Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21002 LG5 29249371 29253930 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108329449
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to water deprivation, response to water deprivation, response to water deprivation
Cellular Component   located in   plasma membrane
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity, protein binding, DNA-binding transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 29249736 5_prime_UTR_variant
T/A 29249737 5_prime_UTR_variant
T/A 29249746 5_prime_UTR_variant
G/A 29249828 5_prime_UTR_variant
T/G 29250330 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 29250483 5_prime_UTR_variant
G/A 29250620 5_prime_UTR_variant
T/A 29250834 synonymous_variant p.Thr68Thr
C/T 29251466 downstream_gene_variant
T/A 29251626 downstream_gene_variant
G/A 29251659 downstream_gene_variant
A/G 29251804 downstream_gene_variant
C/T 29251805 downstream_gene_variant
T/C 29252079 downstream_gene_variant
C/A 29252097 downstream_gene_variant
G/A 29252626 missense_variant p.Glu148Lys
T/A 29252748 downstream_gene_variant
T/A 29252753 splice_region_variant&intron_variant
G/A 29252894 stop_gained p.Trp202*
A/C 29252936 missense_variant p.Asn216Thr
A/T 29252943 synonymous_variant p.Ser218Ser
T/A 29252970 synonymous_variant p.Ile227Ile
T/G 29252976 missense_variant p.Asn229Lys
T/A 29253117 synonymous_variant p.Pro276Pro
G/A 29253372 synonymous_variant p.Leu361Leu
G/T 29253679 3_prime_UTR_variant
G/T 29253685 3_prime_UTR_variant
T/C 29253688 3_prime_UTR_variant
A/T 29253689 3_prime_UTR_variant
C/A 29253866 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21002.1
MEVEQDANLIPNSSHAEVEQDANLIHNSSHTEVEQDANLIHNSSHTEVEQEQDSNVSHKSKEQDSNVTHKSNNLLGRYNRSRKNLTEEEKEARRMRRILANRESARQTIRRRQALCEELTKKAATLVVENESLKKEKDLALKEYQSLETTNKYLKAQIAKSTNTEEEKTPVEPESSVAEVTPSSGSGPWFLYNPFPVQHVFWPSPLQPTYPVHLPNASFNPIIIPSIANVPCSSESELYHKQNNLINDKQTPNPFYMFPCPWIFPCPQFGNGQSSPSCSLKDKQNNLSLGKPCSSSSSLNTLANVDYRAWTEARLVNDPARFSLDGGEKKTGCHIIENYHGPSLGCNAQACASEQENELQLHSGPNNKASSTAYIGASSVEKKQKQFICQGKSLADAVAAAEARKRRKELTKQKSIHSRQSRMQC*


CDS Sequence:
>Vu_21002.1
ATGGAGGTAGAGCAGGATGCCAATTTAATACCTAACTCAAGTCATGCCGAGGTGGAACAGGATGCCAATTTAATACATAACTCAAGTCATACGGAGGTGGAACAGGATGCCAATTTAATACATAACTCAAGTCATACGGAGGTGGAGCAGGAGCAGGATTCCAATGTATCACATAAATCAAAGGAGCAGGATTCCAATGTAACTCATAAATCAAATAACCTTTTAGGTCGTTATAACAGGTCAAGGAAAAATTTAACTGAGGAAGAAAAAGAAGCAAGGAGGATGCGCAGGATATTGGCAAATAGAGAGTCAGCCAGGCAGACAATTCGACGTAGGCAGGCTCTGTGTGAGGAATTAACAAAAAAAGCTGCCACTTTGGTGGTGGAGAATGAAAGTCTAAAGAAGGAGAAAGATTTGGCTTTGAAAGAGTATCAGTCTTTGGAGACTACAAATAAGTACTTAAAGGCACAAATCGCCAAGTCAACAAACACAGAAGAAGAGAAAACTCCCGTTGAGCCCGAGTCATCTGTGGCTGAGGTAACACCTTCGTCTGGTAGTGGTCCATGGTTCCTTTATAACCCTTTTCCTGTTCAACATGTATTTTGGCCTTCGCCCCTTCAGCCTACGTATCCAGTTCATTTACCAAATGCATCATTTAATCCCATCATCATTCCATCTATTGCTAATGTTCCATGTTCTTCCGAGTCTGAATTATATCACAAGCAAAATAACCTTATAAATGATAAGCAAACACCAAATCCATTTTACATGTTTCCATGCCCTTGGATATTCCCATGTCCGCAGTTTGGAAATGGACAATCATCACCTTCTTGTAGCCTGAAAGATAAACAAAATAATCTTTCTCTGGGCAAACCTTGTAGTTCTAGTTCATCTTTGAATACACTGGCAAATGTGGATTATCGAGCCTGGACAGAAGCCAGACTCGTTAATGACCCTGCAAGATTTTCATTGGATGGAGGTGAGAAGAAAACAGGATGTCACATTATAGAAAATTATCATGGACCCTCTCTTGGTTGTAATGCTCAAGCTTGTGCTTCCGAACAAGAAAACGAGCTTCAATTGCATTCTGGTCCAAACAATAAAGCATCTTCAACGGCTTATATTGGTGCATCTTCAGTTGAAAAGAAACAAAAACAGTTTATTTGCCAGGGGAAAAGTCTAGCTGATGCAGTTGCTGCGGCAGAAGCAAGAAAGAGGAGAAAGGAACTAACCAAGCAGAAAAGCATCCATAGCCGCCAGTCTCGAATGCAGTGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_21002::LG5:29247371-29249371(+)
TTTGATGGAAAAAACATCATTTAAATATAGGTTATATTTTATTATGTTTAATTTAATTACTTGTGCTAAATTTGAGATAAATTGTAAATAAAATTTATTATATTCTATTATATCGTCTTGTTATGTCATGTTATTATAAATTGATGTATAATATATTATATATTTTATTAAATAATAATTAAATTAAAAAAATTGATCTTAGTTAATTAATAAGAATAATGTTTTTTATTTAATATATAAAAATTTGTTAATAATATATTACAAGAGACAATTTAACTAGATAAATATTTAAAAGCTATTAAGGACTAAGTATATAAAAGACATATTATATAACATCTTTACACTAATTTTGATTTCTTAATAAAGTTACATAAATTAATTAAAAATTAGAAATGGATGTTTTAAAATTGTGTTTTACTATTTACTATTTAACATTAAAGTGTTTAATCTTTGATTCATAAGTATTTTGAATAGTATTGTAAAAATGGGTTGAAATTTATGAATTAATCTCTACTCATCTGGGATGAACCTGTGATGAGCTGGGTTGACTAGTCAATCCACCTAATTTTGTTTTTTGTGTTTATTTTTGAATTATATTTAGAATTTAAGATAATTCTGAGTTGTATTATATAGTTTTTATTTTGAACTGTCCTTTGAGATTTAATATCATTTTATATTAAAATTTATTTATATTTAAATTAGAAATTTGTATTTTATTCTTTTTAATTAAAAAAAATTCTCTTAACCCATCAACCTGTGGTGAGTCTATCAAATCCGAATTTTTTTGACTCATTATTAAATGAGTCAGGTTAGGTTGATTCCGTGAGTGACTAACCCATGATAGACTGAATGAAATTGGATTAAATGACTCCTTTTGACAATACTGTATAAAACTTTAATTCATTTATTTTAAATATTTTCTAAAACCTTTTGGTAAAAAAATATAAAATAATATAATATTATAAGAATCTTCAATATATATTAATAAAATATCTTAAATTTTTTGAAAAAAAGAGTGTTATTATTCATCTAAGTAAGATTTATCCGAGTGACACGTACACTTAACACGTGTATAAAAAAACCTTCAACATAACTACACGAATAACAGCTCATAAATTCTTCCACAGACGATGTCAAACTCCACCGCCTGACGTGAAGTTATTTCCTCCCCATTCGACTCCCGCTGTCACGCCGATTCTGAAAGGATGTCATCGATATACTCAAATGTCTATACACTCATATGTAAACCTATCATATTCATACCCATAATACTCTATATTAATACTACTGCTTTAGAATCATGTACTAAATTTGAATGCATTTGTATAATTATTTAAAACAGAACAAATTCCAAGAGTATTTTTTATAATTAACTAAACATATTTTAGCATCACTTTTCAATTCATTATCTGAAAACAATTTATATTAACTTTGCTATTATTCACTTCTTATTAAAACACAAGAGGAAAACATCAATCAATTTATAATATATAACTTTTTTAAAAGATAACTGTATATTAATAGGATAAAATAATTGAAAAACATATATATTTTTGTCATAAAATGGTGCAGAAAAACACCAAATTGTGCAGATTAGGTTAATTATATAATAAATTAAGAAACAAATTATTTATATTTTTTTAACTCATTATTTTGTTTGAATTGCTATTGACATTTTGGTTATAAGTTGAAACTCCTAATTAGGGTAACAATCATGATAGAATGTTGAAGGGGCAACTTTTGCAGTGCGGCAAATCGCCTACGTGGTAAAATTTGGGATACGTGGCGAGACAACATAGCTTGTTGCTTATTATCACAGATGTCCACTTGTGAACTGGCATGACACGTGGCAATAATCTACTATCTCTCCTTCTTCTCCTAACCAGTGAGTGATGTGATACCCTCTCTCCCTCTGTTCGGTTCTCACTCTCACCGTTACGTTACATTACAAAAGACTCACTCTTCTCTTATATTCTCTCTTATTTTCTTTCTGCCTGTTG


Gene Sequence:
>Vu_21002(+)
GCAACAGGCTTGAACATCCTCACCATGGATGCTGAATCGGAGAAGCGCGCATTCACCTCCACTTCCGTTTCTAGGTCCTCTTCCTGTGAAGGTATGGATCGGCTTGTTGACAAGGAGGAGATGGAAGCGGCTGAGACTCTCGCACAGTTGGCAATGCGTGATTCTCACTCTACTGACAAATGGTGCACCAAACTATGTGCCATTCCTGAAGTTCATCCTTCACCGACTCTTCACTCTGATCCCTCTCTTGGGACTGCGGTTCCTTTCTCACTGTTCTTTCCTAATTTAATTATATAATTTGGGTCCAGTCAATTTCAACTTCGTTCTCACAAATAGTATTAGTATTTCTCACTAATGCTGTTGAATTATGTTATGTTTTTATGTAAACACACACAGGAGTCTACAGTTAGGCGGGATAACAAGATTTATATGTTTATTTTATTTAGATGGAAAAAGTGATTCAGATAACTATTTTTAACTTTTAAAACTAGAAATAGGGGAATCGAATTGAATAAAATAAGTTTTCTGCAATTGACAGAACAGTAAACAAAATGGTAACTATTCTTCGGCAATTTAAATTTCAGCCAGAGCTCAATTGTATGGATCCGTGTTTTTTTCTATTTGAGACTCATCCATGGTCTGGGTTGCATTTTGTATTTTTTTTTAGAAATAGAGAAAGAAAGTCCTACATTGTTAGCACCAACTATAAGAACTTAGAGTCACTACAAACAATTTTTTGTTTCTGAAAGAAAATATTTATCACATGGAAAGTAAGTAATACAATGAGAGATCTACTGATATTGTATAAAACAAACAGTTAATGTTATGGGCATATGCATTACAAATTATGTGTTGGAATATTAACAATTGATTTTTTTACCCTGTGTTGGTATTCAGATTACCTGGTTGGTGATTGAGACTTTCTTAATGTGACATCCATGTCTAAGAATTTTTTTTTTTCACTTTTTTTTTTTGGTTTTCTCACTTAGCATACCACTGATTAACTTTTACTTCATGAAAGAATTTAAACCTAGTCAGCTTCTTCTTTTTCCTTTTTTAAGATGAATAAGTCAATTAATTAAAGATCACATGCAATAACTAAGATACCATCATCCAGTTGTAGCATTTGATACATGAATTTATAAATGGTTTACTTTATGGCAGGACCAAGCTATTGCAGATCAGCAGCAAGATGAAAAAGTACACACTACTGCATCTGTAGAAACAGAGAGGACTCAGCAGAATAACTGTTCCGAACCCATGGAGGTAGAGCAGGATGCCAATTTAATACCTAACTCAAGTCATGCCGAGGTGGAACAGGATGCCAATTTAATACATAACTCAAGTCATACGGAGGTGGAACAGGATGCCAATTTAATACATAACTCAAGTCATACGGAGGTGGAGCAGGAGCAGGATTCCAATGTATCACATAAATCAAAGGAGCAGGATTCCAATGTAACTCATAAATCAAATAACCTTTTAGGTCGTTATAACAGGTCAAGGAAAAATTTAACTGAGGTATGGGAGTGAATTTGTACAGCAATTTCTGGGTATAGTAGAACCTTATAATTTACTAGGCTTTCTGTTCAGGAAGAAAAAGAAGCAAGGAGGATGCGCAGGATATTGGCAAATAGAGAGTCAGCCAGGCAGACAATTCGACGTAGGCAGGTATATACATAGGCAAATCAATTCACCATTGTTAGATTTGCTTATGTCTTGTTAAATCTAAACCAAACACACCTATGAAGCAAGATGCAAGAAATGTTCTACTTTGTGAACTTTGGGGACAATTTCTCCCACTAACTTTTAAGTTTTCTTAATATAAGGTATAATGTAACTATAATTAATCTTCATAAATTGAAATACAATATAAAACCAATCCATATTATGAGTATTGCTCCCTCGGACTTGTGTGTAAATAAGTATTACTACACATAAAATTTTTGGATCTGTAACTACAGGATGCAAGCAGTTTTGTACCAGAAGCTAATATGGTTAACCTTTTTTATATAGTGCATAATAACTATAACAAACCCTTTTTTGATTGCATTAAGAATAAGGTGTCAGAACAAAAAGTTAGTTTTAAATAACTCTGCTCTTCTTCCAAATACAGAAGTAGACTAGTATCAATAGTGTGCTATTTCGGTTCAGCATGTTTCTTTTAATGCATGATAACTTTAATATGCTATATTTTGATTGTGTTAAGAATTAGACGGCTAAATCCAAAGTTTAGTTTTAAATGACATAATGCCTCCTCCCCTTTTCCAAAATAGAAAAGTTGACAAGGAGTGCCTAGCAACAATAGTTTGAGGGTGGAGAGGGGAGGCTCTAGGCCACTATAGCCACTATAGGATTGAACCAGTGAAATGGTTCTCGATAGCAGTCACGTAGCTGCTTTTCATGTGCTATGGTGGCACTGTCATGATATAGACTTCAATTTTTTTTGTATTATTATATTTAAAATAACACGTCTCTTTTTCTCTCTGCTATATCATTTTCAGAGTTAGCTGGTATATGTTGCTATTCTAGATTGATAACAATGATCTAAAGCCTCAATTCTTCCATTTGTGACCTAAGTATGGATACCATCTGTATTGATGTGCGCCTTCTTTTGATAAATGCCATGAGGATTATTTTTTATTTAGTGTTTTCTGTAATTGATGACTTCCCTAGCTATCGGTGGTATGTTACTCTAAATTTTTCTGTCCCGATCAAAGTAACTACATCAAGAAGATGTCAAATCGATCTTTTCTATTAACGAGATCTTTTCAGTATATTGTTCTTTATAACATCATATTTTCTATTAGATCAAAAGACTCCCAAATCTATAGTTGAGTTGTGAATGTATATGTAATCGTGTTATTGCAAACTTCAATAATATGATTTTTAAAACGAACTATTATGAAAGAAAAACTCTATTTTATTTTAGTTGTATATTTATTTCTGGTTGATTGATTTGTCACTGAAATATTTACAAATTTCTTCTTTATATGTATGTGTATGTAAAAATGTTTCAGGCTCTGTGTGAGGAATTAACAAAAAAAGCTGCCACTTTGGTGGTGGAGAATGAAAGTCTAAAGAAGGTACGTACTATCCCTTATTCTATATTTTTATTGAGGCACTTTTATTGTCTTCCCTTTCTTTATCCTAATCTATTTACCCCAGTGGATGTTTTATCTGAAAATTCATATTTCTTCCACACTTTCTGACAAAAAGGAGAAAGATTTGGCTTTGAAAGAGTATCAGTCTTTGGAGACTACAAATAAGTACTTAAAGGCACAAGTAAGTTGGTTTGATGTTATATAAATCTTTAAGCTTTTGTGTAACTCTTGTTTGCGTAGGAAGTATATTAATCCAGGAAAATCAATGTCATCTTCCATTTTGCAGATCGCCAAGTCAACAAACACAGAAGAAGAGAAAACTCCCGTTGAGCCCGAGTCATCTGTGGCTGAGGTAACACCTTCGTCTGGTAGTGGTCCATGGTTCCTTTATAACCCTTTTCCTGTTCAACATGTATTTTGGCCTTCGCCCCTTCAGCCTACGTATCCAGTTCATTTACCAAATGCATCATTTAATCCCATCATCATTCCATCTATTGCTAATGTTCCATGTTCTTCCGAGTCTGAATTATATCACAAGCAAAATAACCTTATAAATGATAAGCAAACACCAAATCCATTTTACATGTTTCCATGCCCTTGGATATTCCCATGTCCGCAGTTTGGAAATGGACAATCATCACCTTCTTGTAGCCTGAAAGATAAACAAAATAATCTTTCTCTGGGCAAACCTTGTAGTTCTAGTTCATCTTTGAATACACTGGCAAATGTGGATTATCGAGCCTGGACAGAAGCCAGACTCGTTAATGACCCTGCAAGATTTTCATTGGATGGAGGTGAGAAGAAAACAGGATGTCACATTATAGAAAATTATCATGGACCCTCTCTTGGTTGTAATGCTCAAGCTTGTGCTTCCGAACAAGAAAACGAGCTTCAATTGCATTCTGGTCCAAACAATAAAGCATCTTCAACGGCTTATATTGGTGCATCTTCAGTTGAAAAGAAACAAAAACAGTTTATTTGCCAGGGGAAAAGTCTAGCTGATGCAGTTGCTGCGGCAGAAGCAAGAAAGAGGAGAAAGGAACTAACCAAGCAGAAAAGCATCCATAGCCGCCAGTCTCGAATGCAGTGTTGACTGTGGAATATATTCCAAGGGTGCAAGTTCCTCCACACAGGTCAACTATATCTATTGGGGAACTTTGGAGGAAAATAACTGAACAGCAACTCATGTAAAGAGCTGTCTTTGGTGAAGGTTTAATTTTTTTTTCATAAGTCTTTTGCTTGTTTATTTTTAATTTACTTATCAGGAGTTTTTGCCCCCACTGAGGAGAAAAAGAGACAGAGGGAAGTTGGTTTCTTAAGCGGAAACTGACCAAATTTTTCATTGGTAGTTATACCGGAATCTTCAACTTTCAACTTCTGACTGTAAACATCAAAAATCAGAAATTTGCCGCTTTAATGGTCAGAACAAAGAGAAATTTAGACTTTGTACTTTTAC