Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20131 LG5 18550814 18551170 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 18550818 missense_variant p.Val2Ala
G/A 18550860 missense_variant p.Arg16Gln
G/C 18550900 synonymous_variant p.Ala29Ala
C/T 18550917 missense_variant p.Pro35Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20131.1
MVAAAAANKSLLKEPRYRGVRKRPWGRFAAEIRDPLKKARAKTNFPLSHPFYIVSSSFRPPLPFDLNAPPFDDAAADDDLRCTALCLLNVP*


CDS Sequence:
>Vu_20131.1
ATGGTGGCGGCTGCGGCGGCCAACAAATCCCTTTTAAAGGAGCCTCGGTACCGAGGCGTGAGAAAGAGACCGTGGGGGAGGTTTGCGGCGGAGATCAGAGACCCGTTGAAGAAAGCCAGGGCCAAAACAAATTTCCCTCTTTCACACCCTTTCTACATCGTCTCCTCGTCGTTCCGCCCTCCCCTGCCTTTTGATCTCAACGCGCCACCGTTCGACGATGCCGCTGCCGATGACGATCTCCGCTGCACCGCGCTCTGCCTCCTGAACGTGCCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20131::LG5:18548814-18550814(+)
ATTTGTAATCGTGTGAATATTATAGTGGAACCCTCTGTGAAGGAGACTGGACATGGCTTAGTTGGAGCTAACCAGTATAAAATCTCATGTATTATTGTTTCTTCTCTTTACTAAACAATCCTCTTAAAAAGAATACAATAAAAAGGAACCCTCCAAATAAACTAAAAACGTCTTAAAGTGATACCTATAATTAAGATGCTCTTATAACCATATAACAACACTCTACAGCTAAATTAAGCTAAGCTAAAATGTTTGTTAGAAACTTATTTATTTAATTCAACTAGTTAGGTTAACCAACATTTTACAATCTTAGATAAACACAATCAGATTCGACTAACTCATTTCGTAGAGTACACAATATTATATGTAGTTTTTTTATTATAAATAATTTTGTCCCAACTGTAAAACCATTTTGAATATGAAATATTTTCTTTGAATATTTAATGCAATTATATATTAAGAGTTCAAAATCGAAACAATTAGTTAAGATGTCGCACGCAATTCATCTACATTTTTAAGTTTCATGTAAAATTTCTCAAGTTTGACCAAAAAGGTTAGGTCCTGTAATTAGCTCTCAAAGAGTTTGGATACTGAAGCAAAAATTAAATAAAAATAATTCGTTAGGATAGGCTTCTCTAAAAAAAATATTTTTTATAAATTAATATTAAATTATATATTAATTAAAACTAAATATTAGATAAACTATACGAAGAACTTGTACGTACTAGTTTATATAAAATTAAGTTTAACTTATAAATATTCATTTAAACAATATCATCGTTGATATCGTTCATTTAATAATTTGAAAATCTGAACCAACAAGTTGTAGGTTGTAGGTTTTAGTAGTATTCTATTCAGTTAAAAATGATATTGATAAAGTTGTTTTAGTATGTTTTATATTTAATATTTAATAAATATGTAATTTGGCATGAGGGTATATGATAATCTCAATTAAGAAAAACTACGAAAACACTATTTAACCATAAAAAATTATTTGAAACTACAGATTCCATTAAAAATAACCAATAAGATTTTTAACAAAAATTAATCTGTAAAACTCTGGAAGAAAAAAAGTTATAATATCGAATTATGGATAGCAGAAGATAATAACTATGAACGTGAACTCTGTTACGTAATTTGAATACATGGAAAGATTATGATATGTCCTTACAGAAACTTCCACGACTTTTCTTACATTTAGGTTTTCGTAAATCTCACGCTTTTGTTTTCCGTACTTTGAAACCAAAGCGAAAATGGACTTTCAACCCCAACCCATGTGTAGGACAAAGATTATCCAAATCCTTAACAAAGTTAAAACTCACCATTACGTGGAAGATCATATAAAATAACACAACGATTACAAAGAAAATTAATTTAAAATAATAAGTGAATATCAACCTAATTTTACAAACTAGTTTTATTAGTTTAATTTTTAACATAATATTAGAATAATGGATTTATTATGTCATTGTATGGCTTCCCTTCCAATGGATTAGTACTATAGCTTCCCCTCCAAGGTCAGCTACACCCTCCCTTATGTCTGGGTTTGGAACTCCGGCAATAATGTATTTTACATTATTATTTACCTTTTGTAAAAGGGGGAAAAATTAATAATAACTAGATTGATTTTATATAGTAGTGCAAACCCAAGTATTAATTTACTATCTATTGCATTTCAGTTGTTGCAGATTGGTGATTATGGAATTGGAAGATAGTCGAAGCTTGCAGTCTGTAATATCAGATTATAGTGCCAACCTTTCTTGAGGTACTAAGACTTCAGAGGATAGACCTAAATCTTGTTTTGGAACTCAAAGATTAAACAGTCTGTTCCCTAAGGGCAATTTGATGTCTCTTGAGGGAAATGTGATTGAAATTCATAACAACCTAAATCTGGTTTCTTCAATTCATGCTAAAATAGCCAGTTGTATTTTTTTTCTTATTTTTTTATTAATTTCTCCGAAGAGATGCGAAGGGAAGAGGAAGGGCGGCGTCGGTGGTCA


Gene Sequence:
>Vu_20131(+)
ATGGTGGCGGCTGCGGCGGCCAACAAATCCCTTTTAAAGGAGCCTCGGTACCGAGGCGTGAGAAAGAGACCGTGGGGGAGGTTTGCGGCGGAGATCAGAGACCCGTTGAAGAAAGCCAGGGTTTGGTTAGGAACCTTCGATTTTGTCGAGGAAGCTGCTCAAGCCTAAGACGCCGCCGCACGGACTCTCCGGGGTCCCAAGGCCAAAACAAATTTCCCTCTTTCACACCCTTTCTACATCGTCTCCTCGTCGTTCCGCCCTCCCCTGCCTTTTGATCTCAACGCGCCACCGTTCGACGATGCCGCTGCCGATGACGATCTCCGCTGCACCGCGCTCTGCCTCCTGAACGTGCCGTGA