Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20718 LG5 26195187 26199090 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 26196100 synonymous_variant p.Gly997Gly
A/G 26196172 synonymous_variant p.Asn973Asn
T/G 26196187 missense_variant p.Glu968Asp
C/A 26196351 stop_gained p.Gly914*
C/T 26196567 missense_variant p.Gly842Ser
G/A 26196773 missense_variant p.Pro773Leu
C/T 26196781 synonymous_variant p.Gly770Gly
A/T 26196904 missense_variant p.Asp729Glu
C/A 26196909 missense_variant p.Gly728Cys
A/G 26196919 synonymous_variant p.Pro724Pro
A/G 26197415 missense_variant p.Leu559Ser
G/A 26197559 missense_variant p.Ala511Val
C/T 26197720 synonymous_variant p.Leu457Leu
A/G 26197721 missense_variant p.Leu457Pro
A/G 26197723 synonymous_variant p.Gly456Gly
G/A 26197788 missense_variant p.Pro435Ser
G/A 26197870 synonymous_variant p.Thr407Thr
T/G 26198083 synonymous_variant p.Thr336Thr
A/C 26198239 missense_variant p.Phe284Leu
T/A 26198322 missense_variant p.Thr257Ser
G/A 26198326 synonymous_variant p.Asn255Asn
G/A 26198901 missense_variant p.Leu64Phe
A/C 26198982 missense_variant p.Ser37Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20718.1
MLDMTNFQRLHTLVLPIIFLCLFPLRIASSPTAEAESLVKWKNSLTPPLPPSLNSWSLTNLTNLCFWDAVVCDNTSTTVLEINLSGANITGTITVLDFASLPNLTQLNLNANNFEGSIPPAIGNLSKLTLLDLGNNLFEDSLPKELGQLRELRYLSLYNNNLNGTIPYQLMNLPKVWYMDLGSNYFITPLHWSQYSCMPSLTRLALHLNPTLTGEFPSFVLECHNLTYLDISQNGWNGTIPESLYSNLGKLEFLNLTNNGFGGKLSPNLSLLSNLKELRIGNNFFTGPVPTEIGLISGLQILELNNISAHGKIPSSLGQLRELWHLDLSINSFNSTVPSELGLCRNLSFLSLAVNHLTGPLPMSLANLTKISELGLSDNSFSGELSATLLSNWTQLTSLQVQNNNFTGKIPPEIGLLKRINYLFLYNNTFSGSIPVDIGNLKEMVKLDLSQNQFSGLIPSTLWDLTNVQVMNLFFNELSGIIHADIGNLTSLEIFDVNSNNLHGELPATIAQLTALKSFSVFSNNFSGRIPREFGKGNPSLTDVYLSNNSFYGELPIDLCSGGQLTVLAVNNNSFSGPLPKSLRNCSPLVRVRLDNNQLTGNITDAFGVLPNLVLISLSTNLLVGELSPEWGGCANLTSMDMGNNKLSGKIPSALSKLSQLGYLNLHSNEFTGSIPPEIGNLSRLFRLNLSSNHLSGEIPKSYGRLAKLNFLDLSNNNFGGSIPKEIGDCDGLLSLNLSHNSLSGEIPDELGNLFSLQIMLDISSNSLSGALPQNLEKLRALEILNVSHNQLSGTIPRSFSSMLSLQSVDFSYNKLSGSIPTGRVFETATAEAYAGNSGLCGEIEGLTCPKSLSTDKSGGVNKKVLLGVIIPVCVLIGLISVGAILRRRHIIKHGDEESKSNEKSDQPISVVWGRDGKFTFSDLVKATNDFNDKYCIGKGGFGSVYRAQLLTGQVVAVKRLNISDSDEIPPMNRLSFLNEIEALTGVRHRNIIKLYGFCSCRGQMFLVYEYIDRGSLAKVLYGEEGQLELSFGVVVMEILMGKHPGELLGTLSSNKYLSSTEEAQVLLTDVLDQRLPPPTGQLAEAVVFTMTIALACIRESPESRPIMRAVAQELSATTQPYLSQPLSLITMNKLRGFQK*


CDS Sequence:
>Vu_20718.1
ATGCTAGACATGACTAATTTTCAAAGGCTTCACACTCTAGTCCTTCCAATTATCTTCCTGTGTTTGTTTCCTTTGAGAATCGCTTCATCACCAACAGCAGAAGCAGAATCACTTGTCAAATGGAAAAACAGTCTAACACCTCCTCTTCCTCCTTCTCTAAACTCATGGTCCCTCACCAACCTAACCAACCTTTGCTTTTGGGATGCCGTTGTTTGTGACAATACCAGCACAACAGTCTTAGAGATAAACTTGTCTGGTGCCAATATCACTGGGACTATCACTGTCTTGGATTTTGCTTCCCTCCCTAACCTCACCCAACTCAACCTCAATGCCAACAACTTTGAGGGGTCAATACCACCAGCAATTGGTAACCTCTCCAAGCTCACACTTTTGGACTTGGGGAACAACTTATTTGAAGACTCACTGCCTAAAGAACTAGGCCAGCTACGAGAGCTTCGATATCTCAGCCTTTACAACAACAATCTCAATGGCACCATTCCTTATCAGCTCATGAATCTACCTAAGGTATGGTACATGGACCTTGGATCAAATTATTTTATAACTCCTCTTCACTGGTCCCAATATTCATGCATGCCTTCCTTGACACGCCTTGCTTTACATCTAAATCCAACACTCACTGGTGAATTCCCGAGTTTCGTACTGGAGTGCCATAACTTGACATATCTTGACATCTCTCAGAATGGATGGAATGGAACTATTCCAGAATCTTTGTATAGCAATTTGGGCAAGCTAGAATTCCTCAACCTCACCAACAATGGGTTTGGAGGAAAGCTGTCGCCCAACTTGTCCTTGCTTTCTAATCTCAAAGAACTTCGTATTGGTAATAACTTTTTTACTGGTCCTGTTCCCACTGAGATAGGATTGATATCTGGGCTTCAAATTCTTGAACTGAATAACATTTCTGCCCATGGAAAGATCCCTTCTTCCTTAGGCCAACTTAGGGAGCTGTGGCATCTTGATCTCAGTATAAATTCTTTTAACTCTACAGTTCCTTCGGAGCTTGGCCTGTGCAGAAATCTATCCTTCTTGAGTTTAGCGGTGAATCATTTGACTGGTCCTTTGCCTATGTCATTAGCTAATCTGACTAAAATATCAGAACTGGGATTATCAGATAATTCCTTTTCTGGTGAACTTTCTGCTACGCTCCTCTCTAATTGGACCCAGCTTACCTCCTTGCAAGTCCAAAACAATAATTTTACCGGAAAGATTCCTCCGGAGATTGGCCTGTTGAAAAGAATTAACTACCTCTTTCTGTACAATAATACTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTAGATATTGGAAACCTGAAGGAAATGGTAAAGTTAGACCTTTCACAAAACCAATTCTCTGGTCTGATTCCATCAACACTTTGGGATTTGACAAACGTTCAAGTCATGAATCTTTTCTTCAATGAACTCTCTGGAATCATTCACGCGGATATTGGAAATTTGACCTCTCTTGAAATCTTTGATGTCAACAGCAATAACTTGCATGGGGAGTTGCCAGCAACCATTGCTCAACTAACTGCTTTAAAAAGTTTTTCAGTGTTCAGCAATAACTTCAGTGGCAGAATTCCCAGAGAATTTGGAAAGGGAAATCCTTCTTTGACTGATGTCTACCTTTCAAACAACAGCTTTTATGGAGAACTGCCAATTGACTTGTGCAGTGGTGGCCAGCTAACTGTTTTGGCTGTCAATAACAACAGCTTTTCAGGGCCATTGCCAAAGTCCTTGAGAAATTGTTCACCACTAGTTAGAGTTCGGCTTGATAATAACCAGCTCACTGGAAACATCACAGACGCATTTGGGGTTCTCCCAAATCTCGTTTTGATATCACTTAGTACAAACCTACTGGTTGGTGAGCTCTCCCCAGAGTGGGGCGGGTGCGCCAACTTAACCAGTATGGATATGGGAAACAACAAACTTTCTGGAAAAATTCCTTCTGCGCTAAGTAAGCTGAGTCAATTAGGGTATCTAAACCTTCATTCCAATGAATTCACTGGTAGTATCCCACCTGAAATCGGAAATCTAAGCCGGCTTTTCAGATTGAATTTGAGCAGTAACCATTTATCAGGAGAAATCCCAAAGAGTTATGGGAGATTGGCTAAGTTAAATTTTCTTGATTTATCAAATAACAACTTCGGCGGTAGCATTCCTAAAGAAATTGGTGATTGTGATGGCTTACTGAGCCTGAATTTAAGCCATAACAGTCTATCTGGGGAGATACCAGATGAACTTGGCAATCTGTTCTCGCTGCAAATCATGTTGGACATCAGCAGCAACTCTCTTTCCGGGGCTCTTCCCCAAAACCTTGAAAAGTTAAGAGCATTGGAGATTCTCAATGTGTCACACAACCAACTATCAGGGACAATCCCACGATCATTTTCAAGCATGCTCAGCCTTCAATCTGTTGATTTTTCTTACAACAAACTGAGTGGTTCAATCCCCACAGGCCGTGTTTTCGAGACAGCGACTGCTGAAGCCTATGCTGGAAACTCAGGTTTGTGTGGTGAGATAGAAGGATTAACTTGCCCCAAATCACTTTCCACGGACAAATCTGGAGGAGTTAACAAAAAGGTTCTTCTTGGGGTTATCATTCCAGTTTGTGTATTAATTGGGTTAATTAGTGTTGGAGCAATACTTCGCCGGCGGCATATCATAAAACACGGTGATGAAGAGTCCAAAAGCAATGAAAAAAGTGATCAGCCTATCAGCGTGGTGTGGGGAAGAGATGGAAAATTCACATTTTCTGATCTTGTTAAGGCCACCAATGACTTCAATGACAAGTACTGCATCGGAAAAGGAGGATTCGGAAGTGTTTATAGAGCACAGTTGCTCACAGGTCAGGTCGTTGCTGTGAAGAGGCTCAACATATCAGACTCCGATGAAATTCCACCAATGAATCGCCTGAGCTTTTTGAATGAGATAGAAGCACTTACAGGAGTGAGACACCGCAATATAATAAAGCTTTATGGGTTCTGTTCTTGCAGGGGACAAATGTTCTTGGTTTACGAATATATAGACAGAGGAAGTTTGGCAAAAGTGTTGTACGGAGAGGAAGGACAATTGGAGCTAAGTTTTGGAGTGGTGGTGATGGAGATATTGATGGGAAAGCATCCTGGAGAACTGTTGGGTACACTGTCTTCAAACAAGTATTTGTCATCAACAGAGGAAGCACAGGTGCTACTGACGGACGTGCTTGATCAAAGGCTTCCACCTCCTACAGGCCAATTGGCAGAAGCAGTGGTGTTCACAATGACCATAGCTTTGGCATGCATACGTGAGTCTCCAGAGTCCAGACCCATCATGCGTGCTGTGGCTCAAGAACTATCGGCTACTACTCAGCCTTATCTTTCCCAGCCACTTAGCTTGATAACCATGAACAAGCTTAGAGGCTTCCAGAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_20718::LG5:26199090-26201090(-)
TCTTTTTAATTTGGAAGAAAATTATTAAATTATTTTTTTGGACTTATTTTTAAAACTATTTATCATAAATTACTCAAAAATATATAAAATTAAAATGCTTTTCTTAAATTAAAAGACTAAGGAATCTTAAAAAACTTTAAATACAATTATTTTTGGAGAAAAATAATAAAAAAACAGTGAGTCGAATTAATTGTAAGATTGAAACCTTTAATTTCTATTTTTAAACTATTATATTTTGTTCAAATAATGGTATTTTCTAATGTTTTAAATACATATTTTACTATTTATTAATGTAAAATACGAATTTCTAAAATATTACTTCAAACATAAATTAATATCCAACCTCAAAGAAAAGGTATTTAAGGGTTAATTTATTTCTTTATGTTTTTTCTAAACATTCATTTGTTGTGTTTTGTAGAAATGTTTCTCATATTGGTAAAAACCCCAAAAGGGTTCGTGGACCTGACTTTCCTCCAACATTATTTTCGTAATAAATGCAATAAGAAAAAGCTCTAATTTAATAATCTGTATTTTCTTGTGTTCACATGCAAAATTGCATTCCGAAAACAACTTGGACCATATTCAATTAAATATTTTTTGGTTTATGACTTAATATTACGATAATAAATTGACTTTAATATTATTCTAAGTTGTCACACTTTACATGGATTGACCAACTCATGTAGTCTAAGGGATTATTATTGGTAAAAATACTTTACTTTCATTAAATTATTTTACATAAAAGAATTAAAAAATCCTATTAAATATGTTTCAATTTCAAGTTTATTAAGATAGAATTAACTTCCGAAATCTCAAATTTGCTTTTAATCTCGAAATCTATACAATATGAGATTAGTAAACATAAGAAAATATAATTTTTTTATTATAATAAACTTATATAAACATTTGAGGATATATATCATCAATAAAACATATTATAATTATGTATAGAATCATGATTATTCATTATTATTTTTCTACTTAAATAATTTAATAAGTTATTCACTTAAAGATTTACTTATAGTAATGCGATTTGCAAACAATTTTAAGGTTAAAAAATGTATTTTTAGTCTCTTTAATTTCTAGTTCGCAATTTTAATTTTCCTATTATTTTTCCTGATTTTACTGCTTAAATTTTAAAATGTATATATTTTAAAGTAATTCTTAATTTCACATGTTCTTTATATTTTAAATAATTAAATTATTTTTATAGTAATATAAATAATTGTAGTAGATTTAGGGTTAAATTGGGTCCAAATATTTGAAAAAGTATAAAACTTAAAGAAGTTGTCCAAAATTATGATTTTTTTCGTATAATTATAAAATATTCTTAAAAATTAACAAATTTATGATACATAATTATAAGTAAATATAGTAATTAGATAAAAAAAGTTTTAGTCTCCCATAAATTTATATATTTTTAATTGAATTGTTATTAAAAAAATTCAAGAACTTAAAATTTTTAAATTTTTTAACTGAGTTTTTACTGTTTAATATTTTTATTAATAGAATATTATGACTCTTATTTTATCTTATCATTTTGATTCTTTATTTTCATCAAAAAATATGAATTTTCATGTTTAATATAAAACAATATTAACACTCAATTAAATAAAAATTAAACAATAATACTTAATTACAAAAAATATAAAAATTTTGAGTAACAAAAAAAAATCTAATGAAAAGTCTATTAAACATATACAAAATTACGAAGAAATTAAAGAATAATTAATTTATTTTTGACTTTCAATAAAACAAAGGCGTTCTTAGCTGAATATAAAAATGTGATGGTGGTTCTCAGGTCAATAATCAACTCCGAGTGAAGACTATCATATGTTTGATAACATAATTATGGTGACACTGTGAATCACATTTTGTAAACCCCACCACATACTTCTGTTCTCATAATCTTACAAATTTACTTTCTGACTTTCATCAATAGAAACAGGAACCGATTCTGCTATATAAGAGACTAAACGATTTCAAAGAGACCACGCCAA


Gene Sequence:
>Vu_20718(-)
ATGCTAGACATGACTAATTTTCAAAGGCTTCACACTCTAGTCCTTCCAATTATCTTCCTGTGTTTGTTTCCTTTGAGAATCGCTTCATCACCAACAGCAGAAGCAGAATCACTTGTCAAATGGAAAAACAGTCTAACACCTCCTCTTCCTCCTTCTCTAAACTCATGGTCCCTCACCAACCTAACCAACCTTTGCTTTTGGGATGCCGTTGTTTGTGACAATACCAGCACAACAGTCTTAGAGATAAACTTGTCTGGTGCCAATATCACTGGGACTATCACTGTCTTGGATTTTGCTTCCCTCCCTAACCTCACCCAACTCAACCTCAATGCCAACAACTTTGAGGGGTCAATACCACCAGCAATTGGTAACCTCTCCAAGCTCACACTTTTGGACTTGGGGAACAACTTATTTGAAGACTCACTGCCTAAAGAACTAGGCCAGCTACGAGAGCTTCGATATCTCAGCCTTTACAACAACAATCTCAATGGCACCATTCCTTATCAGCTCATGAATCTACCTAAGGTATGGTACATGGACCTTGGATCAAATTATTTTATAACTCCTCTTCACTGGTCCCAATATTCATGCATGCCTTCCTTGACACGCCTTGCTTTACATCTAAATCCAACACTCACTGGTGAATTCCCGAGTTTCGTACTGGAGTGCCATAACTTGACATATCTTGACATCTCTCAGAATGGATGGAATGGAACTATTCCAGAATCTTTGTATAGCAATTTGGGCAAGCTAGAATTCCTCAACCTCACCAACAATGGGTTTGGAGGAAAGCTGTCGCCCAACTTGTCCTTGCTTTCTAATCTCAAAGAACTTCGTATTGGTAATAACTTTTTTACTGGTCCTGTTCCCACTGAGATAGGATTGATATCTGGGCTTCAAATTCTTGAACTGAATAACATTTCTGCCCATGGAAAGATCCCTTCTTCCTTAGGCCAACTTAGGGAGCTGTGGCATCTTGATCTCAGTATAAATTCTTTTAACTCTACAGTTCCTTCGGAGCTTGGCCTGTGCAGAAATCTATCCTTCTTGAGTTTAGCGGTGAATCATTTGACTGGTCCTTTGCCTATGTCATTAGCTAATCTGACTAAAATATCAGAACTGGGATTATCAGATAATTCCTTTTCTGGTGAACTTTCTGCTACGCTCCTCTCTAATTGGACCCAGCTTACCTCCTTGCAAGTCCAAAACAATAATTTTACCGGAAAGATTCCTCCGGAGATTGGCCTGTTGAAAAGAATTAACTACCTCTTTCTGTACAATAATACTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTAGATATTGGAAACCTGAAGGAAATGGTAAAGTTAGACCTTTCACAAAACCAATTCTCTGGTCTGATTCCATCAACACTTTGGGATTTGACAAACGTTCAAGTCATGAATCTTTTCTTCAATGAACTCTCTGGAATCATTCACGCGGATATTGGAAATTTGACCTCTCTTGAAATCTTTGATGTCAACAGCAATAACTTGCATGGGGAGTTGCCAGCAACCATTGCTCAACTAACTGCTTTAAAAAGTTTTTCAGTGTTCAGCAATAACTTCAGTGGCAGAATTCCCAGAGAATTTGGAAAGGGAAATCCTTCTTTGACTGATGTCTACCTTTCAAACAACAGCTTTTATGGAGAACTGCCAATTGACTTGTGCAGTGGTGGCCAGCTAACTGTTTTGGCTGTCAATAACAACAGCTTTTCAGGGCCATTGCCAAAGTCCTTGAGAAATTGTTCACCACTAGTTAGAGTTCGGCTTGATAATAACCAGCTCACTGGAAACATCACAGACGCATTTGGGGTTCTCCCAAATCTCGTTTTGATATCACTTAGTACAAACCTACTGGTTGGTGAGCTCTCCCCAGAGTGGGGCGGGTGCGCCAACTTAACCAGTATGGATATGGGAAACAACAAACTTTCTGGAAAAATTCCTTCTGCGCTAAGTAAGCTGAGTCAATTAGGGTATCTAAACCTTCATTCCAATGAATTCACTGGTAGTATCCCACCTGAAATCGGAAATCTAAGCCGGCTTTTCAGATTGAATTTGAGCAGTAACCATTTATCAGGAGAAATCCCAAAGAGTTATGGGAGATTGGCTAAGTTAAATTTTCTTGATTTATCAAATAACAACTTCGGCGGTAGCATTCCTAAAGAAATTGGTGATTGTGATGGCTTACTGAGCCTGAATTTAAGCCATAACAGTCTATCTGGGGAGATACCAGATGAACTTGGCAATCTGTTCTCGCTGCAAATCATGTTGGACATCAGCAGCAACTCTCTTTCCGGGGCTCTTCCCCAAAACCTTGAAAAGTTAAGAGCATTGGAGATTCTCAATGTGTCACACAACCAACTATCAGGGACAATCCCACGATCATTTTCAAGCATGCTCAGCCTTCAATCTGTTGATTTTTCTTACAACAAACTGAGTGGTTCAATCCCCACAGGCCGTGTTTTCGAGACAGCGACTGCTGAAGCCTATGCTGGAAACTCAGGTTTGTGTGGTGAGATAGAAGGATTAACTTGCCCCAAATCACTTTCCACGGACAAATCTGGAGGAGTTAACAAAAAGGTTCTTCTTGGGGTTATCATTCCAGTTTGTGTATTAATTGGGTTAATTAGTGTTGGAGCAATACTTCGCCGGCGGCATATCATAAAACACGGTGATGAAGAGTCCAAAAGCAATGAAAAAAGTGATCAGCCTATCAGCGTGGTGTGGGGAAGAGATGGAAAATTCACATTTTCTGATCTTGTTAAGGCCACCAATGACTTCAATGACAAGTACTGCATCGGAAAAGGAGGATTCGGAAGTGTTTATAGAGCACAGTTGCTCACAGGTCAGGTCGTTGCTGTGAAGAGGCTCAACATATCAGACTCCGATGAAATTCCACCAATGAATCGCCTGAGCTTTTTGAATGAGATAGAAGCACTTACAGGAGTGAGACACCGCAATATAATAAAGCTTTATGGGTTCTGTTCTTGCAGGGGACAAATGTTCTTGGTTTACGAATATATAGACAGAGGAAGTTTGGCAAAAGTGTTGTACGGAGAGGAAGGACAATTGGAGCTAAGGTGGGCCAAAAGGCTAAAAATTGTGCAAGGAATAGCACATGCAATTTCATACCTGCACACAGATTGTTCCCCACAAATCGTGCACCGGGATGTAACACTGAATAACATACTACTAGACTCCGATTTAGAACCTCGTCTTGCAGATTTTGGCACAGCAAAGCTACTAAGCTCAGACACTTCAACGTGGACCTCAGTTGCTGGATCCTATGGTTACATGGCTCCAGGTACATCATCCATTCAATTTAAATTACAGTATATTATACTATATCGTATGCATCATACTAAGGCAGTCTTTAATATGTTCTGTTAAATGTTTCTGACAGCTTAAAAACATGTTTTATATTCTAGACACAATGTATAGTTTCTTTCTTAATAAATTGTGTATATATGTAAATTAAAGGGTGTGATGAGACTGAGAAAAGTTGAAACTTGCAGAACTAGCACAAACAATGAGAGTGACGGAGAAGTGTGACGTGTATAGTTTTGGAGTGGTGGTGATGGAGATATTGATGGGAAAGCATCCTGGAGAACTGTTGGGTACACTGTCTTCAAACAAGTATTTGTCATCAACAGAGGAAGCACAGGTGCTACTGACGGACGTGCTTGATCAAAGGCTTCCACCTCCTACAGGCCAATTGGCAGAAGCAGTGGTGTTCACAATGACCATAGCTTTGGCATGCATACGTGAGTCTCCAGAGTCCAGACCCATCATGCGTGCTGTGGCTCAAGAACTATCGGCTACTACTCAGCCTTATCTTTCCCAGCCACTTAGCTTGATAACCATGAACAAGCTTAGAGGCTTCCAGAAATAG