Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20184 LG5 19294478 19296846 PREDICTED: cyclic dof factor 2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 19294934 intron_variant
A/C 19295626 missense_variant p.Lys66Gln
A/T 19295633 missense_variant p.Glu68Val
G/T 19295784 missense_variant p.Lys118Asn
G/C 19296738 missense_variant p.Lys436Asn
T/A 19296744 synonymous_variant p.Ile438Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20184.1
MSQTEKDPGIRLFGRKIPVPECQIPANSGPTDALSSIKKEEELGRPSECGENSEKQEKSSDSRDSKQELEHKVQENEPIVNPKPAEDNTENGGSDQDKVLKKPDKILRCPRCNSLDTKFCYFNNYNVNQPRHFCKNCQRYWTAGGTMRNVPIGAGRRKNKHLASQYRHIIVSSNGIPASRLETEEASGFQHVTNLESSVPFRSSADSSTVLKFGPDTTLCESMDSMLNLRDERRCVDASSINRAEYVGEPSLCGSSVTNNSTQGNELSEHKTSNWLQCYPVPPWVLTYPGWNNVSSVEAVHQSSAPMCSPYNTGPAAMQWCPTAMVAIPGMCPPSIPFQVVPPSCWSGTPHWNAGTGSVSIGSNACLSPSSSTSNSCCSGNGSPTLGKHARDTVFADEEKSEKCVLVPKTIRTDASNEASKCPIRAALSIKPDQQKKIEPKEGKDRVLGASQILEANPAAISRAHAFQESI*


CDS Sequence:
>Vu_20184.1
ATGTCTCAGACAGAGAAGGATCCGGGTATCAGGCTATTTGGCAGGAAGATTCCGGTGCCGGAATGTCAGATTCCGGCCAACTCTGGACCCACGGATGCTTTGAGCAGCATAAAAAAGGAGGAGGAACTGGGAAGACCCAGTGAATGTGGAGAAAACTCTGAAAAACAAGAAAAATCATCTGATTCAAGAGATAGTAAACAAGAGTTAGAGCATAAAGTGCAGGAAAATGAGCCAATAGTAAATCCCAAACCCGCGGAAGATAACACGGAGAATGGTGGCTCAGACCAAGATAAAGTCTTAAAGAAACCAGACAAGATTCTTCGGTGTCCACGATGTAACAGTTTGGACACCAAGTTTTGTTATTTTAACAACTACAACGTTAACCAACCTAGGCATTTCTGCAAGAACTGTCAAAGGTATTGGACTGCTGGTGGAACAATGAGAAATGTTCCCATAGGTGCTGGGAGACGGAAGAACAAACACCTAGCTTCTCAATACCGACACATTATAGTATCCTCTAATGGAATTCCTGCCTCCAGACTAGAAACTGAGGAAGCATCTGGTTTCCAACATGTCACAAATCTTGAATCCTCGGTTCCTTTCAGGTCTTCAGCAGATAGCAGCACTGTTTTGAAATTTGGGCCAGATACCACTCTTTGTGAATCAATGGATTCAATGCTTAATCTTAGAGACGAGAGAAGATGTGTTGATGCAAGTTCTATAAACCGTGCAGAGTATGTTGGGGAACCATCTTTATGTGGGTCTTCTGTGACGAACAACAGTACTCAGGGAAATGAATTATCAGAACACAAGACATCAAATTGGTTACAATGCTACCCTGTTCCTCCATGGGTGTTAACTTATCCGGGTTGGAATAATGTGAGTTCCGTGGAAGCAGTTCATCAGTCTTCAGCACCAATGTGTAGTCCATACAACACTGGTCCTGCAGCAATGCAATGGTGTCCCACAGCAATGGTGGCAATTCCTGGCATGTGTCCACCCAGCATTCCTTTTCAGGTTGTTCCACCATCATGCTGGAGTGGAACACCTCATTGGAATGCTGGAACTGGGTCAGTGTCCATAGGATCCAATGCTTGTCTTTCGCCATCGTCCTCCACCAGTAACAGTTGCTGCTCAGGCAATGGCTCCCCAACCCTTGGAAAACATGCAAGAGACACTGTTTTTGCTGATGAAGAGAAATCAGAGAAGTGTGTTTTGGTTCCAAAGACCATCAGAACCGATGCCTCTAACGAGGCCTCAAAATGTCCTATAAGGGCTGCATTAAGCATCAAGCCTGATCAACAGAAGAAAATTGAACCAAAAGAAGGCAAAGATCGTGTGTTGGGTGCCTCTCAAATCTTGGAAGCCAATCCAGCAGCTATTTCTCGTGCTCATGCATTTCAGGAGAGCATATAG


Promoter Sequence:
>Vu_20184::LG5:19292478-19294478(+)
GAATATATGAAGCCTCTAATTTCTTTTTTTTCTCTCTAGATTTTTTTTTATCTTCTCTTTTATTAATTCTACTCTTTTATTTTTTTTCTTATTTCTTATATATCCAAACCTTCCTTCAAATTCCTTTCTGATTATCACAAAAACTTGAGTTCTAATTACATATTAATTACTCATTTAAATAGAGATGATAATCTGGGATTAGTCATTTAAATGCACTAGCATGCATAAGTCGGCATAAGCCAGCTTGTCTGTCTTTTAGCTCCTTATTTATTTTTTAAAATATTTTTTATTATATAAATATAACTAAATATTTTATACATTATTTTATCAATATTATATTATTATTGATACAAATTTAATTTAATTTTATGATCTATTTTAATATATTTTCGCAATAAATTATATATTTCCTTAATTATTTATAATAAATAAATTAATCCTTAAAATTTTCTTTTAGTTATTATAAAAAATTATAAATTAAATATTTATATTTAAAATATTTAAAATTATAAATTAATTTATATTTTTTAATTTTTATTTTAATTCTATGTAACGGACGTCCACATTCACCAACTCCAATTACAAGAATTAATTAAAAATATCTTATAAAAACCACCTACATTTAAATACTCTTACTTTAATCCTAATAATTTCCAACACAACAATAGTTATTCAAAAACTACTAGAAGATGTGAAGAAAAGAAAATATAATAATAAGAAAAATAAAAAGATTTTGATATGCATAATCTCACATGATGAGAATGCGATGTATTGGCATGGTATGATAATAGTAGCAGTGAGAGGTGGGAAAAAGCCATAAACGTTGAAGGCGGCGTGAAAAGATCGTACCCATTTGCTTTGAACTTGCCAAATGAAAGCCATCACTTTTTCTCTTTTCCTTTTTCTCTTTCTCTTTCTCACGTCATCCTCACCTTTTCCCATTCCATTCTTCGCCATCATTTCCACCTTCTCCTTACTCATCTGCCACCTGTCTCCACCCCCTTTCCCCTCTTCTTCCACCCATTTTTACCAATGCTTCCACCCATGTTATGCTCAATAACACACTCCTCAATGCACCCATTTTTCATCCATGGAAGCAAATAAAAAATACACATTTTATAAAAAGACTCCATACCCTTCTTAAGCTTTCTTATAATAATCATACAACTAACCATTTCAACCAACCATACTTAAAAAGACATTAACTTTTCATGATGTTAATTTAGTAAATACCTTTTAAAGTCTTAAATATTTACTGGGTATCTCTGGTTCGAAGACACCCTGTGTACACTTTTATTTAAATAATATTTGTTGAAAGTAAAATAATTATTGTATTTATCAAGGTTCAAGATCATTTAGGAGATGATAATGGTTGTAGTCGGTTAGCATTGATTGTTATTTATGTATTCAAATATCAAGGAATAAATAATAATTGAAGAATTTTTTTTTTGTTGAAAGTAAATAAAATAAACATACTAAATTCTTACAATGAGGAAAACAAGAAACCAAGTGATACCAGAAGCATTTTATATTGTGTGGAGTAGGGTCACATGTTTGAACCCAAACGAGAAGCAAAGAGAAAAGGCGACACTTTTTTCAAAATTTAAAAAAAGGTAATCTTTTTTAAAAGAAAAAGACTTTGTATTAGAAAAAAAGAGAAAGGGAAGAGAGAAAGGTGTTTTTTTCTTTTAATTTTAATGAAAAAACATAAGAGATGGTACTGTAGAATAGTGTGTCTTTGATGCCTCACGTTGTTTGTGCTTTTTGCAGGGTGAGACTTTTTCTCCAGAGGGATTTTAGTGCAAGTGTGATGTCTGTCTACACTTGAAAAGTTGTCTTGTGTGGAAACAAATTCGGAAAGAGAAAGAAAGCCACTTTTTTGTTTATTTTTCTTTTTCTCTTTGTAAAATATTTGATTTTCTTTTTTCCTCTGCTTCCTTCTATGTAATGGGTGTTGGAGGAGCTTAGTTTCAAAGTGTGCAACACAATCACCATCAACA


Gene Sequence:
>Vu_20184(+)
ATGTCTCAGACAGAGAAGGATCCGGGTATCAGGCTATTTGGCAGGAAGATTCCGGTGCCGGAATGTCAGATTCCGGCCAACTCTGGACCCACGGTACTTGCTTCTTTACTGTAGCCGAAGATAACTGTTTGAGTTCATTTCTTCTTCAATCGTGTATTTTGTGTTTTTATTCCTTGTCTGTATAAATGGGTTGGTCGTAAAATTGGATTTTGTTTTTCGTTTTATGTTTGTTGTGTCTTCGTGATGTTCTTAATATTCTTAGTTATTTTCTGGTCTGTCATGATAGTTCATTTCAAGCTTCAAAACCTGGTGGAATTTGAAGGGTGGCGTTGTATCTTAACAAATGAAAACTTTAGTTTGGCTGAATTCAGAAATAGTATATTGTGTGTTTAAGGTTCAGAGATTTGATTTGTTTACACAAATTAAGGCGCTGTCAAGAGGAAGCAAGTTATTATTCCTATCAAACGCAGCTTTGAAATTGTTTCATTTTGAATTGGAGCATCTTTAGCTTATGGTTTCGTTGTTGTTGGTGTGAAGAGGTTGTCTGCTTCATCTGAAAAACAAAAGCATCTTGTAACTGATTATTTTCACTAGATTAGATCTTGTGGTATCTTATGTATCTCTTAGCTTGATTTGTAACAAAGAATTTGGTTAGCTTCTTAGTATTGAAGGCATTTTCTACACTAACTTTCTTGGTGTTCTTTCTGGCGGTTTCTTTTGGTATTTATGTACAGTAATTGCTTTGAAACCTTTATACTTAAATAGTGAAAACCTTTTGTCTAGTTGTTTAAGTACATGAATTCATTTGAATGGTTACGCTGATATTGCATGGAATAAACTGGATTCGAGACAGTTAGTATATAGAACAGACCATGGTTATCCACCAAAAGAACTAAAAGATCATGACAGATGCATGTTAAGTTGAGGTATCAAAGAAGATTTTCGTGTCTGCTATGTGGTCTTTTGTAGTATTTGATGGAAAATGGGTATAACATGATCATTTTGTATCTTTTTGCTCGATTTGTCTGACTGGTTTAAATTTTTAGGATGCTTTGAGCAGCATAAAAAAGGAGGAGGAACTGGGAAGACCCAGTGAATGTGGAGAAAACTCTGAAAAACAAGAAAAATCATCTGATTCAAGAGATAGTAAACAAGAGTTAGAGCATAAAGTGCAGGAAAATGAGCCAATAGTAAATCCCAAACCCGCGGAAGATAACACGGAGAATGGTGGCTCAGACCAAGATAAAGTCTTAAAGAAACCAGACAAGATTCTTCGGTGTCCACGATGTAACAGTTTGGACACCAAGTTTTGTTATTTTAACAACTACAACGTTAACCAACCTAGGCATTTCTGCAAGAACTGTCAAAGGTATTGGACTGCTGGTGGAACAATGAGAAATGTTCCCATAGGTGCTGGGAGACGGAAGAACAAACACCTAGCTTCTCAATACCGACACATTATAGTATCCTCTAATGGAATTCCTGCCTCCAGACTAGAAACTGAGGAAGCATCTGGTTTCCAACATGTCACAAATCTTGAATCCTCGGTTCCTTTCAGGTCTTCAGCAGATAGCAGCACTGTTTTGAAATTTGGGCCAGATACCACTCTTTGTGAATCAATGGATTCAATGCTTAATCTTAGAGACGAGAGAAGATGTGTTGATGCAAGTTCTATAAACCGTGCAGAGTATGTTGGGGAACCATCTTTATGTGGGTCTTCTGTGACGAACAACAGTACTCAGGGAAATGAATTATCAGAACACAAGACATCAAATTGGTTACAATGCTACCCTGTTCCTCCATGGGTGTTAACTTATCCGGGTTGGAATAATGTGAGTTCCGTGGAAGCAGTTCATCAGTCTTCAGCACCAATGTGTAGTCCATACAACACTGGTCCTGCAGCAATGCAATGGTGTCCCACAGCAATGGTGGCAATTCCTGGCATGTGTCCACCCAGCATTCCTTTTCAGGTTGTTCCACCATCATGCTGGAGTGGAACACCTCATTGGAATGCTGGAACTGGGTCAGTGTCCATAGGATCCAATGCTTGTCTTTCGCCATCGTCCTCCACCAGTAACAGTTGCTGCTCAGGCAATGGCTCCCCAACCCTTGGAAAACATGCAAGAGACACTGTTTTTGCTGATGAAGAGAAATCAGAGAAGTGTGTTTTGGTTCCAAAGACCATCAGAACCGATGCCTCTAACGAGGCCTCAAAATGTCCTATAAGGGCTGCATTAAGCATCAAGCCTGATCAACAGAAGAAAATTGAACCAAAAGAAGGCAAAGATCGTGTGTTGGGTGCCTCTCAAATCTTGGAAGCCAATCCAGCAGCTATTTCTCGTGCTCATGCATTTCAGGAGAGCATATAG