Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20665 LG5 25630635 25635782 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 25630919 3_prime_UTR_variant
A/C 25630920 3_prime_UTR_variant
A/C 25631363 intron_variant
C/T 25631516 missense_variant p.Glu563Lys
A/C 25631646 intron_variant
A/T 25631903 intron_variant
A/T 25631912 intron_variant
C/G 25631923 splice_region_variant&intron_variant
G/T 25632552 missense_variant p.Arg297Ser
C/T 25632654 missense_variant p.Glu263Lys
C/T 25632996 missense_variant p.Gly149Arg
A/T 25633185 intron_variant
G/A 25633281 intron_variant
T/C 25633610 intron_variant
C/G 25633617 intron_variant
G/A 25634169 intron_variant
G/T 25634170 intron_variant
T/C 25634233 intron_variant
G/A 25634302 intron_variant
A/G 25634314 intron_variant
G/T 25635061 intron_variant
G/A 25635160 splice_region_variant&intron_variant
A/T 25635221 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20665.1
MSYHAYSLGEGIVGQVAVTGKHRWICADNQVAGSGLSFEFADGWQSQFSAGIRTIAVVAVAPLGVVQLGSLNKVIEDMGFVAHIRNLFQNFSMAQCPSQIQGSLKSSLSQLDISKENLSSDVVPTGFYNAQKSMKSETADVLMSLQCSGRNYALHSACQKMSDNVAKKEGPELYSDESSILLQSISNMMNVEHHDFEEMKPLYGRKCEEGSSSCKDVRFESENNVSSFLSDFITDNDLICPSEKVRVDSACFPSAFLDTVVCETDKLHCVDNNQKGVLNFTQPSDANSQHVEKSKFRTEPSYNDMSNVLNFPAGCELHEALGPSFLKGSKNFDWAAQFNQDMKTVEMSDEISTSQLTSESRPEHLLEALVANVCHSNNDVNSELSFCTSMQSAMASGKNHEASTHNVYAINSEGYSIDQFSLVKEDKHHSLSSSSGICGVMSSKGVSSTFPSSSSGQLERSSEPSKNSKKRARPGESCRPRPRDRQLIQDRIKELRELVPNGAKCSIDSLLERAIKHMLFLQSITKHADKLTDFGDTKSKLHHMEADILGSSSYEQGSSWAMEVGGHLKVHSILVENLSKNGQMLVEMLCEECSHFLEIAEAIRSLGLTILKGGTKVHGEKIWICFVVEGQNNRNVHRLDILWPLVQILQSKSTVYSQ*


CDS Sequence:
>Vu_20665.1
ATGTCATATCATGCATATTCATTAGGAGAAGGTATTGTTGGACAGGTTGCTGTAACAGGAAAGCATAGGTGGATCTGTGCAGATAATCAGGTTGCAGGTTCTGGCTTGTCTTTTGAGTTTGCTGATGGGTGGCAGTCTCAGTTTTCTGCTGGAATCAGGACTATTGCTGTTGTTGCTGTAGCCCCACTTGGTGTTGTTCAGCTTGGTTCTCTCAATAAAGTGATTGAAGATATGGGGTTTGTAGCTCATATCAGAAATCTCTTTCAAAATTTCTCAATGGCCCAATGTCCTAGTCAAATACAGGGTAGTTTGAAGAGTTCTTTATCTCAGTTGGATATATCGAAGGAAAATTTGTCTTCAGATGTTGTGCCGACTGGCTTTTACAATGCACAGAAATCTATGAAGAGTGAAACAGCAGATGTTTTAATGTCCCTTCAATGTTCTGGGAGGAACTATGCACTTCATTCTGCTTGTCAGAAAATGTCTGATAACGTGGCCAAGAAGGAGGGGCCTGAATTGTACAGTGATGAAAGTTCCATTTTGCTTCAGTCAATATCCAATATGATGAATGTGGAGCATCATGATTTTGAAGAGATGAAACCTCTCTATGGGAGGAAGTGTGAAGAAGGAAGTAGTAGTTGTAAAGATGTGAGGTTTGAATCAGAAAACAATGTTTCGTCATTTTTAAGTGACTTTATTACAGATAATGATTTAATATGTCCATCAGAAAAAGTCAGAGTTGATTCTGCATGTTTTCCCTCAGCTTTTCTTGATACAGTTGTTTGTGAAACTGATAAGTTGCATTGTGTGGATAATAACCAAAAAGGGGTGTTGAATTTCACCCAACCTTCAGATGCAAACTCCCAACATGTTGAAAAGTCAAAGTTTCGTACTGAGCCTTCTTACAATGATATGTCAAATGTGTTGAATTTCCCTGCTGGCTGTGAGCTACATGAAGCACTTGGACCATCTTTTCTGAAAGGGAGTAAAAATTTTGATTGGGCAGCACAGTTTAATCAAGATATGAAAACTGTTGAAATGTCAGATGAGATTAGCACTAGCCAATTGACTTCTGAATCTCGTCCAGAGCATCTTTTGGAAGCACTGGTGGCCAACGTTTGCCATAGTAATAATGATGTTAATAGTGAATTATCGTTTTGTACATCAATGCAATCTGCAATGGCCTCGGGAAAAAATCATGAAGCTTCTACTCACAATGTGTATGCTATTAATTCAGAAGGTTATTCAATAGATCAGTTCTCTCTTGTCAAAGAGGACAAACACCATTCCTTGAGTTCATCATCAGGGATATGTGGTGTGATGTCCTCCAAAGGTGTTTCATCTACATTCCCTAGTTCAAGTAGTGGACAACTTGAAAGGTCGTCTGAACCATCTAAGAACAGCAAAAAGAGGGCCAGGCCTGGGGAAAGTTGTAGGCCTCGGCCAAGGGACAGGCAATTAATCCAAGATCGTATTAAGGAGCTGAGAGAGTTGGTGCCAAATGGAGCAAAGTGCAGTATTGATTCCCTACTGGAGCGCGCCATAAAGCACATGCTCTTTCTCCAAAGCATAACTAAACATGCTGACAAGCTAACTGACTTTGGTGATACAAAGTCAAAGCTGCATCACATGGAAGCAGACATTCTTGGATCCTCTAGTTATGAGCAGGGCTCAAGCTGGGCAATGGAGGTAGGGGGTCATCTGAAAGTTCATTCAATATTAGTGGAGAATCTTAGCAAGAATGGACAGATGCTTGTTGAGATGCTCTGTGAGGAGTGCAGCCATTTTCTTGAAATAGCAGAAGCCATAAGAAGTTTGGGTCTTACCATTTTGAAAGGTGGAACTAAAGTTCATGGTGAAAAGATATGGATATGCTTTGTTGTCGAGGGTCAAAACAACAGAAATGTACACAGATTGGATATCTTGTGGCCGCTTGTTCAAATACTGCAATCGAAGAGCACGGTGTATTCACAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_20665::LG5:25635782-25637782(-)
ATAAAGTGTACTCATACCCCAATTGGATTGTTCCCCATCATTCTTTTTCCTCCTTTTCCTTTGCCCTTTCCTGCTTCTTATCGTTAAATATAAACCTCTAATTAGCCCCTAACCCTTCATAGAGTTACTTCCCTTGGGGCCTTTGCCCTCTGTCAACACACGCCATTTTTTTCATTTTATCTTCTCAACAATGATATCATAATACTCATTTTTACTACTTTCTTAAGTATATATAAGTATAATTATGTTCCAAATACTATCAAAGACTAATTCTGTCATGTTCTGTCATATTCTTAAACGTTGTAGTGTGTTTGCATTGCAGTTTGTTTGTTCAAGTTAGCTCAAGTTTTTATCTTCACTGTTTTTATAACTTTTCCATTTTGCACATTAGCATGCACAAATAAACAACCTTTTTCTTTACAAAAATGCATGGTGTGTGATATGATAGGAAGGGACGGTGGATTGGATTACGCAATGGTTACCATGATTGCTTGAATCAACGGTGGAGATTCCCCGAGTGAAAAAGCTAGAAGGAACAGCGTGCCAACGTGACCCCAATATAGAACAAGAGCCTCACTTCTTTTCCACCATTGACATTCTTTCACTCTACCTTCTCCACTCTTTACTCAGCAATTGGAAACTTCTCAAAAACCTCTCTCGCTCACTCTGCAAAGGGTAAAGACTCTGTTCACAATTGCATTCCCAGAGAAACTGAACCTTCTTCCTCCACAAGCAAAAGCCTCACATGTCGTCGGATATAAGCTAGATTATTAGCCGCCCTTTTTCTTTCCTTCTTTTAACTCAATCTTCTTCACACCCCTTTTGGAATCTAACAAGGTTGTTTGTTATTAAATGGCTAGTTTCGAGATTTTCTGCGTTGAGTCTGGTGTTTCAGTTTTAGCGTTAAGTGTGTTGGTGGGTTTGGTTGTGTTTTGACTGTAGTGAGGGACAGTTGGAAGCTTTGGTTGGTGGGGTGGTGGGAATTGGCGGGGTGAGTGATGGGTGCGGATCGTCTGATACTGCCAACAGTTGGACCGCCATTAAAACGGCGAGCGGGGTTGCGGAGGAAGCAGGCTGGAAGAGGTTCCTACAGGGGGAGCTAGGGGAAGGAGGGTGAGTGTGTGGTGTTGGAGGGGTTTTATTCTTTTTTGGAGGATTGGAATTCACGACCCTTTTTCTCGGGGGAGCCTTCGGGGAGTTAAAGTTTCTGACTTGTTAAAGGAGGGGACAACATGGGTAACAACTTGCACCAAGTACTCAGAAGCCTCTGTTTTAATACTCACTGGAACTACGCCATCTTTTGGAAGCTCAAACATCGTGCTCGAATGTACGATTCTACTATTTATTGTTGGTTGTGCTTCTGGTGTTACTTATTTATTTTTTGTTAGTGTTCCTTGTGTGTTGCGTCTTTCCTTTTGTGTGTCTTTGAACTTACCCTCGTTTTAGATAATTACCGGGTTAATTTTATCGGTTGTGTACATTTTCGAGCTTTTGCCTGTTTAGCTGATGTTATAATGGCCAATGGTTTTATCAACTGTCACAGATCCCTCATAGATTAATGATATGGTCAAAATAGTGCATGTAAGTGGGAGACAATTTTCATCTCACTGATTGGTTTTGCGGAGTTGATTAACCAAAATTCTAATATCAACTTTTAGTATGAAGGATTTTTGTAGATATTTATGGATTTTTGTAGATATTTATCCCTCTGTTTTGTCCTTTTTCCAAGTTTGGTGGTTTCCATGCTTGGTTAGAATTTAGAATTTTGGTAGAAGGGCATGGCATGTGTTGTGTATCTACTCTCTTGAATCCATATCATTGAACTGTTTTGCGAGTGTTTTTGCTCTTTGATGGTTTCTATTTTTGTCATTTTGTTTTAGGATTGTGATCCTTCTGTTATTTGAAATGTTTTATGTTGTTTTCATTGTAGTGCGATGGAAGTGGGATAAGTGTGGCATTTGTTGTTGTTTTATATAAAGTGTATTGGTAGTAAGTTCTTT


Gene Sequence:
>Vu_20665(-)
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CATCCTGAAAATAGCACAATACATTCAATATATATCACTCACTAAGTACATTAAATTGCTACCAGCAAGGCTCAACTTTCTATGTTGTTAATGATCAGTCACAATGTGATTGCTTTTCCAGTGGTTAAGAGGTGAAAATGTAAAAGAG