Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_20669	LG5	25680905	25681270	PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF095-like	Map

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category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
T/A	25681076	missense_variant	p.Tyr58Asn
A/T	25681077	missense_variant	p.Tyr58Phe
G/T	25681101	missense_variant	p.Arg66Ile

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20669.1

MEELKEKVSEKETEKIKYRGVRRRPWGKFAAEIRDSARNGARVWLGTFNTAEEAARAYDRAAFEMRGAMAILNFPHEHPPFTSSSKTEHAKQVVVFECLDDKLLEELLDCDHKNMNHNFAN*

CDS Sequence:
>Vu_20669.1

ATGGAGGAGTTAAAGGAAAAGGTGAGTGAAAAGGAAACAGAGAAAATAAAGTACAGAGGAGTAAGAAGGAGGCCATGGGGAAAGTTTGCAGCAGAGATTAGAGATTCAGCTAGAAATGGAGCTCGCGTGTGGCTTGGGACCTTTAACACTGCTGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATCGTGCTGCCTTTGAAATGAGAGGTGCTATGGCCATTCTCAACTTCCCACATGAACACCCTCCTTTCACTTCATCATCTAAAACTGAACATGCTAAACAAGTTGTCGTATTTGAGTGTCTCGATGACAAATTGTTGGAGGAACTCCTTGATTGTGATCACAAAAACATGAATCACAACTTCGCCAACTAG

Promoter Sequence:
>Vu_20669::LG5:25678905-25680905(+)

GAGTTGGATCTAATTTTTTTTTTACTTTTTAAACCAATTTTATATATCTAAATTTTAAACTGAGAAGTTAAATCTATAGTCTTTTTTACTTTTACCACTAAACTAATTTGATAGCTCATGTGTGTCTGGATGGGGTAGTTAAGCTAAGTGCTAAACAATAATATACCTCTAAAATAAATTTCTAAATTAAACGTTTCTTTGGGTTCAAATAATAAATAAAGTGTAAAAACTTATTGGATGATGTTTTCAAGTTGTTTACCTCGTATGATGGCACCACCTAATGTCGGATCTTTTTGTTTTCTTTTTCTCTTTTCGATCTAAGTTTTTGTTTCTCTTTCTTGTGATTTCCAGATTTGTTGATTGCCACAACCCTTCTACAATTTATCCGTGTCGAAAAATGCCACCAAAGAGAGCAACTCGTTTCAAACGGTCCAATGTCCGTCCTATTCAACAATCCGATCAGGCTCAGAAACAAGATCTGAAAACTCAAAATCATTTTCATCAACAGCGTTCCTGTGATCAAATCTCATCTCAGTGGTGCACATGAACATTATACTCTTAATCACTCTTAAGAATAATTAACATTTGTTAGAGTTAATGAAACAGCTGCCTGAATTTTTAATAGGATTTTTCAACTTGCCAGATTAGTAATGAGTAGAAGAAGTTGTCTAAATGCGTTCTTTTTAAACTCAGCAGACCAACTTTATGTTACTGAAAATGTTCATTTATGATGGGACAGTTTGGAATACCTATGACATCATCAGTGACAGTAATCTTGTCCCAAAATCCCAGCTGCTTGATATCTGCCAGTGATGCTATGCCGACATAAATCCTTGCTAGTCCAATTGTGGTCTACATCTCTGTTCTCAGATGTTCTGTTGTACTAATTACTAATTAAGAAGTTAACTGCAAGATTAAGATTCTATTACCGTGTAAATTTAATATCAATGAAAGTATAAACAATTTATATGAAAAATGTGATCCTATCTTTAATGTAGAATATCAAGATAAATTTTTGTATATTGTTCATTCTTAATACATATTGGTCTCTTTATCGTTGCTGGTACTTCTGCTGTTTATATACTCCATCTTAGTCAAATAACTTGATTCTTCTCGATTCGTTATATTTTAAAACCAAATCTACTGAATTCATTTGTGTCCCTACTTAATGTAAACAGCCAATCTCGAGAAGGACTGTTTCCATATCAGTGATCAGGGAAGATTCCCCATCCTCTGTTTTAGGTTTGGGTTTTTACTGTCACGTATTTTTGGAAAATCATTAGCAATGGAAAGTTAAACAGCCCTGATCATCAAGTTGCTGAAAACCACATCAAATAATGAAAATCCAGAAGGTCAGTAGGTTGAGTTCCAAAAATTCAACCTAAAACCATGATGTAAGATGATGGCTGTTTGATATTGTAATGAAGTTCAATGTTTCTCTTAAATTACAATACTTTTAACCACGTGATGAAATTAATCCAGTATTTTTACGTCTCAATCCCACCCTTTAAATTAATACAGAGAGAATTTCCACTTTGATGTTGGGACCAAAGGGATCATTAGTTTAGGGAAACAAGTGGACAGGGTAGTGCAAATGGTTATTTTTCTACAAGATTTCTATTATGTATTGCTAATAAAGATTCGATTAGCTTTATCATAAACTCACAATGCACGGTCCTTCTGATCTCACTTTCTGTCGTATTAGAACTAGGAAACCAAAAGGGTGACTTTCTTTATAAATAATCCATACAAAAATTTGCATAGGTTACAGACTTTAGCAGTGACTACAATCACTATGTGATCCACATTCGTTGAACACTAAAACCAATCTCTATCATGGGGTGTCTGTCATAAACTTTGATAATTTTCCATTTTGTTTTCTCATCCATTGAATGCAATCAGTCCAAGGTAAATTTCCAAATAGTGAAGACTACATACAGTGTTTGGTGAATATAAAAAGGCGAAGGGAAGTTAAAGATTGGTGCAGAAGTGTGAGAGAA

Gene Sequence:

>Vu_20669(+)