Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20429 LG5 22855261 22857858 putative disease resistance protein RGA1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 22855383 missense_variant p.Glu542Val
G/C 22856781 downstream_gene_variant
C/G 22856823 downstream_gene_variant
G/C 22856829 downstream_gene_variant
C/A 22856839 downstream_gene_variant
T/C 22856847 downstream_gene_variant
G/A 22856848 downstream_gene_variant
A/G 22856881 downstream_gene_variant
C/T 22857779 missense_variant p.Arg27Gln
G/T 22857782 missense_variant p.Ser26Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20429.1
MAELFLFSIAESLIAKLASHAFQEASRVVGLYHDLRNLRKTLSLVKAVLLDAQQKQDHNHQLREWLTHLKTVFSEAEDVLDEFECQTLQNKVVKAHGNTKDKVSHFFSTSNPLLFRYKMTQQIKYINKRLDKVAAHRHKFSLQIIDVDTRVVYRRDMTHSRVSDSDVIGRKNDKEKMIELLMQQNPNDDDTSLSVIPIVGIGGLGKTTLAKFVFNDNRIQECFPLKMWVCVSDEFDIKQLIIKIINSANDVDVPPHQQNLNMLDMEQLQIQLKRKLSAAAIDEALLNTCLTKFKCLRVLDLRGSTCKTLPRAIAKMKHLRYLDISENLNIRRLPDSICKLQSLQVLSIKRCMKLEILPKGLRKLISIRSLEFSTKQTILPVNEIAQLGSLEFLSIESCHNVESIFGGVRFPSLKTLCVGDCQSLKSLSLDGQNFPELETLLVKDCGNLDLELCKGHHKEESPKLKLKLVLFFGLSQMVALPKWLQEASKSLQRLYVLNCDNIETLPDWLTTLTDLKALGLINCPNLVSLADNIHHHTALESLRIEGCANLYKKYEPNVGEFWPKISHIKNIVIDEPEELKKN*


CDS Sequence:
>Vu_20429.1
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAGCAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTCTCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAATTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGGTAAGTCACTTCTTCTCCACTTCTAATCCACTTCTTTTTCGCTACAAGATGACACAACAAATTAAATATATCAACAAAAGACTAGACAAGGTTGCAGCGCATAGGCATAAGTTTAGTCTTCAAATAATTGATGTTGACACACGTGTTGTTTATCGGAGAGATATGACACACTCTCGTGTCAGTGATTCAGATGTGATTGGAAGGAAAAACGATAAAGAAAAGATGATAGAACTTTTGATGCAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTATCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAATGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGAGTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCAATTCTGCCAATGATGTAGATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATGTTGGATATGGAGCAACTGCAAATCCAATTGAAAAGAAAACTTTCCGCAGCTGCCATCGATGAAGCTTTACTAAATACGTGTCTGACAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATCTCAACATTAGGAGACTCCCAGACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTCTATTAAGAGATGTATGAAGCTGGAAATATTGCCCAAAGGATTAAGAAAACTAATCAGTATCCGTTCTTTGGAGTTTAGTACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGAATTCTTGAGCATTGAATCATGCCATAATGTGGAGTCCATCTTTGGAGGTGTGAGATTCCCTTCTCTTAAAACATTATGCGTTGGGGATTGTCAAAGTCTAAAGTCATTGTCTCTGGATGGTCAAAATTTTCCTGAATTAGAAACATTGCTTGTTAAGGACTGCGGTAACTTAGACTTGGAACTGTGTAAGGGCCACCATAAAGAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGCTAAAACTTGTATTATTTTTCGGTTTATCACAGATGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTAGCAAATCCTTGCAGCGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATCGAAACACTTCCAGATTGGTTAACAACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTGGTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATTGAAGGTTGTGCTAACTTATATAAAAAGTATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGCCCAAAATATCACACATCAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACTTAAGAAGAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20429::LG5:22857858-22859858(-)
TTAAGTTTTTGACACATAATAAATTTAGATTTTGATACATAATAAATTTAAATAAAGTTAATGTCAATGATCATATTGATTTTTAAATTATAACTCATAATAAAGGTGATTTTTTTTTCAATTTTGAATGTTGAAAATATGAAGAGAAAGAAAGGTTTTTCTAGTTGTAATATTCTTGTGTGTCCCTTTTTTTAATTATTTGAGAGCATTGTTGTATGATTTTTCTTAACTTATTATAACTATTATTTTCCACTTGAAGATTTTGTGTACCTTTTCTCAATAATAAGAATTCTTGTATGTTTAAAATCTTTGTACAGTACATGTGAAGATGCTTTTAGAAGGAAAAATAAAAATCTTAGTACCTTTTTCTTGTTTTTTTTTTTTAAAAAAAACTTCTTCTACACATTCTTGCAAGTTGGAAGAATTTTTGTTCCTATATTTAATGCTCTATTATTTAATTGGTGTTTTGTTGCTTAAGTACATTACATCAGCACAATGTCTTGGTTAATGGAGTATTTATTTGGGCTTGATGGAGATTTTGGGCTTGTTTGAATGGAAGAAGATCAGTTGCTTCTTGCACCCCCTCAAATGTCTTCCTTCACCCATCAATTATGTGAGTTATTAAAATTAATCTTATGGTTATTTAATTTAAGCCTAATTTTTTTTTTATCTCCATTTTTCTTCACTTTGGAGCTTCACCAATTCCACCCTCTATGCACAGTTTACAGTTGTGTTTTCTTCACCTTGACTTGCAGCAGTGCATTCGGTTGACAACACGTAGGTAAGACTTTTCTAATGGAGGAGGTGTAGGCATAAAATTCATATTCCGGAATTGGAAATAGAAAATATATTATTAGAAAACACTTTTCGAAATATTTTCCTCAAATAAACATTTTGGAACATATTTTCATAATATCATTTCTGAAAAAACACTCATCAATTTTATTACAAAATTAATTTTATGAATTTATACATTATTTCTCCGAAAACAACAATAAGAAAAATCATTTCTCACCCCTTCGTACCTTAATATATTCAACATGATCTTATCAATATGTGGTAAGATTCTAATTGTGATTTAATTATTTTTTTATGTAGAAAGAACTTGTTTTTGTTGAGACAAGAAATATCCATCAAACAAAAGATTCTTTAATATATAAGTGAGAGTAAGATCAACATAAATATTTTTATTAAAATAATAGTTATTTAGAGAATAATAATGATATAATAAATAATAATAAAATAATAAATAATGATATAATCAAATTATAAAAAAAATTAAAAAAAATCTTATTGAATCATATTTTTTAACATGCATATTAAACTATATAAAAATACACGTCGTCCCTTTGTGTCCATAAACATAACGAGAAAACTTTAAAGAAAATAAACATGGGTAAAATTAGAAATTCAAAAAATGATGATGTGTAGGTAAATACAATTGCCTGAAAGAACATACAAAATGACTTCGTTGAATGGAACATCACGAAGTCAATTCCCTTGCAACGTCATTCTAGAAAAAGAATTTCGCTAAACGTGAAAGTGGGGCTCAACAAAATTAACGTCGGTGATCCTATTTTCGAACGTCAAATATCCTCTTCCCATTTTACAGACATCACCCTCTGGATATCGAGCTTGAAGAGGATTGCGTTGAACGCCGTAAAACGTCAGTTTACTTGGTTTTCCAACTAGAAAAATGTATTTTTAACGACTTAACAACTTTTTTATAACAGTAATAATTAGTTTGTATTACTGTTACAAATATACGTGCCAATAAAATATTATATCACCAACATTATTTGATATTGGAAAGGACCTTAAAAGTCAAAAAAAAACAGGAAACCTTTTCTACACCAGTGGATACTATAAAAGTTTGCGGACAACTGCAAAAAGCCCAGATAATATCAAGATATTTCTCATTTGCCCTCTTATTTCTTTTTAACCGCTGCTGAAAATAATGCAACAAATGGAATAGTTGTCGTGTAGTTCTGGAAACAACT


Gene Sequence:
>Vu_20429(-)
ATGGCCGAATTATTTCTCTTCAGCATAGCAGAGTCACTCATAGCAAAGCTTGCTTCTCATGCTTTTCAAGAAGCTTCTCGAGTGGTGGGTTTATACCACGATCTTCGAAACCTTAGAAAGACTCTCTCTTTAGTCAAGGCTGTTCTGTTAGATGCTCAGCAAAAGCAAGATCACAACCATCAACTCCGCGAATGGCTCACTCACCTTAAAACTGTCTTCTCCGAAGCCGAAGATGTTTTGGATGAATTTGAGTGTCAAACACTGCAAAACAAAGTGGTCAAAGCTCATGGTAACACCAAAGACAAGGTAAGTCACTTCTTCTCCACTTCTAATCCACTTCTTTTTCGCTACAAGATGACACAACAAATTAAATATATCAACAAAAGACTAGACAAGGTTGCAGCGCATAGGCATAAGTTTAGTCTTCAAATAATTGATGTTGACACACGTGTTGTTTATCGGAGAGATATGACACACTCTCGTGTCAGTGATTCAGATGTGATTGGAAGGAAAAACGATAAAGAAAAGATGATAGAACTTTTGATGCAGCAGAATCCTAATGATGATGATACAAGTCTATCTGTTATCCCCATTGTGGGGATTGGAGGCTTGGGAAAGACTACACTTGCAAAGTTTGTGTTCAATGACAACAGGATCCAGGAATGCTTCCCATTGAAGATGTGGGTGTGTGTTTCTGATGAGTTTGACATTAAGCAACTTATTATCAAAATCATCAATTCTGCCAATGATGTAGATGTTCCTCCTCACCAACAGAATTTGAACATGTTGGATATGGAGCAACTGCAAATCCAATTGAAAAGAAAACTTTCCGGTCAAAAATTCTTACTCGTATTGGACGACGTATGGAACGAAGACCGTGTTAAATGGGTTGAGTTGAGGAATTTAATCCAAGTAAGTGGAGCAGGAAGTAAAGTTGTAGTGACCACACGTAGTCATTCGATTGCTTCCATGATGGGTACAGTTCCCTCTCTCATTTTAGAAGGTCTTTCCAAAGAGGAGTCATTGTCTCTGTTTGTGAAGTGGGCATTTAAAGAAGGAGAGGAAGAAAAACATCCTCACTTAGTAAATATTGGCAGAGAAATTGTGAAAAAATGCAGAGGGGTTCCATTGGCAGTGAGAACATTAGGTAGTTTACTATTTTCGAAATTTGAGGACAGTGAATGGGAATATGTGAGTGCCAGTGAAATTTGGAATTTGCCTCAGAAAAAAGATGACATTTTACCTGCCCTTAAACTGAGTTATGATCTCTTGCCATCCTACTTGAAGCAATGTTTTGCATTGTTTTCCCTTTACCCAAAGGATTATTTATTCCCTAGTTATGAAATAGCTGCGATTTGGGGATCACTTGGACTCATTGCACTACCAAAAACAAATAGGACACTTGAAGATGTGGCCAATCAATATTTGCATGAACTCCTGTCAAGATCCTTTCTCCAAGATTTTGAAAACTTTGGCAATAAGTTTAGGTTTAGAATACATGATTTGGTGCATGATCTCGCCCTATTTGTTGCGTCGGATGAGTGTCTACATGTGAGTTTCAAAATTCAAAATATTCCAGATAATGTTCGACATCTGTCTTTTGCCGAAAGCAGTTTGTTCAGAAATTTTGTCACCAAAAAATCAACACTTGTGAGATCCGTACTGTTTTCAAATGGTGCAGCAGCTGCCATCGATGAAGCTTTACTAAATACGTGTCTGACAAAGTTCAAATGCTTGCGAGTTTTGGATTTACGTGGTTCGACATGCAAGACTTTGCCCCGTGCCATTGCTAAGATGAAACATTTGAGATATTTGGACATTAGCGAAAATCTCAACATTAGGAGACTCCCAGACTCTATTTGCAAGCTCCAAAGTTTGCAAGTGTTGTCTATTAAGAGATGTATGAAGCTGGAAATATTGCCCAAAGGATTAAGAAAACTAATCAGTATCCGTTCTTTGGAGTTTAGTACAAAGCAAACTATTTTGCCTGTGAATGAGATCGCCCAATTGGGGTCGCTTGAATTCTTGAGCATTGAATCATGCCATAATGTGGAGTCCATCTTTGGAGGTGTGAGATTCCCTTCTCTTAAAACATTATGCGTTGGGGATTGTCAAAGTCTAAAGTCATTGTCTCTGGATGGTCAAAATTTTCCTGAATTAGAAACATTGCTTGTTAAGGACTGCGGTAACTTAGACTTGGAACTGTGTAAGGGCCACCATAAAGAAGAAAGCCCGAAGCTGAAGCTAAAACTTGTATTATTTTTCGGTTTATCACAGATGGTGGCCCTGCCTAAATGGCTTCAGGAAGCTAGCAAATCCTTGCAGCGCTTGTATGTTTTAAATTGTGACAATATCGAAACACTTCCAGATTGGTTAACAACTCTGACTGATCTCAAAGCACTTGGTTTAATAAATTGTCCAAATCTGGTATCTCTGGCAGATAACATTCATCACCACACTGCACTTGAAAGTTTGAGGATTGAAGGTTGTGCTAACTTATATAAAAAGTATGAACCCAATGTTGGAGAGTTTTGGCCCAAAATATCACACATCAAAAACATTGTGATTGATGAACCAGAAGAACTTAAGAAGAATTAG