Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20849 LG5 27583441 27585590 DNA-binding protein S1FA
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 27583577 3_prime_UTR_variant
T/A 27584097 downstream_gene_variant
A/T 27584102 downstream_gene_variant
A/G 27584226 downstream_gene_variant
C/T 27584351 downstream_gene_variant
A/T 27585215 downstream_gene_variant
C/T 27585216 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20849.1
MADDFEFADKVPPSFDRVASNQGLNPGLIVLLVVGGLLLTFLVGNFVLYTYAQKTLPPRKKKPVSKKKMKKERLKQGVSAPGE*


CDS Sequence:
>Vu_20849.1
ATGGCCGATGACTTCGAGTTCGCAGATAAAGTTCCTCCTTCGTTCGATCGAGTGGCCTCAAACCAAGGGCTCAACCCAGGCTTAATTGTGCTCCTGGTTGTTGGTGGGTTGCTGTTGACATTCCTCGTTGGAAACTTTGTGCTCTACACGTATGCACAGAAGACCCTCCCTCCTAGAAAAAAGAAGCCTGTTTCAAAGAAAAAGATGAAAAAGGAGAGACTGAAACAAGGTGTGTCTGCACCTGGAGAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20849::LG5:27585590-27587590(-)
AAGAATTCACAAGCTGTTCCATTGTTTTTTGTTGGCGTATGTGACCGAAGAAATCGTTCTCGGTGTCATGTCTGGCTTCTTTCTTCTTATTACATCAATCAAACAATGGTTTTTCCCCTGCTTCAACCCTACCCTGTCCTATCTATACTTTCTTTCTTTACACACTACTTTAGGAAACAAAAGTAAAAAACGTAAGCCTATAATGGGAAAGATTTAAACAATATGTTATATTACTATTTTTGTAGCCACTATTTTAAAAAATACTCCTATATAAATGGTTTGTATATGAGAAATAAATTCGATTTATAATTTATTTTCTACTGCATATTTATATATTCCTAATGATAAAGTTAAGAAAATATAATTTCAAAAATATATAAATGTTTCACTAAAAAAGACGATAATGGTAGGTTATCACGAGAGATAATAATAACATGCCACCTAAACAGTGATATTAAAATGGGTGTCTTCGCTCACATGAATTGTCCACTTATCATTTTCCTTTTTATTAAATGTGAAAGAAATTGTAAACTTATTAGTATAATTTAGAATACATTAAATCAAATATAAATTTATAGTTTTTTATGGTAGTAAAAAAGTAGAGAACAATAATAATAGAACTAGAAGGCAATAAGAAGAAGACGCGGAAAAAAAAAGTGAAAAAATATTTATTATTTGATAGAGTGGAAATGTGAGGATTAAAAACAATGTGATTTTCCCACATTGTTATGACTTTAGGATTTATGCATCTTATTATTCTTAATTGAAATATTGATATAACATGAAATTTAAGATTTTTCTTATAAAAATAAGTATTAAAACTAACTTTTCTCTCAACAAGTTTAGGGGGGAAAAATAAGAAATATTTTAAAGCAATAGACAGTAACAAATCATTTCCTAATAACTAATAACTAACAAAAAAATTGAAATGTTTATTCAAAATTAAAATTTGGAAAACATAAGTATTAATCAATATTTATCAAAAATTAATATTTACAAATAAAAATTATATTATATCAATTAATTAAGTTTTTAATATTAAATACCATCTTAACTTAATTATAATATTATCTTTAATAGGATTAAAATAATAATTAAATACGTGTGTAAGTTCTAAAAAATTAATATACAAAAAATATTATTAAAACGTGAGTTTTATAAAACTTAACATTGGAGAAAATTATAGTAAAAAATAATCTACTATCTAATATGTACTCGACCCATTAATTATAGTCCAAATAAATCCCATAGTTAAAGGTAATATATGATATAAGATAAAATCAAAATCCATTGATAATATTTTATTCTTAATATGTCTAATATGTATTTCCCCTTCTTTATGATATGGAGCTCAATGACATGTTAAAAACTCGATCAGCCTTCTTAAATAAGTCATAGTTCTAATTTTCAAAATTGCTTATTTGAATTAAGGGTAATTAAAAATCTTAAAGATTAATCAATGACTTGAACTCAATTACCAATTAATTATATTTAATCTATTTTATCATGGTTATTGACTGTAGATGGACATATTGACATCCAAGAACATATAATAGATATAAAGTTAAAATTTTATTATTAAAATATTTTTTTTATTTTTTAAGTAAAAATATCATTATCCATATGTTTTTTTTTATATTTAACCTTTCCATATCCCATAATACAAATGTCCGAGTAATATATTCCATCGAAAAAAATTAGATAATCAATATTTAAGTTCTGAATTATATTTTCTATTATATTATTTCTAAGGAATTCATAAAAATTTGAAATTAACACTTTCAATTTTTATTTTGAAAAATATGTTGTTGTTATCATTTAAAGTGTCAACTAAAAATAAATAAATAAATAAAAATCCAAAAGAATTAAAAACTGATTTTTTTTTTTAATTTCAAAAACTAAACTCAATTGTGTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAACAACAGCGAATCGATTTCGTTGGGTTCAAAATAAATAAATCCATGGGCCGTGGGTGTTTCCTGG


Gene Sequence:
>Vu_20849(-)
AACCCTCTTTGAGGTGTGGTGCACATTTGCATTGGAATCTCCGTTTGTTTTGACAGAAACACGAGTTTTCAGCGTCAGCTATGGCCGATGACTTCGAGTTCGCAGATAAAGTTCCTCCTTCGTTCGATCGAGTGGTACACTTTCAATTACTTTTGCAAACCTTCAATTTCATCATCGCTTATTCCTTTACATCTCATCTTAATGGATTCCTGAACAATGTTCCTCCTTGCACGTTTTTCACGGTTTAATTAGGTCTTAAAGTTATAGATCGAACCTTTCACGTGGTCCTCTCGTGTTTTATTCTCAGATCTTTGGAATTGTGGAATCATTAGCATTTTGCTTGATTTTTTTCTTCCGTAATTGACCTTTTCAATGTTCCCAATTATCACCGATTCTAATGTTACAGATTTAGCGAAAATTAAATTAGGATTCATTTTCTTTTAAAAAAATATATATCGTTCAGCTCTTCAGCTAGGATTTTGATCAGGTAAATTTCGTGTTCAGATTAAACGACTTATTTATGATTATCGGATTGTTTATAGTAATGATTGTTATGTTACGCAAATCTATCGTTTGTTGCACTAGTTTTATGATCTGGTGGAGCTACGTTTCGTAAATTGTGGTGTCAAGTGTTTTTGTGTAGGTTACATTTTGTTTGTTATTCAATGCGTTGCTGTTTTGTATATTTTGATGTTGGTGCCAATCAACGTTTTGGATTATAGATGTTAGCAATATTACAGAGCAAATGGATTGTGGTTAGTCTCAACTTCATGCAATTAAACCCTTTTCCACAAGTTATCAGCAAATGATGGGGTTTGTCGTAGTGGAATAACGTTTTTGGAGATTTTATGATGGAATGGAATGAGTTGAATTTTTGTAAGGGTTCTATTCTAACCCGTACCTCCCAAATCAGGGGAAAGAAAGAGAGATTATTGATGGAGTAAAATCTCCATTGGGTTCGACTTCACTCCAACCTATCTTAAAACATCTAAACAATAGAACTTAGTGTCCTGACGATATGTCATTCATATTTTACCACCTATTCAAACATAATTAAAGAGACTCAAGTGTTATGTCATGATATTCAATGTTTTGGTCACTAAGAGAAAATGAAAGAATATCCTATTTTTGTTGAGAATAATATTGTAACGAGATGTGTTATTTCTCTTGTTTCAAAATTTGACTTGTGCTTCGAAATAGTTTTAAAAAGTATTTTATATAATATCTCCAATGTTCTGTGTATTGCAGTTCACATCAATCATTTGACAGAGTTTGATTTCTCTGAACATAGCGGAGGATAAAGTGAAATAATAACCATTAATTAGAAAATCAATGGTTCAGACTGTATTAGACTTTTGATTTTGTTACATATGTATTTGCTTTTATCACAGTTCTCAATCACTGATTTTGTAATCAGTGGTTTTAAGTACACTTTATTTTTTAAATTACATCTATTAGAGGAATCAAATCTATGCCTACTTTTTTGGGTATCAAGCTTTCTCAACTATATTGCACCTTCCTTATTAATGATAACCTCTTTTATCAATCATTCTCAAACAAGTTCAATCATTTGATTTTTCTGCAGTAGTAGTTTTATAAATTAGAGACCCACCCTTGGAGAGGACTAAAATTCACATGTTGGTGTATCAGTAACATTGTCATCAACGATGAATTGCTTGTCTATTTTAAAAAAGTTCGATTTTATTTTATCTGCAATTCGTTTTGCTCAGTGCTTTTTGTTTTGTTATACTTAGGCCTCAAACCAAGGGCTCAACCCAGGCTTAATTGTGCTCCTGGTTGTTGGTGGGTTGCTGTTGACATTCCTCGTTGGAAACTTTGTGCTCTACACGTATGCACAGAAGACCCTCCCTCCTAGAAAAAAGAAGCCTGTTTCAAAGAAAAAGATGAAAAAGGAGAGACTGAAACAAGGTGTGTCTGCACCTGGAGAGTAGACTCTGTACTCAGTTTATGTTCTGTGGTTTAAATTGTACTATTTAGATAAAGCTTCTTCTGTGGAGTCTTGCATGACGTTGATTTTGTTCTTTTCTACCCGTGTATTACTGATGGAAAGCTTAACCGCATAATTTAGTGCTTTAGTAATGTTATTGGGACTGGTTATTTCATGCTTAAATCACCATTTTGCTCCCTAA