Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20040 LG5 17257367 17258430 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 17257367 initiator_codon_variant p.Met1?
A/G 17257370 missense_variant p.Thr2Ala
G/A 17257372 synonymous_variant p.Thr2Thr
G/A 17257414 splice_region_variant&intron_variant
T/C 17257449 intron_variant
T/C 17257450 intron_variant
A/G 17257477 intron_variant
A/G 17257519 intron_variant
C/G 17258010 missense_variant p.Gln107Glu
C/T 17258056 missense_variant p.Ser122Leu
A/T 17258061 missense_variant p.Arg124Trp
C/A 17258208 intron_variant
T/C 17258248 intron_variant
A/G 17258412 synonymous_variant p.Pro174Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20040.1
MTAAICDEEVAIGAATWCLVAGVNHGCILRRLVRILGAVIKLDCLNLSRNNLSGSIPSSFEGMSNLISINIPYNRLEGPLSKNGAFLNASIESLKNNTGVGEQGNFYRADFPSCEVYAVKKLHPGTNGEKLNFKAFENEIKSLTEIRHSNMVQYTNHSCSIPSPAWVAVAKSTPPHPITL*


CDS Sequence:
>Vu_20040.1
ATGACGGCGGCGATTTGCGACGAAGAAGTCGCTATTGGAGCTGCGACATGGTGTTTGGTGGCAGGTGTGAATCATGGATGTATTCTGCGACGGCTTGTGCGCATACTTGGAGCGGTGATCAAACTGGACTGTTTGAATCTCTCTCGCAACAATCTTTCTGGAAGTATTCCATCCAGTTTTGAGGGCATGTCAAATTTGATTTCTATCAACATACCATACAATCGATTAGAAGGGCCACTTTCCAAAAATGGAGCCTTTCTTAATGCTTCAATTGAATCATTGAAAAATAACACAGGTGTCGGAGAACAAGGAAATTTTTACAGGGCTGACTTCCCTTCATGTGAGGTCTATGCGGTGAAGAAACTTCATCCAGGAACAAATGGAGAGAAGCTTAATTTTAAAGCTTTTGAGAATGAAATTAAATCTTTGACTGAAATCAGGCACTCTAATATGGTACAATACACTAATCATTCATGTTCAATACCCTCTCCGGCATGGGTGGCAGTTGCCAAGTCAACTCCACCACATCCAATAACGCTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_20040::LG5:17255367-17257367(+)
ATGGCGGTTCTAACAATTATTAAAAAAAACAATTAACAAAGTCAATAATTGAATTAGTACTATTTCCTTTTTATCTTGAAAATTTTTCAGATCATGTAATCAGGAAATCACTTATACAAAATATAAAATGGTCACTTCGAAAATTTAGAGAAATGTATTTTGAAATTGTGGGAGTATAGAAAATAAAAGCCTGAAGCATATTTGAAAGGCCCATTTAAAATGTGGGCTTATAGAGCGAAGCTGCAAAGTTGAGTGTTGCTTCCTCCACCACCACTAAATGCTCCATGCATCATCCCATATCTAATTTGTCCTTGCTATAAAACGGATGTCAACATCCGTTTCACTTTCAACAGATGTTGAAATCCGTTTACATATTTTATATTTTAGTTTATTGTTTATTTGAAAAAAGAAGAAGAAAACTTTAACGGATGTGACACATTCGTTTAAGTAATTTTATAAAAAATATTTAAATAATTTAATAAATAATAATATATAAATTAAATTAATAATAATTATTTTATTAAATAAAATAAACTTAATTTATATATAATTAAGTAATAAATTTTAAAAAAAGAATAAATAATATTCATATATTAATTTAAAATACAATAAATTAATAAACTAAAAACTAAAAAAAAAAACCTCAACGAATGTCGCCACATCCGATGTGGCACATCCGTTTAAATAGATTTATAAAAAATATTTAAATAATTATTTAAATAATAATACATAAACTAAATTAATAATAATTATTTTATTAAATAAAATAAAATTAATTTATATATAATTACGTAATAAAATTTAAAAAAATTAAATAATATTTATATATTAATTTAAAATACAATAAATTAATAAACTAAAAACTAAGAATAAAAATAAAAAAGAAAACCTCAACGGATGTAGTACATCCGTTGAAGAATTTTTTCTTCAACGAATGTCGACATCCGTTGAAGAAAAGAAGTGGGGGTATAGAATATTTTAAAATATAAATAATAGTTTAGGAATTTTAAAAAAATGTGATGGTGCAGGAAAAAATGTGGGGTGGTGTAGGGAGTAACCCTGTAAAACATTAGCAAACTCGTTTATATTAGCATATTTATTTCTGTACCTCCCCAATTACTATCTACACTGTCTAAAACTCGTTTCATGTAGCTTTCTTTTTTAACATTCTAACTATGTTCATCAATAAAGGAGATGAACAAGAAACAGATGATTATATTTATTTGATATTTATCATGTAGCTTTCTTTATATTTTCTTTAAGTGAATGTAATAAATTATGTGTGTGAAAATTTATAATTTTTTCTTAATTATAAAATTATTTCTTCTGATAATTGTGATCTCATCTTCATAAGATTATAAGTAGTTATCATCATGCGTATATTTTCTGAATTATTATTGGATTGGTGATGCATCGCTTCTGTAATATTTTGAAATGATTATAAGCTTCTATTTGTGTGAAGATAAAATAATTGTGGAAGAAAATATTTTAGTAAATTATGTAGAAATGTCACTAGTAAAACAATTATATACGTTAGTCCTTCAGAGTTTTAATAAAAACATAAATGAGTGTCATGAATTATTTCAATTGTAAAAAATACTCAATAGGATCAAGATTATATACATTGGAGCACCATAATTAAAAGTGGGTAGGTTAAACACCTTAAGTTGTTTCTATCTAGGTGGGTTTTTCCCAATTCGATCTCCGTTTTATTGGATTTTTCAATTTAGTCCTAAAAAATGTAAATTTGAGTCAATTGGGTCTCTGCCGTTAAATTGGGTTAACGGGGTTATATTTTTTATGACCTGGCACCTTGACGTGGTAAGTTTTTAGTACGTGTCATTCGCAAGTTTATACATGGAATTTCATAACATTAAACATTTAAAAATTAGGGTTTGTTGGTGGAATTTATGGGTTTTGCTGTGTGCAGCTTTCATGGTAGCGCATTGAGGTGGTTCTTGAGGAAGATGATTCGAACAACGCCGAATTGTTATGGCTGA


Gene Sequence:
>Vu_20040(+)
ATGACGGCGGCGATTTGCGACGAAGAAGTCGCTATTGGAGGTTTGTTGCGTTTTGTGATTCTTGCGAGAATTTGCTCGCCATTTGACCTCGCCTCTCTGGTCTGCAATTAAGGTTCAAAAGTGGTAGAGGACGAGATGTTGATGGCGACCTGAAGGAGATTCTACGGCGGCCGGAGCACAAACGCGATTTAGGGTTCATCTGCGTTTGATTTGGGATTTTCTGATTCTGCAGGTGTTTCGCGAAGATGATGAATTGTGGTTGTGGTAGCTGCGACATGGTGTTTGGTGGCAGGTGTGAATCATGGATGTATTCTGCGACGGCTTGTGCGCATACTTGGAGCGGTGATCAAACTGGACTGTTTGAATCTCTCTCGCAACAATCTTTCTGGAAGTATTCCATCCAGTTTTGAGGGCATGTCAAATTTGATTTCTATCAACATACCATACAATCGATTAGAAGGGCCACTTTCCAAAAATGGAGCCTTTCTTAATGCTTCAATTGAATCATTGAAAAATAACACAGGTTTGTGTGGGAACGTCACTAGGTTGATGCTTTGTCCAACCAACCACAATGAATATTGTGTGGGGGTGGGTGTTTCAATGACGAATATCTCATAGGTGTCGGAGAACAAGGAAATTTTTACAGGGCTGACTTCCCTTCATGTGAGGTCTATGCGGTGAAGAAACTTCATCCAGGAACAAATGGAGAGAAGCTTAATTTTAAAGCTTTTGAGAATGAAATTAAATCTTTGACTGAAATCAGGCACTCTAATATGGTAAAGCTCAACAGGTTTTGCTCACATCCATTACTCTTCTACTTAAACTCTTTTATTCCCTCAAACAATCATCATTTTTTTCTTCTACCCCTCTTTCACTTTCTGTCAAATCAATTATCCTTCTCAAATGTGTAACCCTGGAAATGGGGAATCAAACACCCAGATACCTAAAGACGAAAACAAGTTTAACCTTTTCAGGTACAATACACTAATCATTCATGTTCAATACCCTCTCCGGCATGGGTGGCAGTTGCCAAGTCAACTCCACCACATCCAATAACGCTATGA