Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20119 LG5 18444852 18445715 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor RAP2-11-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A,C 18444936 missense_variant p.Asn260Lys
A/C 18444939 missense_variant p.Ile259Met
C/T 18445038 synonymous_variant p.Pro226Pro
T/A 18445366 missense_variant p.Lys117Met
C/T 18445422 synonymous_variant p.Leu98Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20119.1
MEIQFQQPNLQHQKSGIAVTRGGKLKGRSRSNNTNKFVGVRQRPSGRWVAEIKDTTQKIRMWLGTFETAEEAARAYDEAACLLRGSNTRTNFITHVSLDSPLASRIRNLLNNKKGIKKQEDANVIANANNAAVPRVSSTGTASTTTTTTTTTTTTSTHCNSNNGNGNNEKYLSTMTPQSSNLFDDAYKPDLSNCREDFGSGHQSNTSWGFGPVFDRFPIAQILDVPKIDDCLTDAADLELCEFERMKVERQISASLYAINGVQEYMETVQDSSETLWDLPPLCSLFC*


CDS Sequence:
>Vu_20119.1
ATGGAAATTCAATTCCAACAACCAAACCTGCAGCATCAGAAATCAGGCATTGCGGTCACCAGAGGAGGAAAGTTGAAAGGGCGAAGCAGAAGCAACAACACCAACAAATTTGTTGGGGTGAGACAAAGGCCTTCGGGGAGATGGGTGGCTGAGATCAAAGACACAACTCAGAAGATAAGAATGTGGCTTGGCACATTTGAAACAGCTGAGGAAGCAGCCAGAGCCTATGATGAAGCTGCATGCCTTCTTCGTGGATCAAACACTCGCACCAACTTCATCACTCATGTGTCCTTGGATTCCCCTCTTGCTTCTCGAATTCGGAATCTTCTTAACAACAAAAAAGGGATAAAGAAACAGGAAGATGCTAATGTTATTGCTAATGCTAATAATGCAGCAGTTCCAAGAGTAAGCAGCACTGGCACTGCTAGTACTACTACCACTACTACTACTACTACAACTACTACTAGTACTCATTGTAATTCAAACAATGGCAATGGCAACAATGAGAAGTATCTTTCTACCATGACACCTCAAAGTTCAAATCTGTTTGATGATGCTTATAAACCAGATTTGAGCAATTGCAGGGAGGATTTTGGGTCAGGTCATCAATCCAATACTTCATGGGGTTTTGGACCTGTCTTTGATCGTTTTCCCATTGCTCAAATATTGGATGTACCGAAGATTGATGATTGTCTCACTGATGCAGCTGACTTGGAGCTTTGTGAATTTGAAAGAATGAAAGTTGAAAGACAGATATCAGCTTCACTCTATGCAATTAACGGGGTGCAAGAGTACATGGAAACTGTTCAGGACTCCAGTGAAACTCTCTGGGATCTTCCACCTTTATGCTCATTGTTCTGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_20119::LG5:18445715-18447715(-)
TTAATAGTTAAGTATATTTTATTTTTATATAATAAATATATTTAAAATTGATTTTTTTTTTGTAAAAAATAATTTAGATAAAAATAATAATAAACAAATATTTTCAAAGTATTTAAATTTTTAGATCTATTATTCATACTATACTATTCAAATAAGTACTAATATTACCATAATACTATTCTTTCGAATTGATGAAGCTTAATCTATCTAAGCACCTTTTGCTAGCTATGTTAAAGGATGAAATTATTGCTAACATGATTGAAGATTTTCCAAAACTTGATCTTGGAAAGATTTTCCGAGATAACATTACCATGTTGGATTGCTAATTTATTTAGTAAAATAAACTTGTGTCTTTTTCCCCATATCTTCATTCTTGTCTAGCGTGAGATCCATTGCAAACTTCTAGTGGCATGCAATATTTAAAGACTGAAAATTCATTTCATAATTAAAAAAAAAAGCAAAAGAAAAAGGGAAAAAGAGTTGGAGGGTTAAGTTAAGGTGAATAGTTGTTTTAGGTTAGCTAATTGTCTCCTCAATGAATTAAGAAAGAAGAGAAGGACAATGTCACAGATATCAAAACCTTGGAATTGGTTGAAATAAGGTGAAGAAGAATCTATGAATAAAACATGTTAGAGGGAACAAAATGTCCTTGGTGACGTGAGAAGAGGGGTTCAACTTACCACAAACGCAGCACGCACGATAAGATATGTGCATGTTTTCTGAATCTTTTATATATTAATTATTATCAACAAAACATTATTGTTGTTATGTGTAGCCACATAGGTGAGAGTGTCAAGCATGGCTCTAATGATCTGTTTGTTTATAAAGGATCATTTTGGGGCCTCCATCTGGCACCCATTCATGCATTCACTACCAAACTTTCAACTGTTTGACTTAGCAAAATGTGATGGAAGAGTGAGGACAAAGACTTCCTACTAAGTATTATAATAACAACTCTCTTATTTCCCTTTTTTCCACTGTTGCTTTTATCTATGTTCTAGCCCTTTCCATGATTTACCAAACTAGGTGTTGACCCAAACCCATGGTTTTATGACCGTTTCAAGATGTAGAATTGTATGCAACAATATGTGCTAATTACTCTTTTTGCTCTAAAACAATTGAATGAATTATGTATTCTTGTGATGGGATTTATTTGATAAAGGTGTACGTTATGAGCAAATTCTAGAACTAAATAAAATTGTTGCCATTTTTTAGGGTATCATAGTGTTGGGTTTATCGACTATCGACTTTGATATTACTTTTCAGTTTATTACATGAGAGATACAAACACTAATAAAATATACATCCCATTATATAAGGGATTGACTGTAATCTCTGCGTAAAATTTTAAGCCAATGAATTAATGGATTTTTTTGACTTTATACAGTATTTTACTTTTTCATTTTTATCGATACGAGATTTGGACTCACAGTTACATTTCCAACGGGAGAAATGTAATGTTAGGACTCAGTTAATTTTATTTTATTTTATTGAGAAAACAAGATTATTAGTAGTGTGACTAAAACTAGATCAAATTGATTCTGTTTCAGACACATTTTTCAAACTGAGGCTTGACTCTTTCTGTAATGGAATGCCCAGAAAAGACATACGTTCATACACAGGGGCGGTTGGAAAGTAAAGGGTGATATATTGAATTTGAAGAGGATACCCTGTCTGCATCATGTCAAATTTTAAATATGCTTTCAAAAAGTTAAACAATTAACAAATCCCATGATGTGCATCTTCTATATTAATCCCACTTGCTTGCTCAAAAGTTAAGCACCTTTTTCAATCCTATGTGTGTGTGTATATTATATGTATATATATATATATTCTCACAGCTTGCAAACAATAACATGAAAATTAAGTAATAGCTAGCTTTCCATCAACATTGTGAGAGCTATAAACAACTTCTGGTCCTCTTGTCTTGTTTCTTGAAACATCTTCATCACAAGTTGTACCGTTCAAGTAGACCATTTTGTTTGATAATAGTATTTGTG


Gene Sequence:
>Vu_20119(-)
ATGGAAATTCAATTCCAACAACCAAACCTGCAGCATCAGAAATCAGGCATTGCGGTCACCAGAGGAGGAAAGTTGAAAGGGCGAAGCAGAAGCAACAACACCAACAAATTTGTTGGGGTGAGACAAAGGCCTTCGGGGAGATGGGTGGCTGAGATCAAAGACACAACTCAGAAGATAAGAATGTGGCTTGGCACATTTGAAACAGCTGAGGAAGCAGCCAGAGCCTATGATGAAGCTGCATGCCTTCTTCGTGGATCAAACACTCGCACCAACTTCATCACTCATGTGTCCTTGGATTCCCCTCTTGCTTCTCGAATTCGGAATCTTCTTAACAACAAAAAAGGGATAAAGAAACAGGAAGATGCTAATGTTATTGCTAATGCTAATAATGCAGCAGTTCCAAGAGTAAGCAGCACTGGCACTGCTAGTACTACTACCACTACTACTACTACTACAACTACTACTAGTACTCATTGTAATTCAAACAATGGCAATGGCAACAATGAGAAGTATCTTTCTACCATGACACCTCAAAGTTCAAATCTGTTTGATGATGCTTATAAACCAGATTTGAGCAATTGCAGGGAGGATTTTGGGTCAGGTCATCAATCCAATACTTCATGGGGTTTTGGACCTGTCTTTGATCGTTTTCCCATTGCTCAAATATTGGATGTACCGAAGATTGATGATTGTCTCACTGATGCAGCTGACTTGGAGCTTTGTGAATTTGAAAGAATGAAAGTTGAAAGACAGATATCAGCTTCACTCTATGCAATTAACGGGGTGCAAGAGTACATGGAAACTGTTCAGGACTCCAGTGAAACTCTCTGGGATCTTCCACCTTTATGCTCATTGTTCTGCTAA