People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20490 LG5 23555285 23558024 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 23555341 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20490.1
MNLTPAAPPASRNVAALPPVPNGSAPPAVKTRICNKFNTAEGCKFGDKCHFAHGEWELGKQIAPSFDDHRALGPTAAGRFGGRMEPSPGPATSFGSHATAKISVEASLAGAIIGKGGVNSKQICRQTGAKLSIREHESDPNIRNIELEGNFEQIKEASNMVKDLLLTLQMSASKANPGVPGAPIREHGSNFKTKLCENFSKGSCTFGERCHFAHGASELRKSV*


CDS Sequence:
>Vu_20490.1
ATGAATCTAACACCTGCAGCACCTCCAGCATCAAGAAATGTGGCAGCTCTGCCACCTGTACCAAATGGGTCTGCGCCACCTGCTGTAAAGACCCGCATATGCAACAAATTTAATACTGCTGAAGGTTGCAAATTTGGTGACAAATGCCACTTTGCCCATGGTGAATGGGAACTTGGGAAGCAAATTGCTCCATCATTTGATGACCATCGAGCGTTGGGGCCGACTGCAGCAGGTCGTTTTGGTGGTCGAATGGAGCCTTCTCCTGGTCCTGCTACAAGTTTTGGTTCCCATGCCACTGCCAAGATAAGCGTAGAAGCATCCCTGGCTGGTGCAATCATTGGGAAGGGTGGTGTGAACTCAAAACAGATATGCCGCCAAACTGGAGCCAAACTTTCGATCAGGGAGCATGAATCGGATCCTAATATTAGAAACATTGAACTAGAGGGAAATTTTGAGCAAATCAAGGAAGCTAGTAATATGGTGAAGGATTTGCTACTGACCCTGCAAATGTCTGCATCAAAAGCTAACCCAGGTGTTCCTGGTGCACCTATTCGAGAGCATGGAAGCAATTTTAAGACGAAGCTGTGCGAGAATTTTTCCAAAGGGTCTTGCACATTTGGAGAGAGATGCCACTTTGCTCATGGAGCTTCCGAATTGCGTAAATCAGTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_20490::LG5:23553285-23555285(+)
ATTATATGATAAAAATAGTAATTAATAAATTTAGATTGTTGAAGTATATAAACAATATTTTTATTTTCTTTTTTAGAAAAATTTGTGGTAATTTTTTATGAAAATATTTTTTATTATTCCAAAACTCTTATTAAGGAGCATAAAGAACATTTAAGAATGATGTTAGAGATTTTAAGTGAGTTCTATTTAAGGGAATTACGATTTTCAAGACTTGTAATTTTTACTCAAGATGTAGGCTGAGTTTTTAATATTTGCACATATCTATAGATACTCAATTTTACAAAACAAATTAAAAGTACTTAAAAAAATATTTTAATCATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTAATTTTAAACATTCAATAAAAAATAAAACACAAATAAATTCAAATAAAATACAATACATCACTTCTTATATATATAAAATATGATATTTGGTAAATTAGAAGTTAACGGATACGGATATTTATGAGTATAAATACTATGATATAAATTTTTTTTACATCTCAAACCATAAAACCCACCTCTAAATTGCATAGCTATAAATGTGAGAAACTTATATCTAACATTACATTAAATGTCCTTATTTGTTCACTAAGCTAAAAGTTGTCTTAAGATATACTCATGGGTAGACAACTAATTATGTGAAAGATGAAAATAAAGATTAGTTATGCATGAATGATAGTTTGTTTTATGTTTTGTTCACTTTGTATGTATCTTTTTCCCCTTCTTTACATATGAAAACCTTTTTCTTTCTTGGTTTATTGTTATGGATGTTGAGTTAAACTCACAACCCCTTTCACTCTTCTTTCTAATTTTATCATTAAACCACCTTATAACTCTATATTTTAAAGATATTTTCTAATATTTTGAGAGTGTGTATAAATTATTTATGGTTTGATCAAGTTTTAAATTCCTATTAAATTTAAAAAATTTCGATCAAATCTCTAATAAATTTTTAAAATGTATTAGATATTTAAAAATTTAATTATCAGATATTTAATAAATTTATATTTTTCAATTAAACTTCTACTATTTAATTTTTCTATTAATTGAATTATGTAATTATTAATTAACTGATGTTATTGTTTGTTACGTTGTTTCGTTACCTAGATATCGTTATATATTATTTTATTATTTTAAAAACTTGTAAAATTATAATATCATAAAATTATGTAAAAATAATTAAATATTATATTTTGAAGATATTAGATAATTAATTACTATGATATTTTAAAAATATTAAATAATTAATTATTATATCAAGATATAATAAAATCTAATAAGAAGTTATTATAACATTATTTATAAATACCTTTAAGATATTTCTTAATATCAATAATATCTTAAAAGTATGTTAAAATTTATTTAGTAATATTTATAAATTTTAAATAATTTAGTTTATGTGATACATGATTATTCGTTTGTAATATTATTATTTGATGTAACGTTTTTCATGAATACCACATTACTTACAAACATATTATATGAAATTTAAATATGAAATAAAAACATAAGATCTTAATCTTTGTAAAAAAAAATGTATTCATGTGTCTATTTATACTTAATTACGTTTGTGACTTGTTAAAAAGCTTAGTTATCATAATATGACATTGTTTATTATTCGTATTTCACTTGATTAAAAACTAGAATCTAATAAAAAAATTATTATATCTTAATAAATATCTTTCTATAATAATCTTGAAAACATGTACAATTATATAAATGTATATAAAATTAAATAAAATACAAAATATAGTTTACGTGACAGCATCAATAATCAATAATATTGTCATGTGACGATAGAAGGAAAGCGGGTAAAAATGTCAGAACAAATCGTACTAAAATTAAACCAAATTGATAGCATCATCAAATATATAAATATATTTATATATATCATTACAAGATATGAAAATAAATATTATCTTTTCTCAATCTTATCACTTTATTCATTTATAGTCGCATCAAACTGACTGCTTTC


Gene Sequence:
>Vu_20490(+)
CTCTACGCTCATTGTTTGCAAAACCCCTGTTTCAGATCACCACTCCTCCTAGATTAGGGTTTTTCCTAATTCAGTTTCCATCAATTCTTCTTCGTCTTTTCATTTCCTCTCATCGATTGTAAGCTTAGGTTTTCACTGCAATCTTATATACCTAGAACTCGTCATTTCTGCCGGATCTCGTTCGATGGATACTCGCAAGAGGGGAAGGCTCGAACTCGGTTTCAACTCCAATGGTGGATTTAAGAAATCCAAGCAAGGTTTGATTTTGAGCATTTTTGGTTTCTTGGGTTTTGGTATTTTCGTTCGATTTGGTTTATTAGGCTGCAAAAGTTGTTTGCCTTTGTTTTCTTCCTTTGTGTTTTGTGGGGTGTCCTTTGAGGGATGAAATTTCTCTCTCGTGCTTATGAGCGTATAGTTTGCTTTGCTGTGGTAGAATTTTTTCAGATTAGTCTATTTTGTAGTAAAACATAACCTCTGATTTTCCTGTCTAATGAACTCAGAAGGTACGAAAAATTCTAAATGTTGTCACTGAAAAGTAATTATATTATAGCGTTGTTCTTTAATACTAATAGTTTTGGAATAAAATTTACTAGATTAATAAGCAAAAAGAATATTAACTGAGAATAAGTAATAATGTTTTGCAACAGAAATGGAGTCCTTATCAACTGGTGTAGGAAGCCAATCAAGCCCTTGTACCCAAGTTTTTCAGGTTCTAATCCGTTCCTATCTAATAAATATTTTTGAACTGCTAATCTATTCTTAATGGTGTTTTATTATAATTAGTTTAAGAATTAATTGTTTAGTTGCTTTAGAACTTAATTGGCCAATTAACTGGGCATTCAAAGCTTTTATACAGGTACGTACTGTTCTTTGTGTACACAAGTTGTATCATAATAGGATAGAAAAAGATAACAAGTGGATACAATGTAGTTGGCACCAAGATCACTTTATTGGTGATAAATTGATCATTTCTCACTTAATGTTTACCTATCATCTTAGTTAGTCTGTTTCCCCTGTAATTATGTTTAACATCAATTTTTCAGCCATTAATGGTTTTAATTGCTTTTGAACCCACCTTTCAATTGGTAAGCTACTAACAAACTAATATGAATTGAACCTCAATTGGTTGGGTTAGGTATTTTGTCAAAACCACATATAAAATTGTGGTGGTTTTGTACTTCAAATGGTATGGCAGTGCTCGGCTGCAATGACATTTTTATAGCGGAGTTTTGGCATTCCTCTATATTCCACTATCTTTCCATTGACAATGCTGTTTGGTTACTCTTTGGCAATCTAAAAAACATATTCATTTATTTGCTGCTGTATATTTATGCTTGAGTTCTTTGAATGCTGTCTTTACTGTGATTATATTTCAGATTGAGTAGAGATGACATTAGATATTTTGGATGGGTAAAACTAGAAGCTATACTCATTTATATTAAGTTTTTTAGGCTGTCTATATACTTGTTGCTGTGACTGGTTGATCCTAAGAAGTGGGCCTTGATTGGAGATCTGCCTGTATGACTTTGTCTTTCTTCTGTTTGGCTTAGTGATGTAGCTGTATTGTTTCCTTTACAATTTGGAGGAACCATTCTGAAACTTTGTGACCTTTAAGCATTACAGTGTGCATGGGTGATGTATCAATATATTACAATATAGTAGACGACTCTGATAGTCTAAGTTGCTTGTTTGTCCTATTTTAAAACTCCTTGCTGTAGATTTTGCGAAATAAGCCGGTAGTTTCTTCATGTTACATTTTATACTTAAAGAAGTGGAAACGAGTGTGGTGTAACCTGATTGTGAATTGTCTTGCAGCACTTCTGGTTGCCCGTTTGGTGAGAGCTGCCACTTCCTGCATTACGTTCCTGGTGGCTATAATGCCGTTGCCCATATAATGAATCTAACACCTGCAGCACCTCCAGCATCAAGAAATGTGGCAGCTCTGCCACCTGTACCAAATGGGTCTGCGCCACCTGCTGTAAAGACCCGCATATGCAACAAATTTAATACTGCTGAAGGTTGCAAATTTGGTGACAAATGCCACTTTGCCCATGGTGAATGGGAACTTGGGAAGCAAATTGCTCCATCATTTGATGACCATCGAGCGTTGGGGCCGACTGCAGCAGGTCGTTTTGGTGGTCGAATGGAGCCTTCTCCTGGTCCTGCTACAAGTTTTGGTTCCCATGCCACTGCCAAGATAAGCGTAGAAGCATCCCTGGCTGGTGCAATCATTGGGAAGGGTGGTGTGAACTCAAAACAGATATGCCGCCAAACTGGAGCCAAACTTTCGATCAGGGAGCATGAATCGGATCCTAATATTAGAAACATTGAACTAGAGGGAAATTTTGAGCAAATCAAGGAAGCTAGTAATATGGTGAAGGATTTGCTACTGACCCTGCAAATGTCTGCATCAAAAGCTAACCCAGGTGTTCCTGGTGCACCTATTCGAGAGCATGGAAGCAATTTTAAGACGAAGCTGTGCGAGAATTTTTCCAAAGGGTCTTGCACATTTGGAGAGAGATGCCACTTTGCTCATGGAGCTTCCGAATTGCGTAAATCAGTATGAAGTTTGTGTTTGTGAGGTACATTAGCCAGAGCTATTATTATTGTTGTGCATTGCCACTTTAGCAGTACTGAATGTTAGTTTTGTTGTTGAGTTGCGTTTTATTTATAGCCTGTTTTGTTTATCAATTGCAACTTCCGCTTATATCATCAAATTCCTGTTCTCTTTAGCTGACCC

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1321869