGTACAGATATTCATTTTACCTTATCCAATTTAAGGCTTTTCATAGCTCCAGAGAAGTGACATATGAAAGGAAGACACAGAGATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTATACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCATTAAAATATACGTATTTGTTGAACTTTTCTTTTCCATAGTGCCTGTATTTCCTTATTTATTTATTTTTTCTTGATTTCGCTCAATGAATTAATTATTAATCATTAGTACGGCAAATCCTTACCTATTCCAGAAAGGTACGGTTTTCCACATGGATACAATGCACACGCGTCTCACCAGCACATCTTATTCTCTCTCATCCCACTTCAACTTCAATCAATCAGCTTACGCAGCACGCCAATACAGTACGCGCAATCTAAACCAGTTCCCTTATCAAAGTCAAAATCTCACCGTTCATCAGACCCCTTCTTCCTCAATCAACAGCCAAGATCCACTTAACAAAATTGCCCAAGTAGACTTCCCCACACGGAACACCCTAAAAATTGAAAATAACCCGCGCGATTTTGAATTCCTCTGCCACTCCGTACTCCACTAGCTTATTTTTAATTTATTTATTTTCCACAAATTTCACTATCATTTTATATAATATAACTGTGTTTTTTACTGAAGTAAGCTAAAAGTTTGTGATTGATCGTGATCGTGGTGGTGGAAGACGAAG


Gene Sequence:
>Vu_21173(-)
ATGAAGGGGAAAAGCCACAAGATTGGAAAGAAGCAGAGTAGGAAGATGAAGGGCGCGTTGACTAACAGCACCACCAGGCACTTGCAGCTTCAGCTAGGTCAAGTCTCCCTCATTCCTCTCAACCAACCATCTTCTACCACTTCTTCCGATGTTTCTTGCTTCCAGAACCTTCTGCATTCCGAACCTCCCAACACGTCTTCATCGCGCGTTCCGCTCACCGACGATTCCTTCGCCGACGACAGATACTGTATTCTCAGCCAGGACTTCTTCTGGTACTTATCTTATTATCCCTATCGAATTTTGCGATTTCGTTTCCTCTTTCGCTCACGCGGTTCCTTTTTTGTTCCTGGTAGCACTCCGGATTACATCACTCCGGACAATCAGCATACTTTGAATGGCTTTGATTGCGATATGGTAATGTATTTCAAATTGACGATGTCGTGGTTCTTTCCGTTGCGTTGAAAAGAAATTGGAGCTTATTAGGGTTTCTGTTTCGCAGGATACACCATGCCCCAAATCGCCTGAGAAGCTTAACACTACGAAGAGTAAGAGATGTCGACCAGGTAAGATCCGTCGCATTTTATTGTGTTTTTTTGACAATCTATTACCGAGTTTTATGTTTTCGGCATTCGGATTTTTTACGAAGAGTCTGAGATTAGAAATCCGTGTACTGTCTCATTTTCTCAGCCTAATCTTTCATATGTATGTATATTAGTCTTGACACGAATGACTTGCATGCCAAGCGAGTTGCAAAGGTTTCATTGTTTATTATACTTTTTGTTTCTTGTTTTCTCATAGTCGGTTCAACCTCATTAAAAACATCTAATATGTATACTTTTCTTAGATGTTATGTCGGTTCAACCTCTCAGCCCCACCTTTTCTGGTGACCATCAGCCAGCTGTGGAACTGGGAAAGGATTCTGTTGACGACGAATTTGCTTTGGAGAAAACAATAGCAGCTGCTAAACCAAAGGGTCAGAATTACGTGTCCCAATCTGCAATTGCATTGCGTTTCCGGGTTATGCCTCCTCCTTGCTTTAGGAACCCATTTTTAAAAGATGTTACAGAAAAGGAGATTGATTCTTTTGGAAACCAAAGATTGAAATGTGCAGGTATGATTCTAGTTAGTTCCTTCGCTATTTCTTTTCAATTATCGTAGACAAGCTTTTGCTACCTGCACGATATTATACCTTTTGGTATTTTTGTTTTCACAATTATTGTAAATTGCTAACTACACAATGGTGAAATTGAAGGCCTCTTCCCTGCAATCAGTGGTGGTGACGGGCTTTCACGCTATCGTGCTGACTTTCATGAAATTGAGGTAGTGTGTTTTTTAAAAGGAAAATGTTAACTTCTATGGATTGTTTGAATTGGTTTTAGCTTCTCTGGTTCGATAACTTAGGTATAACTTATCCTTTCATTTTCAGCAAATTGGTGGAGGGAACTTTAGTCATGTTTTCAAAGTATTAAAACGACTAGATGGATGTTTGTATGCTGTTAAACGGAGCATCAGACCGTTACGCCTTGAAACAGAAAGGTACAATCTTCGAACTATTGGATGTTCTTATTTTTTTCACAGGTCCGGTCGCTTACTATAATCGTCCTACATTGCAGGACAAAAGCTTTGATGGAAGTTCAAGCTTTGGCGGCCCTAGGTTTGTAACTCATAGTTCCACCTCTTGTTTTATTCTGCATAGTGGGTTGTGTCGAGTTTGCTTTCTATATTTCATTAACCTTTTGGTTCTTCAGGTTTGCATCAGAACATCGTGGGCTACTATTCTTCATGGTTTGAAAATGAACAGCTGTACATTCAGATGGAGTTATGTGATCACAGCTTATCTATAAGAAAATGCCCAGAGGCATTTACAGAAGCACAAGTGTTAGATGCCTTATTTCAGGTGAACTTCTTTCGCGACCATTTTTAATGGGCCTTGCTGTTATGCTTCATCACACGGCATGTAGGAGTTATGAAAGCCGGATGTCTCACACGAAATACCTTCTATTTACTATGATGAAAGTCCACTCACTGTCTCTCTTAGATTTTTATTCTGGTAGAGTCATACACAAGTTTCTCCCAATCCGTTGTGCTTATGCATATTTTTTATTCGATTTGTTATGACATTGCCAGGTTGCCAATGCTCTGCGATTTATTCACGAGAAGGGAATGGCTCATCTAGATGTGAAACCCAATAATATTTATGTGAAGAGTGGTGTTTATAAACTCGGTGATTTTGGATGTGCGACTCTTCTTGATAGTAGCCTCCCAATTGAAGAGGGTGACGCACGTTATATGCCCCAGGAAATTCTTAATGAAAATTATGATTATCTAGACAAGGTTGATATCTTCTCCTTGGGAGCTTCTATTTATGAACTAATCCGCAGATTGCCTTTGCCAGAATCAGGATGTCAATATTTTAACCTCAAGGAAGGCAAGTTTCCCCTCTTGCCTGGTCATTCCTTGCATCTTCAAAACTTGCTCAAGGTAATACATTGTTTTGGTTTAATGTCCGGTAAACTGTTAACAATTCACTCCTTCCAATGGTTTTGTTATCTTTCAACACGGTGAATTTCTTGCAAGAGTGATAGAAAATATAGTTTTTGGGTTGTGGTTTACTTTGGTCAAGAAACTAGGCATTCACACACGTAAAATGAATTATAATTCCATTATCATACATTTGCTTTACTACCAGTACTTCTATAATCTGGTGAAGTTTAAGTTCTACTCTAAAGCTTCAGTATTTATCGTTGCGTCATCCAGTTACTACTTCATTTAAATTTGGAAGATTGTTCATTTGCACGAAAATAATTGTGATAATATTTGTGTCCAAAATCTATGTATTGTTTGTTCTTTTGATATTTATCTTCATTTCAAGTTTTCTTGTCCTAAACAACATTGTTTAAATTTGTAATTTTAACATGCTTGTTTTGGTGATTCAGGTCATGATGGACCCTGATCCGGTTAAGCGGCCTTCTGCTAGAGAATTGGTAGAAAACCCAATTTTTTGTAAGAAGACTCAAAGAATTGCGTGA

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