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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20389 LG5 22313930 22316695 putative wall-associated receptor kinase-like 16
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C,* 22313981 missense_variant p.Met18Leu
T/A 22314853 intron_variant
A/T 22314915 intron_variant
G/A 22314926 intron_variant
T/A 22314927 intron_variant
C/T 22314957 intron_variant
A/G 22315283 missense_variant p.Ile318Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20389.1
MELKVVTEMQVSLLLLLMMIALARTATAADDQALPGCPNKCGDVSIPYPFGVGVSNITGKNCSFQTDLKLNCTDSTLYVYNIPVLNITLLGQLEMSFLVSSICKVNISNGVTEADIVILNSPSFTISSTENKFMSIGCDTYGLLNSYVNQSTYSTTGCLTLCGDNLENLENMQTNDGKCAGRGCCQVDIPPAMKNIAIQTNTFNNFSNSSDSNSCSVSFVVKKGGYNFSMDHLNRVPFDMTPMIVDWSVGDAPCNVSKDKANYACKSDYSVCEDPPSAGGNGYLCKCKPGFEGNPYFPQGCTDFPDCKRGKHNCARAEYCHETPGSFECLCPDGMIGNATNEGGGCQPKQRADAFTKIVIGAGVGLIALFVGVSWLYLMLQKRRVLKLKEKFFQQNGGIILTQKLSTRRDSSQSTTIFSAEQLNKATNNFDENLIIGKGGYGTVFKGVLSNNQVVAIKKSKIVDVSQVEQFINEVIILSQINHRNVVKLLGCCLETEVPLLVYEFVKNGTLFDYLHKQSQVGNVSWKTRLRIGAEAAGALSYLHSAASIPIIHRDVKTANILLDDNNTAKVSDFGASRLVPQDQTEIATIVQGTFGYLDPEYMQSGQLTEKSDVYSFGVVLVELLTGEEPFSFQRAEDKRSLTFHFVCSLEEDHLFDVLQIGVEDEENKHEIMQVAILAARCLKLRGEERPSMKEVAMELEGIRLMDKHPWTNTSQNFEERQYLLSEAPSIREPGDSSGQQNAGYDSLKELQLIDFGDGR*


CDS Sequence:
>Vu_20389.1
ATGGAATTGAAGGTGGTGACAGAGATGCAAGTGAGCCTCCTGCTGCTGCTGATGATGATTGCGTTAGCAAGAACAGCTACTGCAGCAGATGACCAAGCCCTGCCCGGCTGCCCCAACAAGTGCGGAGATGTTTCAATTCCATACCCCTTTGGCGTAGGTGTGTCAAATATCACCGGAAAAAACTGTTCCTTTCAGACAGACTTGAAACTCAACTGCACAGACTCCACTCTATACGTATATAACATCCCAGTTCTGAACATAACCCTCCTAGGTCAATTGGAGATGAGTTTCTTGGTCTCCTCTATCTGCAAAGTCAACATTTCTAACGGAGTAACAGAAGCCGACATAGTCATACTCAATAGTCCATCCTTCACCATTTCCAGCACGGAAAACAAGTTCATGAGTATAGGCTGCGACACGTACGGGCTTCTAAACAGTTACGTCAACCAATCTACATACTCGACAACAGGGTGCTTGACATTATGTGGCGACAATCTAGAAAATTTGGAAAACATGCAGACGAATGATGGGAAATGTGCAGGCAGAGGCTGCTGCCAGGTGGATATACCGCCTGCAATGAAGAACATCGCTATACAAACAAATACATTTAATAATTTCAGTAACTCTTCCGATTCCAACAGCTGCAGCGTTTCGTTTGTGGTGAAAAAGGGCGGCTACAACTTCTCCATGGATCATTTGAACCGCGTCCCATTCGATATGACTCCCATGATTGTTGATTGGAGTGTTGGAGATGCTCCCTGTAACGTTTCCAAGGATAAAGCCAACTATGCGTGCAAAAGTGATTATAGCGTTTGCGAGGACCCACCCTCCGCCGGTGGAAATGGCTACCTATGCAAATGTAAACCAGGTTTTGAGGGCAATCCTTACTTTCCCCAAGGTTGCACAGACTTTCCAGATTGTAAAAGGGGCAAACACAACTGCGCAAGAGCAGAATATTGTCATGAAACTCCTGGCTCTTTTGAATGTTTATGTCCTGATGGAATGATCGGAAATGCAACAAACGAAGGTGGAGGATGCCAGCCAAAGCAGCGGGCTGATGCATTTACAAAGATCGTCATTGGAGCAGGTGTAGGATTAATTGCTCTCTTTGTGGGAGTTTCTTGGCTGTACTTGATGCTCCAGAAAAGGAGAGTCCTCAAACTAAAAGAAAAGTTCTTTCAGCAAAATGGGGGCATAATTCTAACACAGAAACTCTCTACTAGAAGAGACTCGTCTCAATCCACCACAATTTTCAGTGCCGAGCAACTCAATAAAGCCACCAACAATTTTGATGAGAATTTGATCATCGGCAAAGGAGGTTATGGAACAGTTTTCAAAGGAGTTCTCTCAAATAATCAAGTTGTCGCTATCAAGAAGTCCAAAATAGTGGACGTGAGCCAGGTGGAGCAATTCATCAACGAGGTCATTATACTGTCACAGATTAATCACAGGAACGTGGTCAAACTCCTAGGTTGTTGTCTAGAGACAGAAGTTCCTTTATTGGTGTATGAATTTGTTAAAAATGGCACCCTTTTTGATTATTTGCATAAACAAAGCCAAGTGGGTAATGTATCTTGGAAAACGCGTCTAAGGATTGGCGCTGAAGCAGCTGGAGCTTTGTCATATCTACACTCAGCAGCTAGCATACCCATCATCCATAGGGATGTGAAAACTGCCAACATACTCTTGGATGACAATAACACTGCCAAAGTTTCTGACTTTGGAGCTTCGCGATTGGTTCCGCAAGACCAAACTGAAATAGCCACAATTGTGCAAGGAACCTTTGGGTATTTAGACCCAGAGTACATGCAATCAGGCCAATTGACTGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTAGTGCTTGTAGAACTGCTAACTGGGGAGGAGCCTTTCTCTTTTCAAAGGGCAGAAGATAAACGAAGTCTCACATTTCACTTTGTATGTAGCTTGGAAGAGGATCATCTATTTGATGTTCTTCAGATTGGTGTTGAGGATGAAGAAAATAAACACGAGATCATGCAGGTTGCTATTCTTGCTGCCAGGTGCTTGAAACTTAGAGGGGAGGAAAGGCCTAGCATGAAGGAAGTGGCAATGGAATTGGAGGGAATAAGGCTTATGGACAAACATCCTTGGACCAATACAAGCCAAAATTTTGAGGAGAGACAATACTTGCTTTCTGAGGCACCAAGCATTCGTGAACCTGGTGACAGTAGTGGCCAACAGAATGCTGGATATGATAGCCTGAAGGAACTTCAATTAATTGACTTTGGTGATGGAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_20389::LG5:22311930-22313930(+)
ATTCTTTGAATTAAGTATACAATAAATAATAAAATTTTGACTTTAATTCTTTGAAAAAATAATATATTTATATTTTGTTCTTATTATTGTTACTCATTTTGATTGCTTCCCTCTATCTCTCACACTACGAATAATCAGTTTATATTCAAAATAACTTTGGAAAAGTTATTTCTTATATTCATTTTTTGTGTTTTTGAAATATAATAGTCACCGATTAATTAATTATCATAATCATAAAAAATAAATATTTTAAAAGTATTCATAATTTCTTAAAAGTAACTTAATTGCTCTTATTTATTTTTACGGTAATTATTTACTGTCAAAATTTCATTAAAATACATATAAAGACAAATGAATAATTTTAAATATTAATTAAATGGTTTTAAGTCTTGGTCAAGCTATAACATGTAGCTGATGTACGACTATCCCGGTGTGAATAAAACGAAGTGTAACATCGATCATTAATTTTTTTTTTAAGTTAGTCTAAATTAATCTATTATTTCAAAGCTACTTTAAATTTTATTTTTTAAAAGCTATACTTTAAATTTTCTAACTTTAATATTTATTTATGTATTTTCATATTTTTCCCCTTTATTATCATAATTAACTTTTTATTTTGATATTAATTAAATTTAACCTACAATTAATATTAATTTCAATTTTAAAAATAATAAATTAAAAAAATTAGACATTTAAAAATAATATGAATAAAAGATTAGAAAAGCATAAAGAAATCTTAGGATAAGAATATGGCAGTAGAAACCTTCTTCTTTCAAATGATAAATTTAAGAGAGAGAGAGTAAGTAAATGAAATTGAAAAAAAAATTGTATTGTTTTAAGGAATGAAGAGATGAAAGTGAAAAAAATTTGAAAATAAAGTTTTAGAATAATTTGATAGATGTAATAAATAAAAAATTGTTTTAATATATAAACTTGTTAGATTATAGTTTTACCTCTATGATTAAAATTATATAAATAAAATGTAATTATTATTAGTTTTAGTATTATTAATATTATTATTATAATAACTATTATTATCAATAATGTTATTACTAATATAATTAACATCACTAATATTATTATTATTAATTATCCACGAGCTAAATTGGAATTTAAAGGAAAATGATGACATTTGAGTAAAAGCATAAGTGATAGGTTGAAATTTAAAGAAAACTGATGAACATTTAAGTAAAACATAAGTGTTGAGCTGATTAAAATATTTTATTCCCCTTAAATTTATTTGCCAAATCAGCTGTGACCTTGCCAAAATTTTTTAAATTTTAAAACCACGAGGTCAACCAGTTTGAAATTATTCAAGAAATTTCATAAACATATTTAAAGGAGTGAGAAAAATATGAAAAAAGAATCAATTTCCAAGTTAATACGTAAACTAAAAGTTAGACCTTAAAACACTAAAATAATTTTTTATTTTCTAATACATAGTCGATATGTTTTTCTAGGTATTCAATAATTTTTTTTAAATAAAGTATACATAATAAATGATAAAATTTTGATTTAAGTCTTTGAAAAAAATAATATATTCATATATTTTGTTCTAATTATTACCAGTCATATTTATTAAAAGGTATTCAAAATTTCTTAAAATAACTTAATTCCTCGTATTTATTTTCTACAGACGTGTCTGTAAATATTGCCTTCCAAAATTTCATTAAAAAAAATAATATTAGTTAAAAGGTTGTAAGTCTTGGTCAAGCTAACGAGTAAAATTACGTGTGACATGTTTTTCAAAGTTACTAATTTGACTGTTTTGTTGTTTTTGAAGTTCCTAATTCTAATATGAGCATGAAAAGTACGAGTGATGAGATAATAACAACATATGAAGAGTTGTCTGACTGAGTCACATAAACTTTGTACAACCAAACAAAACATTCTGATTCCAAACTGAACCGTTGTTGAAAACAGCGGCATTTTAGTTACTATAAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGCAAAGACTTTAGCTTATAGCTTACTATACAA


Gene Sequence:
>Vu_20389(+)
ATGGAATTGAAGGTGGTGACAGAGATGCAAGTGAGCCTCCTGCTGCTGCTGATGATGATTGCGTTAGCAAGAACAGCTACTGCAGCAGATGACCAAGCCCTGCCCGGCTGCCCCAACAAGTGCGGAGATGTTTCAATTCCATACCCCTTTGGCGTAGGTGTGTCAAATATCACCGGAAAAAACTGTTCCTTTCAGACAGACTTGAAACTCAACTGCACAGACTCCACTCTATACGTATATAACATCCCAGTTCTGAACATAACCCTCCTAGGTCAATTGGAGATGAGTTTCTTGGTCTCCTCTATCTGCAAAGTCAACATTTCTAACGGAGTAACAGAAGCCGACATAGTCATACTCAATAGTCCATCCTTCACCATTTCCAGCACGGAAAACAAGTTCATGAGTATAGGCTGCGACACGTACGGGCTTCTAAACAGTTACGTCAACCAATCTACATACTCGACAACAGGGTGCTTGACATTATGTGGCGACAATCTAGAAAATTTGGAAAACATGCAGACGAATGATGGGAAATGTGCAGGCAGAGGCTGCTGCCAGGTGGATATACCGCCTGCAATGAAGAACATCGCTATACAAACAAATACATTTAATAATTTCAGTAACTCTTCCGATTCCAACAGCTGCAGCGTTTCGTTTGTGGTGAAAAAGGGCGGCTACAACTTCTCCATGGATCATTTGAACCGCGTCCCATTCGATATGACTCCCATGATTGTTGATTGGAGTGTTGGAGATGCTCCCTGTAACGTTTCCAAGGATAAAGCCAACTATGCGTGCAAAAGTGATTATAGCGTTTGCGAGGACCCACCCTCCGCCGGTGGAAATGGCTACCTATGCAAATGTAAACCAGGTTTTGAGGGCAATCCTTACTTTCCCCAAGGTTGCACAGGTAAATTATTTAATTATGCTGCCAAAACATTAACATTCTTTTTTCCACTTCTCAAAATTTACTAATATATATATATATATTTTCTTGCTGTAGTTCTCTTTTAGAAAAATATCTTTTTAACAATTTTTTTTATTTTTTTGATATTTTTTTAACTTTTTTAATATTTTTTTAACAACAACTTATCTGATAATACATTAGTCCGTTTCAAATATATAAACTAATAAAACAATTAAGTATCATTTCTTATCAAAAAATTATTAAAAAAAGTTAGTTAAAATATCGTCTCATTACATTTATAAGAACAGAAAACTGGTAGATAGAAGTAAAACTATGTGTTAATATATTATATTTCAGTTTTCTCATTTTACGAAATGATTATTTCTGTTTGGCCTTTGTGTAGACTTTCCAGATTGTAAAAGGGGCAAACACAACTGCGCAAGAGCAGAATATTGTCATGAAACTCCTGGCTCTTTTGAATGTTTATGTCCTGATGGAATGATCGGAAATGCAACAAACGAAGGTGGAGGATGCCAGCCAAAGCAGCGGGCTGATGCATTTACAAAGATCGTCATTGGTGAGCATATCATTACGACCATTAGAGTTTTGTTTTTCTTCCCTTTTGGCAAGACACTAAATTTGAGTTTATTTTGATAACAGGAGCAGGTGTAGGATTAATTGCTCTCTTTGTGGGAGTTTCTTGGCTGTACTTGATGCTCCAGAAAAGGAGAGTCCTCAAACTAAAAGAAAAGTTCTTTCAGCAAAATGGGGGCATAATTCTAACACAGAAACTCTCTACTAGAAGAGACTCGTCTCAATCCACCACAATTTTCAGTGCCGAGCAACTCAATAAAGCCACCAACAATTTTGATGAGAATTTGATCATCGGCAAAGGAGGTTATGGAACAGTTTTCAAAGGAGTTCTCTCAAATAATCAAGTTGTCGCTATCAAGAAGTCCAAAATAGTGGACGTGAGCCAGGTGGAGCAATTCATCAACGAGGTCATTATACTGTCACAGATTAATCACAGGAACGTGGTCAAACTCCTAGGTTGTTGTCTAGAGACAGAAGTTCCTTTATTGGTGTATGAATTTGTTAAAAATGGCACCCTTTTTGATTATTTGCATAAACAAAGCCAAGTGGGTAATGTATCTTGGAAAACGCGTCTAAGGATTGGCGCTGAAGCAGCTGGAGCTTTGTCATATCTACACTCAGCAGCTAGCATACCCATCATCCATAGGGATGTGAAAACTGCCAACATACTCTTGGATGACAATAACACTGCCAAAGTTTCTGACTTTGGAGCTTCGCGATTGGTTCCGCAAGACCAAACTGAAATAGCCACAATTGTGCAAGGAACCTTTGGGTATTTAGACCCAGAGTACATGCAATCAGGCCAATTGACTGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTAGTGCTTGTAGAACTGCTAACTGGGGAGGAGCCTTTCTCTTTTCAAAGGGCAGAAGATAAACGAAGTCTCACATTTCACTTTGTATGTAGCTTGGAAGAGGATCATCTATTTGATGTTCTTCAGATTGGTGTTGAGGATGAAGAAAATAAACACGAGATCATGCAGGTTGCTATTCTTGCTGCCAGGTGCTTGAAACTTAGAGGGGAGGAAAGGCCTAGCATGAAGGAAGTGGCAATGGAATTGGAGGGAATAAGGCTTATGGACAAACATCCTTGGACCAATACAAGCCAAAATTTTGAGGAGAGACAATACTTGCTTTCTGAGGCACCAAGCATTCGTGAACCTGGTGACAGTAGTGGCCAACAGAATGCTGGATATGATAGCCTGAAGGAACTTCAATTAATTGACTTTGGTGATGGAAGATGA

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