Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20621 LG5 25109792 25110640 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 25109820 missense_variant p.Ser10Leu
G/A 25109885 missense_variant p.Asp32Asn
G/C 25109899 synonymous_variant p.Gly36Gly
G/A 25109909 missense_variant p.Glu40Lys
C/T 25109943 missense_variant p.Ser51Phe
C/T 25109953 synonymous_variant p.Ala54Ala
G/T 25109957 missense_variant p.Val56Phe
G/A 25109981 missense_variant p.Ala64Thr
C/T 25109982 missense_variant p.Ala64Val
C/T 25110060 missense_variant p.Thr90Ile
C/A 25110320 missense_variant p.Leu177Ile
C/T,A 25110477 missense_variant p.Ser229Tyr
C/T 25110483 missense_variant p.Pro231Leu
T/A 25110516 missense_variant p.Leu242His
G/A 25110520 synonymous_variant p.Ser243Ser
G/A 25110542 missense_variant p.Val251Ile
T/C 25110555 missense_variant p.Ile255Thr
G/A 25110557 missense_variant p.Gly256Arg
T/A,* 25110584 missense_variant p.Leu265Met
G/A,* 25110596 missense_variant p.Ala269Thr
C/T,* 25110597 missense_variant p.Ala269Val
G/A,* 25110608 missense_variant p.Gly273Arg
G/A,* 25110612 missense_variant p.Gly274Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20621.1
MFSSSSHCSSVIKWSSIVKFLFFVVLFLSPSDAVLGDSDESALLRLKASFSDPAGVLSTWTSAAGTDSGYCSWSGVLCNVNSRVVAVNVTGNGGNRRNGTSHPCKGFSQFPLYGFGVRRMCEGSKGSLFGNVSSFNFISVLTELRVLSLPFNALEREIPEAIWGLEKLEVLDLEGNLISGYLPFRINGLRKLRVLNLGFNKIVGEIPGSISSLESLEVLNLAGNGLNGSVPGFVGRLRGVYLSFNQFSGVVPREIGENCWKLEHLDLSAVAEGGERLGEMVL*


CDS Sequence:
>Vu_20621.1
ATGTTTTCTTCTTCTTCTCATTGCAGTTCAGTGATCAAATGGAGTTCCATAGTGAAGTTTCTCTTCTTTGTGGTTCTGTTCTTGTCGCCAAGCGACGCAGTATTGGGGGATTCGGACGAATCTGCTCTCCTTCGTCTGAAGGCATCGTTTTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACATGGACCTCCGCAGCCGGCACTGACTCTGGCTACTGCTCTTGGTCTGGTGTCCTCTGCAACGTGAACTCCCGAGTGGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGGCAACCGCCGCAACGGAACCTCTCACCCGTGCAAAGGTTTCTCTCAATTCCCTCTTTACGGATTCGGAGTTCGGCGAATGTGCGAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTTGGAAACGTTTCTTCTTTTAATTTCATCAGTGTGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTTCAACGCGTTGGAGAGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCTTGGAAAAGCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAATCTAATAAGTGGATATCTTCCGTTTAGAATTAACGGCTTGAGGAAGTTGAGGGTTTTGAATCTTGGGTTTAATAAGATTGTGGGGGAGATTCCTGGTTCAATTTCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTTTGAATTTGGCTGGTAATGGATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTTGGGAGGCTAAGAGGGGTGTATCTTTCGTTTAATCAGTTCAGTGGGGTTGTTCCGCGAGAGATTGGGGAGAATTGTTGGAAGCTTGAGCATTTGGATTTGTCTGCTGTTGCTGAGGGAGGCGAGAGATTGGGGGAGATGGTGTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20621::LG5:25107792-25109792(+)
GATTATGTGAACTGGATTTTCTGCATGGCTGAGTCACTCTCTCACATTCCAAGGATTTAGATAGGAGTAGAGTCTTGATGTGTCACACAACAACACATCTTAGTTCCATGTTTTTCCTAAGTTATTTTTTCTTAATTATATTATATTTATTATAAAAATATATATCATTCTTTCAAAAAGTTTCACATATACAAGACACTGTCAATTAATTATTTATTTTTCTTTACTTACAATATTTTAACTCAAAATATTAGGTAATGCTGTTGAATCTAATTTGTCTGACCTAAGTACTAAGACTCACTTTGAAAATGTAAATATTTTAATCCTTAAATTTCACACATTGTACGTATATTTAATGTTATAGGTACTTTTCGTCTTTTAAGATATATAGATATTAGCTTTCCTTTTTCAGTTTTATGTTTTAAAAACAATCTGAAATAAAACATCATATAATAACTAAAAATGTATAGAATATTATTACAGACATCTATTTTCCGAATCATTTTTAATCATAAAAATATTTATCTTTTTATGCTAAATAAAGTATTACCTTATATATCTTAATTTTTTCAATATATAAATTTAAAAAATAAAATAATTACATTATGTAAATGATATAAAATAAGTGGTGATGGAAATAAAAAAACTGTTTTATAAAATAACAAAAAAAAATTATTAAAAGGTTGGCATTTATGGATGGACAAGTAACTGGTTATGATAAGCAGATATTTTCCCGACCAAAGACTGATTTTTTTGGGGTGAAATTGAAAACCTAGGATTGGTTTGATCCACACTTTAAAATAATGGATTGAACAGGGTTTTTCAGCAACAAAATATCCTTGTAAGAATTTGAGTGTAAGCATATAGGTTGAGAAGTCTTCATTCAAAGAAAGATAAAGGAAAGAACAGAAACTATCGTTTGAAGGTGGGAGGAAGACACCAATAATTCATCTGCCAAAAACTTAAAATAATCAACAAGTGATACAAAAATAGTAGATTCGAGAACATTGTAGAAGGTTCATTGGGTTGATTTGAAAATATTAATAGATTTAATATTCCGTCCACACAGAGGACCTAAAGAATATTAAAATATCACGTAAGAAGAGAGAAGCAATGCGCTCTAAACGATACAAGTTAATTTTTTAACGGGTGAGAATAATATTATTATAGTGAAGAAGATGATGATGTACAATTATATATGAATATAAAATTACAGGTTGGAAATTTTAGTGGTGAAGAAGCTTCTGGATTTGTGGTCTGCAAGGATGTCTGGATCTGCATGGCTGAGTCACTCACTCACTCACCCACTCGGATCGAGGAAATTGATATGGAGTATGTGTGTGTGATTTTGGAGCCTTATCACCCACTACTTTGCTTCTCGATAACTTCATTAATTAACTAATTAAATATTTTATCTTCACCTTTCTTCTTCTTTAGTCTGCTTACAATTGTGTCTTTCTGCTTCCAACTTTCAACCCTCCAAATATTTTGCTTTTACAATTTTGGTTTAATACCCAATTTTGTTTCCAGTTTGGTTCGGAAATCTCAATTTAGTCTCTCTTTATAAAACTAATTGTAATGGATCCTTACTTGTAATTATGTGAGTCAAATTAGTCCCTTCCGTTAAATATAGGCAAACGGAGTTAATGGGCTGATGATGTGGCAGTAGTTACTGGTTAGGTGTCTAACACGTAATTGTGTGGGTGCTTACGTGGTGTTAGGGCAGCTGATTTTAAAATTGGGTTTTAATTAGAAATTGGGTTTATTTAATTGGGTTTATCTACAACACCATCTCTCCAATCTCTCGCCTCCCTCAGCAAAGAGAACACTGTTGAGTCCGAGTCTTGTTTCTCCTTCTTCCCTATCATTTTCCATCGCCTTTTTTCTTCCATATCACAGGATTAGGGTTTTCAAAAACCCTTTCTTCTTCTCTTCGACGTCACTCCTACAACGGGGAAGAAGGGGTTTTCCGTGCGATTCGATTTTCTTTCACTGTGAGA


Gene Sequence:
>Vu_20621(+)
ATGTTTTCTTCTTCTTCTCATTGCAGTTCAGTGATCAAATGGAGTTCCATAGTGAAGTTTCTCTTCTTTGTGGTTCTGTTCTTGTCGCCAAGCGACGCAGTATTGGGGGATTCGGACGAATCTGCTCTCCTTCGTCTGAAGGCATCGTTTTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACATGGACCTCCGCAGCCGGCACTGACTCTGGCTACTGCTCTTGGTCTGGTGTCCTCTGCAACGTGAACTCCCGAGTGGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGGCAACCGCCGCAACGGAACCTCTCACCCGTGCAAAGGTTTCTCTCAATTCCCTCTTTACGGATTCGGAGTTCGGCGAATGTGCGAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTTGGAAACGTTTCTTCTTTTAATTTCATCAGTGTGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTTCAACGCGTTGGAGAGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCTTGGAAAAGCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAATCTAATAAGTGGATATCTTCCGTTTAGAATTAACGGCTTGAGGAAGTTGAGGGTTTTGAATCTTGGGTTTAATAAGATTGTGGGGGAGATTCCTGGTTCAATTTCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTTTGAATTTGGCTGGTAATGGATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTTGGGAGGCTAAGAGGGGTGTATCTTTCGTTTAATCAGTTCAGTGGGGTTGTTCCGCGAGAGATTGGGGAGAATTGTTGGAAGCTTGAGCATTTGGATTTGTCTGCTGTTGCTGAGGGAGGCGAGAGATTGGGGGAGATGGTGTTGTAG