Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20029 LG5 17062326 17065493 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 17062342 missense_variant p.Glu865Asp
T/A 17062343 missense_variant p.Glu865Val
T/C 17063368 missense_variant p.His709Arg
C/T 17063396 missense_variant p.Val700Ile
C/T 17063617 missense_variant p.Arg626Lys
T/A 17064074 missense_variant p.Ser474Cys
G/A 17064078 synonymous_variant p.Leu472Leu
A/G 17064118 missense_variant p.Phe459Ser
T/C 17064122 missense_variant p.Ser458Gly
A/G 17064123 synonymous_variant p.Asn457Asn
T/G 17064124 missense_variant p.Asn457Thr
T/C 17064188 missense_variant p.Thr436Ala
A/C 17064204 missense_variant p.Cys430Trp
G/T 17064218 missense_variant p.His426Asn
A/C 17064247 missense_variant p.Leu416Trp
C/T 17064272 missense_variant p.Ala408Thr
A/G 17064396 synonymous_variant p.Asn366Asn
G/T 17064592 missense_variant p.Pro301His
G/T 17064743 synonymous_variant p.Arg251Arg
G/A 17065009 missense_variant p.Ser162Leu
A/G 17065021 missense_variant p.Val158Ala
A/G 17065034 missense_variant p.Phe154Leu
A/G 17065050 synonymous_variant p.Ser148Ser
A/T 17065130 missense_variant p.Phe122Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20029.1
MDLLFLLQCLLFFTSHHANALNASISRDALSLLSFKSFVSSDPSNILAGWTNHSSSNICRWHSVACGGPGSLSDRVTSLNVTGLRGGLLSPSVGDLSELRVLSLVGNMFSGEIPDTVGNLRFLEVLELQGNNFSGRVPTQMSFAFLQSLKLVNFSGNVFSGSIPSDIIGSGSVKIVDLSNNQFSGVIPLNGTCDSLKHLKLSRNFLTGEIPSQIGKCRNLRTLLVDGNIFEGRIPSEIGQIVELRVLDVSRNSLTGRVPKELANCVKLSVLVLTDLFEDRDDGGLDDGFRGEFNAFVGNIPHQVLLLPSLTVLWAPRANLGGRLPSGWSDLCSLRVLNLVQNYVTGVLPESLGMCRNLSFLDLSSNNLVGYLPSLQLRVPCMVYFNVSRNNISGTLKGFRKESCGVSAVDPSFLELDGFSDDEYFHLPVCRFQKNTFVGSGFEENNTIVVSHDFSWNSFVGSLPSFSLGDSLFSANRKVSYALSLNNNRFSGTLPDQLVSNCNELKTLSVNLSVNQLSGGNFQTSVLECLKLTDFEAGYNQIDGSIGPAIGGLVMLQHLDLSGNKLSGSLPNQFGNLQNMKRMHLGGNNLTGEIPTQLGQLTSLTVLNLSHNALVGTIPASLSNARSFEILLVDHNKLSGEIPLTFSTLSNLVQLDVSFNNLSGHIPRLQHPSDCDSYKGNAHLHPCPDPYSDSPASLPVPLEIQHHTHRGRKLRTLVIVVVTSASVVLCTLLGIVLVIFSGRSKFGRLSSIRRRQVVTFQDVPTELNYDSVATATGNFSIRHLIGTGGFGSTYKAELAPGFLVAIKRLSIELLMTEGRCSELFSSTLWEAGPKEKLLGLLKLALTCTEETLSIRPSMKQVLEKLKYLKS*


CDS Sequence:
>Vu_20029.1
ATGGATCTTCTCTTTCTTCTTCAGTGCCTTCTCTTCTTCACTTCGCATCACGCAAATGCCCTCAATGCTTCAATTTCTCGCGACGCATTGTCACTTCTCTCTTTTAAAAGCTTCGTCTCTTCCGACCCTTCCAACATCCTCGCCGGTTGGACCAACCACTCCTCCTCCAATATCTGCCGATGGCACTCCGTCGCGTGTGGCGGCCCAGGGAGCCTCTCTGACCGAGTCACTTCCCTCAATGTCACCGGTCTCCGCGGCGGCCTTTTGTCGCCCTCCGTCGGCGACTTGTCTGAGCTCCGCGTGCTGTCCCTCGTCGGGAACATGTTCTCCGGCGAGATTCCTGATACCGTTGGGAACCTTCGGTTTCTCGAGGTCCTCGAACTGCAAGGGAACAACTTTTCAGGGAGAGTCCCGACCCAGATGAGTTTTGCTTTTCTTCAGTCTCTTAAACTTGTTAACTTCTCTGGTAATGTCTTCTCTGGTTCGATTCCGAGTGATATTATTGGCTCTGGGAGTGTGAAAATCGTTGATTTGTCGAATAATCAGTTTTCTGGTGTGATTCCTCTGAATGGTACTTGTGATTCGTTGAAGCATTTGAAGTTGTCTCGTAACTTTTTGACTGGGGAGATTCCATCCCAAATTGGCAAATGTAGAAACTTGAGGACCCTTTTGGTTGATGGGAACATCTTCGAAGGTAGAATCCCTTCTGAGATTGGCCAAATTGTTGAACTGAGAGTTCTGGATGTTTCTCGAAACTCACTCACTGGAAGGGTCCCTAAGGAGTTGGCTAATTGTGTGAAACTGTCTGTGCTTGTGCTTACTGATTTGTTTGAGGATCGTGATGATGGAGGATTGGATGATGGCTTTAGAGGAGAGTTTAATGCCTTTGTTGGGAACATACCTCATCAGGTGTTGCTGCTTCCAAGTCTAACGGTGTTATGGGCGCCAAGGGCAAATCTTGGTGGACGGTTGCCTAGTGGCTGGTCGGATTTGTGCTCTCTGAGGGTGCTCAATTTGGTGCAGAATTATGTTACTGGTGTCTTGCCTGAGAGTTTGGGGATGTGTAGGAATTTGAGTTTCTTGGATTTGAGTTCTAATAATTTGGTGGGGTATTTGCCTTCATTGCAGCTTCGTGTTCCTTGTATGGTGTACTTTAATGTCAGCAGAAACAATATATCTGGCACTCTTAAAGGATTTAGGAAAGAAAGTTGCGGTGTGAGTGCAGTAGACCCTTCATTTCTAGAATTGGATGGTTTTAGTGATGATGAATACTTTCATTTACCTGTTTGTAGGTTTCAAAAGAATACTTTCGTTGGGTCTGGTTTTGAGGAGAATAACACTATTGTTGTTAGCCATGATTTCAGCTGGAATAGTTTTGTGGGATCCTTGCCTTCGTTCTCTCTTGGAGATAGTCTCTTTAGTGCTAATCGTAAAGTCTCCTATGCGCTGTCTCTCAATAATAATAGATTCAGTGGAACTCTACCGGACCAGTTAGTTTCAAACTGTAACGAGCTCAAGACATTGTCAGTTAACTTGAGTGTGAACCAACTATCGGGTGGGAATTTCCAAACGTCGGTTTTGGAGTGCCTAAAGTTGACAGATTTTGAAGCAGGGTACAACCAGATTGATGGGTCAATTGGACCAGCTATAGGTGGCTTGGTGATGCTTCAGCATCTTGATTTAAGTGGGAACAAGCTATCTGGATCACTGCCGAATCAGTTTGGAAACCTTCAAAACATGAAACGGATGCATCTGGGAGGAAACAATCTAACAGGGGAAATTCCTACCCAACTTGGCCAACTGACTTCCCTTACTGTTTTGAATTTGTCTCACAATGCTCTAGTTGGAACAATACCTGCGAGTTTGTCAAATGCCAGAAGTTTTGAAATTCTGTTGGTGGACCACAACAAACTTTCTGGGGAAATACCTTTAACTTTTTCTACTCTTTCCAATCTTGTGCAGCTAGATGTTTCTTTTAACAATCTTTCGGGTCATATTCCTCGTCTTCAACACCCAAGTGACTGTGATTCCTACAAAGGAAATGCACACTTGCATCCTTGCCCTGATCCATATTCTGACTCACCTGCTTCTCTTCCCGTCCCCCTTGAAATCCAGCATCATACTCATAGAGGGAGAAAATTAAGGACATTGGTTATTGTTGTGGTAACTTCTGCTTCTGTGGTACTGTGCACTCTTCTGGGAATAGTATTGGTTATCTTTTCTGGAAGGAGTAAATTTGGTCGGCTTAGCAGTATAAGAAGGCGACAGGTAGTGACCTTTCAAGATGTTCCAACTGAATTGAACTATGACAGTGTGGCCACAGCTACTGGAAACTTCAGCATCCGGCATCTAATTGGCACAGGCGGCTTTGGGTCAACATACAAGGCAGAACTGGCCCCAGGTTTTCTTGTTGCCATAAAGAGGTTGTCCATAGAGCTACTAATGACCGAAGGCCGTTGTTCTGAGCTATTTTCATCTACTTTATGGGAAGCAGGGCCTAAGGAAAAATTGTTGGGCCTTTTAAAGCTTGCATTAACATGCACAGAAGAGACTCTTTCTATTCGACCATCAATGAAACAGGTTCTTGAGAAATTGAAATATTTGAAAAGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20029::LG5:17065493-17067493(-)
ATACATTAGTTAATCCTACATTAATGACAGCAATACAAAACATTTAATATAAGTAACTGGATAATAATTAAACATAAAGAATGGTTCAAACACTTACATAATCTATAATTGAATAATTGTAATATTTAGTTTTTAGAACATATTACAAATATTCATTAATTTTAGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGAGAGTGCTCCAAACACATGACAATGGAAAACCTAAAATGCAATAACAAAATAACAAAATGAAGAAGAATAGTGTTAGAGTTCTACAATGATAAACAAACCTCAACAAAAGAGAATAAAAATAAGAGGGAAGAGAAAAATAAACCTTAAGAACAACAAAAGAGAATAACAACTAGTTTTGTAGTAGTATTATGCAAGACGTTAGTTTTACATACAACCGAAGCTTATACTCAACCACTCAGGTAAAATTACATTTTTTAAACTATTAACACAATTATAAGATTTGGTTTTAAATTAACCGAAGCTTATGTTTGACTATATAAATATAAACTTCGATATTTTTAACAGTGCTTACAAAGACACTTCATGTTTGTATAAATACAATAAAAAATACAAGAATAATCGAATAAATAGTCATATCTAGTGAATAATATGTCATGAGGTTTTATTTGAATAAGTCTATGTTGACTGTGTTTAAACTATCTTATGCTTAGATATTTTGATTTCTCCTTAATTCTTGATTATTCAGCCTGATTCTACTTAATTAATCGTAATTAAACTAAGATGATGTCATCTTCTATGACCTAGAGTTTATCAATCCCATCCGAGACAGAAAGCAAAAAAGTTATTTTGTGTTTTCTTATATGTATGTATCATATATATCATACCATTTTATATACTACACAAATGATTATTAGAAAACTAAATACCCTTATATTCACACTTACACACAACTTTTCCGGTAAAAGTCATAACACAAATTATATTAGTTACTCCTAATTAAATTAATTTTACATATTGGCAATATTTAAACTAGTCCGTTTTGCCACTCACAGATTGTTCCTTGAAAATGTATCTATATTTTTTTATCGTGGCAATGCCTGTTTTTCGTTAGTGATAATTTTTCAAACATTAATGAGCAATTACAAATATTTGCCCAAACATAATAATAAAATAAATTCAAATGATACTATATTGTTTTCTTTTACACTGCACATATTAAAAAACCTTATATTTATAGCATATATGTGTATTTTAGTGTGAGCAACAGCCATAGGCTAATATTTTAATCCAAAAACAAATGTTTATAGCGGCAGGCACGGGTTTGCCATTGATGGGTTATTGTTTCACCAAATTAAATACAGAATGACACCAAAAAACAATGAAACATTCACATGTGGTTGGAACTGGAACAAGCAACAAAGATGAAGTTCGACAAATATTATATTCTAGATCCTCAGGTTCAACAAACTACTATAATTTTCGTTATAAACTATTTTAAACGTTGTTTAAATAATTTTTTCTACCGTTTTATTACGAAAATTTTATATTAAACTTTAAACCAAGGAAAAGGTGAATGAAAATTAAGTCAGAAAAACGCAAAAGCATTTCCCCGTTTGTGCGTAAAACAAACCTATAAAGTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAATTAGAAAAATCGAAGACAGAGAGAGAAACGTTACCGTTTTCGCTCCAAATGGGACACAACTTTTCAACGTAATTTGCTGCTTTGCCACTCTCACTCACATCTCTTTCCTTCACTCTCTCACTCTCACTTGCCGCCGGAGCTCCATTTTCCGGCCCCATCCTTGCCGGCGACGTATTTCCGCCACCAGATTCACCCACCATGGCTTAACAAACAAATTTCGAATCTTTGGAAAAAGCCAACTCGTTTTCATTCTCATTTTGATTATTCACACACTCTCTGAGAAAC


Gene Sequence:
>Vu_20029(-)
ATGGATCTTCTCTTTCTTCTTCAGTGCCTTCTCTTCTTCACTTCGCATCACGCAAATGCCCTCAATGCTTCAATTTCTCGCGACGCATTGTCACTTCTCTCTTTTAAAAGCTTCGTCTCTTCCGACCCTTCCAACATCCTCGCCGGTTGGACCAACCACTCCTCCTCCAATATCTGCCGATGGCACTCCGTCGCGTGTGGCGGCCCAGGGAGCCTCTCTGACCGAGTCACTTCCCTCAATGTCACCGGTCTCCGCGGCGGCCTTTTGTCGCCCTCCGTCGGCGACTTGTCTGAGCTCCGCGTGCTGTCCCTCGTCGGGAACATGTTCTCCGGCGAGATTCCTGATACCGTTGGGAACCTTCGGTTTCTCGAGGTCCTCGAACTGCAAGGGAACAACTTTTCAGGGAGAGTCCCGACCCAGATGAGTTTTGCTTTTCTTCAGTCTCTTAAACTTGTTAACTTCTCTGGTAATGTCTTCTCTGGTTCGATTCCGAGTGATATTATTGGCTCTGGGAGTGTGAAAATCGTTGATTTGTCGAATAATCAGTTTTCTGGTGTGATTCCTCTGAATGGTACTTGTGATTCGTTGAAGCATTTGAAGTTGTCTCGTAACTTTTTGACTGGGGAGATTCCATCCCAAATTGGCAAATGTAGAAACTTGAGGACCCTTTTGGTTGATGGGAACATCTTCGAAGGTAGAATCCCTTCTGAGATTGGCCAAATTGTTGAACTGAGAGTTCTGGATGTTTCTCGAAACTCACTCACTGGAAGGGTCCCTAAGGAGTTGGCTAATTGTGTGAAACTGTCTGTGCTTGTGCTTACTGATTTGTTTGAGGATCGTGATGATGGAGGATTGGATGATGGCTTTAGAGGAGAGTTTAATGCCTTTGTTGGGAACATACCTCATCAGGTGTTGCTGCTTCCAAGTCTAACGGTGTTATGGGCGCCAAGGGCAAATCTTGGTGGACGGTTGCCTAGTGGCTGGTCGGATTTGTGCTCTCTGAGGGTGCTCAATTTGGTGCAGAATTATGTTACTGGTGTCTTGCCTGAGAGTTTGGGGATGTGTAGGAATTTGAGTTTCTTGGATTTGAGTTCTAATAATTTGGTGGGGTATTTGCCTTCATTGCAGCTTCGTGTTCCTTGTATGGTGTACTTTAATGTCAGCAGAAACAATATATCTGGCACTCTTAAAGGATTTAGGAAAGAAAGTTGCGGTGTGAGTGCAGTAGACCCTTCATTTCTAGAATTGGATGGTTTTAGTGATGATGAATACTTTCATTTACCTGTTTGTAGGTTTCAAAAGAATACTTTCGTTGGGTCTGGTTTTGAGGAGAATAACACTATTGTTGTTAGCCATGATTTCAGCTGGAATAGTTTTGTGGGATCCTTGCCTTCGTTCTCTCTTGGAGATAGTCTCTTTAGTGCTAATCGTAAAGTCTCCTATGCGCTGTCTCTCAATAATAATAGATTCAGTGGAACTCTACCGGACCAGTTAGTTTCAAACTGTAACGAGCTCAAGACATTGTCAGTTAACTTGAGTGTGAACCAACTATCGGGTGGGAATTTCCAAACGTCGGTTTTGGAGTGCCTAAAGTTGACAGATTTTGAAGCAGGGTACAACCAGATTGATGGGTCAATTGGACCAGCTATAGGTGGCTTGGTGATGCTTCAGCATCTTGATTTAAGTGGGAACAAGCTATCTGGATCACTGCCGAATCAGTTTGGAAACCTTCAAAACATGAAACGGATGCATCTGGGAGGAAACAATCTAACAGGGGAAATTCCTACCCAACTTGGCCAACTGACTTCCCTTACTGTTTTGAATTTGTCTCACAATGCTCTAGTTGGAACAATACCTGCGAGTTTGTCAAATGCCAGAAGTTTTGAAATTCTGTTGGTGGACCACAACAAACTTTCTGGGGAAATACCTTTAACTTTTTCTACTCTTTCCAATCTTGTGCAGCTAGATGTTTCTTTTAACAATCTTTCGGGTCATATTCCTCGTCTTCAACACCCAAGTGACTGTGATTCCTACAAAGGAAATGCACACTTGCATCCTTGCCCTGATCCATATTCTGACTCACCTGCTTCTCTTCCCGTCCCCCTTGAAATCCAGCATCATACTCATAGAGGGAGAAAATTAAGGACATTGGTTATTGTTGTGGTAACTTCTGCTTCTGTGGTACTGTGCACTCTTCTGGGAATAGTATTGGTTATCTTTTCTGGAAGGAGTAAATTTGGTCGGCTTAGCAGTATAAGAAGGCGACAGGTAGTGACCTTTCAAGATGTTCCAACTGAATTGAACTATGACAGTGTGGCCACAGCTACTGGAAACTTCAGCATCCGGCATCTAATTGGCACAGGCGGCTTTGGGTCAACATACAAGGCAGAACTGGCCCCAGGTTTTCTTGTTGCCATAAAGAGGTTGTCCATAGGTAGGTTTCAAGGCATTCAACAGTTTGAAACGGAAATAAGGACACTGGGAAGAATTCGACACAAGAATCTTGTGACTCTTATTGGATATTATGTAGGGAAGGCTGAAATGTTCTTAATTTACAACTACCTTTCTGGAGGGAACCTTGAAGCTTTCATACATGACAGGTCAGGGAAGAATGTTCAGTGGCCAGTTATTTACAAAATAGCAAAAGACATAGCAGAGGCCCTTGCTTTTCTTCACTACTCATGTGTTCCTCGCATTGTTCACCGAGATATCAAACCTAGCAACATTTTACTTGATGAAGATCATAATGCCTACCTGTCAGATTTTGGCTTGGCACGACTGCTTGAGGTAACTGAGACCCATGCCACCACTGATGTTGCAGGCACATTTGGTTACGTTGCACCAGAATATGCCACCACCTGCAGGGTTTCTGACAAAGCCGATGTCTACAGCTTTGGTGTGGTGTTATTAGAATTGATGTCTGGAAGAAAGTCACTTGATCCATCCTTTTCTGAATATGGAAATGGATTCAACATTGTACCATGGGCAGAGCTACTAATGACCGAAGGCCGTTGTTCTGAGCTATTTTCATCTACTTTATGGGAAGCAGGGCCTAAGGAAAAATTGTTGGGCCTTTTAAAGCTTGCATTAACATGCACAGAAGAGACTCTTTCTATTCGACCATCAATGAAACAGGTTCTTGAGAAATTGAAATATTTGAAAAGTTGA