Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20407 LG5 22600340 22602060 PREDICTED: disease resistance protein RGA2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 22600450 synonymous_variant p.Gly37Gly
A/T 22600451 missense_variant p.Ile38Phe
T/C 22600669 intron_variant
G/T 22600957 intron_variant
A/G 22600985 intron_variant
C/T 22601359 synonymous_variant p.Val213Val
A/G 22601450 missense_variant p.Lys244Glu
G/A 22601483 missense_variant p.Gly255Arg
A/C 22601492 missense_variant p.Met258Leu
T/C 22601571 missense_variant p.Ile284Thr
A/C 22601629 missense_variant p.Glu303Asp
G/A 22601654 missense_variant p.Val312Ile
T/A 22601663 missense_variant p.Phe315Ile
T/A 22601749 missense_variant p.Phe343Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20407.1
MAEYFVFDIAESLVRKLASFVCEEASRVYEVYDDVKGIKDTLSIVKGVLLDAEQKKEQRHGLREWIRQIQTVCLDAQDVLDGLDCQNVRKQFLKASGSTRMKMWVCISDDFDIRQILINIINSASVSASATTTAIAHQENIKNFDIEQLQTVLKLKLSGQKYLLVLDDIWNDNRAKWTELKDLIKVGAVGSKILVTTRSNSISSMMGTVPSYVLEGLSMENCYALFNKWAFKEGEEKEYSNLVKIGKEIVKKCRGVPMAVRTLGSSLFLVFDLERWEFVRDHEIWNIKQNKDDILPALKLSYEQMPSCLRHVFAFFSLYPKDYGFCSAEILILWESLGLLQSFGGNRKLENVARQYIDELHARSFLEDFEDFGYYYYFKVHDLVHDLALFVAKEELLMSENYFISLKRNWHRK*


CDS Sequence:
>Vu_20407.1
ATGGCTGAATATTTTGTCTTTGATATTGCTGAATCACTGGTAAGGAAGCTTGCTTCTTTTGTTTGTGAAGAAGCTTCTCGTGTCTATGAAGTGTACGATGATGTCAAAGGGATCAAAGATACTCTGTCAATTGTGAAAGGTGTGCTTTTGGATGCAGAGCAAAAGAAGGAGCAGAGGCATGGGTTGCGTGAATGGATCAGACAGATTCAGACTGTATGCTTGGATGCTCAAGATGTGTTGGATGGACTTGACTGCCAAAACGTCAGAAAGCAATTTCTCAAAGCTTCGGGCAGCACAAGGATGAAGATGTGGGTGTGTATCTCTGATGACTTTGACATAAGGCAGATACTGATTAATATCATCAACTCTGCTTCTGTTTCAGCTTCGGCCACAACTACTGCTATTGCTCACCAAGAAAACATTAAAAACTTTGATATTGAGCAGCTACAAACTGTTCTTAAACTGAAGCTTTCTGGTCAGAAGTATTTGCTAGTCTTGGACGATATTTGGAATGATAATCGTGCAAAATGGACAGAGTTGAAAGATTTAATTAAAGTGGGTGCAGTTGGAAGCAAAATCTTGGTGACAACACGAAGTAACTCAATTTCTTCAATGATGGGCACTGTTCCCTCGTATGTCTTGGAAGGTCTTTCCATGGAGAATTGTTATGCTCTGTTTAACAAATGGGCATTTAAGGAAGGCGAAGAAAAAGAATATTCAAATCTAGTAAAGATTGGAAAAGAAATTGTGAAAAAATGTAGAGGGGTTCCAATGGCAGTGCGAACATTAGGAAGTTCTCTGTTCCTAGTTTTTGATTTAGAGAGGTGGGAATTTGTAAGAGACCATGAAATATGGAACATAAAACAAAACAAAGATGACATTTTACCCGCTCTTAAGTTGAGCTATGAACAAATGCCTTCTTGTTTAAGGCACGTTTTTGCGTTCTTTTCTCTTTATCCTAAAGATTATGGCTTTTGTAGTGCTGAGATTCTTATTCTTTGGGAGTCTCTTGGATTACTTCAATCTTTTGGTGGAAATCGAAAGCTTGAGAATGTTGCAAGGCAATATATTGATGAGTTACATGCAAGATCGTTTCTTGAGGATTTTGAGGACTTCGGGTACTATTACTATTTCAAAGTACATGATTTGGTACACGATCTTGCTCTGTTTGTTGCGAAAGAGGAGCTTCTAATGAGTGAGAACTATTTTATTTCCCTTAAAAGGAACTGGCATAGAAAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_20407::LG5:22598340-22600340(+)
TTGTTTCACCATACATGGGACCGGTCCCCACGAGTCCAACATCAATACATGTATCTGGATGGTCGCAGTTTAAAGTTGATATGATTATTTCTGTATTGCTTGATTTATATTAGGAATGTGATATTAATATTTTAAAATGTATGAATGTTTCTTTGCTACTTTAGCTTATACCCTTCTATCTTTGTCTGTTCATGTGTGTTTTTGTTTTGTCTTTTGCAATGATCACCTTAATAGTGTGAGCTTAGGACATGTCTCTGGTGAGCAGGAGCTAGTTGGTGGCAGAGCTAAAGCTTAAAGTAGGACGTTTCATCGCTTCTATTTTGTTTTGTAAACTTTATATTACGTTTTTTGTTGTAGTATATCTCCTTATAGTGTAGGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTTTGTTATTATATATTATTTTGGATAATTATAATAGTAATTTATATGTTTTTCTCCTAATCAACTATTTTGTTTCATTAAAAATGTGATATATTTACAGTAGTTGAACATTATGAAAATTAAAATGTTACAAATAAACTCTATGAGTGAAAAAGATAAAAAAAGGTGACAAAAGAAGAAAAAGGAAAATAGTGGAGGAGAAAAGAATGAGAAAGAGTAAAAGAATGATGGAAAGTGGTGGATGGTAAAAGACAGTGGAAGGAGAAAGAAAAATACAATAGAAAAAAAGAGTAGAAACTGATACTGTATTACCTTTTAACCCGAGTTAAATAAAAGGAATTAATCCTTTTAAATAAAATGAAAAAAAAATTAAAAAGAAAATAGAAGAACATTGAATAAAGTCCACTGAGGTTAAAATACTAATTATAACAATTTATGAATTAATTATATTCTTTAATAATCAAATTGATATTATATTATAATATTTATGTGTAATCTTTTAATTGAAGTTATAGAAGATGTAATTGTCATTCTCTTTAGTCACTCATGTATTAAATAAGAGTTTTCTTTTTTCCTAACTAAATTGAACCCAAACTGCATTTAAGTTTTGATAGAGAGGAGTAGTAATGCACTATTTAACATACTTTCTATTTCTCATTTCGTAAGTCATTAAATATTAGAAAATAGAAAATAAAACATTGAATCAAGAGTTTATATCATAAGACGAAAATAATTTTGGAAATTTTTTTCCGCAAAACTAAAACTATTTTTATAAATATACAATAAATTAATTGAATAATAAATTAGTAAATATAAAACACAATAAAACGCAGCGTATGGTTTAATAGAGATGCAAAGTTTGTACACGAAGAAGAAAATTCAAACAAACTGTCACCGCTCACTCTATATGTCTACATGCATACTATGTGCTAATACAAAATAATACCTTATACTTAAGATGAATAATTTCTTTAAAAATAATCAAATTAAGTATATCTTGAATCTAACACATTTTCAGTACTATATAACACACACACACACAAAATAAAAAATCTTACTAATTAATAATTCTTTAATCTTGAATAACAAATTACTTGCTCCTTAAGTCCAATTTTTCCATGTTATAATTTTGCCAGAATATTAAATCACAAGAAATCTTTTTTCTCATAAAACTGGATTTACAACAGTTGTTATGAATTCAGCCAGAATTGAACCACAATCAATAACGGAAGTTATTTGAATTAATCTTCATGTCATCAATGGATCCATCGCCATCAAATAATACATATAACATGAGAAATGGGTTGAGGAGTAAGCAGAGTGATGAGGTATATTAAAGTCTTTTATGACTCTGACTTCAAATTTAACACAAAATTTCTCATAACACGTGTACCACAAAATTTGCTTGTTTATTTTTGTCCGTCACATATATCAAACATACTTGCTTGTTTCCATTCAAAACAGTATAGACTTGACGATGGAAAACAAGCATGTATGAATAGGGACCAAACCATTCCCCAAACCACAAACTTGCATCTTAACTCTGTTTCTGCTCTTTCGTCAACA


Gene Sequence:
>Vu_20407(+)
ATGGCTGAATATTTTGTCTTTGATATTGCTGAATCACTGGTAAGGAAGCTTGCTTCTTTTGTTTGTGAAGAAGCTTCTCGTGTCTATGAAGTGTACGATGATGTCAAAGGGATCAAAGATACTCTGTCAATTGTGAAAGGTGTGCTTTTGGATGCAGAGCAAAAGAAGGAGCAGAGGCATGGGTTGCGTGAATGGATCAGACAGATTCAGACTGTATGCTTGGATGCTCAAGATGTGTTGGATGGACTTGACTGCCAAAACGTCAGAAAGCAATTTCTCAAAGCTTCGGGCAGCACAAGGATGAAGGTAGGACACTTCTTTTCTCCATCTAATTCTCTTGTTTTCCGTTTTCAGATGGCTCGGCAAATAAAAAACATTAGGCGTAGATTGGATAAGATAGCAGCAGATGGGAACAAGTTTGGTCTTGAGAGGATTGAGGTTGACAGCAGACTTGTGCAAAGGAGAGAAATGACTTATTCCCATGTTGATGCTTCGGGGGTGATTGGAAGGGAGAGTGATAGGGAAGAAGTTATCAAGCTTTTGATGCAACCTCACCCTCATGGTGATGGTTATGGAGATCAAAGTGTTTGTGTTATTCCCATAGTGGGTATTGGAGGGATGGGGAAGACCACACTTGCAAAGTTGATGTTCAATGATAACAGAATGGATTATCTTTTCCAATTGAAGATGTGGGTGTGTATCTCTGATGACTTTGACATAAGGCAGATACTGATTAATATCATCAACTCTGCTTCTGTTTCAGCTTCGGCCACAACTACTGCTATTGCTCACCAAGAAAACATTAAAAACTTTGATATTGAGCAGCTACAAACTGTTCTTAAACTGAAGCTTTCTGGTCAGAAGTATTTGCTAGTCTTGGACGATATTTGGAATGATAATCGTGCAAAATGGACAGAGTTGAAAGATTTAATTAAAGTGGGTGCAGTTGGAAGCAAAATCTTGGTGACAACACGAAGTAACTCAATTTCTTCAATGATGGGCACTGTTCCCTCGTATGTCTTGGAAGGTCTTTCCATGGAGAATTGTTATGCTCTGTTTAACAAATGGGCATTTAAGGAAGGCGAAGAAAAAGAATATTCAAATCTAGTAAAGATTGGAAAAGAAATTGTGAAAAAATGTAGAGGGGTTCCAATGGCAGTGCGAACATTAGGAAGTTCTCTGTTCCTAGTTTTTGATTTAGAGAGGTGGGAATTTGTAAGAGACCATGAAATATGGAACATAAAACAAAACAAAGATGACATTTTACCCGCTCTTAAGTTGAGCTATGAACAAATGCCTTCTTGTTTAAGGCACGTTTTTGCGTTCTTTTCTCTTTATCCTAAAGATTATGGCTTTTGTAGTGCTGAGATTCTTATTCTTTGGGAGTCTCTTGGATTACTTCAATCTTTTGGTGGAAATCGAAAGCTTGAGAATGTTGCAAGGCAATATATTGATGAGTTACATGCAAGATCGTTTCTTGAGGATTTTGAGGACTTCGGGTACTATTACTATTTCAAAGTACATGATTTGGTACACGATCTTGCTCTGTTTGTTGCGAAAGAGGAGCTTCTAATGGTAAACTCCTTTACTCGTTATATTCCTGAGCAAATAAGGCATTTATCAGTTGTTGAAAATGATTCACTTAACCACGTTTTGTTCCCCAAATCCAACAGAGTGAGAACTATTTTATTTCCCTTAAAAGGAACTGGCATAGAAAGTAA