Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20882 LG5 27959375 27964509 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g47070
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 27963713 missense_variant p.Val349Ile
C/T,* 27963788 missense_variant p.Pro374Ser
G/A 27963792 missense_variant p.Arg375His
C/A 27963988 3_prime_UTR_variant
G/A 27964214 3_prime_UTR_variant
T/A 27964261 3_prime_UTR_variant
A/T 27964263 3_prime_UTR_variant
A/G 27964265 3_prime_UTR_variant
T/G 27964272 3_prime_UTR_variant
G/A 27964503 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20882.1
MKCFTFSYGEKKEEPKGLPSTSSRSENSMYGDIRRSGSELNSQEVSDNGSTESLRRNAISSLSQRSSNLRVFTVSELKSATRNFSRSVMIGEGGFGCVYLGLIKSVEVPSGRIEVAVKQLSKRGMQGHREWVTEVNVLGVVEHPNLVKLVGYCADDDERGIQRLLIYEYMPNRSVEHHLSHRSEAPLSWSRRLKIARDAARGLTYLHEEMGFQIIFRDFKSSNILLDEQWNAKLSDFGLARLGPSDGLTHVSTAVVGTMGYASPEYVQTGRLTSKNDVWSYGVFLYELITGRRPIDRNRPRGEQKLLEWIRPYLSDGRKFQLILDPRLDKKQIFKSAHRLSMIANRCLVKNPKNRPKMSEVLEMVNGMLESSSPRSSPPLPLRSVARVETSQDTETNNKKRTMDQKPGESNWFARMWRPKLVRTC*


CDS Sequence:
>Vu_20882.1
ATGAAGTGTTTTACATTCTCCTATGGAGAGAAAAAAGAAGAGCCAAAAGGCTTGCCGTCAACATCGAGCCGGTCAGAGAATTCCATGTATGGTGATATTAGAAGATCTGGTTCTGAGTTAAATTCTCAGGAAGTTTCAGACAATGGCAGCACAGAATCTCTCAGGAGGAATGCAATATCCAGTTTGTCCCAGAGGTCCAGCAACCTCAGAGTGTTTACTGTTTCTGAACTGAAATCAGCCACAAGGAATTTCAGTCGCTCTGTTATGATCGGAGAGGGCGGCTTTGGGTGTGTCTACCTGGGATTGATTAAAAGTGTGGAGGTCCCCTCTGGAAGAATTGAAGTTGCTGTTAAACAGCTTAGTAAAAGGGGAATGCAGGGGCACAGGGAATGGGTGACAGAAGTGAATGTTCTGGGTGTTGTTGAGCATCCGAATCTTGTGAAACTAGTGGGTTATTGTGCAGATGATGATGAAAGAGGAATCCAGCGGCTTCTGATTTATGAATACATGCCTAACAGAAGTGTGGAACACCATTTATCCCATCGATCAGAAGCTCCTCTCTCATGGAGTAGGAGATTGAAAATAGCACGAGATGCAGCTCGTGGATTAACATACCTGCATGAAGAAATGGGTTTTCAGATAATTTTCAGAGATTTCAAATCTTCAAATATCCTTTTGGATGAACAATGGAATGCAAAGCTCTCAGACTTTGGGTTGGCAAGGTTGGGACCATCGGATGGACTGACTCATGTCTCAACAGCGGTTGTAGGAACAATGGGATATGCATCTCCAGAATATGTTCAAACTGGACGTCTAACATCAAAGAATGACGTGTGGAGCTACGGTGTCTTCCTTTATGAACTCATCACCGGTAGGCGCCCTATAGATCGAAATCGCCCCAGGGGTGAGCAGAAGCTCTTGGAATGGATAAGGCCATACCTATCAGATGGGAGAAAATTTCAACTAATATTAGACCCAAGACTAGATAAGAAACAAATCTTCAAATCAGCCCATAGACTTTCTATGATAGCAAACCGATGCTTGGTAAAAAATCCAAAGAATCGCCCAAAGATGAGTGAGGTATTGGAAATGGTGAATGGGATGTTAGAATCTTCCTCACCCCGTTCCAGTCCACCATTGCCCTTGAGGAGTGTGGCAAGAGTGGAAACTTCCCAGGATACTGAAACAAATAACAAGAAACGGACCATGGATCAGAAGCCTGGAGAAAGTAATTGGTTTGCTAGGATGTGGAGACCAAAGCTTGTTAGAACATGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20882::LG5:27957375-27959375(+)
TTGGTTGAATGTTATTTAGTTGAATGTTGTAATATATTTTAAAAGATAATTTATACTTTTTGTTTAGAAAAAGAGAGTCTATGATATGATTCAGAAAGATTCTGTAATATCTTTTATCCCATCAACTTTTTAATGGAATGTTTTTTAATTATCTAGATTTTTTTAACCCTAATTAACGTAGGTCAAGACAAATTAACAGTTTTGAATCATATGTTAAGAGAAATCACAACCTCAAAATAAAAAATTTATCAAACCAATAGACTGGTAATAAGAATTTTCAAAATATCATGATATTAAAAACGATATTTAGTTCATCCAACTTAGACAATAAATGAGTTTTTTTTTATATAGTTTATCAATATTTATGTAACTGTGATTACGGGCATTTTGGGTTCAATATAAGGGGAATTCCCCCAAAACTTTTGATTATGGGCAGAACTTAAGTTTTGACAAAAATACTTTTCAAGACTTTATGTACACAATGATGGAAACAAAATAGGCAACCCTCAATTGTTGACAATTGATGTTCATGAACTTCTATTTGAGATTTTAAACTAAAAAAAGAAAAAAACATTACAGGTCTAAGCAATTTCAGAGTATATAAAATATGAAATGTTGGATAAGATCCAACTGTGTAAGTGTAGTTAGGCAGAGGTGATGCTCATTGGCCTTGTTATTTGTTTTTAAAAACGATAAGGGGGAGAATTTGCCTTATTACTTACTTTATACTTGTTTAAAAAGTACCAATGATTTCTTTTATTTTAAAATATAAAAAAAATAATAAATTTGACCTTAAAATAAAAATATTAATATAAAGAAGTTACATAACAAAATATCAATTTCAACAAATTAAAATGATTTTAATTTCATAAGTCAAAAAATACAAATATATAAAATTAATTTTTATACTTCTTTTAATTGTTAATATTTTCTAACTAATTGTCAATTGATTTAAAAGAAATCGATAAAAATCGCATGAAAGGGGTATAATTTGGAAAATCAATTTGGAATAAATTTATTTTTACTATTTTCTCTTATAAAGATTATATTTTAAAAATATTACACCTTGTTTTCTTTGTAACACGACTGGAATTATCTTTATGAACAAGATACACTCTTTGCAATGTCTCTGCAGAAAAATAGTAAATTAATTACTCTGCCATTTATGCAGTCAAACACTAAAGACTTTAACATGAAAGGAAGAAGAGTGGTGGAAGGTTCACCATGACATGACTATGACGAAGAAATGAAATTGCATTAATTTGATTGTTGCTATCTTAACTTTTTCTATTTTATTCGTTTTCATTCAGTTGTGCTTCTTCCACGTTCCTTCCAAAGTTACATTTTCTTTTCTTTGACGTTTTGGATAAGTTATTTCATTTCGTCCAAATTCTGCGTATATTCAGTTATCCACTTCACTATCCACTGTTCTTTTGATTAGTTTAAGAGAACTGTATGGACCCGAATATTTACAAAAAAATATGTTCTCTCAAGTTATTGTGATTTTCACACTTTATTTAATGCATTCTGCTTACAATTTTATAAACAGTGTTAAAAATTATATTAATTAATGTATTACTAACGTTTTTGTTATATTTTAAATACATGTATCACTTTATGACAACAGGGAACTTAAGTTTGATGATACAGGCTGTTTCTTCCTTCTCTTACGGCACCATTATGAGTATTATAAAAGAGTGTTACAGGAGTCTGTTTTTATTATATTTACTTTACAACATTGTTTTTTTTTTCAATGTAAGAAATTTATAATTTTTTTTATAATTTAAGCATTATATTAGAATTAAATTTTAATTTTGATTTTAAAACTCATTGTTTCAACATTTAGGTTCTTAAATTCAAGAGTCACTCTTCTCAAAGCTCATAGATTACACCAGGAATGGTTACTATTATAGTCAAATCCAAAACAACACCCTTTTCACACTATTTTTTTCTTCTCAACATGTTTAGTACTTACTTTATTAGGCTGAACTTTTGTTCGG


Gene Sequence:
>Vu_20882(+)
GTAAACTAAGGTGACCAAGCCAGCAGCTGCTGCCGTGTGTAAAACTTCTCTTATACACTTTCTTTCTCCTTTCACTCTCTAAAGTCTCCACTTTTGGAGGCAAATGAAATGGTGCTGGTCCTCTTCGGAATCTTGACCCAAAGGGGACTGCCAACGTCTCACTTCTGTTAGATCAAAAGTTTCCTTTTTGCACCAACCGGAGGTGAGTTTCACCCCCAAAAATCTCTCCTTTTCTAGTTTTTCCTTTTGTATAAGGGTGCATGCAACTGATCCCATATGATCCTTAATACGATTCAAACGGTGCTGGGCTTCTACACTTTCAGATTGTGATATGGATGACCAATTTGGACGCTTTCTATTCTAATCTTATTTCCCAAAAAGAAAATTTTGTTTTCATTACCAATTTTTAATCTTTTGTAGTTTCAAATTTTGACTTATCTGGTACGGGTTGATGGTTTCTGTCAGTATTTCTGAGAATATGGAGATTTGGTACGCCCCAAAGACAAAAAATTGAAAATTCATTATGTATTTCCCAAAAGTAAAACTTAGTTTTTGTTAGTATTTATGGTCAATTGGGCTACTTCCTAGATTGTGATTGGTTATCTGAAACCTTCTGACTTGTTTAACTTTTGTTGAGGGTAAAAGAAACATGGAACATTGATTAAAAACGTTTATATGTGGATTATCTGAAATTGGAGACGTTGATGACTGGGGGAATTAGGCCGACATGGATTTTTTAGAAGGTGTTTGATGATATGGTTATTTGAAGGAATTTTTTTTCTTTCTGAATTCAATTTGAGGATTCTTCATCATATATGTCTTTACATTGGATGCGATGTTGCTTCTAAATGAATATCGAAATCTCAACATTCTCTTCTGAAAATGAAAATGCAGTCTAGTCAGCAGCCATGAAGTGTTTTACATTCTCCTATGGAGAGAAAAAAGAAGAGCCAAAAGGCTTGCCGTCAACATCGAGCCGGTCAGAGAATTCCATGTATGGTGATATTAGAAGATCTGGTTCTGAGTTAAATTCTCAGGAAGTTTCAGACAATGGCAGCACAGAATCTCTCAGGAGGAATGCAATATCCAGTTTGTCCCAGAGGTCCAGCAACCTCAGAGTGTTTACTGTTTCTGAACTGAAATCAGCCACAAGGAATTTCAGTCGCTCTGTTATGATCGGAGAGGGCGGCTTTGGGTGTGTCTACCTGGGATTGATTAAAAGTGTGGAGGTCCCCTCTGGAAGAATTGAAGTTGCTGTTAAACAGCTTAGTAAAAGGGGAATGCAGGTGAGGGTGTAGCTTTTTTTTTATTTTTATCTTAGGTCCTCTCCAATGTAAGGTCATCTTACTGTATGTTTTCATCGCATACTTTAAATTTTCTTGGGAGAAAAACCTTCAAATTCTTACATTTTGTTATCCCTAGTTGAGGCTGGAAGATTTCTGTTGTCAAGTAAGTGGTTGTTTGATTTTTGCATTGCATACATCCGATGCACATATTTAATGTTAACTACAGAAGCCATGAAGAGTAGCTTCTCTGTTGATATAAATTTGATGTGCGTTCCCAAATACACTGACATGCTATGGTTGCTACTGAAGATATGAATTATTTGTTTCTATGTATTGTTTTCTCCGCTTTAATTTTTGGTACTCTACTTTTGGCTTGTAGGGGCACAGGGAATGGGTGACAGAAGTGAATGTTCTGGGTGTTGTTGAGCATCCGAATCTTGTGAAACTAGTGGGTTATTGTGCAGATGATGATGAAAGAGGAATCCAGCGGCTTCTGATTTATGAATACATGCCTAACAGAAGTGTGGAACACCATTTATCCCATCGATCAGAAGCTCCTCTCTCATGGAGTAGGAGATTGAAAATAGCACGAGATGCAGCTCGTGGATTAACATACCTGCATGAAGAAATGGGTTTTCAGGTATAGGTTTGTGGCACAAGTTTCATAAATTCCTATTCAATTTAATAAGCCTTTGTCTACAAATCTTTTGCTGCACATTTATATAACCCAGATGGCCACATCCCCAAAGGAAAAAGGTGAATTACTCTGTCCTCACCGAAAAGATGCTAACACTATACTTTCCTCTCACACTCTTTTATGTTAACATTTAAACTCCCTCCCTTATGACATGAAATGTGTTAGTCCATTTAATGCAAACAACTACTAATGAGTTTCCCACGGACATTTTTCCTCTGTAAAACTTTAGCTAGTTTTGAGCATCCTATCATCGCCTTTACACGGACTTTAGGACTTTAAATGATGAAGTGATGTTTTTAGACACCCTTGTTAATGGCTTTGGAACTTAAAATCTTTATTTCATCTTCTAGCATTCCAGAGTCTACCTACTAAGCTAAAAGGTTGTTTGTTATCTGATACATTTTTTCATATATGGGAATCATGAATCGTAGGAATTATAATACTCATGAATGACTAAATTCTATTTGGTTAATAAAAAATATTGCTAGAAATATTCATGCTGTGTTTCTAGAAATTTCCTAAACTCTTTAATTCATTACTGTGTTAAATGATGTAATAAGGCTAACATGGTGTTTTTCTCATTAAAATTTTTATTTAATTCAGAAAAGTTAGCTTCCTACCTTCTTTCGTAAGAATCTTTTTGTGAGGATGTTATTTTTTCTTAAAGTAAACCAAGCATAGAAAATATAGTTTACCAATTTCAGAAAACCGGGAAACTAAAATTTTTCTTTCTACTAGACATCACCTAAGGATCACAAAGATAGAAAACTAGTTGTAAGGGGCTTGTTCACGTTAAAGTAGACTAAAGCATAAAACATGTAAATCTCTTGGGGAAGGCACTGTAATTTAAGCATATCTCATGAAAGAGAAGTGTAATTTAGCTAAAAAAGAAGAAAGGTATCTGGGAGGAGTTAATTTGAGTACTTTGATCAATGTCATGTTTAATTTATTTACCATTCATATCTCGGTGCAGTAAATGCCATGCTAACTATGTACTCATCATGCAGATAATTTTCAGAGATTTCAAATCTTCAAATATCCTTTTGGATGAACAATGGAATGCAAAGCTCTCAGACTTTGGGTTGGCAAGGTTGGGACCATCGGATGGACTGACTCATGTCTCAACAGCGGTATGGCTTTGTGTACTATTAATCCATGATTTTTTAAATAGATATTGCTAACATATTAAGACTGGTAATTGCCTTTAATCGTTTTAATTCACATGAGAAAATAGAGAAATTCAATATAAGACTAGGGGTAAATCTTTAGTCGTCTGTAGATCGAGTGGGGCTGGATAACATTGTGAAAAATATGAAGTATAATAGAATGAATCTTGATTCAGTTCTGAAAATCGTAAGAAATAACCATCTATAGAAGCTAAATGTGTGTAAAAAATTGAGTTAGTTTCTTGATTATTCTTACAGAGTGATTAGGACCTAACTCAATCCTACAAAATCACTTTGTGAGGTGAGGATTATATCCATTTATATACTATATTTTGATATTATCTATAGTTGATATGAGATTTTAAGTTTTCTCCAATACACTTCCTCATATACTATTGGACTTCATATGTATGTAACATGGCGAGTAATCCTTTTAGATAGACTCTAATATAACATAAAGAAAGGAGAAGCTTTATTAATTCTGAATGATGCAAAAGCTACCTTATGAGGGTCAACAAAAGCTATTATATCTGTACAAAAAAGATACTAGCTATGGTTAATAGATTACAGTTAACTAACAATAGCACATACATAGTCTAGAAGCCATCTAATGACTATTTTGTATCTAAATAAAGCAGAAAACAAAAATTATAACAGCAAATAATGTGTACTCTATTAATGTTTACTCGAATAATCTATAGTCTAATACAATACTCAATCTAAATTCAGCTTTCATTTTATCACTGTTATTTCAACATGGGCATGCAGATGGTTAAGTTGCCCCCTTTTGGCACCCCCTTTTGTTGTTCAAGTGTGTAACATATTGCTCAACAGCACCCAACCATAAAAAATTGGAATCCAATGACCATATTACTTGTGTTCATATATGGCTGTCTGTGCTTCTCAGGTTGTAGGAACAATGGGATATGCATCTCCAGAATATGTTCAAACTGGACGTCTAACATCAAAGAATGACGTGTGGAGCTACGGTGTCTTCCTTTATGAACTCATCACCGGTAGGCGCCCTATAGATCGAAATCGCCCCAGGGGTGAGCAGAAGCTCTTGGAATGGATAAGGCCATACCTATCAGATGGGAGAAAATTTCAACTAATATTAGACCCAAGACTAGATAAGAAACAAATCTTCAAATCAGCCCATAGACTTTCTATGATAGCAAACCGATGCTTGGTAAAAAATCCAAAGAATCGCCCAAAGATGAGTGAGGTATTGGAAATGGTGAATGGGATGTTAGAATCTTCCTCACCCCGTTCCAGTCCACCATTGCCCTTGAGGAGTGTGGCAAGAGTGGAAACTTCCCAGGATACTGAAACAAATAACAAGAAACGGACCATGGATCAGAAGCCTGGAGAAAGTAATTGGTTTGCTAGGATGTGGAGACCAAAGCTTGTTAGAACATGTTGATTATTGCAATTTAAAGCCGTCAAGCCTGAGCAAAATTTCTTCATGATTAGACAAGAGCTCATGCATGATATGGTGTCTCCAGCCATGCTACCATAAACAATGTGTGCAACTTTTCCCTTAATAGGATGTGTATAAATCTGCCATCACATACCACTTACCAAGTACCATAGGTGTTTCTTTCTTGTCAAGTTATTGAGGAAATTTTCTGCGATGATTTATGAACTTAAGGAGAGACGACAGGTTTCTGATGTAAAATAGTTTAGCTATGGTTTTAAATTAATCTTTAGCCTCATCTTGTAATTTTTCTACTTCTGTTAGAGGTCCCTGGAAGTTCTGCAGTCTCTGCAACAAATGCATAAAATGCATGAATGATTCTTGCCCAAGATCAGAAGCCAAGAAATTAATCCTACTTGGAAATCACCTTATCCTTGAGTTTCTTTGGTTGAACTGATATAGGTTTAAAATGACGTGAACTTGTGATTGTTGAGATATTTTGTGTGCTCTTAAAATGTGCATGAATGATTATTCTGATAATTTATTTATATATGTTGATTTTGTCTGTG