Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21147 LG5 30571710 30580401 PREDICTED: auxin response factor 23-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 30572015 3_prime_UTR_variant
T/A 30572108 missense_variant p.Met648Leu
C/A 30572109 missense_variant p.Lys647Asn
A/T 30572505 upstream_gene_variant
T/A 30572577 upstream_gene_variant
T/C 30572655 upstream_gene_variant
C/T 30572950 upstream_gene_variant
C/T 30573024 upstream_gene_variant
C/A 30573198 upstream_gene_variant
G/A 30573245 upstream_gene_variant
C/T 30574189 upstream_gene_variant
A/G 30574504 upstream_gene_variant
G/A 30574580 missense_variant p.Thr320Met
G/A 30574612 upstream_gene_variant
C/T 30574782 synonymous_variant p.Gln305Gln
C/A 30574814 missense_variant p.Val295Leu
C/T 30575236 upstream_gene_variant
C/T 30575305 upstream_gene_variant
C/T 30575355 upstream_gene_variant
G/A 30575435 synonymous_variant p.Ala212Ala
C/T 30575682 synonymous_variant p.Gln170Gln
A/G 30575723 upstream_gene_variant
A/T 30575731 upstream_gene_variant
C/T 30575732 upstream_gene_variant
T/C 30575743 upstream_gene_variant
T/C 30575748 upstream_gene_variant
C/G 30576214 splice_region_variant&intron_variant
A/T 30576273 upstream_gene_variant
C/T 30576430 intron_variant
A/C 30576500 intron_variant
T/A 30576509 intron_variant
G/C 30576633 intron_variant
C/T 30576740 intron_variant
T/A 30576751 intron_variant
A/T 30576825 intron_variant
A/G 30576827 intron_variant
C/T 30576828 intron_variant
G/C 30576843 intron_variant
G/T 30576975 intron_variant
T/C 30577000 intron_variant
G/A 30577006 intron_variant
A/G 30577077 intron_variant
T/A 30577375 intron_variant
T/A 30577483 intron_variant
C/G 30577484 intron_variant
T/A 30577485 intron_variant
C/A 30577887 intron_variant
A/G 30578014 intron_variant
C/T 30578077 intron_variant
A/C 30578095 intron_variant
T/G 30578638 intron_variant
A/G 30578663 intron_variant
T/C 30578674 intron_variant
G/A 30578791 intron_variant
G/A 30579006 intron_variant
T/A 30579011 intron_variant
A/G 30579028 intron_variant
G/A 30579127 intron_variant
A/C 30579159 intron_variant
G/A 30579763 intron_variant
A/G 30579788 intron_variant
A/T 30579848 intron_variant
A/C 30579865 intron_variant
A/G 30579888 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21147.1
MRRRREMEAAPRDGLPHNRGGTDDLYTELWRACAGSSVYVPRVGERVFYFPQGHLEQVAAFTQHQQDGHMEIPVYDLPPKILCRVACVLLQAETYTDEVFAQVTLVPEPRQNHFGLENEDNHVPSRTTTYSFGKVLTPSDTSTHGGFSIPKRHADECFRPLDMTHQTPSQEIVAKDLHGFEWHFRHIYRGQPKRHLLTSGWSTFVNAKKLVAGDSCIFVSGEYGEVRVGIRRAIRHHSNASPSSSLISGHSMQLGILASASHAVATGSMFTVYYHPWTNPFEFIIPLKNYLKSTVPDYSIGTRVQMQCDVEESLRRYAGTIIGNEVIDSIRWPGSEWRCLKVQWDAIVDAFMHPERVCPWWIEPLESGMEKHIPVLPNPKKAHVLHQRPLPGLNVFAMDDAAAQSSARPVADRDLQGQDYSGLSTSRALQRPPSTDVIHPSKFSIRGSQFGKENLNQLPFLMQDILHKSLGRSTSLPHEDLSISSSNLSSLCSESLGWPPSESRNENDAPLGHLGSCSKYKLFGVNLIDRQPELPSPQLAGFSKTSSLLSSPPMCVTSGKTCKKCRSVNNRSCTKVLKLGTALGRAVDLTRFRGYDELIAELDSMFDFGGSLVNGSSGWHVTCIDDDGDMMFLRDYPWQDFQCMVQKMIICQKHGINNLNPSSSADPPSL*


CDS Sequence:
>Vu_21147.1
ATGAGGAGGAGGAGAGAGATGGAAGCCGCACCCAGAGATGGACTTCCCCATAACCGAGGTGGCACAGATGATTTGTACACAGAACTGTGGCGTGCATGTGCGGGGTCTTCCGTTTATGTTCCTCGTGTTGGAGAGAGGGTTTTCTACTTCCCACAAGGTCACTTGGAGCAGGTTGCTGCATTTACTCAGCATCAGCAAGATGGACACATGGAAATTCCTGTGTATGATTTGCCTCCTAAGATCTTATGCAGAGTCGCGTGTGTTCTATTACAGGCCGAAACTTACACTGATGAGGTTTTTGCTCAAGTTACATTAGTTCCGGAGCCCAGGCAAAATCACTTTGGTTTAGAGAACGAAGACAATCATGTTCCTAGCAGAACTACAACCTACTCCTTTGGTAAGGTACTCACTCCGTCAGACACAAGTACACATGGTGGATTCTCTATTCCGAAGAGACATGCTGATGAATGCTTCCGTCCCCTGGACATGACTCATCAAACGCCTTCACAGGAAATTGTTGCGAAGGACTTGCACGGGTTCGAGTGGCATTTTCGACACATATACCGTGGTCAGCCGAAACGACACTTGCTAACTAGCGGTTGGAGCACGTTCGTGAATGCAAAGAAACTTGTTGCCGGAGATTCATGCATTTTTGTTAGTGGGGAGTATGGAGAAGTTCGTGTTGGGATTCGTCGGGCAATTAGACATCACAGCAATGCATCCCCCTCTTCATCTCTGATATCGGGTCATAGCATGCAACTTGGAATTTTGGCTAGTGCTTCCCATGCTGTCGCCACAGGATCCATGTTCACTGTCTATTACCACCCTTGGACGAACCCCTTTGAGTTTATCATTCCTCTGAAAAACTATTTGAAGTCAACTGTACCCGACTATTCAATTGGAACGAGAGTTCAGATGCAGTGTGATGTTGAAGAGTCTTTAAGAAGATATGCAGGTACGATAATTGGTAATGAAGTTATTGACAGCATTAGGTGGCCTGGTTCTGAATGGAGATGTCTCAAGGTGCAATGGGATGCCATAGTAGATGCCTTCATGCACCCTGAAAGGGTCTGTCCTTGGTGGATTGAGCCCTTGGAATCTGGCATGGAGAAGCACATTCCCGTTCTCCCCAACCCAAAAAAGGCACATGTACTTCACCAGCGCCCTTTGCCTGGATTAAATGTCTTTGCCATGGATGATGCTGCTGCTCAGAGTTCAGCCAGGCCGGTAGCGGATAGGGACTTGCAAGGACAAGATTACAGTGGCCTGAGTACTTCACGGGCATTGCAAAGACCACCATCGACTGATGTAATCCACCCATCGAAGTTCTCAATCCGTGGCTCACAATTCGGGAAGGAGAATCTCAACCAGCTTCCCTTTCTGATGCAAGACATTCTTCATAAATCTCTTGGAAGATCAACGTCATTGCCACATGAAGACTTGTCAATTTCAAGTTCAAATTTAAGCTCCCTTTGTTCTGAATCCTTGGGATGGCCGCCTTCTGAATCTAGAAATGAAAATGATGCTCCACTTGGCCATCTTGGCAGTTGTAGCAAATACAAGCTTTTTGGAGTTAACTTAATTGACCGGCAACCGGAGCTCCCTTCACCACAACTTGCTGGTTTCAGCAAGACTTCAAGTCTGCTTTCTAGTCCTCCAATGTGTGTTACCTCCGGGAAAACATGTAAGAAGTGTCGTTCTGTCAATAATCGTAGCTGCACAAAGGTTCTTAAGCTGGGAACTGCTCTCGGAAGAGCAGTTGATCTAACCCGATTTCGTGGATATGATGAACTCATTGCTGAGCTCGACTCGATGTTTGATTTTGGAGGCAGCTTAGTCAATGGAAGCAGTGGTTGGCATGTGACCTGCATAGATGATGATGGAGACATGATGTTCTTGCGAGATTACCCATGGCAGGATTTCCAGTGTATGGTGCAAAAGATGATCATATGTCAGAAGCATGGTATCAACAATCTCAATCCAAGCTCCTCAGCAGATCCCCCAAGCCTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_21147::LG5:30580401-30582401(-)
GGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTTAAAAAAATTATAATTTTTTGTTTTAAAAAAAACTTATAATTAAGTCTGTTAGTGAGCCAACCCGTTTAACCTACTAATCCGTGGTGGATTGGACCAAATTCGGATTTTTTTCCGCTCGTAATAAGTGAGTCAAGTTGGGTTGACTCACTAAGTGACTAACCTGTGGTGGGGTTAGTGAACCGAGCCGTGTTGAGTCGGATTATTCGTTTTGACAACTTTATTAAAATTTTTAGGTTATATATTAAATCTAAAATTTCAAGCGAGGTAACTTTCACTCTATTAATATTTGATTTATATAAATAATATTATATAATGAAAATTAAAAGAGGTTCTTATATAATGCGAATAAGAGATATATCTACTATACTATAAGAATTGAATTTCTATCATATAATTTTATTTTATTATGCTGACACTTCTCATAATGAAAGTGATAATAAAATAGTATGATAAATACAACTTAAATTTGATTTAACATTTGACATGTGAGCAATTCGAACATTGATTAAATATTTGTAATGTATGGTGTAAACAACGATAACTGGAGAACCGATAATTGGAGAAGTCAATATGAAAAAAAAAAACTATACCATCAATTTTGTTACCTGAATTAGTTCATTATGAAACCATGCAAATAGATGGATGATAGTTGTTTAATGAAAAAGTTCATTATGTATCAATAAGAATAGATGGGTGGAATATAAATAAAGTATATAAATTTATTATTTTAATACATGTTCATATGATTTATAAGTTGTTTTAAAAAGACTTGGAATAAAAATCGTATATGTTTATATTGTTGTTTTTAAGTTAAACATATTTTTTGATATTCTATAAAAAAATTTAATTTTAATTTTTTTAGAAAATAATATATAAAATAGATGCTGACACCTGTGTGATGAAGTGGAAATATTTAATAATTAATATAAGTATTGTGAAAAAAAATGTTACACCAGAAGCAACACAATGAAAAATGTAGCATGACCATCAAAACACTAACAAAATATGGTTATCAACATTTATGGAATTACAAGTTTAGTAGTACAAATTGAAAAATTACCAAATAATAATAATAATAAAACATGTAATTTAAAAATATAATATACATAGTAATAGATCAAAAGTCATCTTCCTATTAGTTCCCAAACGTTCATATTATTAAAAATGAAAAAATAAAACAAAATAATTTTAACAGTAAAATTTGCAAAAACTAAAAATTAGAGTGAGAAAAGAAGTGATTAATATGATGTACATGGTAAAATCAAAATAAATAAACACTTCAAAAAGATGGTGAATTGTTGTTGGAAAGAAAGGAAAGAGAAATAGTGATGCAGCAGCCAGCCATAATAGCCTGAACGGTGTGAATGGTGTATCCGTACAACCCTTTCTGCAATCACTGACGCTGCCTCTGCATGCAAAGTACCCGCATGCCTTCACTCTCTCTCATATCTTAATTAATTTATTTATTAATCAACGCCAAAATCATTTATCACTCTCATCCAAACCCAATTAACTCAATTAATTAATAACCCAATTAACTCAATTAATCAATGGTTATGGTTACGGTTCAGGTGTGACCATCACAAAGACAAACCCCAAAGGCGGTGCAAGCAACTAACAAACGCCTCTTCTCCTCGATCGAATAAGCGCACGTTAGCAATACGCAGTACCGTTGGTGTGTGATGATAGAGAGAAGAGAGATGCCGAGAGAGAGGGAACAAGCGAGTGAGTAATGGAACAATAAAAGCAAAGGGTTTTGCACCTTACTGCACAAAAACATTAACACACACATAAACACAAACATAAACCTAAAACTCTTAATTTGTCTTTGTCTGATTTCCAGTGTTGTTATGTTACACCTGCGCGCACCGGAACGCACGTTGAGCATTAGTACTGTGAAGGTGGGATGACCATGG


Gene Sequence:
>Vu_21147(-)
AGGAGAGTGAGAGATGTAGCTGTTTAGAGAGAGAAAGTAAGGGTCCGCATAGTGTTGTAACATAACTCTCATGAATCAATGAACCACATTGTTTGAAACGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTTCGAACAACAGGACACGCCTCTCTCGCTCCTTCTTAAATCTCACGTGTCCTCACTTTCTCTTTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTAGCTTTCTCCGTTTCTTCTTTCGTTTTCTCCGCCTCCCTTTGCCTTCCATGAGGAGGAGGAGAGAGATGGAAGCCGCACCCAGAGATGGACTTCCCCATAACCGAGGTACTGTTACTGTTGTCACTGCTATAGTTACTACCACGGACTCATTCATTTTCCTCTTTTTCTCAGGCACCTTCAATACAATAGTGCTACTTTACTTTTTCTTTCTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTAATCTGTGCTGCTGGATTTACCAGGACAGATATTTTTACAATCGCTCCACCAAATCAGAGTCAACAACTACTGATTATTATGTTTTGTTTTTTTTTTATTGTTGTCGGGTTAAGGTTGTTTCAAGAATGTTGAACTGAATCAGTATCAGTTCTTGATTTTCATCTCTTCTGAATCCGGTGCCCTGTTTGTTTATGGATCGGTTCTGTGGTTTAATTCTGATATTTTGTTATGGTTTGGTAGGTGGCACAGATGATTTGTACACAGAACTGTGGCGTGCATGTGCGGGGTCTTCCGTTTATGTTCCTCGTGTTGGAGAGAGGGTTTTCTACTTCCCACAAGGTCACTTGGAGCAGGTTCTTCAATTTTCTTCCTTCTTTCTTTCTCTCTTTCTCTTTTACTTCCAATCTTGTCTTTGTCGTTCTCAATTCTACTCATGTTTTCTGTTGACTGTACAACAAAGATGGTAACTTTCCAAGGTTGTCTTGTCATCTATTATTTTTGTTTTATTATTATTTCAGTTAATTTTATTGGGTCAATTATTGCACAAATGTTTTCAATTTCCATGTCTTCCTGGTTCATTGTAAATCAAACAGCTTTTATTTATTTTTTCCTTTTCCGAAAATTAAATATGTTTTGCTTTATTTAATGTAAACAAATTTATTGATGATGAGTGTTGGAAACATCGTTTTGAAATATGCAATTTTCCTGTGTCAACTAATTTTGCTTCGTGATTATTGATCTTTTTTAATGGTGTATATCTTACTTTTGCTGATTTTAATTTAATAGGTTTCACTTAATACTTTTTCTTGTAAACATTGAACTTGACTTCGTATGAATTCGAGAGGACGCGTTTCTGCTTTCTCATTTTTTTTCACAGGGATTAAAACATTAGGAACCGGATGGAAATTATTATTTTTTGTATATTTAGTACATTTTTTTAAAATATTCATTTACATAATCTGTGACACTTAAAGTTTTGTTTTTCTCACTCTCCCGGTTTCGGTTTCATCGTTTCTGTACAATGTAGTGTCGTCTCTCAAATGCCCTTTATACTTAGATTGTTCTGGTTGGCTGAAGCTCATTTTTAATAAAGCTTTATTGAATTTTTTTCTTTTTGGAATTCAGAAAATACTAAACATTTCAGTTGAAACGATTATGCTTACTTTTTTATATTCAGTGCTTTTTTTATTTAATATTTTTATTAATTACGTATTATTTTATTAACTTTTTGTTTTTTTAAATAAGTGTAACTCTTAACTGCATGTTTGTTTTTTCGTCAGAAATTCCGTTTAACGTAAATCCTTGGGTCACGTTTAGTAGCATTGAAAGATGTGCAAATGATAATTCAAATACAGATTAAATTTATAGAATTTACGTTTTCTAGTCTTTGAACGTATCTTTTAGCGTATGATATTCTTATAATTCTTTTTATTTATTTGATTACCAATTTAAACTATTTGAAGAAAGCGTTATTTGTAACAATGTAAAACTTTGTTTCTTAATTTTATGTTTTCAAATTTGTGAACAGGGAAAACATCGTTACCTCTCAAGCATACTTTTACACTCAATTTATATAAGATTTATGTTTTCTTTCAACTGTTGACTTTCTTAATCTATGATAGATAAGAATCTTATGGAGTATATTCTTGATGTCTGTGTTTTCGATGACCAATTATAATGAAGCAAAGGAGACATATATATGAATGATGTATACAATTTTTGTTTCTTCATTTCACATGCTTTGGAAAATGCGAAAACCTAAGGAGTGAATTTGCAAATAAACTTTTTGTCACTTTGTGTTTAGTAGACAACTAAGACTCTATAGTTAAAGTGCGTTTCATACGATTTTTTTATTAAAAAATAATAGCTTTCTTTTTAAAAAAGAAATGTATAAAAACAGGTAATTGTTTTGTTAAAGTAATCTGATTCAAAGAATTTACTTAAACTACTCTAGAGGGCTAAAGTTTCATTTTCTTAATCTATGATTTAACTTTTTTGGAATTTAAAAACCACTCAAGAATTTTAATTGAAACAATTACAAAATAGACGACATTAATATTTTTTGCTCAAATGTTTCTGGCATTTTTAAATATTTTTCATTCAATATTTTTATCAATTATTAAAATAGTTTTACAACCTTACCTGACTTATTTTGTGAGACAAGTTCGTTTTTCTTTTAATTTGTAAAATTTATGGATTTCTCCCATTTCCTTTTCTTCATCTTTGTTTATTTGGTAGCCATCATATCCTAAATATCCTTGATCACTCTTTTTCTTATGTCCCTAACCACCACTTTAATATTTAGATAAAAGTTTATTTTTTTAACTTCTGACGAACCTTCTTCAATTTCAAGATTTGGTTTAGAAATAAAAAATACTGTTAAGCTCTTCATTTGACCTCTAATGGGTTTATTTATCTTTCTTTTAAATTTGCGAAACCTTTGAGTTTGGCTTCTAGATTATACTCAAGTGTTTTAATTGAGACAATTAAAAATAATAATAAAACTAATAATAATGTTTTTCAAATATTTAATGTATTCAATGTTTTATCAATTATTAAAACAGTAATGTAATTAACTTATTTTAAAAAGACAAGTGTGTGTTTGTCAGAGTTATGATGTCTTTAATCTATCCTATTTTTCCTTTGATCTCTGCTTTTCTTTTGTCATTGACTGCTATTTGTCTGATCTTGATTACACTAGTTTTACTGAAGTTCTTTCTCTTTTAGTCTTTCGAAATCAATGAGTTTGGCTTTTTTAATTAACAAAACTCAATCATTTCAGTTGACACCATTAAGTTAAACAACATCAATAATTGCAGATTTTTATAATATTTTTATTTAAATAACCATTAAACCCTTATTAAAACAACATGAAGCTATATGACTGATGTAAGTTTTTTCATCTCTGTTTGACCGTGACGTTTTTTTCAAATGTTCTTGATTTTTACTTATGAGAGATCAGATCACATTAGCCGTGGCTAAAATTCCACCTCTTATAATTGTTTTAGCATGCTATTCGTATCTCTTAAATTATTATTTTAAAATATACTAGTTCATATTTAAAACAAAAAAAAAACGCAAAAATTCAATTGATAATATTAGCATGTAAATAGTATTATTTACTGATTCTTTAAAATGTTTATTTAATCTAAGCAAGAAAGAGTTAATAAAATAATATCAAAACGTTGTTTTTGTTGACTTATTTATTAAAATAAGTGTGTGTGTGTATATAAGGACATCAAATTTATTTTAGAAGTAAGTTTTTAAACATTTTCTTTGTTTTTTAATGTTCTAGACAATCATGACTCTACATTATTAACAATTTCTTATAACTAGTAATGTATTGTAATGCTTTTAGTATTTGTCTTATATCATATTTTTCATTTATTTGACGATAATTATTTTTCAAATGCTTTTGGTTTATCTTTTTTCGTCCTTGACCATTTGTGACTTCTCATACTAAAGTTAGATCACACTAGCGTAGCAAAAACTCTGTCTTTTGCAAAACCTATAAACTGTCTTATGACACCATTTCGTGATCGAATGATTGGCATGTGGAATAGGTTGCTGCATTTACTCAGCATCAGCAAGATGGACACATGGAAATTCCTGTGTATGATTTGCCTCCTAAGATCTTATGCAGAGTCGCGTGTGTTCTATTACAGGTATTATCATCTTTCTACTCGCGTTAGTATCAATGTTTACATCAAATGTTTATTGCATATTGGAAATAATGTACATATTTGATTTTGCAGGCCGAAACTTACACTGATGAGGTTTTTGCTCAAGTTACATTAGTTCCGGAGCCCAGGGTTGGCTACCTTCACCTTCTTCCATTTTTGCTTCTTTAATGTGCAACCGTAATTGTTATGATATTTTTTATGGTATTCATTCAGTATATGATATTAGTATTCTATAGACTTTAATGTTAAAGAATGAATGGCAATTTACCTTGTACGACATGCAAACAAGGATAATGTTTTAATAGGATTGGTTATTTCTTGGATCTTTGCAGCAAAATCACTTTGGTTTAGAGAACGAAGACAATCATGTTCCTAGCAGAACTACAACCTACTCCTTTGGTAAGGTACTCACTCCGTCAGACACAAGTACACATGGTGGATTCTCTATTCCGAAGAGACATGCTGATGAATGCTTCCGTCCCCTGGTTGGAATCCTTATCATCTGTCGTTTATTTGTGTTTTTCTTTTTGAGGAATTTGACTTGTTTAAGGTCTCTGTCTCTTTGATATTACAGGACATGACTCATCAAACGCCTTCACAGGAAATTGTTGCGAAGGACTTGCACGGGTTCGAGTGGCATTTTCGACACATATACCGTGGTATGTTTAGATTACTTTTATTTTCATCAAATATATGATGCCAAGTAGAATAAATCACATATTTTTTGCAAGAAATGTTGGTTTAGTTTCTGGGTTCGATATTTTTTCAAATGAAATGCAGGTCAGCCGAAACGACACTTGCTAACTAGCGGTTGGAGCACGTTCGTGAATGCAAAGAAACTTGTTGCCGGAGATTCATGCATTTTTGTTAGGTACTTTCTG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