Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20001 LG5 16537657 16540849 PREDICTED: MDIS1-interacting receptor like kinase 2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 16538022 missense_variant p.Leu106His
G/A 16538094 missense_variant p.Ser130Asn
G/A 16538096 missense_variant p.Ala131Thr
A/G 16538130 missense_variant p.Asn142Ser
C/T 16538142 missense_variant p.Thr146Ile
T/A 16538188 missense_variant p.Asn161Lys
G/A 16538189 missense_variant p.Gly162Ser
G/A 16538213 missense_variant p.Glu170Lys
T/C 16538227 synonymous_variant p.Leu174Leu
C/T 16538273 missense_variant p.Pro190Ser
T/C 16538499 missense_variant p.Val265Ala
A/T 16538711 missense_variant p.Thr336Ser
C/G 16539003 missense_variant p.Ser433Trp
A/T 16539164 missense_variant p.Asn487Tyr
C/T 16539174 missense_variant p.Ser490Leu
C/A 16539176 missense_variant p.Arg491Ser
C/T 16539748 synonymous_variant p.Pro681Pro
G/C 16540249 intron_variant
G/C 16540389 missense_variant p.Val866Leu
A/G 16540491 missense_variant p.Asn900Asp
T/C 16540493 synonymous_variant p.Asn900Asn
A/G 16540722 3_prime_UTR_variant
A/T 16540787 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20001.1
MVFVFPTLLSMKLKPLSMLLVMLFCAFSHYDAASSSDSEANALLKWKGSLDSLSQASLSSWNGSNPCNWLGIECDNSHSVSHINLTRVGLKGTLQTFNFSSLPNILGLNMSFNSLSGSIPQQIEKLSNLSALDLSTNKLSGNIPKTICNLSKLKYLNLSVNGLSGSIPNEVGHLQSLLTFDIFTNNLSGPIPPTLGTLPLLESIHLFENKLSGPIPASIGNLSRLTMLSLSSNQLTGSIPPHIGNLSNAKVICFIGNELSGEIPVEIEKLTGLECLQLADNNFIGHIPQNICLGGNMKYFTAGNNNFTGPIPQTLKKCYSLKRLRLQQNHLTGDITNFFDVLPNLNYIDLSENNFHGSLSPTWGKFRSLTSFMISKNNLSGVIPPELGGATKLQVLDLSSNHLTGNIPEDLCNLTLLFDLSINNNNLSGNVPSKIESLEALKILELGSNDFTGLIQKKIGNLRNLLYLNLSQNKFEGNIPSELGNLNYLSRLDLSGNLLSERLPPTLGGIKGLETLNLSHNSLSGGLSSLHDMMSLTSFDISYNQFEGPLPDIPVFQNATIEALRNNTGLCGNVTGLEPCPKVSGKSHNNTTRKVLIAVLPVTVAILMLALFLFGVSYNLCRTSNEEQEKALSSRSASMFPAWSFGGKIMFENIIEATEYFDDKYLIGVGGQGRVYKAILPTGEVVAVKKLHSVSNGEVLNQKAFTREIQALTEIRHRNIVKFHGFCSHSQYSLLVCEFLERGDVKKILKDDEQASAFDWNKRVDAVKDVANALCYMHHDCLPPIVHRDISSKNVLLDSEYVAHVSDFGTAKLLDHSSANWTSFAGTFGYAAPELAYTMEVNEKCDVYSFGVLALEILFGRHPGDVTSLMQSSLSTGMISTLDHMALMDNLDERLPVPTNSTLKEVVSILKTAISCLTESPRSRPTMKLVTNELALSRSSSMSHTELKD*


CDS Sequence:
>Vu_20001.1
ATGGTGTTCGTCTTTCCAACGCTTCTGTCCATGAAGCTCAAACCTTTATCGATGCTTCTTGTAATGTTGTTTTGTGCATTTTCACATTATGATGCTGCCAGTTCTTCTGATTCGGAAGCAAATGCTTTGTTGAAGTGGAAAGGCAGCCTTGACAGCCTCAGTCAAGCTTCTCTCTCTTCATGGAATGGCAGTAATCCTTGCAACTGGCTGGGAATAGAATGTGATAATTCCCATTCTGTTTCTCACATAAATCTTACACGTGTTGGATTGAAAGGTACACTTCAAACTTTTAACTTCTCATCACTTCCAAACATTCTCGGTCTGAATATGAGTTTCAACTCCTTGTCTGGAAGTATTCCTCAACAGATTGAAAAGTTGTCCAATCTCAGCGCGCTTGATTTGTCTACCAATAAACTCTCCGGTAACATTCCCAAAACCATCTGTAATCTTTCTAAACTAAAGTATCTGAATCTTAGTGTCAATGGTCTCTCTGGTTCTATTCCTAATGAAGTGGGCCATCTTCAGTCTCTTCTCACATTCGATATATTTACCAACAACCTCTCTGGGCCAATCCCTCCTACCTTAGGAACTCTGCCCCTTTTAGAATCCATTCACCTTTTTGAAAATAAACTCTCTGGACCCATTCCTGCCAGTATTGGGAATCTGTCCAGGCTCACCATGTTATCTTTATCTTCAAATCAACTCACCGGATCCATCCCTCCCCATATCGGAAATTTATCAAACGCCAAGGTCATATGTTTTATTGGGAATGAACTTAGTGGCGAGATTCCAGTAGAAATTGAGAAGCTTACTGGTCTCGAATGTTTGCAACTTGCTGATAATAATTTTATAGGCCATATACCTCAGAACATTTGCCTCGGCGGAAACATGAAATACTTCACAGCTGGTAATAACAATTTCACTGGCCCAATTCCACAGACTTTGAAGAAATGCTACAGCCTTAAAAGACTCAGGCTTCAGCAAAACCATCTTACTGGGGATATAACAAACTTTTTTGATGTCCTTCCAAACTTGAACTACATCGATCTCAGTGAAAATAATTTTCACGGTAGTCTTTCACCTACTTGGGGAAAATTTCGCAGCCTCACGAGCTTCATGATTTCCAAAAACAATTTGTCAGGTGTTATTCCACCAGAACTAGGTGGCGCAACCAAATTACAGGTGCTTGATCTATCCTCAAACCATCTTACAGGAAACATTCCAGAAGATTTATGCAACTTGACCCTCTTGTTTGATCTTTCAATCAACAACAATAATCTTTCTGGAAATGTTCCCTCGAAAATAGAATCACTGGAGGCACTTAAAATTTTGGAGCTCGGGTCAAATGATTTCACAGGCTTAATCCAGAAAAAAATTGGAAATTTGCGCAATTTATTGTACTTGAATCTGAGCCAGAATAAATTTGAGGGAAATATTCCTTCAGAGCTTGGCAATTTGAATTATCTCTCACGTCTTGATCTCAGTGGAAATTTGTTGAGTGAAAGATTACCACCAACGCTTGGTGGAATAAAAGGCTTAGAAACATTGAATCTATCCCACAATAGTCTTTCAGGTGGTCTCTCTAGCTTACATGATATGATGAGTTTGACATCTTTTGACATATCATACAACCAGTTTGAGGGTCCACTTCCTGACATTCCAGTCTTCCAGAATGCCACCATTGAAGCTCTGAGAAATAATACAGGCCTGTGTGGCAATGTCACAGGCTTGGAGCCTTGCCCGAAAGTAAGTGGGAAATCTCATAATAATACTACAAGGAAAGTGCTAATAGCAGTTTTACCCGTTACTGTGGCCATTCTAATGCTTGCACTATTTCTTTTTGGTGTCTCCTACAATTTATGCCGAACTTCAAACGAAGAACAAGAGAAGGCTCTAAGTTCACGATCTGCCAGCATGTTTCCAGCATGGAGTTTCGGAGGCAAAATTATGTTTGAGAATATTATTGAAGCCACCGAATATTTTGATGACAAATATCTCATTGGAGTTGGAGGTCAAGGTCGTGTTTACAAAGCAATATTACCCACAGGTGAAGTTGTTGCTGTGAAGAAACTCCATTCAGTTTCAAACGGAGAAGTCCTCAATCAGAAAGCTTTCACAAGGGAGATCCAGGCTTTGACAGAAATCCGACATCGTAACATTGTAAAGTTTCATGGGTTTTGTTCGCATTCACAATATTCACTTTTGGTGTGCGAATTCCTAGAGAGGGGCGATGTGAAGAAGATTTTGAAAGATGATGAACAAGCATCTGCATTTGATTGGAATAAAAGGGTGGATGCTGTTAAAGACGTGGCAAATGCTTTATGCTATATGCACCATGATTGCTTACCTCCAATTGTCCATCGTGATATATCAAGCAAAAATGTTCTTTTGGATTCAGAATATGTAGCTCATGTCTCAGACTTCGGAACAGCTAAGCTTCTTGATCATAGTTCAGCCAATTGGACATCATTTGCAGGAACCTTTGGATATGCTGCTCCAGAACTTGCATACACAATGGAAGTAAACGAGAAATGTGACGTGTATAGTTTTGGGGTCTTGGCATTGGAAATATTATTTGGAAGGCACCCTGGTGATGTTACATCTTTAATGCAATCTTCTTTATCAACTGGTATGATCTCAACGCTTGATCATATGGCATTGATGGATAACTTGGATGAACGTCTACCTGTTCCAACAAATTCTACTTTGAAAGAGGTGGTATCAATTCTCAAGACAGCAATTTCTTGCCTGACTGAAAGTCCACGATCCCGACCAACCATGAAGCTCGTAACCAACGAGCTTGCATTGTCGAGGTCATCTTCAATGTCACACACAGAGCTGAAAGACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_20001::LG5:16535657-16537657(+)
GAGACGATGGAAAATTGATAGATCCATCGCTTTCATATCCCTCAAAATCAACTGCATGGCCCACTTCAGAGAAATTGCTATGGCTGTTGGTATTATTGACTCATCCATGATAATGTTACTATAATTTGCACCAAAGATGATGCCAACTGCACTATCATTTTCCCTAAAACCCAGTCGTCTATGTTGACTTTGAATTTTGCATGTGCATCTTGTCTACTTGCTTGCAAGTGTACATCTTACTGTGGTTTTTTCTTCTTAATATCTACTAATTTAATTTCTTAAATTCACTTTTATTTTTACCTTAGATTTGATGAGAAAAAGCGTTTATACATGTCTTTCTCAAATCATATTGAATATAGTTACAGTAGTTTTAAAATAAATATTTGTTTTTTCAAATTTAATAAATAGAAACCATCTTTCAAATTATTAAAAAAACCAATATTTATCTCTATACTTTTAATAAAACTATACGTAAATTTGTAATATTTCTACAACAGTAACCCTTAATTACCTCTATTGTTTTATTTTATAAAATATATATTAGTTAAAATTTAAATAAAAATATGAAAAAGGCTTTATTTACAAATATTCATTTTTAAAATTTAAGTTTTAGATTATATATTTAATTAAATTTAATCTATGTTATTTTTTTAATAAAAGAAAGGAAGTAATGACACTTTATTAACGATATGAGTAATGTCATTATATTTAAATTATAAGGATGGAAAATACCATTCTATTAAAAATTAGAAAAACTAGAGCTGGTATGATATGTATTTATTTTAAAAATATTGAGTATAATAAGTATAGTTGTTTAATTATAAGTACTTTTTATAACTTGGATGGAGTAATATAGAAACAAAATTCATTTATTTAGAGAATTTTAAATTCTTCATAATATAATATAATGTTTGTTTGAATAAAGTAAAGTAATTAAAATTAAATTGAAAGTTAAGAAATTTTCAAATGTATTTTAAATGAATAGAATAAAAAATTTACAAATATATTAAAAAATACAAGTTATTTGATATTTTACGTCACTCTTACTCTATTTGTAAAGTTTGAGTCGAGTTGGTTGTTAAAGGCTCAATTGAATTGTCCTAATTGAGAAAGGTTGATAAAAGTTAAAGGTAAAAACAAATTGATTTTGATTACAGATCGGGACTAGTTCGTTCAGATCAAAGATTGGATGAGTCAATCTTGACAAGAAACGACATAAGTCAATTTTTTTTCTAGGTCAAAGATCGAGACGAGACGTCTTCGAAAATCAAGACGAGTCCTCTTTAACCTAGGATCGAGATAATTTATTTCAAATCCAAAGTCGAGTTAAATCGACTGAACCTAGAATTAAATCCAATCATTCAAATGTTAGATTGAATCAACCTGAGTCAAATGTTAAAATGAATGCGAGAAGAGTTAATTTAGCCTAAATATCAATTATAAAATAAAAAAATCTTGAAGAACTTTCACAAAAGAAAAATAATATAAATCAATATTTATTACAAAAGATAACCAATATTAATATCTTTTAACAATTATTTAATATTTAAATATTTTTTAAAATTTGGTAGTAATTTAATACTTTGGAAAAAAAATTAAAATTGACTATATTTGAATTTCTTTGTCTAAACAATAAATCTGAAAATAAAATTAAAATAAAATCAATTAAAATTTAATGTATTTAAATATCTTGAGAATTGAAAAATATGTATATAAAATTTTTAAGATGAAAAAGAAAACGAATAAACTAAAAAAGATTATAGAACAATTTAAATATCTTTCAACTTGGGGATAAACATTGTGTGGTTTAACAGATAAAGATAGGTGACATTTTAACAGTGAACATATGTCGTATAAAGAAGGGAATATGACGGTAACAGTATAACGTGGATAATACGCTGTAATAACAACGATTCTAGACCAATTCAACGAAAGAAAAAGTACAATATTTCTTGACTTGGGTTTTTATATATGTCACGCTCAGAAGTATTTGCAAAATC


Gene Sequence:
>Vu_20001(+)
CCCATCAACTGCATGCAAGTTATTTTCTCTTGTAATTGAAAATTTCATCATGGTGTTCGTCTTTCCAACGCTTCTGTCCATGAAGCTCAAACCTTTATCGATGCTTCTTGTAATGTTGTTTTGTGCATTTTCACATTATGATGCTGCCAGTTCTTCTGATTCGGAAGCAAATGCTTTGTTGAAGTGGAAAGGCAGCCTTGACAGCCTCAGTCAAGCTTCTCTCTCTTCATGGAATGGCAGTAATCCTTGCAACTGGCTGGGAATAGAATGTGATAATTCCCATTCTGTTTCTCACATAAATCTTACACGTGTTGGATTGAAAGGTACACTTCAAACTTTTAACTTCTCATCACTTCCAAACATTCTCGGTCTGAATATGAGTTTCAACTCCTTGTCTGGAAGTATTCCTCAACAGATTGAAAAGTTGTCCAATCTCAGCGCGCTTGATTTGTCTACCAATAAACTCTCCGGTAACATTCCCAAAACCATCTGTAATCTTTCTAAACTAAAGTATCTGAATCTTAGTGTCAATGGTCTCTCTGGTTCTATTCCTAATGAAGTGGGCCATCTTCAGTCTCTTCTCACATTCGATATATTTACCAACAACCTCTCTGGGCCAATCCCTCCTACCTTAGGAACTCTGCCCCTTTTAGAATCCATTCACCTTTTTGAAAATAAACTCTCTGGACCCATTCCTGCCAGTATTGGGAATCTGTCCAGGCTCACCATGTTATCTTTATCTTCAAATCAACTCACCGGATCCATCCCTCCCCATATCGGAAATTTATCAAACGCCAAGGTCATATGTTTTATTGGGAATGAACTTAGTGGCGAGATTCCAGTAGAAATTGAGAAGCTTACTGGTCTCGAATGTTTGCAACTTGCTGATAATAATTTTATAGGCCATATACCTCAGAACATTTGCCTCGGCGGAAACATGAAATACTTCACAGCTGGTAATAACAATTTCACTGGCCCAATTCCACAGACTTTGAAGAAATGCTACAGCCTTAAAAGACTCAGGCTTCAGCAAAACCATCTTACTGGGGATATAACAAACTTTTTTGATGTCCTTCCAAACTTGAACTACATCGATCTCAGTGAAAATAATTTTCACGGTAGTCTTTCACCTACTTGGGGAAAATTTCGCAGCCTCACGAGCTTCATGATTTCCAAAAACAATTTGTCAGGTGTTATTCCACCAGAACTAGGTGGCGCAACCAAATTACAGGTGCTTGATCTATCCTCAAACCATCTTACAGGAAACATTCCAGAAGATTTATGCAACTTGACCCTCTTGTTTGATCTTTCAATCAACAACAATAATCTTTCTGGAAATGTTCCCTCGAAAATAGAATCACTGGAGGCACTTAAAATTTTGGAGCTCGGGTCAAATGATTTCACAGGCTTAATCCAGAAAAAAATTGGAAATTTGCGCAATTTATTGTACTTGAATCTGAGCCAGAATAAATTTGAGGGAAATATTCCTTCAGAGCTTGGCAATTTGAATTATCTCTCACGTCTTGATCTCAGTGGAAATTTGTTGAGTGAAAGATTACCACCAACGCTTGGTGGAATAAAAGGCTTAGAAACATTGAATCTATCCCACAATAGTCTTTCAGGTGGTCTCTCTAGCTTACATGATATGATGAGTTTGACATCTTTTGACATATCATACAACCAGTTTGAGGGTCCACTTCCTGACATTCCAGTCTTCCAGAATGCCACCATTGAAGCTCTGAGAAATAATACAGGCCTGTGTGGCAATGTCACAGGCTTGGAGCCTTGCCCGAAAGTAAGTGGGAAATCTCATAATAATACTACAAGGAAAGTGCTAATAGCAGTTTTACCCGTTACTGTGGCCATTCTAATGCTTGCACTATTTCTTTTTGGTGTCTCCTACAATTTATGCCGAACTTCAAACGAAGAACAAGAGAAGGCTCTAAGTTCACGATCTGCCAGCATGTTTCCAGCATGGAGTTTCGGAGGCAAAATTATGTTTGAGAATATTATTGAAGCCACCGAATATTTTGATGACAAATATCTCATTGGAGTTGGAGGTCAAGGTCGTGTTTACAAAGCAATATTACCCACAGGTGAAGTTGTTGCTGTGAAGAAACTCCATTCAGTTTCAAACGGAGAAGTCCTCAATCAGAAAGCTTTCACAAGGGAGATCCAGGCTTTGACAGAAATCCGACATCGTAACATTGTAAAGTTTCATGGGTTTTGTTCGCATTCACAATATTCACTTTTGGTGTGCGAATTCCTAGAGAGGGGCGATGTGAAGAAGATTTTGAAAGATGATGAACAAGCATCTGCATTTGATTGGAATAAAAGGGTGGATGCTGTTAAAGACGTGGCAAATGCTTTATGCTATATGCACCATGATTGCTTACCTCCAATTGTCCATCGTGATATATCAAGCAAAAATGTTCTTTTGGATTCAGAATATGTAGCTCATGTCTCAGACTTCGGAACAGCTAAGCTTCTTGATCATAGTTCAGCCAATTGGACATCATTTGCAGGAACCTTTGGATATGCTGCTCCAGGTTAGTTTCCTTTCTATATTGAGTATATATCATGATATTTCAGGTTGTGTTTGTTGATGATTTACAAAATATTTTTAATTTTATACAGAACTTGCATACACAATGGAAGTAAACGAGAAATGTGACGTGTATAGTTTTGGGGTCTTGGCATTGGAAATATTATTTGGAAGGCACCCTGGTGATGTTACATCTTTAATGCAATCTTCTTTATCAACTGGTATGATCTCAACGCTTGATCATATGGCATTGATGGATAACTTGGATGAACGTCTACCTGTTCCAACAAATTCTACTTTGAAAGAGGTGGTATCAATTCTCAAGACAGCAATTTCTTGCCTGACTGAAAGTCCACGATCCCGACCAACCATGAAGCTCGTAACCAACGAGCTTGCATTGTCGAGGTCATCTTCAATGTCACACACAGAGCTGAAAGACTGAACATCCTACATATACATGCTTGAGTTGTACTTGTTCCCTTGATTTTGTACTGTATTTTCTTGTTTCTTATTTTATATAATCTCTTTAATGTTATGAAATATAGATCTTGTAATCGTGAAGTTAGCTTGTCTTTGTAATATAGTACTACACCACGAAAAGAATAAAACTTCTAACCTTTGTTTATTTAGACTATGATATATAGATTA