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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20614 LG5 25014065 25021206 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase Nek4-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to water deprivation, response to water deprivation, phosphorylation, phosphorylation, response to osmotic stress, response to abscisic acid, protein phosphorylation, cellular response to oxygen-containing compound, cellular response to oxygen-containing compound, response to abscisic acid, protein phosphorylation, tissue development, protein phosphorylation, response to osmotic stress, response to water deprivation
Cellular Component   located in   plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20614.1
MEQYEILEQIGKGAFGSALLVRHRHEKKMYVLKKIRLARQTDRTRRSAHQEMELISKVRNPFIVEYKDSWVEKGCFVCIIIGYCEGGDMAEAIKKAKGVNFSEEKLCKWLVQLLMALDYLHGNHILHRDVKCSNIFLTKDRDIRLGDFGLAKMLTSDDLASSVVGTPSYMCPELLADIPYGSKSDIWSLGCCIYEMAAHKPAFKALDIQSLINKINKCIVAPLPTMYTAAFRGLVKSMLRKNPELRPTASELLNHPHLQPYIQKIHLKLNSPRRSTFPFQWPEPNYVRRTRFVEPESVSTLSDQDKCLSFSKDRALNPSISGTEQVSQCSTQRAHGLSTCSEEKIYELSVGCVGNKYNPGTKFSTVERTPRLRAVTVSATAKRQTMAPSKTTYPGPDRDSLPASKGPSGRFSSPTRARATTNLYTNFCVLGSVDSPNVSVNAPRIDKMAEYPLAYSEDPFFPVRGPSSTSARFSSSSTRSTADCSITMVKCTIQEDKVTVPNIISDACPGPKATQCPSEHVKACVSIRSSAEVDQRRFDTSSYQQRAEALEGLLEFSARLLQQQRFDELGVLLKPFGPEKVSPRETAIWLTKSFKETVV*


CDS Sequence:
>Vu_20614.1
ATGGAGCAGTACGAAATTCTAGAACAAATTGGCAAGGGTGCATTTGGTTCTGCTCTGCTTGTGAGGCATAGGCACGAAAAGAAAATGTATGTTCTTAAAAAGATTCGTCTTGCTCGTCAAACTGACAGAACCCGCAGATCTGCCCACCAGGAGATGGAGCTTATATCTAAAGTTCGAAATCCATTTATTGTGGAGTATAAAGATTCCTGGGTGGAAAAGGGTTGTTTTGTATGTATCATCATTGGCTATTGTGAAGGAGGGGATATGGCTGAAGCTATCAAAAAGGCTAAGGGTGTCAACTTTTCTGAAGAGAAACTTTGCAAGTGGCTCGTTCAATTGCTGATGGCTCTTGATTACTTGCATGGAAATCATATCCTTCATCGTGACGTCAAGTGTTCAAATATATTTTTGACAAAAGATCGAGATATACGTCTAGGGGACTTTGGTCTTGCTAAAATGTTGACATCTGATGATCTTGCTTCCTCAGTCGTTGGGACTCCCAGTTATATGTGCCCAGAGCTTCTTGCTGATATACCCTATGGCTCTAAGTCAGATATCTGGTCTTTGGGATGCTGTATCTATGAAATGGCTGCTCACAAGCCAGCATTTAAAGCACTTGACATACAATCATTGATTAACAAAATAAACAAGTGTATAGTAGCTCCCCTGCCAACTATGTATACTGCTGCTTTTCGAGGGCTCGTCAAAAGTATGCTGCGGAAAAATCCAGAGCTGAGGCCAACTGCTTCAGAATTACTAAATCATCCGCATCTTCAGCCTTACATTCAAAAGATTCACCTTAAATTAAATAGCCCCAGAAGAAGTACTTTTCCTTTTCAATGGCCGGAGCCAAATTATGTAAGGAGAACTCGGTTCGTGGAGCCAGAATCTGTTTCTACTCTTTCTGACCAAGATAAATGCTTGTCATTTAGCAAGGACAGGGCACTGAATCCTAGCATTTCTGGAACTGAACAAGTTTCTCAGTGTTCTACTCAAAGAGCACATGGATTATCCACTTGTTCAGAAGAGAAAATCTATGAATTATCTGTAGGTTGTGTTGGTAACAAATACAATCCTGGTACGAAGTTCTCAACAGTTGAAAGAACACCAAGATTGAGGGCAGTTACAGTTTCTGCCACTGCCAAAAGGCAAACAATGGCACCATCAAAGACAACCTATCCTGGTCCAGACCGAGATTCACTTCCAGCATCTAAGGGACCATCTGGAAGGTTTTCCTCACCAACAAGAGCCAGAGCGACGACAAACTTGTACACCAATTTCTGTGTCCTTGGAAGTGTGGACTCTCCTAATGTCTCTGTTAATGCACCACGAATCGACAAGATGGCTGAATACCCACTGGCTTACAGTGAGGATCCTTTTTTCCCTGTTCGTGGACCATCATCAACTTCAGCTCGCTTCTCTTCAAGCTCAACACGGAGTACTGCTGATTGCTCCATCACAATGGTCAAGTGTACAATTCAGGAGGACAAAGTTACTGTCCCCAACATTATCAGTGATGCTTGCCCTGGTCCAAAGGCAACTCAATGCCCTTCTGAGCATGTAAAAGCTTGCGTTTCTATTCGCTCCTCTGCTGAGGTGGATCAGCGCCGCTTTGACACGTCATCATACCAGCAACGTGCAGAGGCTTTGGAGGGTTTGCTGGAGTTCAGTGCCAGACTCCTTCAACAACAAAGGTTTGATGAGCTAGGGGTGTTGCTGAAGCCGTTCGGGCCTGAGAAGGTTTCTCCTAGGGAAACAGCTATTTGGTTGACCAAGAGCTTTAAGGAAACTGTGGTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_20614::LG5:25012065-25014065(+)
ATAATTAATTACAGTCATTTTTAGTGTTTGAATATTATTTTATTTTTTAATTTTAAAACATAATTAAAACTAAAGTAAATATCTTCAACATGTATTCCTTTATATATTATTATAGTTTTTTTTAATTTGAAAGTATAATTAAAAGTAAAACATAGGAAAGGTGAAATGATTATTTTAATTTTAAAAGATCATTTAAAGAGTAAGTTTTGAGACAGAAAATGCAGATATAAAAAAAAGTAGAATCTCATTTATATAATATGGATATAAATATAAGATATTACTTTATTTGGTAATTGTTATTTAACTAACTTTTTTTAATGCATTTGCATAATGATTAAAAATAAAAACGGATAGAAAATAAATAAAAACAGATAGAAAATAAATATTATTTTGGAATGATACGGTATTTCTTTTGTTTTGTTTTTTTCAAGTCCTAACTTCTGTTTATGGTAGTTTTATCATTTTCAGGTAGACAGAAGGACAAACTTGTTTAATATTTATATTTTAGATTTATAAGAAAATTTTAAATATAAAAGTGTCAATAATTTGGAAGAAGATTTTTCAATTTATAGGAAATATTTAGAAAAAATTATTTAGATTGATCAAAGAATTTTATAATATTGTTAAACGTATTATTTTAAGGATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAATCTGTGAAACCTAGCAACGAAGGTTAAGTTGTCTTTTATTTTTTTCGAATTATTTATGGAAAACGTATGACAGTGATCCATTTTTTAGTAATGAAGTGTATGCTTTTCTTTTCCTTGACTAGGTCATTAAAACAGTAATGATGCGTGAAGAGAAAAATAAATACATTTATAACAAGATTACGATAGTCTACTGATAATTTCACTATCAAATTAAAATGTTATAATTACTAATGTAATTAACAGAAGTCTTTAGGACACATACAAATATATTTTTGACTTATTTTTGGTAAAATATTTTTTCCAAATATTCCTTTTGCACTCAAGCATTCCTTTACAAATATTACTCTTGGTTTAACATAAGCTTTTATAAACTGATTTTATTACATTTACTATTAAGTTTACATAAAATAAAACTCTTCTTTGATAAAAAAGATTATTAAATAAATACTTAACTATATTTTTCGTACTTATTTAAAGTTTCATTTTTATTTTTATTTGCTTAATTAAACTTTTTATCTCTTCTAATTTTAAGCGTGGTTCATTTATCAACATTAATGTTTTGTTTGATGGCATCAAAAGTAGATGGAAGGACTGTTAAACGTGTTAAACACGGTTGTTAATTTTTTAAATAAAGACAAGACTAGGGTATGGTAAGTTTACTTTTTTTTATTATTATTATTATAAAATTAAGAGTAATATTTGTAATAACAGTAAACTTTTATAGTTAAAATCAATAATTTGATAAAAAAAAATAAAGGAACATGTTTTTGAATGAGAGAAAAAAAAGATAAAAAGGAAATTAAAATAAATATGAGAAGAAATATAAGTTAACTTGAAAAGATTTAAAAATTGTACCTTACTGCCAGACCACCCGTGCACCTCTTTTGTCGTCAAGTGCTCGCATTTTCCACCAAAAAGCTTCTACACTTTCCACACTTTCTCATCCTCTTACTGTTTTTCTAAGAGTTACATTATTTATAAATATTTTTTTCATATATATTTTAATTAGTTTCACCATTTAATCACTTTATCATGTGTGTGTGTATATATATATATATACATATATATTATTTTTGTTTTCTTTTCTTGTATCATAGTACAAATCTTTGCATGAAAAAAAAAATGTATAGTATAATGATTTCACGTTTTGGAATCACAAGTCGCTTTTGCGTGCACTTTACTTCTTTATGGTTTTGGCGCTCTCTCTCTTTCTAATATTGATTGCTCGATTTCAAAATAGAATAAAAGCAACAACATTATAAAATCATAGTTTA


Gene Sequence:
>Vu_20614(+)
AGTAATATTTTTGTATGATATGGTTTATGCTGGCTTAAAGTATTAGCAGGGGCTGCTCGGTGCTAACTTCACAAAGCTGCAATTGCAAATTTCTCTGTACCATTGGCCGAATTGCTTTTCAATTTCACGAATTCAGGTTCTTTTCCTTGTAATAACTGTTCATTGCAAATTCTGCTCTTGTTTGTTATCTGTATATACTTTTTGCCTTCTAATATTACTTGCTGCTGTGCTTATGTATGTTAATGGGAATTCTGTATTTCCCCCTCTTCTATGTTTTCAGTTTCATTCATCACTGGGAAACTAACCTGTTAGATGTGAAACACTTATTTGTAATTTTTTTTTCATTTTTTGTTATTAATTGTCAAGTTTCACAGCTTATGGAGGATATGGGGAGTCTATGATTGGCTGACGACTAGATAATCTGAATTATGCACTTGTTATTTGAAATTACGATGTGATGAAATGAAAACCATGTTTAATGTAACTGAGTTTTTATGGACTTAATTTCTGTGTTTTGTTCCACTTTTTAGTTGGCAAGTTTGAATTTTTTATTCTAAAAGAATCTAATTTTTGGGTGGTCGCGTGGTTTTGCAAAGTTATAAACATAAACATGTTTTTCGTCCTGGGTGAGATTAATGAGTAGAGGGAGACGATAATGATAAATCCTTGGAACTGAAGATACTATGGGCAGCCTATTCAGCAGTATTGAATGATTGCCGTTAAAGCCTAACCACATAATTGCTGGTCTTGGCCTTGAACAATTAAAGAAAGTAAATAACCAAACCAGAACTGATTGGTCACATATGGTGCTCTTTATTACACAGCTCTTCTATTGTATGACAGCTTTTTATGTTTCTTATACAACTATAATTTGGAAATGATTAGTCCCTTGACGAGAAAGGCTCTTGTCTGTAGAAAGTGGTAAATACTTACCTGACTTTAGCCGTGTTCTATTCCTGTGTCCAGATTTCAGATCTTGTTCTGTAAGAATCTGGTAGAGTTGTCAGTTATCACCGCAGAATTATTTCTTGTGGATGTCTTGTTCTCAATCTGTTCATCGTATGTTATTGGAAATAGTTCAGCATATTTGTAGTGGCAATGATTTATGTCACATTATGGGTGTGGCTGTTATTATTTATTTATGAGAAGTTTAGTGTTTCTATTTGCTATCATTTCCAGGAATTTCACTCTATCACTGATAGTGGGTGGTAAAGTGATTTCAATTCAAATGGAGCAGTACGAAATTCTAGAACAAATTGGCAAGGGTGCATTTGGTTCTGCTCTGCTTGTGAGGCATAGGCACGAAAAGAAAATGTGAGTATCATCCAATATCTTGTTGAAATGTGCTTTAAGATATTATATATCCTTTTGCAGGTTAATTTGTTAAGTATTTATTTGTGAATTTATCGTTGTTGCTAATATCGACAGCCTGTTATATCATGTATATGGTCTACTTTTTTTGAGTTGTGACATTTATATTTTAGGTATGTTCTTAAAAAGATTCGTCTTGCTCGTCAAACTGACAGAACCCGCAGATCTGCCCACCAGGAGGTAACCCACTCTTAGCGTTGGATTTATTGAATGATTATCATTTTTCTGGAAGGGATTAGCGAAGGCCAGACGTTTTCGTGTAGAAAATCAAATATTCATTCTTGTATATTTTCTATTGTTGTGCTAGTTTTTGCACCTTGAAATTTGAAGTTGATCTCTAAGCCTAGGTTTTTCATTAATTAGATTATGAGATGCTTCATTGGTTCTGTCATGCAGATGGAGCTTATATCTAAAGTTCGAAATCCATTTATTGTGGAGTATAAAGATTCCTGGGTGGAAAAGGTTAGCATTATTTTCAAGCACAGTTTTCTAACTCTGTTGATTTTCATGTTTGTGTGTGCCTGTGTATTTGTTATCGACTAAGGTTGTCAAGAATCCTTTTTCCTTTAAATGTTTTGCCAAAAGTAAACCTTATTTTGGGTTCTTCAAATTTAGTATTTTGGTCTTTACTTATTTGTTTACAGACGTGTTATTTTTTATCATAGTAACAGAAATATTGAGAGAAGAACCTGTATTGTGCTCCATTTTATTGGTTTATAAATTTGATTGATTTCAGATACTGAATTTAGCCAAGTTGGTACCTTTACTTGCAGGGTTGTTTTGTATGTATCATCATTGGCTATTGTGAAGGAGGGGATATGTAAGTTATAATTTACTCTGTATTCAAATATTTGAGTTAGAGCATTTGTTAACACATTGTCTTTTACTAGCCAAATTATGTAATTTTTTAATAGTTTGGCTCTGTTGAACAGGGCTGAAGCTATCAAAAAGGCTAAGGGTGTCAACTTTTCTGAAGAGGTTGATCACTTTCACAAAAACTCCATTCGCAACTGAGCCTTTCCAATTTCCAGCTCCAAGATCTTTTGAACTATGTAAAATAATTGTTATAGGTCAACCTTGTGCATGCAGAAACTTTGCAAGTGGCTCGTTCAATTGCTGATGGCTCTTGATTACTTGCATGGAAATCATATCCTTCATCGTGACGTCAAGGTAACGGACAGGACTTGTTTAAAAGCTAAACAACAATTGATGTTATGTATCTAATATCTTAGAGAATTTTGAGGAACAGCCTTATGCCGATGTGTGATTTTCATCTGTTTCAGTGTTCAAATATATTTTTGACAAAAGATCGAGATATACGTCTAGGTAAATAGCCTTACTCATTTTATCCTCACACTGCTCTTTTGATTTGATCTCTAAGTTGGGATTTTGGTGTGTTGTATACTATCCGCATGCTAAAAATTGTGGATGCAGGGGACTTTGGTCTTGCTAAAATGTTGACATCTGATGATCTTGCTTCCTCAGTGAGTGATATTGCCAAACTATTTTTTTGTTCACTGTTTCAACATTTTTTGTCTGAATTAATTTCTGTCTGTTCTTGCTCTAAACTTAGGTCGTTGGGACTCCCAGTTATATGTGCCCAGAGCTTCTTGCTGATATACCCTATGGCTCTAAGTCAGATATCTGGTCTTTGGGTAGGATACATTGAAGTTGTACTCCTATTGCCTAATCTTGATTATTCTTTGTTGATCCCTCTTTTACCGTATCTTTTAACCATATTTGTCATTTGTTTTGATTGACAAAATAATCAGATGTATATATTATGTTAACATTTGACAGGATGCTGTATCTATGAAATGGCTGCTCACAAGCCAGCATTTAAAGCACTTGTAAGTTACGATCCAAAGCATTTGTATTCATTTTTCTCATGAAATGTTATTTACAAAACTTGTTAATCTTGTGTAGGAGAATGTACTAGGAATACAATAATTCGGTTAAAGTAAAATTATGCTGTTGGATTATAAGCGTATCTGACTTTCAATATTCCACATTTCTAAAGTGACTATCCTAATCTTTGTTGAGTCTAATAATCTTTTGTATTCAATTTTTTAATGAAATGCCAGGAAATTTGTAGTCTTAATGAAATTTTTGTAAGGGTGCAACATTTTGTTTAAAACACTTGAAAGTATGTTGTTCGATTTTAAGCTTTCGTGTCCATGTTTAAGACTTAAATTGTATCATTTTGGAATGCTTCTCATTCATTTATGATGTCATACTAACTCAGTATTTCACATTTCCATATATCTCAACATTAAATCATCGACTGTACCCTTTTAATTTTTTTGTGTGTGTTGTCTTCATTTGAGCAGGACATACAATCATTGATTAACAAAATAAACAAGTGTATAGTAGCTCCCCTGCCAACTATGTATACTGCTGCTTTGTGAGTCCTCTGTTTCGTGAGAATCTTTGACTTGTCTGTTTTAGCCGCTTTATCTAACTGATAAATATATGAAACTTAACTCTTAACGTTGTTGAGTTATCCATGTTAATTGTTAAGTGCCACATCATTTAAAATTTTACTCCGTTTTTCAACATACTTGATTTACACAAGGACAAAACATTATGGTAGAAGTACAAGGATGACGTGTAATTCAGTCATCAGAATTGGTTTACCATTTTACATTTTGCAATGGTAACGTAACAGGGAGCAATCCTATTCTGTGTATATGCCCTTTCCGGTATATATTTTATCTCATTGATTCTCCTCTTCATTATTCCCCCTTTAAGTGATGAACCTCCTTCAGCGACTTTTATTTGTGTCACTTGTTTGACATACATACTTCTTCTTTCAGTCGAGGGCTCGTCAAAAGTATGCTGCGGAAAAATCCAGAGCTGAGGCCAACTGTAAGTTTTATCTTTTGGGAATTTCATTACCTTTATTAAGGTGCTATTGGTATATAGATTAAAACTAGTTTCTAAAAGAAAAATGACATGCATATGCCATTGTCAATTGTCATTAAATAAGTACAACACAAATGTTATAAGTCCGACAAATGCAGATTTGTATTTGTGCTCTTATTTTCTTTTTTTATAAATAATTTTAATTTTTAATTACCACCTTATGCGTAGTTAGGCAGAGCAATTCTTCTAGATTATTTGACTTTATTTCCCAAGCCTTCATTTCTGGGGCCCTATTCTTAAGACATTTCTATTCAAGTTCATAAGTGCTGCAATGAGCTATTTCTTGTTGTTTGGGTCACTTGAGAGTTGGGTAGCGAAAAATGTGTAACGGGAAAAGCATAAATATACAGAATTCTAGTTTTACACTTCTACTTGACATACTTGTTTGATTATGCAAGAGAAATTCAGAGTCAAGTACAATTGAAAATATATAGATTGGGGTCAAGGTGGGCAATGTGAAGAGAGATCTAGAGCATTAATCTGTAGAGATATACAGAAAGGTAGAGATTGATAGATTTAAATTTTAAAATAATACATAAACCTTTACATGATTGGAGTAAAACTATAGAAAGTTAGGGTTCCACGTTCATCACTTTTTAAGGAGATATGTATGCAGTTAGCAAGGCAGAAGAAACTTCTGAGCATGCATAATATACAAAATACTATACAAATAAGTATTTAAGCAAAAGCATTTGGCATGTACA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