Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20854 LG5 27619312 27620508 PREDICTED: NAC transcription factor 25-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 27619349 missense_variant p.Trp222Leu
A/G 27620069 downstream_gene_variant
G/A 27620316 downstream_gene_variant
T/A 27620371 synonymous_variant p.Ile46Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20854.1
MDKDGNSEIRLPPGFRFHPSDEELIVHYLRNKVTSSPLPGSFIAEIDLYKYNPWELQNKASVKVVVVILIKLDEWVLCRVRQKASNTRSNWEESIYEATSQFEEMNENSNPEAAKNSVHDEYPLLPYILASVSDSIGLVSGSGCGCDDDGKAYASLHDKNTNVISGAEFMAAEGLFNPLKRKNTKEKELELYASLDKKLSEEHDVGNEHDLNKDCNSNNFDHWTSIILPQELNI*


CDS Sequence:
>Vu_20854.1
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Promoter Sequence:
>Vu_20854::LG5:27620508-27622508(-)
GAAGAAAAGAAAAGGAGAAGGAAGGGGAAAAGAAGCCAGTGGGAGTGACAAAGACGTGATATATGTACAATAATGATGTAACAACGAAGCAATGGTAGAGGCTACTACAACAACGACAGTCGACCGGACACGACAAAAGAAAGGACATGAGAAGATAAAGAAAAAAAATATAAAATGAAAACCGAAAAAAAAATGAAAAAGAAAGATCTAATTGCAAGATTTACCAACTCATTTAAGCGATCAATAATTATCGACATATATTTGTTGATGGATTTTTAGTTGTCCGTAATTATCAATAGATTTTGTGATTCGTTGATAAAATTTTCAGCAAACATTTTATCAATGAATTTTTTATAGCCAATAATTTATCAATAAAATTAAATAATTAATGGATTTTTTCTATAATTGACAATTTTTTTTGCATGTAATTATGAAATTTTTTAATAGATAACTGAGAAGAAATATGATAATAACTTAAAAAGAAGTATAATAAGGAGAAGGATTACACGTATAACTTATACTTTTTTAAAAAATAATGAGAATTTCAGGTTCAAGGGGTGAGACCGAATGATGAGGATAGGTGAGTTGTGATGTTAATAATGGGTGGTGACGACAAAAAAGTAGAACAAAATAGGTGCATGGTGTGCAATGAGAGGTCTCAAATATAAATGATAGAAACATTAAAATGAAACTATTTTTAAAACTATTTTTATTTTTTTTCACGCTTATGAACAAGACATGTAAAGGACAAAGAGAGTGATGATAATATAAAAGTTAGTGCTGGGTTTTTCCTTCTAATATAGAAGACATGTGCTCACAAAATATTTAATTTTCTTATTTTTAGGTTAATAATATAGAATTAATCTAACTAATGTTAATATCATTATTTATTATATTTATAGAATTCTAACATAGTTATAATATTCAATTAAAAAGAAATGATGATTATATATTCTAAATACGGTATTTCTAAGATAAAAAGATCATTTTTCGCTCAAAATTTAATACAAATTAAAAAGTTATTTTAGTAATTTTAACTTTTGAGTACTGCTTTGTGTAGGTTTCTTAAACTTATAAATATATAGCTCATTTAAATAATCATTCATTAGAACGGCTCCTGGTTTTTTCTATAATTTCTTAAGTAGATACTGTTTTTACTCTTGAATTTTTTATACAATGATATATTAACACATATTTTTAAACAACATTTTAATATAGCACATATTGTTTTTTATTAGATTTAGAATACATCAATACAATAATAAATTAAAAGTAAATTAGTGAAAAAAAAATGTGTTGTGTCAAAATATTATCCAATTTTTTTTATAAAGCTATCTTTTCTTAATTTTTGTGCTAACTTGTAATAAAAAGTAGCTGAAAAAAATTTGAACTAACTATGGGCTAGTTAGCCACGCTATCTCTTGCTAAGAAGATGTAGACCCTGCGCCATCCCATGGGATGTGACTTTAGCCGGAGATTCCTATGAATATGCAATCATCTGAAGTTTCTGGGCCACTAGCACACCTATTTTAATGTTGAAATTCAATTATATTGTCTGAAAGTTGAGCCATATTAGCAAATTGATTTAGAAATATCGATAATTTAAAGCTGAAAGTTGACAAACTTTGCCTTTGAAGCCTCAAACCAAGCTTTATCTATGACAACCTGATTTTGTTGCCACCCAGAACTCAATCTTTTGGCTAAATTGCTAAGCAACTTTGCTGATGAAATTATAGATACCCTTTGAAGAATGTTGGTCATTCAACATGGGACAAACGCGTTGCTTTCAAAGTCTCTTTCCACACACCTATTTAGTATTATATATAAAATAATTGTCCCTCTCTGCATGACCAAGCAATATACATATATATATATACATATATATATATAAACACCATGCACAGTAGTTTCAAGCTTACAGCCTTTTTGATCGAAAATATCGGTAACTGATTGATGCATTTTCTAGTTTGTTCCTCCAGAGGCGTTATATCTTCGTATTC


Gene Sequence:
>Vu_20854(-)
ATGGACAAAGATGGTAATTCAGAAATCCGACTTCCTCCAGGGTTTAGATTCCACCCTTCTGATGAAGAGCTGATTGTTCATTATCTGAGAAACAAAGTGACATCATCACCCCTTCCTGGCTCATTCATAGCAGAAATAGATCTTTACAAGTATAATCCATGGGAGCTCCAAAGTCTGTGTTAGAAATTGCACCGATTTAGTTTTTGTTTCATTGTTTTCTCGAAAGTATTATTCATCCAGTGAGATAAAGCATCTGTTAAAGTGGTAGTTGTAATACTGATTAAGGTTTTGAATTTTGAACAGGTAAGGCTTTGTTTGGGGAGGACGAATGGTATTTCTTTACTCCCAGAGACAGGAAGTATCCGAATGGAGTGAGGCCTAATAGAGCAGCTGCTTCTGGTTATTGGAAGGCTACTGGCACTGACAGACCCATTTTTACTTCATGTGGGATGAAGAATATTGGAGTGAAGAAGGCCCTTGTGTTCTACAAGGGTCGAGCACCAAAAGGATCTAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACAGGTTGCACAATTCCATGAATTCCATTTCACAGCAAAGAAGGTCCATGAGAGTAGGTCAACAATACCATGATTTCAATTTTCCTATATATGTAAAAAAAACAGTTTTTTATGGCTAAAGTGATATAGTATATGAAGTTTTGATTTGTTTTTTGTCATGTGCTTCAGCTGGATGAGTGGGTGCTGTGTCGGGTCCGACAGAAAGCAAGCAACACAAGAAGTAATTGGGAAGAGTCTATTTATGAAGCAACAAGCCAGTTTGAAGAGATGAATGAGAACTCAAATCCTGAAGCAGCCAAAAATTCTGTGCATGATGAATATCCATTGTTGCCTTATATTCTGGCTTCTGTGTCTGATTCTATTGGCCTAGTCTCAGGCTCAGGCTGTGGTTGTGATGATGATGGAAAAGCATATGCTTCATTGCATGATAAGAACACGAACGTAATAAGTGGAGCAGAGTTTATGGCAGCTGAGGGTTTGTTTAATCCACTGAAGAGGAAAAACACTAAAGAGAAGGAGTTGGAGTTGTATGCTTCCCTCGATAAAAAACTAAGCGAAGAACATGATGTTGGGAATGAGCATGATCTGAACAAAGACTGCAATTCCAATAACTTTGACCACTGGACTTCTATCATACTACCCCAAGAGCTTAATATCTAG