Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20459 LG5 23307225 23310391 PREDICTED: transcription factor bHLH130-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 23307230 5_prime_UTR_variant
T/C 23307246 5_prime_UTR_variant
T/A 23307385 5_prime_UTR_variant
T/A,* 23307550 5_prime_UTR_variant
C/A 23307555 5_prime_UTR_variant
C/T 23308056 synonymous_variant p.Tyr107Tyr
A/G 23308071 synonymous_variant p.Leu112Leu
T/C 23308194 synonymous_variant p.Phe153Phe
T/C 23308239 splice_region_variant&intron_variant
T/A 23309009 intron_variant
A/C 23309010 intron_variant
T/A 23309154 missense_variant p.Ser183Arg
A/T 23309156 missense_variant p.Asp184Val
A/G 23309162 missense_variant p.Glu186Gly
C/T 23309509 splice_region_variant&synonymous_variant p.Asn273Asn
A/G 23310043 missense_variant p.Asn371Ser
T/A 23310124 upstream_gene_variant
T/C 23310259 3_prime_UTR_variant
C/A 23310387 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20459.1
MDSNSRYQVQQQHQPNSGLLRFRSAPTQVSNFKQGEASSINANPWEGSEPLLRFFNSGDTLDTTSPTIREFVDNKVSNENKQPKESTISSSSPSLSPLSRMNSQQGYSTSVLPSRYPRHDSTVTVSSSMMVGSVGMDQGGKSFNPNLLRQSSFPSGNFSNSISFHNGYDGTRGVENFGGVNGSDGEHRISMNRMKNHISFSSRSPSSLGILSPTSKMGTESLRVTSPEDGKHGGSNGDARYYGPGFPYASWNETANPKRQRNSNDELLSEAQNGDLGNQVHSLSYHLSLPRASSEMFAMDNLLQFNDSVPCKIRAKRGFATHPRSIAERVRRTRISERIRKLQELVPNMEKQTSTAEMLDLAVDYIKNLQNQFKNLSERRAKCKCINMQKPETDKIA*


CDS Sequence:
>Vu_20459.1
ATGGATTCCAATTCCCGTTACCAAGTTCAGCAACAACACCAACCCAATTCCGGTTTACTTCGCTTTCGCTCTGCCCCCACTCAAGTCTCCAACTTCAAACAAGGCGAAGCTTCTTCCATCAACGCCAACCCCTGGGAGGGTTCTGAACCACTTTTAAGATTCTTCAATTCCGGCGACACCCTCGATACGACATCCCCTACCATACGAGAATTCGTAGATAACAAGGTTTCTAACGAGAATAAACAACCGAAGGAGTCAACAATATCGTCGTCGTCCCCATCATTATCACCTCTGAGTCGCATGAATTCCCAGCAAGGTTACAGTACTTCTGTGTTACCCTCTCGGTACCCGAGGCATGACTCGACAGTAACTGTTTCTTCATCTATGATGGTGGGTTCTGTGGGAATGGATCAGGGTGGCAAAAGCTTTAATCCCAATCTTCTCAGGCAGAGTAGCTTTCCTTCTGGCAATTTCTCTAACAGCATCTCCTTTCACAACGGGTATGATGGTACGAGAGGTGTTGAAAACTTTGGTGGTGTTAACGGCAGTGATGGTGAGCATAGAATATCTATGAACAGAATGAAGAATCACATTAGCTTCTCATCAAGGAGTCCTTCTTCTTTGGGAATTTTATCACCAACCTCTAAAATGGGCACGGAGAGTCTTAGGGTAACTAGCCCCGAGGATGGTAAACATGGAGGTAGCAATGGTGACGCTCGATATTACGGCCCTGGATTCCCTTATGCTTCTTGGAATGAGACGGCAAACCCCAAAAGACAGCGAAATAGTAATGATGAATTACTTTCTGAAGCTCAGAACGGAGACCTGGGAAATCAAGTTCATTCTCTTTCGTATCATTTGAGTTTGCCGAGAGCATCCTCGGAGATGTTTGCTATGGACAACTTGCTTCAGTTTAACGATTCTGTTCCTTGTAAAATCAGAGCAAAGAGAGGCTTTGCTACTCATCCTCGAAGCATTGCCGAAAGGGTGCGAAGAACTAGGATCAGTGAACGAATAAGAAAATTGCAAGAGCTTGTTCCAAACATGGAGAAGCAAACCAGCACAGCAGAGATGTTGGATTTGGCTGTAGACTACATAAAAAATCTTCAGAATCAATTCAAGAATCTGAGCGAAAGACGAGCTAAATGCAAATGTATAAACATGCAGAAACCAGAAACAGATAAAATTGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20459::LG5:23305225-23307225(+)
CTTAGTCAAATTTTAGTTTATAGTCTAAGTGAAGAGAGTTAACGTTTGAACTTCTATTTGTTAACTCAAACGATAATATTTAGCACTTCAAATTTATATTTTTTTTGGATGTTTTTTTTAAAGACATCAACAAACATAATTTAAAAAAAATCAAATTATTCTAAATATTTTTTTTACTCAAACCAATCATTATTCTAGCAAGTTTAGAGCATTCATTTGGACTCAATAAAACACATATTAGTTAATTTAGCTAGCATGGTTCATTTTTACTCTTCTAATCCATTGTCAAAATCAAAACCAATGCAACCATTGAAATCAATGAGTTAATCAAATTCAAACATACCACTCAAATTTCAATATGCAATACTATCAAAGATAAAATAAAAAAAAATCAACTATAACTTAAAACTACTCTTATTTTTCTTTGACTATTATATATACTTTCCAAATAATAAATATAAAAAAGAGTAGATAACATAAAAAATACAAAAATCTAGTGAAATATGTTCAAACAATTTCAAATTTTATTCAAAGAATAAACTAGTTTAGGAATTCTTTCTCTGAACCAATCTAACTAGAAAAGGGATCAAACATTCACAAAGTCGGAGATTAAAAGATATTAGAACAAATTCTATATTTATACTTAAATGAATTATGATAATTTAAAATACGTAAGTTACTATATGTAATGTGATAAGATTTCAAAAAGAAATAAAAAAAGAAAGTCACATTCTTAATAACAAAAGACGTGGTTGAAGGGGGAAAAATGATCAATAAATAAAAAAGAGAGAAAAGAAGGTGGACCAGGCCTTTAAAACTCACAACTCTTACCTACCAAAAAATTTTAAAAACACTCTTTGCTTGGACATTAAATGAAACAAATAATTACAATATTAAACTATTAATTTTTTTTAATTAATCCACAGCGGTGCCCTGATAGCAGTTTGAAAATATAAAATATAAAACAAAAAAAAATGTAACTATCGTACTTCTTAATCAATATCATTCATTGAAAATCATTTTCATCTCATTACTCGTACATCTTCTTAATGATATACATTTTTTTTATTTCTCATGTCCCTCAAAATCTATTTTAATTTTTTAATTAAACGCTCAATCTTTCTACCTTTAATTAAATACGCATTTTGTACCTAATAATGGAAGTTCTCTTAAAAAATACGCATGAAAACTCTCATAGATGTCTACATTTTTTTTACAATAATAAAAAAAAATTCTAGAACAAAAAAAAATATTATAACATTAAAAATAAAACTGTATGAAAACTATTTACATACTAGGAGGTGTATATTCTTTGTACATTGGTACGTATGAGTATGGGTTAGAATGACGTGGTGACAGATATACGATGGATTATGTCGTGTAAACAGTGACAAGCAGCGTTGCCACGTCGGTTTTTCTTCTCCTTCGTTTCAGATTACGCTCACACGCGCCGTCTTTCCATAAATAAAACTGCATACTATATTCTCCATATTTGCAAACTCACCGTTTTCTTTACCATTTAAGATTAGAACTTTAAGAACCATGGTTTCTTTTCTTAATAATTAGCATGTCTTCTTTATCTTGATTTGATTCCATGGATTTTTTATTATGCTGTTAAAGTGTGTAAACCATTGGCGCTGGAGTATTCGTTCATGCACACCCTTTCTTCTTTAGTATTAAATGGATTAAATATAGGTCAAGATTGAACAAGTAGTAGTAAGTGATAGGTTTCGTAATGTTTTCAAGGGTTGTTAAGCACTTAAAGAAAACCCTAATTTAACCAACCTAAAATATAATCAAGCTTATAAAAACAAAAGAAAATGTACCACCAAATCAATTTTATATTTCAGTTAATTAAAGTAATATTTTCTGGTGTTCGGAATTATCAAGCAATCTAAGAACAGACAAACAGTATCCAGTCCTGTGACGCTACTTGATGTACTCCTCAATTCTCTCATTGGTTCAATTGCCTCAAAATGCTACAAAGACAAAATCAATTA


Gene Sequence:
>Vu_20459(+)
ATTTCTTATTAAATTTCATTATTCATGCCGTAAATGTTTTTTTTTTCATCTTGATTTTAGAACTTGTTGTGTTTCTAAGAAAAAAAAAAAACTCAAGGAGCTCCTTTTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTGCATACACTTTCTCTGTCCTCTGTTTTTTTTTCTCTCTCTAGTTCATTCACAGGATCTTGCTTGCTCTTGCTCTCTTTTTTCAAAAAGCAAAATAATCAGGTTTCTGAAACTGCACTAGCGCGTATCTTTTTATCTTTCTCTACATATTTCTCTCCTTGTCTTTTTCACTGCTTCTGTGTTTATCTGTTTCTCTTCTGCACAACACCGACCTCTCAACCTTCCCTTTAAGCCCCTCCTTGAATTTTGAGCCACCAAGCTTTCCCTTTTCCTTCCCATTTGGGTTACTTCCAGAACCTTTTCGATTTTCATCATAATGATTCTCTAGCCTCTCGTATCAATATCACCTTCACTCCTTCTTTTTCAACTGATTACCAAACCATGGATTCCAATTCCCGTTACCAAGTTCAGCAACAACACCAACCCAATTCCGGTTTACTTCGCTTTCGCTCTGCCCCCACTCAAGTCTCCAACTTCAAACAAGGCGAAGCTTCTTCCATCAACGCCAACCCCTGGGAGGGTTCTGAACCACTTTTAAGATTCTTCAATTCCGGCGACACCCTCGATACGACATCCCCTACCATACGAGAATTCGTAGATAACAAGGTTTCTAACGAGAATAAACAACCGAAGGAGTCAACAATATCGTCGTCGTCCCCATCATTATCACCTCTGAGTCGCATGAATTCCCAGCAAGGTTACAGTACTTCTGTGTTACCCTCTCGGTACCCGAGGCATGACTCGACAGTAACTGTTTCTTCATCTATGATGGTGGGTTCTGTGGGAATGGATCAGGGTGGCAAAAGCTTTAATCCCAATCTTCTCAGGCAGAGTAGCTTTCCTTCTGGCAATTTCTCTAACAGCATCTCCTTTCACAACGGTACTGTACTTGTTCTGTATTCAGTTTTTGTTTACTACTTTTTATGGCAGATTTTAGGGTGTCCGTACGTTTTGTTTAGCACCAAATGGAAATTGTTCATGCCGAATGAAATCAATCTGTTGAAGATGGTGGTGGTAGCTTATTCAACTGCAATTGCGTGTTCTGACTTTTGAAATTAGACAGCAAGGATATGATGAGTGGTTAGACATATAAGATTTATTTATGATTCCCAACGTAATAATTTGATTTGGGAAGAATTCTATAAACACTTAATGTCAACAAAGCGCTTGTATAACTTTCTAAAGCTGTGGTTTTTGTACGGAACAAACCACATATGTCAATATTTGAACTTTAAGCTTGTCTTTTCATACTTTTTGTAGCAACTTCGGTTTGAGGACTTTAACTTTGCCATACACATTGACATGATCTTGTAAAAAGAAACTCTTAATTCTCAGAATATGGTTGGGAGTGTTCAAAATACCTTAAACCGCAAAACAACACATGTTATGGTTGTTTTTCAACTTGAAGGGTTCCATATTGAGTTTGGAGAATGAACTCAATTTCGTAACATATTTTATTATCTTCAAAAATATGCTTCCGTTTTAAAATTTGTCTAAAAACCTTGGTTTTTTTAGTGAACTTAATCATGTAAAAGTGAGATTTGGTTTGTTTTTACTTATGAACTTAATTTTAATCCAAATTTAACGTTACAAATTTTAATCAACAAATCCCATATATTCTTCCTTGTTCATTTTGCGTATCCAAAACTGGAGATATGCATTAAAAATTCTGAAAACACGTTTCCAAATTTTATACGAAGATAAACCTAGTTGTCACTGAAGTAGTTTCAGTTCATGTTGAAAACTGCAGGGTATGATGGTACGAGAGGTGTTGAAAACTTTGGTGGTGTTAACGGCAGTGATGGTGAGCATAGAATATCTATGAACAGAATGAAGAATCACATTAGCTTCTCATCAAGGAGTCCTTCTTCTTTGGGAATTTTATCACCAACCTCTAAAATGGGCACGGAGAGTCTTAGGGTAACTAGCCCCGAGGATGGTAAACATGGAGGTAGCAATGGTGACGCTCGATATTACGGCCCTGGATTCCCTTATGCTTCTTGGAATGAGACGGCAAACCCCAAAAGACAGCGAAATAGTAATGATGAATTACTTTCTGAAGCTCAGGTTTGTTTGGGATTTTCAATTTTCTTGTTGTATTGATCCGAACTTTTTTCTGGTTCTCAATACAAATATGTTCTCATACACTCAGAACGGAGACCTGGGAAATCAAGTTCATTCTCTTTCGTATCATTTGAGTTTGCCGAGAGCATCCTCGGAGATGTTTGCTATGGACAACTTGCTTCAGTTTAACGATTCTGTTCCTTGTAAAATCAGAGCAAAGAGAGGCTTTGCTACTCATCCTCGAAGCATTGCCGAAAGGGTAAGAGAGTATCATGTTATCTGCCTGTGCCAAAACTTGTTTTCACAAACATTTGGTATGGTGAAGTTCTATCAATTAAAATGAAGTTGTGTTCCTTTGCCAAAACTATAATAAGAAATGATGATTATGTGAAAAGATTATTCTAACAAGTACTTGTTCTCAGGTGCGAAGAACTAGGATCAGTGAACGAATAAGAAAATTGCAAGAGCTTGTTCCAAACATGGAGAAGGTCAGTAATAAAACAGAAGTTGATTTGCCCTTGCATTGTTTTGTGTTTGGAATGTTAACATTCTTGAGTTATTGGCAGCAAACCAGCACAGCAGAGATGTTGGATTTGGCTGTAGACTACATAAAAAATCTTCAGAATCAATTCAAGGTACTCAAAGGGAGAAGTTATTTGTTAGAACCCCATAGTCATATAGCCATGCAACTGATGACTCTTTTCATGCATGCACTGACATTTTGAATACCTTTCTGCAGAATCTGAGCGAAAGACGAGCTAAATGCAAATGTATAAACATGCAGAAACCAGAAACAGATAAAATTGCTTGAGTTTCTTTTGTACATGTGATGAAAGGAACTATGCAAACATGGACCCGGGTACTATATTTTGACGTGATGAATCACACGAACGATAAATCAAATAGTTTAATTTTGTAATTTTTTATACAAAAATTGTAATGAATTATTTTAATGTTATTCTTTTTTTCCCCT