Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20405 LG5 22586956 22588933 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 22587127 synonymous_variant p.Leu330Leu
T/G 22588367 downstream_gene_variant
T/G 22588376 downstream_gene_variant
G/C 22588465 downstream_gene_variant
T/G 22588710 intron_variant
G/A 22588814 intron_variant
T/C 22588824 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20405.1
MILSMWVCISDDFDIRQYVAKEEILVVDSGTRNIPEQVRHLSVVENDSLRDALFPKSSRVRTILFPTDGVGVDSVALLDAWITRYKFLRILDLSDSSFETFPNSIAKLEHLRALSLENNRRIKRLPQSICKLQNLQVLTLRGCVELETLPKGFGMLISLRKFFITTKQSILSEDEFASLINLNILSFEFCDNLMFLFRGAQQLKSLEVLIVQSCRRLESFPFHILSKLEVLFVIRCEMLNLSLNCENPIARLRMKFLHIEECPRQQTLPQWIQGAAETLQTLFISNLYSLEMLPEWLTAMTHLKMLHIVNCPQLLYLPSDMHRLSALEDLTIDGCSELCRKCEPQSGEYWSFIAHIKHLSIGETREGKLLFQMQKKIRLKLQDLQN*


CDS Sequence:
>Vu_20405.1
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Promoter Sequence:
>Vu_20405::LG5:22588933-22590933(-)
GGTAGTTGGTGGTTGAAAAAGAGAGGAGTATTTGTGGAGGAGGGCTTGAAGGTGGGGGTGATCAGAGGTGGGAGTATGTGTAATAGTGGTGGCGGGGGAAGGATGGGGTGTGGTTGTGGTGGCAGAGTAAGAGTGGAAGGATGATGAGTATGTAGGCTCGAGTGTGAGTTGGAAAAGAGCCTCAATACTATTTGTTTGTTGCAGTCTCCGTAATTGGTGGACAGAAATTGGGCTCGGAGTTGGGCCGGTTTCTCCTTTCAGTTCCACTAATTGACCTTCCCACATGAATCTCATAAAAGGGCCATTGTAGTCCATCACAAATGGGCTTACTTGAGTCAACCAATGAACCCCTAATACAATGTCAGTACCAGACAATTCTAATGGATACAAATCAATGGAGAATTTTAAAGAGGCCAAATGAAGTTGGGCCTTGGGACAAAAAGTTGAGCAGGGGAGAAAATCACCGTTACCGACCATTACTCTCAAAGGAGTCGAAGTGGGCTCATTCTGGAGCTGAAGGAAATGAGCCACCCTACTTTGTATGAAATTGTGTGTAGCTCCACTATCCACCAAAACTTGGACTTTGTACCCGTTAATGGATCCCGTCAGACGTAGGGTGCGAGGAGCCCATTGACCCGAGAGTGCATGTAGACTAATGAGGCCTGATTCAGGAGAAGGGTCATCTATAACCCGTGGATCCGAGTCTGTTGGTGTATCTGGGTCATCGTCTGGTTCGGTTGAGACTAGAAGGAGAAATTGAGACTTACAACGATGCCCACGCGTATACTGTTCATCGCAGTTGTAGCATAAATTCTTCTCTCTCCTTGCCTGCATTTCTGTCTCTGTTAATCTTTTGATGGGTAGTTTATTGGGGGGTGTGGGTAAGAGTGGTGGTAGTGGTTTTGGGGAGGTAAGTGGTGGTGTGTTGGTTGATGGAGATGGACGGGAAAAACGATTGAATGGGGGGTTGCTAGAGTGTTTGTCCTCATGCAGCTTGGCAAACGCAATAGCTTGGTTCAGGTCTGACGGTTGGAGGACCGTGACCTCTCGACGAAGGTGGGGTTTGAGGCCCGAGATAAAACAACTCAGATAAAAGCTGGTGGGGTAACCAGAGATCCTATTAGAGAGTTTCTCAAACTCAGAGAGGTAGTCTTGCAATGAGTGTGTTTGAGAAAGCTTGCACAGGGTTGCGATAGGATCGTCAAATTTTGACGGAGCAAATCGGAGTTCGAGCGCTCGGAGGAAAGAGTCCCACGAGGTGAGTAACCCGTTGTTGTGCATCCACTGAAACCAGGAAAGGGCTTTTCCTTCAAGAGAAAAGGAAGCGAGCTGAATGCGTTGTTCCAGGGGAGTTTGGTGGAAGGCGAAGAACTGATTGGCTTTGAAGATCCAACCAAGGGAATCCGTTCCATCAAAGGGCGGAAGGTCCATTTTCATCGATCGGTAAGGGGTATTGAGAGGTTTAGGGTTGAGTGAGAGTTGGTTCTCAAGGTGGGATGTACGATTGTCAATGTCCATGAGGGTGTTGGAAAAATTGGCTTGGGCTAGTAATATTTGTTCTAATTTGCGGTCAAGGGAGGTGAATGGGTCAGGTGAGTCGGCCATGGATGGAGGAAGTAAGACTCAACGAAAGCACCAATTATAAGGGGAAAAAACAGAGAATAGAATAATCTGGAAGAATACAGGACAGAGAAGGAGAAATTCAGAAGAGACACGTAATAATTCTTTTTTTTTTTCCCAACATAACAGAAAGGTGCTTTATATAAGCACTACTCCTTACAGCTAATATTCCTTCACATGGTATAACGGTTTCTCCTAAAAGGGAGACACGTCACTTAGTAACAAAATCCCTAAGATAAATTGGCTGACGCACAATCCTCTTAGGTCGATCAATAGAAGCCTCTGGAGTATTGGTTGGGCCGTGTTCAGCTTCTGCAGTAGTACTTGGGCTACCCTCACCTTGTGCACAGTCAATAGGATTAGAGTACTGTAAGGGCCCA


Gene Sequence:
>Vu_20405(-)
ATGATTCTTTCAATGTGGGTGTGTATCTCTGATGACTTTGACATAAGGCAGGTACTTATTAAAATCATCAACTCTGCTTCTGCTTCAGCTCCAACTATTGCTCATGCTCACCAAGAAAACATCAAAAACTTTGATATTGAGCAGCTACAAAGTCGTCTTAGACACAGGCTTTCTGGTCAGAAATATTTGCTAGTATTGGATGACGTATGGAATGATAATCGTGAAAAATGGACACAGTTGAAAGATTTAATTAAAGTGGGTGCAGTAGGAAGCAAAATCTTGGTGACAACACGTAGTAACTCAATTGCTTCAATGATGGGAACTGTTCCCTCGTACGTTTTGGAAGGTCTTTCACTGGAGAATTGTTATGCTCTGTTTAACAAATGGGCATTTAAGGAAGGCGAAGAAAAAAAATATTCAAATCTAGTAGAGATTGGAAAAGAAATTGTGAAAAAATGTAGAGGGGTGCCACTAGCCGTGCGAACTTTAGGAAGTTCTCTGTTCTTAAATTTTAATTTAGAAAGGTGGGAATTTGTAAGAGACCATGGCATCTAGGAACTTAAAACAAGAAAAAGATGACATTTTACCTGCTCTTAAGTTGAGTTATGACCAAATGCCTTCCTATTTGAGGCACTGTTTTGCTTTCTTTTCTCTTTACCCAAAAGATTATGGCTTTACTGGTGCTGAAGTTGTTAATCTTTGGATGTCACTCGGGTTACTTCGATCTGAGGTTGGAAGTCAAAAGCTAGAGAATGCTGCAAGACTGTATATAGACGAGTTACATTCGAGATCATTTCTTGAGGATTTTGAGGACTTTGGCAACATTTACTATTTCAAAGTGCATGATTTGGTACATGATCTTGCCCAGTATGTTGCAAAAGAAGAGATTCTTGTGGTAGACTCAGGCACCCGGAATATACCCGAGCAAGTAAGGCATTTATCAGTTGTTGAAAATGATTCACTAAGGGATGCTTTGTTTCCCAAGTCCAGTAGAGTGAGAACCATATTATTTCCGACAGATGGAGTTGGTGTTGACAGTGTAGCTCTTTTGGATGCATGGATAACAAGATACAAATTCTTGCGTATTTTAGATTTAAGTGATTCCTCTTTTGAGACATTTCCCAATTCAATTGCTAAACTGGAGCATCTGCGAGCTCTCAGTCTTGAAAATAACCGAAGAATAAAAAGACTTCCTCAATCCATATGCAAACTCCAAAATTTGCAAGTTTTGACTTTGAGAGGATGTGTGGAGCTTGAAACATTGCCTAAAGGATTCGGGATGTTAATCAGCCTTCGAAAATTTTTTATCACCACAAAACAGTCTATTCTGTCAGAGGATGAATTTGCAAGCTTGATCAATCTTAATATTTTGAGTTTTGAATTTTGTGACAATTTGATGTTTCTGTTCCGAGGGGCACAACAACTCAAATCCCTTGAAGTTTTGATTGTTCAATCATGTAGGCGTCTAGAGTCCTTTCCATTTCATATTCTCTCTAAACTGGAGGTTCTATTTGTCATAAGGTGTGAGATGCTAAATCTGTCCTTGAACTGTGAAAACCCCATCGCGAGATTGAGGATGAAGTTTCTGCATATTGAGGAATGTCCAAGGCAACAGACATTGCCTCAATGGATTCAAGGAGCTGCAGAAACTTTGCAGACGTTGTTTATTTCAAATTTGTATAGTCTTGAGATGCTTCCTGAGTGGCTTACAGCAATGACTCATCTTAAGATGCTCCATATTGTTAACTGTCCTCAGCTGTTGTATCTCCCGAGTGACATGCATCGCCTCAGTGCCCTTGAAGATTTGACCATAGATGGCTGTTCTGAATTGTGTCGAAAATGTGAACCACAATCTGGTGAGTACTGGTCTTTCATTGCTCACATCAAACACCTTTCCATTGGAGAAACAAGAGAAGGGAAACTCCTCTTCCAAATGCAGAAGAAGATTCGATTGAAATTGCAGGATTTGCAGAATTAA