Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20980 LG5 28995925 28998025 hypothetical protein TSUD_370920
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 28996498 downstream_gene_variant
T/A 28996831 downstream_gene_variant
G/A 28997005 downstream_gene_variant
T/C 28997008 downstream_gene_variant
T/A 28997011 downstream_gene_variant
T/G 28997014 downstream_gene_variant
T/G 28997016 downstream_gene_variant
T/C 28997027 downstream_gene_variant
A/T 28997135 downstream_gene_variant
C/T 28997999 synonymous_variant p.Val149Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20980.1
MISTAGGCCENFDGTRLCRGSLYRLLHKPGATEMLDERRRISMAYDVPEWMAPEVLRDEPSNEKSDVYSFGVILWELATLQQPWSNLNPPQVVAAVGFKGKRLEIPRDLNPQIASIIEACWANEPWKRPSFSSIMDSLKGLIKPPVPQPGRPNMSLLI*


CDS Sequence:
>Vu_20980.1
ATGATAAGTACCGCAGGAGGTTGCTGTGAAAATTTTGATGGAACAAGACTTTGCAGGGGTAGCTTGTACAGGCTGTTGCATAAACCTGGTGCCACAGAAATGTTGGATGAGAGACGTAGGATAAGTATGGCTTATGATGTGCCTGAGTGGATGGCTCCAGAAGTTCTTCGTGATGAGCCATCCAATGAGAAGTCAGATGTTTACAGCTTTGGTGTCATCTTGTGGGAGCTTGCAACATTGCAACAGCCTTGGAGTAATTTGAATCCACCACAGGTTGTGGCAGCTGTTGGCTTTAAGGGAAAAAGACTTGAAATACCACGAGATTTAAATCCTCAAATAGCATCAATAATTGAGGCTTGCTGGGCCAACGAACCCTGGAAACGCCCTTCTTTTTCAAGTATTATGGATTCTTTGAAAGGATTGATCAAACCCCCTGTACCTCAACCTGGTCGTCCAAACATGTCGTTGCTCATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20980::LG5:28993925-28995925(+)
TGGATGTCTCCAATTTTTAGTTGTAGAAGTACTTGCCTAAGCCACGAAAGCTAACAAGTGGCTGCTGCCATGGCTAGAAAGAGACAAACAGAAGTTATTTCTGCCACAGCGGAACATAAGTTACCAGACTGACAACGGCAACGACATGTTGTGTAGGTTGCATGGTTGCCTTGTATGGGAGGCACTCATTATAGGCATCAACAGGATTGGAAATCTCATATGATTGTTTTGGAGAATTGACCTGAGCAATATTAGCGGTCTTATGTTGTTGTCGTGTCTTTGTACGACATTTTGCCTCAGTGTGGCCATATCGTTGACAAAAATTACAATGAGGGTGTTGACCACGATATCCACCACAATTCCCACTTCGTCCACCTCGAGAGGAAGATTGGGAATAAAAAACAGAGGAATTGGTGGTGATTGACCAAACCTGTGAGGAATAAAGAGGCGAAGTAATTGTTCACTAGCACGTGATTAATACCAGTTACTATCAGATAACAATGTATCTAAGAAAATATGAGCATTGTTCCACAATCAAATACACCATAGAGCAGCAAAAGTTATCACATCACCACACAATTTTGTAGTGATGCTACAAAATGCTCTAAAGTTAACCAATTAAAATTTAGCCTGTGTTAAGTACGAAGAATTTAATGAATTAGTAGCATTACATGCTTCTTGTAGCTTGAAGTGAAATTGATATCAATAGTATGATAGAATATAATGTGTATGATAGGAGAAAACATATTAAGAAGTAGTTGTGAGTTAGGTTGTTAGGGTGAGTGAGGTTTCTTTTATATATTTTTGGATAATTTTGTTGATTGAGCTTTAGCTTTTTGTGAAGGAGAGACCCTTGGAAGAGAGAGTGCTCTTCTATTTTGTGTTCTTTTCAGTTTATACAATAAAAAATATTACTCTTCTTTCTCTTTTCAATTCTGGATTCCTAACAAAGTGACTAATTAAATTTGGTCTGTAATATTTTAAGGTTCTTTTGGAACTGTACATCAAGCTGAGTGGAATGGCTCGGTAAGTCCCTCTCTTCTTTTTTTCTTTCATAAGTGCTCTATAAAATAAGATTAACCCAGGCTTACTGTTTTTTCATGGGTTGTTTATATTTTTTGTTTTTCAGCATCTCTGTCATTGTATCTTGCAAATTCAACTAAACGTGTAATTAGTATATTGATATGTGAATGGCATCTCTCTCTATATCTGTACAATAGTCAAACTCTATACAATATCTGGCATTTTTTTGTAAGCATTCATTGCTTATTGATTATATGCACATGAAGGTATAATAAAGTCATTAAGTGCATTTTTTTAAAATGCCATGCTTTGTTTTCTGGATCTAATGATTGTCTATTGATCTTGTTATATATATGCTTGTAAATTAAAGTAAGTCTTCTTATTGTTCAAAGGTTGCTGTGCCTGATCAGCTGAACTCATTCGACCTGTGTTGTTTTGTATTTTGCCTCCCATTTTCCAATCTTCTTACGACTACATCCAAACATTTTTGCATATATTTTCATATTGAGCTGTGCTGTAAAAATTACCGGGCACAGGGCTTATTTTAAAAACTTAATTCGCTAAGTTGCAACTTGCAGCATCGAAACATTGTTTCATTTATGGGCGCAGTCAACTTATCAGCACTAAAGGTTTCATTCATTTACTATTTCATTTTCAATAAATAGATGAAGCATTAGGGAAGATGGCATATTTTATTAATGCTCTTTTTATGCTTTCAACTAGAAGGCTTCTGTCCTTGTACTTTTGCTGTCTTTGCAAAAAATAAAATAAAAATTCAACTTTATTAGTTTCATGATTTAGAATGCATATTTATTTATTTTTAATTTGGGAGGTGTACATGCTTGTGTATTGCTCCATTAAAGTTTGAAGCCAAAGTGAGTTTAATATTTAAATTTGTTTAATGTATCCTTTTTTCCATCCCTCTACTTGTTTGTTGCATATGTTATTTTAGTTTGTTGCATTTACATCTGTCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_20980(+)
ATGATAAGTACCGCAGGAGGTTGCTGTGAAAATTTTGATGGAACAAGACTTTGCAGGTGAACGCTTCCAGGAATTCTTGAGGGAGGTAGGCCCAGTAGTTCTTGTCTTCTTTTGCATTGAAAAATACTAATTGTAAGCTTGCTGCTGATTTGAGCTATATTTTCACCCCTTTTGCTAGGTTGCAATAATGAAAAGCTTACGGCATCCAAACATTGTTTTACTTATGGGTGCAGTCACTAAGCCTCCCAATTTATCAATTGTCACAGAATACTTGTCCAGGTTTTGCAATATCTCATCTACCAGTTTCTTTACTCTTCCCTCATATAAGAGGAACCTCTTTTCATGTTTATAACATATGTTACAATTGAGACCTGAAGAATTTGAGTGAACTAAATGCAGGGGTAGCTTGTACAGGCTGTTGCATAAACCTGGTGCCACAGAAATGTTGGATGAGAGACGTAGGATAAGTATGGCTTATGATGTGGTAAACTTTCAGAACAAATATATTATTATTTTTGGTTCTGTTTATTTTTTGAGCTAATATGTAACCTTTGTATACATTGGTTAAGTATTTGTTGTTTTCCCGTGCAGGCTAAGGGGATGAATTATCTTCATAAACGTAATCCTCCCATTGTTCACAGAGATCTGAAATCTCCAAACCTTCTTGTTGACAAGAAATATACAGTGAAGGCAAGAAGGAAATTGTTTTATGTCTGAAAAATTGTGTAGAGTTTCATTTAACCCATTAGCGACCTTTGTTAGTATGATTCGACTTCTCCAACATGCATTCCATTCTACAATCAGAAGGCTATATTGAATCCCCAAATTTCATATCATTTTGTGTATGCTAGCGTTAAAGTACTGATATAGTCCATGCTGAATGACACTGTTTAACCACCATCTCTTTTGAACTTTTAGTGAATCTATGAAAGAAATATTACAGCAAAACTTGGTCTACATACTGTTGACAAAAGTTTTACATTCTGCCAATTAGCTGGGCTTCATTTGACTCAAATTTCACATATTGACAAAAAAATCAATTTAATACGTTCAGTGCGTAGCAAAATTTATTTTCTGGAGGTTTAGTTGTTTATGGTCTGTTTTGCTTTGGCATTATGGGCATTATTGTAGTGATTTGAATTTTCACAGATCCTTGTTTACTTGTGTTGTCCCTTTAGGTTAGTGATTTTGGGCTTTCCCGACTAAAGGCAAACACATTTCTCTCATCCAAGTCAGCTGCTGGGACAGTAAGTTTACTTTCAAAACCTGTGTATGTGCTTATCATATTTTTCAGAGGTCTATTTTATTATTGCACATTAAGTTGAACACCCTTTTATCTATTAGCCTGAGTGGATGGCTCCAGAAGTTCTTCGTGATGAGCCATCCAATGAGAAGTCAGATGTTTACAGCTTTGGTGTCATCTTGTGGGAGCTTGCAACATTGCAACAGCCTTGGAGTAATTTGAATCCACCACAGGTTTGTCATATAACTGATCTATTTCAGTGTGCTTATGGTTAGATTTCTTATTATGATTATGTTGCTTTGATTTTTATTGAAGCGTCTTTAATGACTGTAAGTGCGTCACATAAAAGAAATAGAATGCTATTGGTAATTGAAATCTGAAAATGATTGCAAGAAAGATATAATTCTGTTTGATGGCGGCCTGTTATCAACATATAATTCTACTGAGACTGAAATTTGCATCAATATTTCTTTCTATCTATTTTTACTTTTGGTCTGTAGCTTTTAGTAATGTTTTTGATGCAGAGCTTTTGAATTACGTAGTCATCATAAGCCTGTAATGTTTTGTAGGTTGTGGCAGCTGTTGGCTTTAAGGGAAAAAGACTTGAAATACCACGAGATTTAAATCCTCAAATAGCATCAATAATTGAGGCTTGCTGGGCCAAGTGAGTTGCAGATACATCTTTCGTTTGTAGTGTGGTTGTATATTCTGCTTGAGTTTTACTCTTATGCCTGGTTTACAAACTGCAGCGAACCCTGGAAACGCCCTTCTTTTTCAAGTATTATGGATTCTTTGAAAGGATTGATCAAACCCCCTGTACCTCAACCTGGTCGTCCAAACATGTCGTTGCTCATTTGA