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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20880 LG5 27936287 27941047 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g47070
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   pattern recognition receptor signaling pathway, protein phosphorylation, regulation of salicylic acid biosynthetic process, regulation of salicylic acid biosynthetic process, defense response to bacterium, protein phosphorylation, regulation of salicylic acid biosynthetic process, defense response to bacterium, pattern recognition receptor signaling pathway, response to bacterium, response to bacterium, defense response to bacterium, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   plasma membrane, cytosol, plasma membrane, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20880.1
MKCFTFSYGEKKEEPKGLPSTSSRSENSMYGDIRRSGSELNSQEVSDNGSTESLRRNAISSLSQRSSNLRVFTVSELKSATRNFSRSVMIGEGGFGCVYLGLIKSVEVPSGRIEVAVKQLSKRGMQGHREWVTEVNVLGVVEHPNLVKLVGYCADDDERGIQRLLIYEYMPNRSVEHHLSHRSEAPLSWSRRLKIARDAARGLTYLHEEMGFQIIFRDFKSSNILLDEQWNAKLSDFGLARLGPSDGLTHVSTAVVGTMGYASPEYVQTGRLTSKNDVWSYGVFLYELITGRRPIDRNRPRGEQKLLEWIRPYLSDGRKFQLILDPRLDKKQIFKSAHRLSMIANRCLVKNPKNRPKMSEVLEMVNGMLESSSPRSSPPLPLRSVARVETSQDTETNNKKRTMVYKPLSWTYVTSNFTFGLDNQSENSTNWPGRTAKIKLEKFK*


CDS Sequence:
>Vu_20880.1
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Promoter Sequence:
>Vu_20880::LG5:27934287-27936287(+)
AATGTTATTTAGTTGAATGTTGTAATATATTTTAAAAGATAATTTATACTTTTTGTTTAGAAAAAGAGAGTCTATGATATGATTCAGAAAGATTCTGTAATATCTTTTATCCCATCAACTTTTTAATGGAATGTTTTTTAATTATCTAGATTTTTTTAACCCTAATTAACGTAGGTCAAGACAAATTAACAGTTTTGAATCATATGTTAAGAGAAATCACAACCTCAAAATAAAAAATTTATCAAACCAATAGACTGGTAATAAGAATTTTCAAAATATCATGATATTAAAAACGATATTTAGTTCATCCAACTTAGACAATAAATGAGTTTTTTTTTATATAGTTTATCAATATTTATGTAACTGTGATTACGGGCATTTTGGGTTCAATATAAGGGGAATTCCCCCAAAACTTTTGATTATGGGCAGAACTTAAGTTTTGACAAAAATACTTTTCAAGACTTTATGTACACAATGATGGAAACAAAATAGGCAACCCTCAATTGTTGACAATTGATGTTCATGAACTTCTATTTGAGATTTTAAACTAAAAAAAGAAAAAAACATTACAGGTCTAAGCAATTTCAGAGTATATAAAATATGAAATGTTGGATAAGATCCAACTGTGTAAGTGTAGTTAGGCAGAGGTGATGCTCATTGGCCTTGTTATTTGTTTTTAAAAACGATAAGGGGGAGAATTTGCCTTATTACTTACTTTATACTTGTTTAAAAAGTACCAATGATTTCTTTTATTTTAAAATATAAAAAAAATAATAAATTTGACCTTAAAATAAAAATATTAATATAAAGAAGTTACATAACAAAATATCAATTTCAACAAATTAAAATGATTTTAATTTCATAAGTCAAAAAATACAAATATATAAAATTAATTTTTATACTTCTTTTAATTGTTAATATTTTCTAACTAATTGTCAATTGATTTAAAAGAAATCGATAAAAATCGCATGAAAGGGGTATAATTTGGAAAATCAATTTGGAATAAATTTATTTTTACTATTTTCTCTTATAAAGATTATATTTTAAAAATATTACACCTTGTTTTCTTTGTAACACGACTGGAATTATCTTTATGAACAAGATACACTCTTTGCAATGTCTCTGCAGAAAAATAGTAAATTAATTACTCTGCCATTTATGCAGTCAAACACTAAAGACTTTAACATGAAAGGAAGAAGAGTGGTGGAAGGTTCACCATGACATGACTATGACGAAGAAATGAAATTGCATTAATTTGATTGTTGCTATCTTAACTTTTTCTATTTTATTCGTTTTCATTCAGTTGTGCTTCTTCCACGTTCCTTCCAAAGTTACATTTTCTTTTCTTTGACGTTTTGGATAAGTTATTTCATTTCGTCCAAATTCTGCGTATATTCAGTTATCCACTTCACTATCCACTGTTCTTTTGATTAGTTTAAGAGAACTGTATGGACCCGAATATTTACAAAAAAATATGTTCTCTCAAGTTATTGTGATTTTCACACTTTATTTAATGCATTCTGCTTACAATTTTATAAACAGTGTTAAAAATTATATTAATTAATGTATTACTAACGTTTTTGTTATATTTTAAATACATGTATCACTTTATGACAACAGGGAACTTAAGTTTGATGATACAGGCTGTTTCTTCCTTCTCTTACGGCACCATTATGAGTATTATAAAAGAGTGTTACAGGAGTCTGTTTTTATTATATTTACTTTACAACATTGTTTTTTTTTTCAATGTAAGAAATTTATAATTTTTTTTATAATTTAAGCATTATATTAGAATTAAATTTTAATTTTGATTTTAAAACTCATTGTTTCAACATTTAGGTTCTTAAATTCAAGAGTCACTCTTCTCAAAGCTCATAGATTACACCAGGAATGGTTACTATTATAGTCAAATCCAAAACAACACCCTTTTCACACTATTTTTTTCTTCTCAACATGTTTAGTACTTACTTTATTAGGCTGAACTTTTGTTCGGTAAACTA


Gene Sequence:
>Vu_20880(+)
AAGGTGACCAAGCCAGCAGCTGCTGCCGTGTGTAAAACTTCTCTTATACACTTTCTTTCTCCTTTCACTCTCTAAAGTCTCCACTTTTGGAGGCAAATGAAATGGTGCTGGTCCTCTTCGGAATCTTGACCCAAAGGGGACTGCCAACGTCTCACTTCTGTTAGATCAAAAGTTTCCTTTTTGCACCAACCGGAGGTGAGTTTCACCCCCAAAAATCTCTCCTTTTCTAGTTTTTCCTTTTGTATAAGGGTGCATGCAACTGATCCCATATGATCCTTAATACGATTCAAACGGTGCTGGGCTTCTACACTTTCAGATTGTGATATGGATGACCAATTTGGACGCTTTCTATTCTAATCTTATTTCCCAAAAAGAAAATTTTGTTTTCATTACCAATTTTTAATCTTTTGTAGTTTCAAATTTTGACTTATCTGGTACGGGTTGATGGTTTCTGTCAGTATTTCTGAGAATATGGAGATTTGGTACGCCCCAAAGACAAAAAATTGAAAATTCATTATGTATTTCCCAAAAGTAAAACTTAGTTTTTGTTAGTATTTATGGTCAATTGGGCTACTTCCTAGATTGTGATTGGTTATCTGAAACCTTCTGACTTGTTTAACTTTTGTTGAGGGTAAAAGAAACATGGAACATTGATTAAAAACGTTTATATGTGGATTATCTGAAATTGGAGACGTTGATGACTGGGGGAATTAGGCCGACATGGATTTTTTAGAAGGTGTTTGATGATATGGTTATTTGAAGGAATTTTTTTTCTTTCTGAATTCAATTTGAGGATTCTTCATCATATATGTCTTTACATTGGATGCGATGTTGCTTCTAAATGAATATCGAAATCTCAACATTCTCTTCTGAAAATGAAAATGCAGTCTAGTCAGCAGCCATGAAGTGTTTTACATTCTCCTATGGAGAGAAAAAAGAAGAGCCAAAAGGCTTGCCGTCAACATCGAGCCGGTCAGAGAATTCCATGTATGGTGATATTAGAAGATCTGGTTCTGAGTTAAATTCTCAGGAAGTTTCAGACAATGGCAGCACAGAATCTCTCAGGAGGAATGCAATATCCAGTTTGTCCCAGAGGTCCAGCAACCTCAGAGTGTTTACTGTTTCTGAACTGAAATCAGCCACAAGGAATTTCAGTCGCTCTGTTATGATCGGAGAGGGCGGCTTTGGGTGTGTCTACCTGGGATTGATTAAAAGTGTGGAGGTCCCCTCTGGAAGAATTGAAGTTGCTGTTAAACAGCTTAGTAAAAGGGGAATGCAGGTGAGGGTGTAGCTTTTTTTTTATTTTTATCTTAGGTCCTCTCCAATGTAAGGTCATCTTACTGTATGTTTTCATCGCATACTTTAAATTTTCTTGGGAGAAAAACCTTCAAATTCTTACATTTTGTTATCCCTAGTTGAGGCTGGAAGATTTCTGTTGTCAAGTAAGTGGTTGTTTGATTTTTGCATTGCATACATCCGATGCACATATTTAATGTTAACTACAGAAGCCATGAAGAGTAGCTTCTCTGTTGATATAAATTTGATGTGCGTTCCCAAATACACTGACATGCTATGGTTGCTACTGAAGATATGAATTATTTGTTTCTATGTATTGTTTTCTCCGCTTTAATTTTTGGTACTCTACTTTTGGCTTGTAGGGGCACAGGGAATGGGTGACAGAAGTGAATGTTCTGGGTGTTGTTGAGCATCCGAATCTTGTGAAACTAGTGGGTTATTGTGCAGATGATGATGAAAGAGGAATCCAGCGGCTTCTGATTTATGAATACATGCCTAACAGAAGTGTGGAACACCATTTATCCCATCGATCAGAAGCTCCTCTCTCATGGAGTAGGAGATTGAAAATAGCACGAGATGCAGCTCGTGGATTAACATACCTGCATGAAGAAATGGGTTTTCAGGTATAGGTTTGTGGCACAAGTTTCATAAATTCCTATTCAATTTAATAAGCCTTTGTCTACAAATCTTTTGCTGCACATTTATATAACCCAGATGGCCACATCCCCAAAGGAAAAAGGTGAATTACTCTGTCCTCACCGAAAAGATGCTAACACTATACTTTCCTCTCACACTCTTTTATGTTAACATTTAAACTCCCTCCCTTATGACATGAAATGTGTTAGTCCATTTAATGCAAACAACTACTAATGAGTTTCCCACGGACATTTTTCCTCTGTAAAACTTTAGCTAGTTTTGAGCATCCTATCATCGCCTTTACACGGACTTTAGGACTTTAAATGATGAAGTGATGTTTTTAGACACCCTTGTTAATGGCTTTGGAACTTAAAATCTTTATTTCATCTTCTAGCATTCCAGAGTCTACCTACTAAGCTAAAAGGTTGTTTGTTATCTGATACATTTTTTCATATATGGGAATCATGAATCGTAGGAATTATAATACTCATGAATGACTAAATTCTATTTGGTTAATAAAAAATATTGCTAGAAATATTCATGCTGTGTTTCTAGAAATTTCCTAAACTCTTTAATTCATTACTGTGTTAAATGATGTAATAAGGCTAACATGGTGTTTTTCTCATTAAAATTTTTATTTAATTCAGAAAAGTTAGCTTCCTACCTTCTTTCGTAAGAATCTTTTTGTGAGGATGTTATTTTTTCTTAAAGTAAACCAAGCATAGAAAATATAGTTTACCAATTTCAGAAAACCGGGAAACTAAAATTTTTCTTTCTACTAGACATCACCTAAGGATCACAAAGATAGAAAACTAGTTGTAAGGGGCTTGTTCACGTTAAAGTAGACTAAAGCATAAAACATGTAAATCTCTTGGGGAAGGCACTGTAATTTAAGCATATCTCATGAAAGAGAAGTGTAATTTAGCTAAAAAAGAAGAAAGGTATCTGGGAGGAGTTAATTTGAGTACTTTGATCAATGTCATGTTTAATTTATTTACCATTCATATCTCGGTGCAGTAAATGCCATGCTAACTATGTACTCATCATGCAGATAATTTTCAGAGATTTCAAATCTTCAAATATCCTTTTGGATGAACAATGGAATGCAAAGCTCTCAGACTTTGGGTTGGCAAGGTTGGGACCATCGGATGGACTGACTCATGTCTCAACAGCGGTATGGCTTTGTGTACTATTAATCCATGATTTTTTAAATAGATATTGCTAACATATTAAGACTGGTAATTGCCTTTAATCGTTTTAATTCACATGAGAAAATAGAGAAATTCAATATAAGACTAGGGGTAAATCTTTAGTCGTCTGTAGATCGAGTGGGGCTGGATAACATTGTGAAAAATATGAAGTATAATAGAATGAATCTTGATTCAGTTCTGAAAATCGTAAGAAATAACCATCTATAGAAGCTAAATGTGTGTAAAAAATTGAGTTAGTTTCTTGATTATTCTTACAGAGTGATTAGGACCTAACTCAATCCTACAAAATCACTTTGTGAGGTGAGGATTATATCCATTTATATACTATATTTTGATATTATCTATAGTTGATATGAGATTTTAAGTTTTCTCCAATACACTTCCTCATATACTATTGGACTTCATATGTATGTAACATGGCGAGTAATCCTTTTAGATAGACTCTAATATAACATAAAGAAAGGAGAAGCTTTATTAATTCTGAATGATGCAAAAGCTACCTTATGAGGGTCAACAAAAGCTATTATATCTGTACAAAAAAGATACTAGCTATGGTTAATAGATTACAGTTAACTAACAATAGCACATACATAGTCTAGAAGCCATCTAATGACTATTTTGTATCTAAATAAAGCAGAAAACAAAAATTATAACAGCAAATAATGTGTACTCTATTAATGTTTACTCGAATAATCTATAGTCTAATACAATACTCAATCTAAATTCAGCTTTCATTTTATCACTGTTATTTCAACATGGGCATGCAGATGGTTAAGTTGCCCCCTTTTGGCACCCCCTTTTGTTGTTCAAGTGTGTAACATATTGCTCAACAGCACCCAACCATAAAAAATTGGAATCCAATGACCATATTACTTGTGTTCATATATGGCTGTCTGTGCTTCTCAGGTTGTAGGAACAATGGGATATGCATCTCCAGAATATGTTCAAACTGGACGTCTAACATCAAAGAATGACGTGTGGAGCTACGGTGTCTTCCTTTATGAACTCATCACCGGTAGGCGCCCTATAGATCGAAATCGCCCCAGGGGTGAGCAGAAGCTCTTGGAATGGATAAGGCCATACCTATCAGATGGGAGAAAATTTCAACTAATATTAGACCCAAGACTAGATAAGAAACAAATCTTCAAATCAGCCCATAGACTTTCTATGATAGCAAACCGATGCTTGGTAAAAAATCCAAAGAATCGCCCAAAGATGAGTGAGGTATTGGAAATGGTGAATGGGATGTTAGAATCTTCCTCACCCCGTTCCAGTCCACCATTGCCCTTGAGGAGTGTGGCAAGAGTGGAAACTTCCCAGGATACTGAAACAAATAACAAGAAACGGACCATGGTGTATAAGCCATTAAGTTGGACATATGTAACAAGTAACTTTACCTTTGGTCTCGATAACCAATCAGAAAATTCAACCAATTGGCCAGGCAGAACTGCTAAAATTAAGCTAGAAAAATTCAAGTAATGCCTTTTTTATGGATCATCTAGAAAAGTCTGACGAGACAATCCTTAAAACTGAATGGGATGTACAATTATAAATTCTACTGCCACCATATGCTCGTGCTAGTGAAACGAATTTTATTCCCAATGGTTATTCGGAAGTA

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