Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20450 LG5 23192559 23195878 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 23192578 missense_variant p.Asn7Ile
T/C 23192662 missense_variant p.Val35Ala
T/G 23192706 missense_variant p.Ser50Ala
T/A 23192823 missense_variant p.Ser89Thr
G/A 23193130 intron_variant
G/T 23193338 intron_variant
T/A 23193441 intron_variant
G/A 23193473 missense_variant&splice_region_variant p.Cys161Tyr
C/T 23193871 intron_variant
T/A 23193891 intron_variant
C/A 23193901 intron_variant
A/C 23194363 intron_variant
A/G 23194373 intron_variant
A/T 23194448 intron_variant
C/A 23194579 intron_variant
T/G 23194879 missense_variant p.Leu264Val
A/T 23194914 missense_variant p.Glu275Asp
A/G 23195322 synonymous_variant p.Gln411Gln
C/T 23195619 synonymous_variant p.Ser510Ser
A/T 23195629 missense_variant p.Ser514Cys
A/T 23195665 missense_variant p.Thr526Ser
A/T 23195847 stop_lost p.Ter586Cysext*?
C/T 23195848 missense_variant p.His587Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20450.1
MLQNSTNMEQTVLTTQEGTPGNWNQDAMLLHQHLVTPQMESTSQGSINNSTCSSSLQYHVLSLLEGIINEKHIEETLIQSKLLSCNVGSIAATATATIINERERNDCGENDRRQHESCLDLVAKTIGSKSSVYRGVIKCNDDRFEAFVWDNSDPGEKGRTGAYSSEVDAAKAHDLVSIRIGGLKALTNFHVRCYSKDMDEMRRMSKWDYICAVRGLGKGYTDGDSPFRGVYRVPTSRKWEARLGREGSPTIHLGTYYTAEDAARAYDIISIKLKGGKAITNFDWNSYETEGIMETVIAQATDGSIILQKEEKNKEPEASPQNSSSVQCHPQPPSIPSICRCCHNQILTPTNPHALGTIADTAGNSAINNSIVNDAVQFPNENATQQQPRPLQTPRQVSFNDGSNQNLVNNNNNNNQLPNHNAAQQQSLQTPRQVSFNNAFNLNLVNNNYNNSNNQFLPQGSNLALPATGIRNLELEKCVRFPDWRSGFGKKLLGGNLELEPLNNVAALSLQALPQVTLNGSTGATQLHAPALHQSYEHQNLNSCTPDSFQNPVSEPNNNGFQSQLDLDMRDYLNRSYIEDNDFTCDYDMFSAMNGGR*


CDS Sequence:
>Vu_20450.1
ATGCTCCAGAATTCAACAAATATGGAACAAACCGTGTTAACCACTCAAGAAGGCACGCCCGGGAATTGGAATCAAGACGCAATGCTACTCCATCAACACCTTGTCACTCCACAAATGGAAAGCACTTCTCAAGGCTCAATCAACAATTCCACCTGCAGTTCATCCCTTCAGTATCATGTTTTATCCCTTTTAGAGGGAATAATTAACGAAAAACACATAGAAGAAACCCTAATCCAATCCAAGCTATTGTCTTGCAATGTTGGGTCCATTGCTGCCACAGCGACAGCAACGATTATCAATGAAAGGGAACGAAACGATTGTGGAGAGAATGATCGAAGACAGCACGAGTCGTGTCTTGATTTGGTTGCTAAAACAATCGGTAGCAAGAGCTCTGTGTATCGAGGAGTAATCAAGTGCAACGATGATCGTTTTGAAGCATTTGTGTGGGATAACAGCGATCCAGGGGAAAAAGGAAGAACAGGTGCTTATTCATCTGAAGTTGACGCCGCCAAAGCTCATGATTTGGTGTCAATCAGAATAGGGGGCTTAAAAGCATTAACCAATTTTCATGTGAGATGTTATTCCAAGGACATGGATGAAATGAGAAGAATGAGCAAATGGGACTATATTTGTGCTGTTAGAGGGTTGGGCAAGGGCTATACAGACGGTGATTCCCCTTTCCGTGGCGTCTACAGGGTACCCACAAGCAGAAAATGGGAAGCAAGGCTCGGTCGTGAGGGGTCACCAACCATACACTTGGGAACTTATTACACTGCAGAGGATGCAGCGAGAGCTTATGACATTATATCAATAAAACTGAAGGGAGGGAAAGCAATTACCAACTTTGACTGGAATTCGTATGAAACTGAGGGCATAATGGAGACTGTGATTGCTCAAGCAACGGACGGATCGATCATTCTGCAGAAAGAAGAAAAAAACAAAGAACCCGAAGCATCTCCTCAAAACAGCTCCTCAGTTCAATGCCATCCTCAACCACCCAGCATCCCATCCATTTGTCGTTGCTGCCACAACCAAATTCTCACACCAACCAACCCTCATGCTCTTGGTACCATTGCTGATACTGCAGGAAACAGTGCAATTAACAATTCAATTGTTAACGATGCTGTACAGTTTCCAAACGAGAATGCAACACAGCAACAGCCCCGACCACTTCAGACTCCGAGGCAAGTGAGTTTCAACGATGGCTCCAATCAGAACCTTGTCAACAACAACAACAACAACAATCAGCTTCCAAATCATAATGCAGCACAGCAACAGTCACTTCAGACTCCGAGGCAAGTGAGTTTTAACAATGCCTTTAATCTGAACCTTGTGAACAATAACTACAACAACAGCAACAACCAGTTTCTGCCTCAGGGTTCTAACCTTGCTTTGCCTGCTACTGGCATCCGAAATCTAGAGTTAGAAAAGTGCGTCCGTTTCCCTGATTGGAGATCAGGTTTCGGAAAGAAGTTACTTGGGGGGAACTTGGAATTGGAACCTTTAAACAACGTTGCTGCCCTCAGTCTGCAAGCTCTACCACAAGTCACGCTGAATGGAAGTACAGGAGCAACACAGCTACACGCACCTGCATTGCACCAAAGTTATGAGCATCAGAACTTGAACTCCTGCACCCCTGATAGTTTTCAGAATCCTGTTTCTGAACCAAACAACAACGGCTTCCAAAGTCAACTTGATTTGGACATGAGAGATTATCTCAACAGATCTTACATAGAAGACAACGATTTCACATGTGATTATGACATGTTTTCAGCCATGAATGGGGGTAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_20450::LG5:23190559-23192559(+)
TTCATTACATAATTTTTGTGTTAAATTTATAATTTTCCATAGTTTTATTAAAATACAAATATTAGCTATAGATTATGTATGTACTACAAGAAATAATAAAAACTAACCAATTCTTCTTTTTGTAGATCCCTTTCTTTACATTCACTTTTTATTATTCTTTATTTATTGCTAATAGATTTATAACGAATTTTAATATATATATTTATCAATAAAAAAATCAGTCAATAAATAAAATTTGTATTATTAAGAAAATCAGTAATTAAAATTTTAAAATTTGACCTTTATCGACAAACTTATTCTGTAAATAAAATTTGTTTAATTTGAAGAAATTTTTGTGTTTGATTATGAATCTTATGATACATATGAATTTTTCTTAATGGAAAGGATAAACTGTTAAAAGGTTAGTGATTCTTTGGGCCTTATACATAGTGATGTATGCATCCTTAACATCAAGACTAGATGATTTTCAGTATTTATTAAATATGAATATGTGCTGAAACATAAATGCGAAACTTTTCAAAAGTCCAAAGAGTTAAAAAATAATGTAGAAAATCAAGTTGGCAAAAGTATGAAAAACTCAGTAATTAAATTCTGTTCATTTTTAAGTCAATAATTTGATTATCATCTAACGGTGTACGGTATGATATCTCAATTCTTACTCTAAAAACATCACAAAGGAATAAAGTTTGCGAAACCAGGAATCACACCTTTGGCATTTTCAATCTTGCTTTATTTAGGAGTCGTCTTATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGGAACATAATAGAGTCTATACAATCGTTTATTTAATGTTATTCCTAAACTATCATAGTTAAGTATTTTTATTAATACGGATTACAATATTGCGATTAACCTATGGACTAATTAATGATAAAGTCATGATAATTAATAAATCTTATAAGAGGATCAAATCTACTTAAAATGTAATTTTTAGAATTACTCATATAAACTCATTCATACATGATTATTTTTGCTTAATTAGTATTTTTTAATTAGATTCTGCTGCATTCATAAGAACACAAATAGAGGGATACTACAACAAATACTACAGCTCTGTTTGGCAATACATCATAGGAAAATATATGGACATTAATGTATTTAACTCCTATAGGAAAGGGATAAAAATTTGCACTATAGCAAGAAAGGTTTTTGGGACTAATATTGAAGTATATGTCTTGTAAATGAGTTAAATTATTCCAAATACTACATTATACTTATAAATATATATTTTTTATGAAAAAAATTAATTTTTAATAAAGTCCTAACTTGGAAAATAACTCCGCCAATAAAAAAAATTGCCATCAATAATACTCATAATCAAATTAAAGGTTTGGATATAAAAAGAAAATGTAGCCAATTAAGACCCTTTGAGCTTGAAGGTGTGATATTATTGATACTTAACCAATGTTTTTAAATAAAATTAATTATTTGTAAATACTTCTTACCTATATAGTATACAGTTTCTAAAAATTATCAGAAAAAAGAATCTTAAAGAAATAAAATTAAAAAGGTTAATAACCTTTTTTTTTTATTTGTATCCAGTCTGTGCAATTTATATTTCTCAGCTGTTAAATTTTTTTAATATGATTCCACCTACTGAATTTCTAAGGAATTCAAGTAACTGTTGAGATGGAATGATTACTTGAAAATTCAACAACTTATTTCCAACTCATATTAACATTTTCCTTTATAAAATAATAATATTATATTTTTATTTTTATTTTTGTATTCAATAAGTGATTAAGAAAATAATTAATCATGTTCAACATAACAATAAAAAAACAAAATATCATGGTCAAACATTGCTGTGGGAGTTACATTTTTTGAATCAACGTAGTCTCAGCCAGCTATATGAATTCTTAACCAAACCACCTTATTACCTCTCTATTCCGGAAACCTTAAACTCGTACAACCCAAATTATTATATCCTGAGTTCAGCAGCCTAGAAAATTGACCATGGAAGAACCATACTCCA


Gene Sequence:
>Vu_20450(+)
ATGCTCCAGAATTCAACAAATATGGAACAAACCGTGTTAACCACTCAAGAAGGCACGCCCGGGAATTGGAATCAAGACGCAATGCTACTCCATCAACACCTTGTCACTCCACAAATGGAAAGCACTTCTCAAGGCTCAATCAACAATTCCACCTGCAGTTCATCCCTTCAGTATCATGTTTTATCCCTTTTAGAGGGAATAATTAACGAAAAACACATAGAAGAAACCCTAATCCAATCCAAGCTATTGTCTTGCAATGTTGGGTCCATTGCTGCCACAGCGACAGCAACGTACATGCCACCTTCGGTACTTTACTTTACAATAATACATTCAATTTTATTTTTCTTACATGAAATGTTGTAGCAGGATTATCAATGAAAGGGAACGAAACGATTGTGGAGAGAATGATCGAAGACAGCACGAGTCGTGTCTTGATTTGGTTGCTAAAACAATCGGTAGCAAGAGCTCTGTGTATCGAGGAGTAATCAAGTATATTTATATGATTCTCTGTTTCAAATAATTACGCTGCTGCATTAGCTTTTACTTGATTTTTTGTGACCCTGAGTGAAAGGAAACATTAATTCTGATATAGGTGCAACGATGATCGTTTTGAAGCATTTGTGTGGGATAACAGCGATCCAGGGGAAAAAGGAAGAACAGGTTGAAATAGACTTTAGAACATATATATCTTTTCAATTCTCCTTTTATTTGCTTATCTCAAGAAACTACTCACTAACTTCGTTTCATTTTTTCGCTTGTATGTCTGCATCTTCTTCAACGGTTGCAGTTTATATTGGTTAGTACAATCTGCTTTTCTGCATCAAGTGTTGGTTATCTTAATGTGAATAGTAGATGATAAAATATTGGTTTTGGTGTGAATCTTTCTCTGATCTTTGCTTGCTTTTGTTGCAGGTGCTTATTCATCTGAAGTTGACGCCGCCAAAGCTCATGATTTGGTGTCAATCAGAATAGGGGGCTTAAAAGCATTAACCAATTTTCATGTATCTGTCATTCCTTATAGATACATTTATGAATTTCATAAATATAATCTTGTTGCAGATTTTGATTCAATTGTTATTAATTAGTTGAATTCCTTCTCATAAAGCATACTATTATTCGTAGGTGAGATGTTATTCCAAGGACATGGATGAAATGAGAAGAATGAGCAAATGGGACTATATTTGTGCTGTTAGAGGGTAAGATGTGATTTTTTTTTTTTGTGAATCTCCTTATAGCTATGTAATACTGTTATACTTTGTAAAATATTATCAAATAAAAAAGAAAATATAGATCTTATAAAGTGATGTATAGACTCATAAAAAAAGTGATATATAATAAATTTCTACTTCAATGAGTTAAGAGTAGAATCTTTCCATTAATTTCTTACAACTATTAATTGTATTTCTTTTTTTTTCTTTCAAATCAGCTATTTAAAACTTGGTCTGTTTTTTTACTAAATGAGGTTCTGAATCGTCATTGCTGCTGTAATCTTGATTTGTTGTGATGCTTAATATTATATGAAATCGTGGCTGATGTTAACATCACAGAAAATTAAATATAAATATACACTGTTGTTCTTACTACAAATACTTTATGAAGAAAAATATCTTAACATTGCAGCTAAAACTTGATAACCATTTTTTCAAAACATTCTGTCAAATATCAGTGTCCTTTTTTCTAACACTAGAATGAAAGTTAGCATATTACGTATGCTTGTGATGACCCCCCAAAGTTCCACACAGTGGCCTCCAAATATTTTTTTTTTTCTTTTTATCCTGACTTGTTGGATCAACTAATATTGCTCATTTGTATTTATTTGTTTAGAATGACAAAAGCCAAATGATTCTTTTAGAAATCTTCAACCATTACTATGAGTTCATAATTAAGATAAAGAAATTCATGATTGCATGGAAACTTGAAAAAATATCAGGTTGGGCAAGGGCTATACAGACGGTGATTCCCCTTTCCGTGGCGTCTACAGGTTTGTATTCCTTCTTTCTCTCTTTCATTTATTTACTATCTCTATCTCTCTAATTACTTCCACAAACAGGGTACCCACAAGCAGAAAATGGGAAGCAAGGCTCGGTCGTGAGGGGTCACCAACCATACACTTGGGAACTTATTGTGAGTATATTGCAACTCATCAAATTCATGTTGTAATTTATGGCAAATTGAATGGATAAGCATCAAGATGCATGTGTTTATGTGAACAATACATAATCAGTATAATATTTTTGGTACACTCTCTAAATCTAAATCAAAGTTTAACGTAAGACATATGATTGTGTACTTCAGACACTGCAGAGGATGCAGCGAGAGCTTATGACATTATATCAATAAAACTGAAGGGAGGGAAAGCAATTACCAACTTTGACTGGAATTCGTATGAAACTGAGGGCATAATGGAGACTGTGATTGCTCAAGCAACGGACGGATCGATCATTCTGCAGAAAGAAGAAAAAAACAAAGAACCCGAAGCATCTCCTCAAAACAGCTCCTCAGTTCAATGCCATCCTCAACCACCCAGCATCCCATCCATTTGTCGTTGCTGCCACAACCAAATTCTCACACCAACCAACCCTCATGCTCTTGGTACCATTGCTGATACTGCAGGAAACAGTGCAATTAACAATTCAATTGTTAACGATGCTGTACAGTTTCCAAACGAGAATGCAACACAGCAACAGCCCCGACCACTTCAGACTCCGAGGCAAGTGAGTTTCAACGATGGCTCCAATCAGAACCTTGTCAACAACAACAACAACAACAATCAGCTTCCAAATCATAATGCAGCACAGCAACAGTCACTTCAGACTCCGAGGCAAGTGAGTTTTAACAATGCCTTTAATCTGAACCTTGTGAACAATAACTACAACAACAGCAACAACCAGTTTCTGCCTCAGGGTTCTAACCTTGCTTTGCCTGCTACTGGCATCCGAAATCTAGAGTTAGAAAAGTGCGTCCGTTTCCCTGATTGGAGATCAGGTTTCGGAAAGAAGTTACTTGGGGGGAACTTGGAATTGGAACCTTTAAACAACGTTGCTGCCCTCAGTCTGCAAGCTCTACCACAAGTCACGCTGAATGGAAGTACAGGAGCAACACAGCTACACGCACCTGCATTGCACCAAAGTTATGAGCATCAGAACTTGAACTCCTGCACCCCTGATAGTTTTCAGAATCCTGTTTCTGAACCAAACAACAACGGCTTCCAAAGTCAACTTGATTTGGACATGAGAGATTATCTCAACAGATCTTACATAGAAGACAACGATTTCACATGTGATTATGACATGTTTTCAGCCATGAATGGGGGTAGATAG