Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20863 LG5 27698505 27704295 PREDICTED: putative serine/threonine-protein kinase isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 27699713 intron_variant
T/C 27700000 intron_variant
T/A 27700012 intron_variant
G/A 27700307 intron_variant
A/G 27700318 intron_variant
T/A 27700322 intron_variant
T/A 27701235 intron_variant
A/G 27701342 intron_variant
T/A 27701351 intron_variant
C/G 27701436 intron_variant
A/G 27701888 intron_variant
T/A 27702490 intron_variant
G/C 27702520 intron_variant
G/C 27702729 intron_variant
T/G 27702942 intron_variant
A/T 27703386 synonymous_variant p.Ala366Ala
A/T 27703750 missense_variant p.Thr454Ser
G/A 27703841 missense_variant p.Arg484Gln
T/A 27703847 missense_variant p.Val486Asp
G/A 27704191 missense_variant p.Ala568Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20863.1
MDPALGESDLAMRGHFSFSGIVQVSRKENFLLSYGNAASLRGGRCDRHSIGIVEACFFRENHDGDRGVSSELRVPLASLDGDGSAPDRRKQRRRRVLGSFSFSDLGVSFLDFSWRKDQVWWHRCDVLSVAVCAAMAALRGFEDALVTVGIAETPWSRTDDGLSASVWRQRRESQFLESRVLDRFGVFRVFLFLTAVRVHDGHWQRFGYNLWKEILGKKWNGKKNVEKAREKRKRNTSSLKRILHWIYNNYPTEEPGEDDDGNFRIFTYRELNSATRGFHPSEKIGEGGFGSVYKGQLRDGSLVAVKVLSIELDSVKGEMGFVAELNTLANVKHQNLVILRGCCVEGAHRYIVYDYMENNSLRHTFLGSEQKRMTFSWEARRDVSVGVARVLAFLHEELQPHIVHRDIKSSNVLLDGNFTPKVSDFGLAKLLRDEKSHISTQVAGTLGYLAPEYASSGHLTRKSDVYSFGVLLLEIVSGQRAVDDHEGADRFIVEKSWAAYEEKDLLRMVDPMLKMNYHMEEAKRFLMVGLCCVQETARVRPRMSEVVDMLSKNIEMEEFQVSRPGFVNDMRNARTRRQVNSSEESSASAAASFADSSGWSTSNLAR*


CDS Sequence:
>Vu_20863.1
ATGGACCCGGCTTTGGGGGAGTCAGACCTAGCTATGAGGGGTCATTTTTCTTTTTCTGGTATCGTACAAGTCTCGCGCAAGGAGAACTTTCTCCTCTCCTATGGTAACGCGGCGTCTCTTCGTGGCGGTAGGTGTGACCGCCACAGCATCGGGATCGTGGAGGCATGCTTCTTCAGAGAAAATCACGATGGTGATCGTGGCGTGTCGAGCGAATTGCGTGTTCCTCTTGCAAGCTTAGATGGCGACGGCAGCGCCCCTGATAGGCGAAAGCAGCGGCGACGTCGAGTTTTGGGTTCATTTTCGTTCTCTGATCTTGGGGTTTCCTTCTTGGATTTTTCATGGAGGAAAGACCAGGTTTGGTGGCACAGGTGCGACGTTCTCTCCGTAGCAGTGTGCGCCGCAATGGCGGCCCTCCGCGGGTTTGAGGACGCTCTTGTAACGGTGGGAATCGCGGAAACCCCTTGGTCCAGAACTGACGACGGGTTGAGTGCGTCAGTGTGGCGGCAACGACGTGAATCTCAGTTTCTGGAATCTCGTGTTCTTGATCGTTTTGGGGTTTTCAGGGTCTTCCTTTTCCTTACGGCGGTGAGAGTCCATGATGGCCACTGGCAACGATTTGGCTACAATTTGTGGAAAGAAATTTTAGGAAAGAAGTGGAACGGCAAAAAGAACGTGGAAAAGGCGCGAGAAAAGAGGAAGAGAAACACGTCAAGCTTAAAAAGAATTCTGCATTGGATCTATAATAATTACCCAACAGAAGAGCCAGGTGAAGATGACGATGGAAACTTTCGCATATTCACTTACAGAGAATTGAATTCTGCCACGCGGGGTTTTCATCCCTCGGAAAAGATTGGAGAAGGAGGCTTTGGCTCTGTCTATAAGGGGCAGCTTCGGGATGGAAGTTTGGTGGCTGTTAAAGTGCTTTCGATTGAGCTGGATTCCGTAAAAGGAGAGATGGGTTTTGTGGCAGAATTGAATACACTTGCAAATGTGAAGCACCAAAATCTAGTTATTCTTCGAGGGTGTTGTGTTGAAGGAGCCCACAGATACATAGTCTACGATTATATGGAAAACAATAGCCTTCGTCACACTTTCTTAGGTTCTGAGCAAAAAAGAATGACATTCAGCTGGGAGGCTCGGAGAGATGTATCAGTTGGTGTGGCCAGAGTGCTTGCCTTTCTTCATGAGGAGCTTCAACCCCATATTGTGCACAGAGATATCAAATCCAGCAATGTTCTTCTTGATGGAAATTTCACACCAAAAGTCTCAGATTTTGGCCTGGCCAAGCTGTTAAGAGATGAAAAATCCCACATCAGTACACAAGTTGCAGGCACATTAGGTTATCTTGCTCCTGAATATGCCAGTTCTGGCCACCTGACACGAAAATCAGATGTTTATAGTTTTGGAGTACTGCTTCTAGAAATTGTGAGTGGCCAAAGAGCAGTAGATGATCATGAAGGTGCGGATCGTTTTATAGTTGAGAAGTCCTGGGCAGCGTACGAGGAAAAAGATCTTTTGAGAATGGTGGATCCAATGCTGAAGATGAACTATCACATGGAAGAAGCTAAACGGTTCCTAATGGTGGGACTTTGTTGCGTGCAAGAAACGGCCAGGGTGAGGCCACGAATGTCAGAGGTTGTAGACATGTTGAGCAAAAACATTGAGATGGAGGAGTTTCAAGTTTCACGACCAGGATTTGTGAATGATATGAGGAACGCCAGAACGAGGAGGCAAGTAAATTCATCGGAGGAATCAAGTGCTAGTGCAGCAGCATCCTTTGCAGATTCCTCCGGATGGAGTACCTCCAATCTTGCTCGTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20863::LG5:27696505-27698505(+)
TAAAAATAATATTAATTTTGAATATAAGAAAAAGAAGAAAATTAATTCTTAATGGATCACAAATTTAAATGTTTTTAATTTGTTAAATAATTATATATAAACATTTTAAGTTTCAATAAACTTAGTTTATATAAAAAAAATTATACAATAATATAAGACGTTGAAATCATTGATTGAAAAATTATATTTAATTTCTTTTGATTAGTTAAATATGTTTTAGAAGTATATAATTAAGTTAATCTTTTAATTTTGTTGTACAAAAATTAATTTAAATATGAATCAAAATAAACAAAATATCTCAATTTAAAGTAATAAATTTAATAATAAGTTTATGGATTTCTTTGTTACATGTTTATTTTTTTTAATATATGATTTAAATTTATATTTAAATTTTATTAATTAATTATTTAGTTTTAATAATATATAATAAATATATATTTAATAATTATAAAATAATTAGTGTGAATTTTATTAAAATTAATCTAATATTTTGATATTTTGACATTTTGACTAGATTTTATAATTTTTTTCGTCTTGGGAATTTATCCCAACGTTAATCATGATATAATGAAATATTCATATTAATTATACTAAACGTCCATATTATTTATTTTCTGATTGATTATTAACTTAAAATATTGTTATTAAACTTCACATATTATATTAATATATACTTTTCATTTAGTTTATATTTCACTTAAAAGAATTATGAAATAAAAAATAAAAAAATGAGGTTAGTATTTGAGGCTAACTCCACCCAAATTATATCCCAATCCTTTCACATAAGGCTTTTAGAACTAAAACTTTAAAAAACCTCCAATTAAATGGACAAAAACAAAACAAAATCCACTTTTAAAGAGATTCAGAGTTAACCTATGAATCATGAACCTAAATAACAACTATATCTCAACTTATTATAATAATAATAATAATACATAAAAATGGAAATGATTGCTTATTATAACAATAATACATCAAATATAGAAATTACATAAAAAATAAATAATGTATTCTATTTTATGAATTTTAAATTCTGGTGTTATGTCACACATGACATTAGAACCATGTTAATAGATGACAGGGATGAAATGTGACGCTAAAAATAAAATCCAATATAAGCTAAGATAACCTTGACACATGCTTCTCAGAATCTTTGAAATTGGTCAAAGGGGTTAGTTGCACCAATATGCATTAGTTCTAGTTTGAAACCAAGTCATCTTCTCTCCTTTTCCTTTCTTCTTTTCCTCTTCTAAAATTATTCTGGGTTTATCCTTATACTCTCTTTAGAGTTTCTTGCTAGTTCTGAGATCCTCAGATATTCTGGAAGTTCCTGTTGTATCCTGGGGGACTTGCGCAATACACCGCGGATAAGTCCTTAAGGACAGTGACTCTACACGCCTCAGGAAATTTTGTTCGTGATTATATCAGTTTTTCCAACAATCTTAAGGACTTATGGCTGACATCAACAATTCAATCTTGGAGGTTCAAAACTTTGCTTCTAAACTGAAAGGTATTTGAGAAACCACTTTCATATATACAAGCTACTGTCAAAAGTAAAAAAGGTATGAAAGTTTACTTTTGTTTATTGTATGATGATGTTTGAATTTTTGAATGATACTTCTAATCAAAAATAAATGGAATTGATTATTGCGTATTAATATGTTAATATCATTTTGGATGATTGAATTCTATAATGAATTCTACAATTAAATTCACATAATTAAATTCTCGTAATTGAATTCCATAGTTGAATTCACGTGATTGAATTCACGTAATTGAACTCTGCAGCAGAATTTTGTAATTGAGACTTCTTTATTTAGGATATAATAAAGTTAGGGTTTTGTTCAAATTAGAAAAAGGAAAAGAAAAAGAGAATTACGTTTGAAAGAGGTTGCAGCGTTTTAAGATAACCTTAGTTATCTTCTTTTGGGCTTCAGATTGGGTTTGAAATGTGGAATTTTTTTTCCTTTTTCCACTTGGTTTCTTTGCTTCTCTCACGA


Gene Sequence:
>Vu_20863(+)
ATGGACCCGGCTTTGGGGGAGTCAGACCTAGCTATGAGGGGTCATTTTTCTTTTTCTGGTATCGTACAAGTCTCGCGCAAGGAGAACTTTCTCCTCTCCTATGGTAACGCGGCGTCTCTTCGTGGCGGTAGGTGTGACCGCCACAGCATCGGGATCGTGGAGGCATGCTTCTTCAGAGAAAATCACGATGGTGATCGTGGCGTGTCGAGCGAATTGCGTGTTCCTCTTGCAAGCTTAGGTTTTCGATTTGTGGTTACATTTCGGGTTTCATTGGATTTTGGGTTTTCTCTGTTTTCATGTTCGATTCTGATCTTGGGGGTTTCGATTCCTGTGTGAAGAGCTCATGTTTTGAATGCATGAAGATGGCGACGGCAGCGCCCCTGATAGGCGAAAGCAGCGGCGACGTCGAGTTTTGGGTTCATTTTCGTTCTCTGATCTTGGGGTTTCCTTCTTGGATTTTTCATGGAGGAAAGACCAGGTTTGGTGGCACAGGTGCGACGTTCTCTCCGTAGCAGTGTGCGCCGCAATGGCGGCCCTCCGCGGGTTTGAGGACGCTCTTGTAACGGTGGGAATCGCGGAAACCCCTTGGTCCAGAACTGACGACGGGTTGAGTGCGTCAGTGTGGCGGCAACGACGTGAATCTCAGTTTCTGGAATCTCGTGTTCTTGATCGTTTTGGGGTTTTCGTAACTTTGTGTATTTTGATTCGCGATTGGGGGTAAATTCTTTCCTGTTGATTCCTAGCGTGTTTTGGGTCTGCGTTGATTAGCAGAGGGTCTTCCTTTTCCTTACGGCGGTGAGAGTCCATGATGGCCACTGGCAACGTGAGGACTTTGGGTTGCTATAGGTTACACCTATCGGACTTAAGGTCCATATCGAATTGGAACTACAAATTAATTTGGTTTAAAAGGGAAGGATAAGAGTTTAAAGGAAAGTAATGAGATGATTAATTAAAGTAATAAATGATTTATTATTTGAATTAATATTGAATTATATTTATTTATATTTTCTCATTATTTGTTGAGTATAATCTATTCATGATGTTATTTTTGAATGAGATAACGGTGAATGATAATGTTAGATAGAGAATGATAAGAATGAGAATGATTCTTGTTAGAACTAAATAAACTTTGAAATGAAAGACATGGGTGAAGCCAATGTGTTTTTAGGTATTAGAATCATAAGGAATGAAGATAGTATATTACTATCCCAAGAACAATACATTGAGAAACTTCTTAAGAAGTTTGGATTTTATGACTTAAACCAGTGAGTACCCCTTATGATGCTAACTCTAAATTAATGAAAAATAGAGGAGAATCATTATCTCAGCCTCAGTATGCCCAGATAATTGGGAGCTTACTGCACTTGATGAGCTTTTCTAGACCTGATATTGCTTATGCAGTAGGTAGACTAAGTAGGTACACTCAATGTCCAAATCAGGAACATTGGGATGCACTTGCTAGGCTTATGAGATACTTAAGAGGTTCAATGGATTATGCCATTGAATATAGTGGATTTCCCGCTGTACTAGAAGGGTACAGTGATGCTAACTGGATCTTTGATTCAGATGAGACAAAATCCACTAGTGGTTATGTATTCACTCTTGGGGGTGGTACGATTACATGGAGATCAGCCAGACAAACAATTATTGCAAGATCAACAATGGAGTCTGAGTTTGTCGCTCTTGAGATGGCTGGTAGTGAGGCTGAGTGGTTGAAAAACTTCTTAGCAAACATTCCACTAGGAATGAAACCAACCCCATCTGTGTCAATACACTGTGATTGCCAATCGGCAATAGCTATAGCTAAAAACAAAAATTATAATGGAAAGAATAGACATATTCAATTGAGACACAATTTGGTGAAGCAGCTGCTAAAGAGTGGAACTATTTCCATTGACTTATGTGAAGTCAGAACGGGAATCTAGCAGATCCTCTGACAAAACCCATGGGAAGACAAATGATATTAGAAACATCGAGGGGAATGGGACTTAAGCCGCTTGCAAACAAACAAGTGATGGTAACCCAACCTTTGTGATTGGAGATCCCATGAATAAGGTTCATATGGGTAAAAACAAGTCACTTTGTTAGTTCTGATAGCACTAAATTGATTTTAATCAATTATGTCCCTTCCTATGGTGTGTGTGAAAGTGCTAGAGACTGCAATATTGAGAGGTTAAACTTTGTCATTAAAATTCTATACGGTGATAGAATTTTGTCTGAAACAAAGTTTTAATGATTTTTCATATCCCTTACGGGTGGTGTATGATTTGCAGCATACACTTGATGAAATCACCTATATGAGTGTCGAGTGGGGCCGCTTGCATGAGATCTTGGCATGATCTCTAGAGCACTCATGAATACCGGGCACGCGCATGGCCTAGTTAGCGCAACACAGCGATAACAGCAAGGATTGTGGGGGTGTATTGTGATTGATAAACCTCTAACACACGTCAAGTGTCTTTGGTTCATATAGCTTGCTATACCAACTACACTGTGTGTTAAGTATTTCAATCTAAGACTGGTTCATATAGCTTGCTATACCAGGTCTGATGCATTACATCCTATGAGACCCAGAATAAAAGTTTCTTGTTTTTTTCTTTCTTTGCAATAAGTGGGGGATTGTTGTAATAATGTTAGATTATTGCAAAAGAAAACGTTGGATTATAACGGTCAAAACTTTAATTGCCAACAACGTTCGTATTAATTTTATTAAGTGCTCCAACGGCAAAATCAAAGAAAAGTATCAAATGAAGACTCTGTCACCCAAAAGAAAATACCTTGAAGATGACATTTTTCGAATGTACAACTTTCTTCACCTAACATGCCTTTCTTATCTCACAATAATCTTTCAATTTTGTCTTTATTTGTTAAAGAGTGCTATCATTATTTATTATTATTTTTATTGGAGTCTGGAAACTTTTTTTTTTGTTACATAAAGTATTTTGGACGGATAATTAGAGATTAAACTAAAGTTTAAAATGATAACTCTAAAATTAATAGAACATGATAATAACTTTATAGTTGATAAGATTTTTCGTATTAATCCGACATTTAAGAATGATTTGTTATTGTTGTCCTCCTAATAAAAGTATATACATTTTTCAAATTTTACTTTTCAAAACAAATTAGAGATTTCTTAATTTTAAGGTGTAATGAAAATATTCTATATGAAGGTTCGTTGTGGATAATATTCAACTTCTTTAAAAAATTATTAGGATTTGGCTACAATTTGTGGAAAGAAATTTTAGGAAAGAAGTGGAACGGCAAAAAGAACGTGGAAAAGGCGCGAGAAAAGAGGAAGAGAAACACGTCAAGCTTAAAAAGGTATTTTTTTTAAACAAAAAAGCGTACCGAAAACTTTCCATATAGAATAAAAAAAAATGAAAAAAGTTATATAATAGATTATGTTCTCAGAATAATTAAATTCAATTGTTTTAAAAGTTATAGCTGATTAGATCTTCAAATTTTTATATATAGCTGATTAGATTTTCTTTCTTTATTATAATTCAAATAGTTTCCTTACTACTTTTTTCTTAATTCACCATTAAAAAAACAAGGTTGCAAAAGAGAGCAAACGATAACAACTAATATATTAATGAAAAAATATTGAAAATTTTCAGGAATTTTCATTGAAAACAATTATTTTTTACTTGCATAACTTTTTCCTAAAACAGGTTCTTAAACAAACTTTTAAATCAAGTCGAACTCTAAAAATATATTGATTTAAAAAGTGATCAATTTGAACTTTCAATTAAAAAATAAAACATAGTCAAACTTCACCTTTTAAAAAAAATGACAAACTTGGAACTAGTATCATTTTCATCCATAATCCAGAAAATCCAGAAGAAAAATCTAAGAAACTCGGGAGTGAAATGAGATGGCAACATGGTAAACAAGAGAATCTATCACAAATAGAGAAAATATATATATATATATATGAAGTTTAAGTCAATGGGTCAAAGACTTACCTTTGTGTGCCGCCTCCTCTTCATTACAACCTCCCCATGCTCTCCTTGGCTTTCTTCACACCATTGCCATCTCCAAACAAACCTTAGCGAAACAAACACCCAAATCAATCATCCTAGGAATTTTACACGTGTCTCCAGGCATGAAGATTCCCTGTTGTTCTTTTTGTACTTGTTTCTCAGCATCGGTCAAAGATCAAGAAACTAAGCACGGTATATATAAACATGTTAATGTCTTTTCCTCCTTCTGTCATCATTTGCTTTTTCATCACATTTTATCTTAACGTCATAGAATTCTGCATTGGATCTATAATAATTACCCAACAGAAGAGCCAGGTGAAGATGACGATGGAAACTTTCGCATATTCACTTACAGAGAATTGAATTCTGCCACGCGGGGTTTTCATCCCTCGGAAAAGATTGGAGAAGGAGGCTTTGGCTCTGTCTATAAGGTTATACACACATATCGTCATTTTTTCTTTCTTTTTTCATGTGGGTATTGAAGAAATCTACAATTTGATGCTGTGTGTTAGTTCTGTTAATGAATCGAGAATTGAATTTGAAGTGGCTGTGTAAATTGTAAAGGGGCAGCTTCGGGATGGAAGTTTGGTGGCTGTTAAAGTGCTTTCGATTGAGCTGGATTCCGTAAAAGGAGAGATGGGTTTTGTGGCAGAATTGAATACACTTGCAAATGTGAAGCACCAAAATCTAGTTATTCTTCGAGGGTGTTGTGTTGAAGGAGCCCACAGATACATAGTCTACGATTATATGGAAAACAATAGCCTTCGTCACACTTTCTTAGGTGATCTTCAGATTATTATTTTCTAATTTTTTAAGTTAATTAGTCAAAGTGTAGAATTATATTTCATGCATGTATTGTCTTTTGATTCTCTGTTACTATTGACAGGTTCTGAGCAAAAAAGAATGACATTCAGCTGGGAGGCTCGGAGAGATGTATCAGTTGGTGTGGCCAGAGTGCTTGCCTTTCTTCATGAGGAGCTTCAACCCCATATTGTGCACAGAGATATCAAATCCAGCAATGTTCTTCTTGATGGAAATTTCACACCAAAAGTCTCAGATTTTGGCCTGGCCAAGCTGTTAAGAGATGAAAAATCCCACATCAGTACACAAGTTGCAGGCACATTGTGAGTGAAACCAGAACCCCTTTTGATTGAATGAAACAAATTTGGATTCTTTTTACTGAATTACTGATGGGTTTCTTTAATCTTTTTTAAAACGTTATAGAGGTTATCTTGCTCCTGAATATGCCAGTTCTGGCCACCTGACACGAAAATCAGATGTTTATAGTTTTGGAGTACTGCTTCTAGAAATTGTGAGTGGCCAAAGAGCAGTAGATGATCATGAAGGTGCGGATCGTTTTATAGTTGAGAAGGTAAAAAAATTGGACAAGTGAACAGAAATGTTTTATTGTTTGGACATCCATGTTAAATGATACCATGTTAATTGTGATTGTGTGAACATGTTGACAGTCCTGGGCAGCGTACGAGGAAAAAGATCTTTTGAGAATGGTGGATCCAATGCTGAAGATGAACTATCACATGGAAGAAGCTAAACGGTTCCTAATGGTGGGACTTTGTTGCGTGCAAGAAACGGCCAGGGTGAGGCCACGAATGTCAGAGGTTGTAGACATGTTGAGCAAAAACATTGAGATGGAGGAGTTTCAAGTTTCACGACCAGGATTTGTGAATGATATGAGGAACGCCAGAACGAGGAGGCAAGTAAATTCATCGGAGGAATCAAGTGCTAGTGCAGCAGCATCCTTTGCAGATTCCTCCGGATGGAGTACCTCCAATCTTGCTCGTTAG