Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20720 LG5 26204151 26208116 PREDICTED: MDIS1-interacting receptor like kinase 2-like isoform X1
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SNP Position Effect Amino acid change
C/A 26204442 missense_variant p.Leu98Ile
T/A 26205309 missense_variant p.Phe387Ile
T/C 26205592 missense_variant p.Met481Thr
A/G 26205666 missense_variant p.Thr506Ala
T/A 26205692 missense_variant p.Ser514Arg
C/T 26205725 synonymous_variant p.Gly525Gly
A/T 26205747 stop_gained p.Lys533*
C/T 26205956 synonymous_variant p.Asp602Asp
A/T 26206089 stop_gained p.Lys647*
T/C 26206664 synonymous_variant p.Cys838Cys
C/T 26206799 synonymous_variant p.Leu883Leu
T/A 26206899 missense_variant p.Ser917Thr
G/T 26207288 downstream_gene_variant
C/T 26207289 downstream_gene_variant
G/A 26207592 downstream_gene_variant
A/G 26207701 downstream_gene_variant
G/T 26207729 downstream_gene_variant
T/G 26207909 stop_lost p.Ter1006Glyext*?
G/C 26207917 missense_variant p.Lys1008Asn
G/C 26208000 missense_variant p.Arg1036Thr
C/T 26208010 synonymous_variant p.Thr1039Thr
T/A 26208056 missense_variant p.Leu1055Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20720.1
MTTFQKVHALAFHILLLALLPLKIASSLTTEAEALVKWKNSLSSPLPPSQDSWSLTNLSNLCIWDAIVCDNTNTTVSEINLSGANLTGTLSALDFASLPNLTQLNLNANNFGGSIPSEIGKLSKLTLLDLGNNLFEDSLPKELGQLRELRYLSLYNNNLNGTIPYQLMNLPKVWYMNLGSNYFITPLHWSQYSCMPSLTRLALHLNPSLTGEFPSFILECHNLTYLDISQNGWNDTIPESLYSNLGKLEYLNLTNNGFGGKLSPNLSMLSNLKELRIGYNLFTGPVPTEIGLISGLQILELNNISAHGKIPSSLGQLRELWHLDLSINSFNSTVPSELGLCRNLSFLSLAVNDLTGPLPMSLANLTKISELGLSDNSFSGELSATLFSNWTQLISLQIQNNNFTGKLPPHIGLLKKLNFLYLHNNHFSGPIPVEIGNLKEMTWLDLSQNQFSGPIPSTLWNLTNIQLMNLYSNELSGTIPMDIGNLTSLQIFDVSNNKLYGELPATIAQLTALSKFSVFSNNFTGSLPRQFGKINPSLTYVYLSNNSFSGELPPDICSGGKLIIFAINNNNFSGPLPKSLRNCPSLIRVRLDDNQLTGNITDAFGVLPNLVFISLNTNQLVGELSPEWGECASLTNMNMGSNKLSGKIPSALSKLSQLRYLSLHSNEFTGSIPPEIGNLSLLYSFNLSSNHLSGEIPKSYGRLAKLNFLDLSNNNFSGSIPKEIGDCDGLLSLNLSHNSLSGEIPDELGNLFSLQIMLDISSNSLSGALPQNLEKLTALEILNVSHNHLSGTIPRSFSSMLSLQYIDFSYNKLSGSIPTGRVFQTANAEAYAGNSGLCGEIKGLTCPKSLSPDKSGGVNKKVLLGFIIPVCVLIGMISVGAILRRRHIINNLDEVSKSNEKSDQPISVVCGRDGKFSFSDLVKATDDFNDKYCVGKGGFGSVYRAQLPTELAQTMRVTEKCDVYSFGVVVMEILMGKHPGELLGTLSSNKYLSSTEEAQVLLKDVLDQRLPPPTGQLAEAVVFTMTIALACIRESPESRPIMRAVAQELSATTQPYLSQPFTMITMNKLRGFQK*


CDS Sequence:
>Vu_20720.1
ATGACAACTTTCCAAAAGGTTCATGCTTTAGCCTTTCATATACTCTTGCTAGCTTTGCTTCCATTGAAAATCGCTTCATCACTAACAACAGAAGCAGAAGCCCTTGTCAAATGGAAAAACAGTTTATCCTCTCCTCTTCCTCCTTCTCAAGACTCATGGTCCCTCACCAACCTTTCCAACCTTTGCATTTGGGATGCCATTGTTTGTGACAATACCAACACAACAGTCTCAGAGATAAACTTGTCTGGTGCTAATCTCACTGGGACTCTCTCTGCCTTGGATTTTGCTTCCCTCCCTAACCTCACCCAACTCAACCTCAATGCCAACAACTTTGGGGGGTCAATACCATCAGAAATTGGCAAACTCTCCAAGCTCACACTATTGGACTTGGGGAACAACTTATTTGAAGACTCGCTGCCTAAAGAACTAGGCCAGCTAAGGGAGCTTCGATATCTCAGCCTTTACAACAACAATCTCAATGGCACCATTCCTTATCAGCTCATGAATCTACCTAAGGTATGGTACATGAACCTCGGATCAAATTATTTCATAACTCCTCTTCACTGGTCCCAATATTCATGCATGCCTTCCTTGACACGCCTTGCTTTACATCTAAATCCATCACTCACTGGTGAATTCCCGAGTTTCATACTTGAGTGCCATAACTTGACATACCTTGACATCTCTCAGAATGGATGGAATGACACTATTCCAGAATCTCTGTATAGCAATTTGGGCAAGCTAGAATACCTCAACCTCACCAACAACGGGTTTGGAGGAAAGCTGTCACCCAACTTGTCCATGCTTTCTAATCTCAAAGAACTTCGTATTGGTTATAACTTGTTTACTGGTCCTGTTCCCACTGAGATAGGATTGATATCTGGGCTTCAAATTCTTGAACTGAATAACATTTCTGCCCATGGAAAGATCCCTTCTTCCTTAGGCCAACTTAGGGAGCTGTGGCATCTTGATCTCAGTATAAATTCTTTTAACTCTACAGTCCCTTCGGAGCTTGGCCTGTGCAGAAATCTATCTTTCTTGAGCTTAGCAGTGAATGATTTGACTGGTCCTTTGCCTATGTCATTAGCTAATCTGACTAAAATATCAGAACTGGGATTATCAGATAACTCCTTTTCTGGTGAACTTTCTGCTACGCTTTTCTCTAACTGGACCCAGTTGATCTCCTTGCAAATCCAAAACAATAACTTTACAGGAAAGCTTCCTCCACATATTGGCCTGTTGAAAAAACTTAACTTTCTCTACCTGCACAATAATCACTTCTCTGGTCCCATTCCTGTGGAGATTGGAAACCTGAAGGAAATGACATGGTTAGACCTTTCACAAAACCAATTCTCTGGCCCAATTCCATCAACTCTTTGGAATCTGACTAACATTCAACTCATGAATCTTTACTCCAATGAGCTCTCTGGAACCATCCCCATGGATATTGGAAACTTGACCTCACTCCAAATCTTTGATGTCAGCAACAATAAATTGTATGGGGAGTTGCCAGCAACCATTGCTCAACTAACTGCTTTAAGTAAATTTTCCGTGTTCAGCAATAACTTCACTGGCAGCCTTCCTAGACAATTTGGAAAGATTAATCCTTCTTTGACCTACGTCTACCTTTCAAACAACAGTTTCTCAGGAGAACTGCCACCTGACATATGCAGTGGGGGCAAACTAATTATTTTTGCAATCAATAACAACAACTTTTCAGGGCCATTGCCAAAGTCCTTGAGAAATTGTCCATCACTTATTAGAGTTCGGCTTGATGATAACCAGCTCACTGGAAACATCACAGACGCATTTGGGGTTCTCCCAAATCTTGTTTTTATCTCACTTAATACAAACCAACTAGTGGGTGAGCTATCTCCCGAGTGGGGCGAGTGTGCCAGCTTAACCAATATGAATATGGGAAGCAACAAACTTTCTGGAAAAATTCCTTCTGCGCTAAGTAAGTTGAGTCAATTAAGGTATCTAAGCCTTCATTCCAATGAATTCACTGGTAGTATCCCACCCGAAATCGGAAATCTAAGCCTGCTTTACTCGTTCAATTTGAGCAGTAACCATTTATCCGGAGAAATCCCAAAGAGTTATGGGAGATTGGCTAAGCTAAATTTTCTTGATTTATCAAATAACAACTTCAGTGGAAGCATTCCTAAAGAAATCGGTGATTGTGATGGCTTACTGAGCCTGAATTTAAGCCATAACAGTCTATCTGGGGAGATACCAGATGAACTTGGCAATCTGTTCTCACTGCAAATCATGTTGGACATCAGCAGCAACTCTCTTTCCGGGGCTCTTCCCCAAAACCTTGAAAAGTTAACAGCATTGGAAATTCTCAATGTGTCACACAACCATCTATCAGGGACAATCCCACGATCATTTTCAAGCATGCTCAGCCTTCAATATATTGATTTTTCTTACAACAAGCTGAGTGGTTCAATCCCCACAGGCCGTGTTTTCCAGACAGCAAATGCTGAAGCCTACGCGGGAAACTCAGGTTTGTGTGGTGAGATAAAAGGATTAACATGCCCCAAATCACTTTCCCCGGACAAATCTGGAGGAGTTAACAAAAAGGTTCTTCTTGGGTTTATCATACCAGTTTGTGTATTAATTGGGATGATTAGTGTTGGAGCAATACTCCGCCGGCGGCATATCATAAATAACCTTGATGAAGTGTCCAAAAGCAATGAAAAAAGTGATCAGCCTATCAGCGTGGTGTGTGGAAGAGATGGAAAATTCTCATTTTCTGATCTTGTTAAGGCCACCGATGACTTCAATGACAAGTACTGCGTTGGAAAAGGAGGATTCGGAAGTGTTTATAGAGCACAATTACCCACAGAACTGGCACAAACAATGAGAGTGACGGAGAAGTGTGACGTGTATAGTTTTGGAGTGGTGGTGATGGAGATATTGATGGGAAAGCATCCTGGAGAACTGTTGGGTACACTGTCTTCAAACAAGTATTTGTCATCAACGGAGGAAGCACAGGTGCTACTGAAGGACGTGCTTGATCAAAGGCTTCCACCTCCTACAGGCCAATTGGCAGAAGCAGTGGTGTTCACAATGACCATAGCTTTGGCATGCATACGTGAGTCTCCAGAGTCCAGACCCATCATGCGTGCTGTGGCTCAAGAACTATCGGCTACTACTCAGCCTTATCTTTCCCAGCCATTTACCATGATTACCATGAACAAGCTTAGAGGCTTCCAGAAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20720::LG5:26202151-26204151(+)
CATTTTAAGCAAGCTGATGGGTCAACCCGTACACCGTGACCCACCTCTAAACATAATATTAATATCTGACTTTTAAAAATAAATATATAACTTTTTAATATTAAAAAACTGAAGATAAAGATTAATCTTTGAAGTATTTGTTGGGTTGGACTAAATAAATTACTAACTCTTCAACTATACATGAAACTTTTCAGGTGTTACTCCCTCCTCACCACCACACGTTATTTCCTGCACTTTCCAATTTCTCTTTTGCCTTTCAATAATATTTAAACGAATGTAAACTAAAGGGATATCAACATTCGTGAATGAACATAACCTCCGTTAAAAGACAAATATTAACATCCGTAAACAGACATGAATCTCCGTTGAAGAAGGACAAATAGATGTCAACCGATATCATCTTGGTCGACGGATATTCACATTTGTCCAACCGTACTATTGCAATATTTTGTTTAGATGTTGACATCCGTCATCCGTTTATTTGTCATTTGATAACCACACTTTGGATGACTAGGAAATATTTTGTTGGGTGCCAGAGATATGGGTTTAAAAAACAATGTTGGTCCACAGAAGCATCAAGCAGTAATGACAAGTGCGGATCAAGCAGTTTTCTATAAGTGCCGCATTGATGCATATCCACTCCAAGCTCTCCGAACTCAACCTCTTCGAACGCAAGGGCCACACCACCCTCATCTTGCTCTCCCTCATCCTCACCCTCCTCCCTCTCTGCGTCTGCGGCGTCGTCTTCTCCGTCATTCACTGCCATTTGACCCCATCCACAGTCCTCCTAGACCGCAATTTGGTGGCAAAGATCACGGGCTTTGGACTCCATGATTGTCGTGACGAACAGTGTAACAATTGCTCATTGCTTATTGCGATTGCGATTAAGCTTGATAAGGAAATCTTGGTAGAGGCAAAACAGCAATGGAGACAGTGGGGAGTTCTAGAGTGTTTTTGAAATAAAAAGAATAATAAAAAGAATAATAAAAAGGTGAAGGGTATTTTTGAAATAAAACAAATAGTGGAGAGGTGGAGAAAGCACGTAGGGGTGGTGGAGGGAGCGTAGGGGTGGTGGAGGGAGCAAAACCCAACTTTTCATTGGATGCTTACTGGAAAATTTTCATTTTCGATATGCATTGTAAACACAAATTTCGTTTTCCAACACCATAAACTTAAATGACTAGTCTGTCTTTGTTTGTGTATTTGTGAAGCTTAATAACGCAAATTCAAATCTTCTCTCTTTTCTACATTTCTGCATTGGTTGAACCCACCTTATGTCTTTGGAAATTTGAAAACACAGTAAATGAAAATTCACACTTTCCAAAACAGCATATGCAGAATGAAGCGTGTTACCAACATTTACTTCCTCAGCAAAAGTATTTTTTACTAGTTTTTTAAGAATATTTGTTCAATGACACTCTTACATATGTTAATCAAGAATAAATAATTGACACATTTTTAAGCGTATTCTTTTAGTATGTTCTTCGATGCAACTGGAGATGTTGCGCCACATAGGAAAATATGAATCACCATGACAACGAGTTGGACTATAACCAAACTACTTGATTTTCTATTATTTTATGCTTTTTATTCAATACCATATGGAAGCTTTTTGCAAGTGCCGCAAACACTGTCATTCCTTTTAGGATAAAATGTGAATGATAAATCCATTTGTGCTTCTTAAAATAATGATAATTAATGATAAAGTCAACCAAGTAAGACTATGCAATGCATATCTTTGTTTTTAAAAACAAGCAATGCAGTTATAATCAATCAAAACAAACCACATGGCGTGGACCAATTCACCATGTAGTTTTTTATGTTTTCCTTGTATTTACATTTAGAGTCTGTGCCTTTCATTAACAGAAACTAACTCACTCATTTCAAGATTGAATTATTTTTTCAGAATATGTTTGAAAATTCTGAAGCGTTAAGAGAAATGGATTATGCTATATAAGTGAGTTAAAGATTTACACAGAGGTCATGCCAAGTGCTAGACA


Gene Sequence:
>Vu_20720(+)
ATGACAACTTTCCAAAAGGTTCATGCTTTAGCCTTTCATATACTCTTGCTAGCTTTGCTTCCATTGAAAATCGCTTCATCACTAACAACAGAAGCAGAAGCCCTTGTCAAATGGAAAAACAGTTTATCCTCTCCTCTTCCTCCTTCTCAAGACTCATGGTCCCTCACCAACCTTTCCAACCTTTGCATTTGGGATGCCATTGTTTGTGACAATACCAACACAACAGTCTCAGAGATAAACTTGTCTGGTGCTAATCTCACTGGGACTCTCTCTGCCTTGGATTTTGCTTCCCTCCCTAACCTCACCCAACTCAACCTCAATGCCAACAACTTTGGGGGGTCAATACCATCAGAAATTGGCAAACTCTCCAAGCTCACACTATTGGACTTGGGGAACAACTTATTTGAAGACTCGCTGCCTAAAGAACTAGGCCAGCTAAGGGAGCTTCGATATCTCAGCCTTTACAACAACAATCTCAATGGCACCATTCCTTATCAGCTCATGAATCTACCTAAGGTATGGTACATGAACCTCGGATCAAATTATTTCATAACTCCTCTTCACTGGTCCCAATATTCATGCATGCCTTCCTTGACACGCCTTGCTTTACATCTAAATCCATCACTCACTGGTGAATTCCCGAGTTTCATACTTGAGTGCCATAACTTGACATACCTTGACATCTCTCAGAATGGATGGAATGACACTATTCCAGAATCTCTGTATAGCAATTTGGGCAAGCTAGAATACCTCAACCTCACCAACAACGGGTTTGGAGGAAAGCTGTCACCCAACTTGTCCATGCTTTCTAATCTCAAAGAACTTCGTATTGGTTATAACTTGTTTACTGGTCCTGTTCCCACTGAGATAGGATTGATATCTGGGCTTCAAATTCTTGAACTGAATAACATTTCTGCCCATGGAAAGATCCCTTCTTCCTTAGGCCAACTTAGGGAGCTGTGGCATCTTGATCTCAGTATAAATTCTTTTAACTCTACAGTCCCTTCGGAGCTTGGCCTGTGCAGAAATCTATCTTTCTTGAGCTTAGCAGTGAATGATTTGACTGGTCCTTTGCCTATGTCATTAGCTAATCTGACTAAAATATCAGAACTGGGATTATCAGATAACTCCTTTTCTGGTGAACTTTCTGCTACGCTTTTCTCTAACTGGACCCAGTTGATCTCCTTGCAAATCCAAAACAATAACTTTACAGGAAAGCTTCCTCCACATATTGGCCTGTTGAAAAAACTTAACTTTCTCTACCTGCACAATAATCACTTCTCTGGTCCCATTCCTGTGGAGATTGGAAACCTGAAGGAAATGACATGGTTAGACCTTTCACAAAACCAATTCTCTGGCCCAATTCCATCAACTCTTTGGAATCTGACTAACATTCAACTCATGAATCTTTACTCCAATGAGCTCTCTGGAACCATCCCCATGGATATTGGAAACTTGACCTCACTCCAAATCTTTGATGTCAGCAACAATAAATTGTATGGGGAGTTGCCAGCAACCATTGCTCAACTAACTGCTTTAAGTAAATTTTCCGTGTTCAGCAATAACTTCACTGGCAGCCTTCCTAGACAATTTGGAAAGATTAATCCTTCTTTGACCTACGTCTACCTTTCAAACAACAGTTTCTCAGGAGAACTGCCACCTGACATATGCAGTGGGGGCAAACTAATTATTTTTGCAATCAATAACAACAACTTTTCAGGGCCATTGCCAAAGTCCTTGAGAAATTGTCCATCACTTATTAGAGTTCGGCTTGATGATAACCAGCTCACTGGAAACATCACAGACGCATTTGGGGTTCTCCCAAATCTTGTTTTTATCTCACTTAATACAAACCAACTAGTGGGTGAGCTATCTCCCGAGTGGGGCGAGTGTGCCAGCTTAACCAATATGAATATGGGAAGCAACAAACTTTCTGGAAAAATTCCTTCTGCGCTAAGTAAGTTGAGTCAATTAAGGTATCTAAGCCTTCATTCCAATGAATTCACTGGTAGTATCCCACCCGAAATCGGAAATCTAAGCCTGCTTTACTCGTTCAATTTGAGCAGTAACCATTTATCCGGAGAAATCCCAAAGAGTTATGGGAGATTGGCTAAGCTAAATTTTCTTGATTTATCAAATAACAACTTCAGTGGAAGCATTCCTAAAGAAATCGGTGATTGTGATGGCTTACTGAGCCTGAATTTAAGCCATAACAGTCTATCTGGGGAGATACCAGATGAACTTGGCAATCTGTTCTCACTGCAAATCATGTTGGACATCAGCAGCAACTCTCTTTCCGGGGCTCTTCCCCAAAACCTTGAAAAGTTAACAGCATTGGAAATTCTCAATGTGTCACACAACCATCTATCAGGGACAATCCCACGATCATTTTCAAGCATGCTCAGCCTTCAATATATTGATTTTTCTTACAACAAGCTGAGTGGTTCAATCCCCACAGGCCGTGTTTTCCAGACAGCAAATGCTGAAGCCTACGCGGGAAACTCAGGTTTGTGTGGTGAGATAAAAGGATTAACATGCCCCAAATCACTTTCCCCGGACAAATCTGGAGGAGTTAACAAAAAGGTTCTTCTTGGGTTTATCATACCAGTTTGTGTATTAATTGGGATGATTAGTGTTGGAGCAATACTCCGCCGGCGGCATATCATAAATAACCTTGATGAAGTGTCCAAAAGCAATGAAAAAAGTGATCAGCCTATCAGCGTGGTGTGTGGAAGAGATGGAAAATTCTCATTTTCTGATCTTGTTAAGGCCACCGATGACTTCAATGACAAGTACTGCGTTGGAAAAGGAGGATTCGGAAGTGTTTATAGAGCACAATTACCCACAGGTCAAGTCGTTGCTGTGAAGAGGCTCAACATATCATACTCCGATGACATTCAACCAATGAACCGCCATAGCTTTTTGAATGAGATAGAAGCACTTACAGGTGTGAGACACCGCAATATAATAAAGCTTTATGGATTCTGTTCTTGCAGGGGACAAATGTTCTTGGTTTATGAATACATAGACAGAGGAAGTTTGGAAAAAGTGTTGTACGGAGAGGAAGGAAAATTGGAGCTAAGCTGGGCCACAAGGATAAAAATTGTACAAGGAATAGCACATGCAATTTCATACCTGCACACAGATTGCTCCCCACAAATTGTGCACCGGGATGTAACACTGAATAACATACTACTAGACTTCGACTTTGAACCCCGTCTTGCAGATTTTGGCACAGCAAAGCTCCTAAGCTCAGACGCTTCAAAGTGGACCTCAGTTGCTGGATCCTATGGTTACATGGCTCCAGGTACATCATCCAATCTATTTAAATTACAGTATGTATACTATATAATATGCATCACGATAAGGCATTCTTTAATATGTTCCTAAGATGATTCTGACAATTTAAAAACATTTGTTACATGATTTGCTTTTTAAATAGAAATGTCTTGTTTCTTTCTTATTAAATTGTGTATATACGGTTTTTTTATCAATGTCTGAATATACTCTTGTTACAAGGCTTTGGAGTTTTATTCAGTGTATATAAATTAAAGTGTGTGATGAGACTGAGAAAAGTTGAAATTTGCAGAACTGGCACAAACAATGAGAGTGACGGAGAAGTGTGACGTGTATAGTTTTGGAGTGGTGGTGATGGAGATATTGATGGGAAAGCATCCTGGAGAACTGTTGGGTACACTGTCTTCAAACAAGTATTTGTCATCAACGGAGGAAGCACAGGTGCTACTGAAGGACGTGCTTGATCAAAGGCTTCCACCTCCTACAGGCCAATTGGCAGAAGCAGTGGTGTTCACAATGACCATAGCTTTGGCATGCATACGTGAGTCTCCAGAGTCCAGACCCATCATGCGTGCTGTGGCTCAAGAACTATCGGCTACTACTCAGCCTTATCTTTCCCAGCCATTTACCATGATTACCATGAACAAGCTTAGAGGCTTCCAGAAGTAG