Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20948 LG5 28625479 28627260 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 28625482 synonymous_variant p.Glu423Glu
T/C 28625507 missense_variant p.Tyr415Cys
T/G 28625528 missense_variant p.Asp408Ala
C/A 28625530 missense_variant p.Lys407Asn
A/G 28625729 missense_variant p.Phe341Ser
A/G 28626139 intron_variant
A/G 28626208 intron_variant
T/A 28626210 intron_variant
G/A 28626398 missense_variant p.Ala288Val
C/T 28626417 missense_variant p.Asp282Asn
C/T 28626422 missense_variant p.Arg280Lys
A/G 28626445 synonymous_variant p.Tyr272Tyr
C/A 28626688 synonymous_variant p.Val191Val
G/A 28627165 synonymous_variant p.Asp32Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20948.1
MQVPYPLSTHPSCGDPYYKLRCDSHSQKLYFDTLNGSSYLLLRIMPSIQRMVVEPSPWLPGSCVTQDMPRSNGIWLNQSLPFNITSSNTVFLLNCSPRLLVSPLNCTYSSVCHRYLESSGHVDTKRAFDCASGLHPCCTFLAGGIPSAYRIRLHESGCKAFRSILHLNQDKPPNQWEEGLEIQWALPPEPVCKTQKDCSGDSTCSPSGRSGLFRCLCNGGHRWDPFVTTCVKCERKPKWKTSLVVSIGVVVTFFSLVVVLTIISKSRKISTYRDNKAKEREDKLKSSAGDKPCRMFQLKEGTLGYLDPEYYRNYQLTDKSDVYSYGVVLLELLTSQKAIDFSRDEDDVNLAIHVSQRASNGTIMELVDQRLVSVESSGDKMLTSIKLLLELALECLREKKAERPSMKDIVQRLLYIIRIEEGE*


CDS Sequence:
>Vu_20948.1
ATGCAAGTTCCATATCCTTTGAGCACACATCCAAGTTGTGGTGATCCATACTACAAGCTTCGTTGTGATTCCCACTCTCAAAAGCTTTACTTCGACACCCTCAATGGAAGTTCCTATCTCCTTCTCCGAATCATGCCTTCAATCCAACGCATGGTGGTGGAGCCATCACCTTGGTTACCAGGTTCCTGTGTTACACAAGACATGCCCAGAAGCAACGGTATATGGTTGAACCAGTCACTTCCTTTCAATATAACTTCATCCAATACAGTGTTCCTCCTTAATTGCTCTCCACGCCTCTTGGTTTCTCCTCTCAACTGCACTTATTCTAGTGTTTGCCATCGTTACTTAGAGAGTTCTGGTCATGTTGACACAAAACGAGCGTTTGACTGTGCAAGCGGTCTTCACCCTTGTTGCACTTTTCTAGCTGGTGGAATACCTTCAGCTTACAGGATCAGGCTTCATGAGTCTGGCTGCAAAGCATTCAGAAGCATCCTTCATTTGAACCAAGACAAGCCTCCTAATCAGTGGGAGGAAGGGCTTGAAATTCAATGGGCTCTTCCACCTGAACCAGTGTGCAAGACACAAAAGGATTGCTCTGGAGACTCTACGTGTTCCCCTTCTGGTAGAAGTGGTTTATTTCGCTGTCTTTGTAATGGGGGACACCGTTGGGACCCTTTTGTCACAACGTGTGTGAAGTGTGAAAGAAAACCCAAATGGAAAACCAGTTTGGTGGTTTCAATAGGGGTTGTTGTTACCTTTTTCTCTCTTGTTGTGGTTCTGACCATCATCTCAAAGTCCCGCAAAATCTCAACCTATAGAGATAATAAAGCGAAGGAAAGAGAAGACAAACTGAAATCAAGTGCTGGGGATAAGCCTTGTAGGATGTTTCAACTGAAAGAGGGAACGTTGGGGTACTTGGATCCTGAATACTACCGCAACTATCAGTTAACAGATAAAAGTGATGTTTATAGTTATGGGGTTGTGTTGCTAGAGCTTTTGACTTCACAAAAAGCGATTGACTTCAGTCGTGACGAAGATGATGTGAACCTGGCAATTCATGTGAGTCAACGTGCAAGCAATGGTACAATCATGGAATTGGTGGATCAAAGGCTTGTTTCCGTGGAGAGCTCGGGGGATAAAATGTTGACAAGCATAAAACTGTTGTTGGAGCTTGCACTTGAATGTCTGAGAGAGAAGAAAGCTGAAAGGCCAAGTATGAAGGATATTGTTCAACGCCTACTATACATAATTAGGATTGAAGAAGGAGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20948::LG5:28627260-28629260(-)
CAATATAAATAATAGCTTTAGATTACTGTAAGATTAACTTAATTTCACAATAAAATATAATAATTATATTTTAACTTTATAGAAAATTATTCTTTTAAGATAAAAAAGACTTCATATTAAAGATTTTCCATAAAGTAAGTATAAGAGACATAAGTCCCATCTTATAACTCTCTTTTCTTTTGTAAAATTTGATTAAATTTAAAGTTTATTTTTTAAGATGACATTGGAATTACCCAAAACTTATTCTAGCAAATTATTCAACATTAATTCTAGCAAATTTATTATTAAACAAATTAGAAAACCACAGTATGGTATTATGTACATTTGTGCTAAAATAACGTTAAACTACTACTTATGTTCAATAAATTTATAAAATTGTAAAGTCAAAATATTTAATGAAAAAGTTAATTCCTTAAAGATCATTTGAGTTACAATAAAAAACATTACGTGGAGTGAAGGATGAAAAGGTTTATTTTGATTTCAAAATCACTAACTTGTCCTTAAGGATACGAGTTTATAGAATTTGTCCTTTTTGTCACTCTCAATCAGAGTTGTTTTTAGTTACATACAGAAATATTATACAACAAACACTATCATAATTGACAAACCATAAATACAAAGTACTTGGCCAACTTTGAAAAACTGGCTCGTAGGGAACGTTTCTCAACTCTTGACTTACCTTCAATTAGCTGGTAGGAAACGTTTTTCAACTCCTGTCGAGCCTTTTACAGGTGGTTAGGAACTTTTTTAACTCCTGAATTACTTTCAACTAGGTGGTTAGGGAACGATTTTTTAACTCTTGAATTACTTTCAAACAGTCGACAGGAAACGTTTTTCAACTCGTATCGAGCCCTTCACATGTGGTTATGAACGTTTCTCAACTCTTGACTTACCTTCAACATCTTGACAGGGAATGTTTTTCAACTCCTGTTCAGCCATTCAAAAGTTGTCAATGAACTTTTTGAACTCCTGCCTTACTTGCAACGACTAGTCAAAGAGGTTCAGAATCTTGGTCAAACGTACAACAACACACAAAGACACGTGTCGAAGGTAAAATTAATTCGCATCAGAAGCATACTACCTAAAACCCCTTTGCACATTATATTGTGCTTAGGCTTGGGGGTTTGTGTACTGTAGGACAACGCGATCAGTCAAAGGACCGACAGCTGACCATCCAGTGAGAAAACAATTTACCGGTCTGAAAATTATTCTGAGCAATAATAGCCATTAATGGACACTTAATTAGAATAATATTGCTTGACAATTAACAGGAATAAAGTCATTTATTGGTAATTAATGAGTCAGACCTAATGGTAAGCTCATTAATAATATTTATAAATATATATGTCGACAGAAAAGGCAATTATTAATCTTTATTACAATTTTGAATGTTTTGGGTTAGGGATCTCAATCCTACCTAAACAATGATCTATGTTAAATTTTGGATAACATATAATTAAAAGATCTAATTAAAAGATCTAAAAGATGGATCGAGTTTCATTCGATTTTAAATGGTTTCAGAGATTTGTAACAAAAGTTACTAATTTTTTTTACTGAGTTGTTTAAAAGTGAAAAAAAGTCATTTACATAATTTTCTTTACTTAAATTTTTTAAAATTTGTCCATACGATAATATGACAATCAGATTTGTCCATTTAGGTAAAAAAAAAAAAACCATTAACTCTCCTTAAACATATGTTTGAGAATTATATACTTGGCGAAGCTGGACCTAAGGTGTAGGATGGGCTAGAATAGTATTCGTTGTGGTAGATTCTTGCAGCCACTTTTTTCTGCAGTAACTGGGAGCACCCTTTATATTTATTCATCGTGTATCTTTCAGTTCATAAGATGTTTCTTCCCTAATAATTCCCCATGCAAATGATTGCTGAATCAAACATGAGACCCTGCTTCCATTGTTGCTATTCCTATACCTTTCTATTTCTTTTCCTTCTCCTTGCCCATCACACTACTTCACAGAAGACTTGCCCAAACTGTGGCTCT


Gene Sequence:
>Vu_20948(-)
ATGCAAGTTCCATATCCTTTGAGCACACATCCAAGTTGTGGTGATCCATACTACAAGCTTCGTTGTGATTCCCACTCTCAAAAGCTTTACTTCGACACCCTCAATGGAAGTTCCTATCTCCTTCTCCGAATCATGCCTTCAATCCAACGCATGGTGGTGGAGCCATCACCTTGGTTACCAGGTTCCTGTGTTACACAAGACATGCCCAGAAGCAACGGTATATGGTTGAACCAGTCACTTCCTTTCAATATAACTTCATCCAATACAGTGTTCCTCCTTAATTGCTCTCCACGCCTCTTGGTTTCTCCTCTCAACTGCACTTATTCTAGTGTTTGCCATCGTTACTTAGAGAGTTCTGGTCATGTTGACACAAAACGAGCGTTTGACTGTGCAAGCGGTCTTCACCCTTGTTGCACTTTTCTAGCTGGTGGAATACCTTCAGCTTACAGGATCAGGCTTCATGAGTCTGGCTGCAAAGCATTCAGAAGCATCCTTCATTTGAACCAAGACAAGCCTCCTAATCAGTGGGAGGAAGGGCTTGAAATTCAATGGGCTCTTCCACCTGAACCAGTGTGCAAGACACAAAAGGATTGCTCTGGAGACTCTACGTGTTCCCCTTCTGGTAGAAGTGGTTTATTTCGCTGTCTTTGTAATGGGGGACACCGTTGGGACCCTTTTGTCACAACGTGTGTGAAGTGTGAAAGAAAACCCAAATGGAAAACCAGTTTGGTGGTTTCAATAGGGGTTGTTGTTACCTTTTTCTCTCTTGTTGTGGTTCTGACCATCATCTCAAAGTCCCGCAAAATCTCAACCTATAGAGATAATAAAGCGAAGGAAAGAGAAGACAAACTGAAATCAAGTGCTGGGGATAAGCCTTGTAGGATGTTTCAACTGAAAGAGGTGAAGAAAGCAACAAATGATTTTTCCCATCAGAGGTTCTTGGGAAGTGGTGGCTTTGGGGAAGTTTACAAAGGTGAGCTACAAGATGGAACATTGGTGGCAGTGAAGAAAGCTAGAGTGGGAAACCTGAAAAGCACCCAACAAGTGCTTAATGAGGTTGCAATACTTTCTCAAGTCAATCACAAGAACTTGGTCAGGCTCTTGGGATGCTGTGTGGAATCTGAGCTACCATTTATGATCTACGAGTATATCTCAAATGGGACCCTCTACGACCATCTTCATGGCAAATATTGTTCGAACTTTCTAAACTGGAAAACGAGGCTCAAGGTTGCTTTTCAAACAGCAGAAGCATTGGCCTACCTGCATTCTGCTGCACACACTCCCATCTACCACAGAGATGTTAAGTCAACAAACATACTATTGGATGATGATTTCAATGCCAAGGTCTCAGATTTTGGACTCTCCAGATTGGCTAGCCCAGGACTCAGTCACGTTTCAACATGTGCTCAGGGAACGTTGGGGTACTTGGATCCTGAATACTACCGCAACTATCAGTTAACAGATAAAAGTGATGTTTATAGTTATGGGGTTGTGTTGCTAGAGCTTTTGACTTCACAAAAAGCGATTGACTTCAGTCGTGACGAAGATGATGTGAACCTGGCAATTCATGTGAGTCAACGTGCAAGCAATGGTACAATCATGGAATTGGTGGATCAAAGGCTTGTTTCCGTGGAGAGCTCGGGGGATAAAATGTTGACAAGCATAAAACTGTTGTTGGAGCTTGCACTTGAATGTCTGAGAGAGAAGAAAGCTGAAAGGCCAAGTATGAAGGATATTGTTCAACGCCTACTATACATAATTAGGATTGAAGAAGGAGAGTGA